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      草地螟觸角普通氣味結(jié)合蛋白基因的克隆及序列分析

      2008-04-29 00:44:03王進(jìn)軍李克斌韋永貴曹雅忠
      植物保護(hù) 2008年4期
      關(guān)鍵詞:草地螟觸角

      鐘 濤 尹 姣 劉 懷 王進(jìn)軍 李克斌 韋永貴 曹雅忠

      摘要利用RT-PCR結(jié)合RACE技術(shù)克隆了編碼草地螟(Loxostege stzcticalis)觸角中一種普通氣味結(jié)合蛋白的基因。序列分析表明,成熟蛋白的序列中含有閱讀框序列,推導(dǎo)的氨基酸序列與已報(bào)道的11種鱗翅目昆蟲普通氣味結(jié)合蛋白I比較,平均相似度在62.3%左右,并擁有氣味結(jié)合蛋白的典型結(jié)構(gòu)特征。該基因歸屬于普通氣味結(jié)合蛋白I基因亞族。因此將它命名為LstiGOBPl。

      關(guān)鍵詞草地螟;觸角;普通氣味結(jié)合蛋白;RT-PCR;RACE

      中圖分類號Q 785,S 433.4

      草地螟[Loxostege sticticalis(Linnaeus)]又名網(wǎng)錐額野螟、甜菜網(wǎng)螟,屬鱗翅目、螟蛾科、野螟亞科、錐額野螟屬,是我國東北、華北和西北地區(qū)發(fā)生的多食性害蟲之一,取食為害大豆、苜蓿和甜菜等作物,具有遠(yuǎn)距離遷飛為害和周期性暴發(fā)特性,嚴(yán)重威脅了我國北方的農(nóng)牧業(yè)生產(chǎn)。

      草地螟對寄主植物具有明顯的選擇取食、產(chǎn)卵為害的特性,其中,嗅覺識別又是蛾類感知寄主植物信息的重要方式。靈敏的嗅覺在草地螟搜尋合適的寄主植物及選擇產(chǎn)卵地的過程中發(fā)揮著重要作用,而觸角作為昆蟲最主要的嗅覺感受器官,能夠依靠化學(xué)物質(zhì)進(jìn)行信息的傳遞,從而在數(shù)萬種化合物分子中識別出它所需要的氣味分子。已有研究證實(shí),在鱗翅目、雙翅目、鞘翅目和膜翅目等全變態(tài)昆蟲中都發(fā)現(xiàn)了氣味結(jié)合蛋白(OBPs)的存在,這種蛋白能結(jié)合疏水性氣味化合物,并攜帶它們快捷地穿過水溶性的淋巴液,實(shí)現(xiàn)氣味在觸角表皮與嗅覺神經(jīng)元上的膜結(jié)合受體之間傳遞。

      目前,對草地螟與寄主植物之間的化學(xué)通訊研究比較缺乏,僅在草地螟對寄主植物的選擇性及寄主植物的揮發(fā)物質(zhì)行為反應(yīng)等方面進(jìn)行了研究。因此,開展草地螟感知、識別寄主的分子機(jī)理方面的研究不僅能夠揭示其選擇寄主植物的分子機(jī)制,而且還可以為進(jìn)一步了解草地螟與寄主植物之間的化學(xué)信息聯(lián)系,闡明草地螟選擇寄主產(chǎn)卵與取食的內(nèi)因提供可靠的理論依據(jù),同時(shí)為研制、開發(fā)防控草地螟的藥劑提供新思路。

      1材料與方法

      1.1材料

      1.1.1供試?yán)ハx

      草地螟幼蟲用野生灰菜飼養(yǎng),成蟲羽化后3 d內(nèi)分別剪下雌、雄觸角,立即放在液氮中速凍,然后-70℃保存。

      1.1.2菌種及質(zhì)粒

      pGEM-T Easy載體購自Promega公司,感受態(tài)大腸桿菌DH5a購自北京博大泰克公司。

      1.1.3主要試劑及工具酶

      Ex Taq DNA聚合酶,限制性內(nèi)切酶EcoR I、瓊脂糖凝膠DNA純化試劑盒、3'-Full RACE CoreSet購自TaKaRa公司,Ampicillin、X-gal、IPTG購自北京博大泰克公司,總RNA提取試劑盒、cDNA第1鏈合成試劑盒等購自QIAGEN公司,質(zhì)粒小量快速抽提試劑盒及DNA Marker(DL4000和D50)購自北京明日百傲公司,其他試劑均為國產(chǎn)或進(jìn)口分析純試劑。

      1.2方法

      1.2.1觸角總RNA的提取及cDNA第1鏈合成

      將保存的草地螟雌、雄成蟲觸角各取20 mg,加液氮搗碎組織后,使用QIAGEN公司的RNeasyMini Kit提取總RNA,經(jīng)NanoDrop核酸濃度儀測定含量后,使用cDNA第1鏈合成試劑盒合成CD—NA第1鏈。

      1.2.2引物設(shè)計(jì)

      根據(jù)GenBank中已登錄的其他蛾類昆蟲的GOBPl基因序列[家蠶(Bombyx mori)、黃地老虎(Agrotis segetum)、小地老虎(A.ipsilon)、棉鈴蟲(Helicoverpa armigera)、煙芽夜蛾(Heliothis vi—rescens)、斜紋夜蛾(Spodoptera litura)、中國柞蠶(Antheraea pernyi)、煙草天蛾(Manduca sexta)、煙實(shí)夜蛾(Helicoverpa assulta)的GenBank登錄號分別為NM_001044031、DQ838577、DQ838578、AY049739、 X96862、EFl59978,Y10970、M73797、AY864774]設(shè)計(jì)并合成引物:正向引物(gps4):5-GTBATGAARGAYGTCACBCTNGG-3;反向引物(gpa4):5-AGGTTRAAGTGBCKGCTCAT-3(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成)。

      1.2.3PCR擴(kuò)增

      以合成的cDNA第1鏈為模板,反應(yīng)體系為cD-NA 2μL,10×Ex Taq Buffer 2.5 μL,dNTP2taL(各2.5 mmol/L),TaKaRa Ex Taq(5U/μL)0.25μL,正反引物各1μL(10 μmoL/L),加滅菌水至25μL,混勻、離心,然后放入PCR儀(Eppendorf Mastercycler Gra—dient)擴(kuò)增。反應(yīng)條件為94℃變性3 min;接著35個(gè)循環(huán),循環(huán)條件為94℃45 s,56.6℃45 s,72℃1 min,最后72℃延伸5 min。擴(kuò)增完畢后,用2%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定、純化,并回收目的片段。

      1.2.4PCR產(chǎn)物的克隆和鑒定

      利用瓊脂糖凝膠DNA純化試劑盒回收PCR產(chǎn)物,將純化得到的DNA連接到pGEM—T Easy載體,再轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌DH5a中,然后涂布在含有Ampicillin/X-gal/IPTG的LB平板上,37℃培養(yǎng)16 h。待長出藍(lán)、白斑后,隨機(jī)挑取白斑,培養(yǎng)后采用質(zhì)粒小量快速抽提試劑盒提取質(zhì)粒,利用菌落PCR和EcoR工酶切的方法,鑒定重組克隆PGEM/LstiGOBPl。

      1.2.5序列測定和分析

      DNA的序列測定在北京奧萊博生物科技有限責(zé)任公司進(jìn)行。

      1.2.6RACE擴(kuò)增

      以RT-PCR得到的目的DNA序列,按照試劑盒的要求設(shè)計(jì)引物,并參照說明書擴(kuò)增該基因的cDNA的3末端序列。目的DNA片段的上游特異性引物(3R-g01):5-GACGGAGGAGTTCTTC—CACTTCTG-3(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成);試劑盒中的下游接頭引物(3sites Adap—tor Primer):5-CTGATCTAGAGGTACCGGATCC-3。

      1.2.7RACE產(chǎn)物的克隆和鑒定

      方法參照1.2.4 PCR產(chǎn)物的克隆和鑒定。

      1.2.8序列測定和分析

      DNA的序列測定在北京奧萊博生物科技有限責(zé)任公司進(jìn)行。

      2結(jié)果與分析

      2.1GOBP1基因的擴(kuò)增和克隆

      以草地螟觸角cDNA為模板擴(kuò)增的DNA產(chǎn)物,分別進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析

      。從中可以明顯看出,PCR及3RACE擴(kuò)增的產(chǎn)物長度分別達(dá)到170 bp和500 bp左右,并且它們分別經(jīng)EcoR I酶切后得到的條帶與設(shè)計(jì)相符。

      2.2序列測定和分析

      草地螟CK)BPl基因的核苷酸序列,推導(dǎo)的氨基酸序列位于核苷酸序列之下,方框內(nèi)為保守的半胱氨酸位點(diǎn)。該基因已在GenBank中登錄,登錄號為EU413989。

      序列測定和結(jié)果分析表明,已獲得草地螟(X)BPl基因開放閱讀框?yàn)?23 bp,編碼142個(gè)氨基酸殘基,預(yù)測的分子量為16.1ku,等電點(diǎn)為5.00。該蛋白擁有氣味結(jié)合蛋白的共同特征,序列中含有6個(gè)保守的半胱氨酸位點(diǎn),呈酸性,且雌雄蟲GOBPl的核苷酸序列相同。

      利用DNASIS軟件,根據(jù)Robson的方法對編碼GOBPl-Lsti的mRNA進(jìn)行了二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,結(jié)果表明該基因的二級結(jié)構(gòu)主要為a一螺旋。此外,采用Kyte和Doolittle等的方法對GOBPl-Lsti氨基酸序列進(jìn)行親脂性分析,表明該蛋白中包含3個(gè)親脂性區(qū)域。這些區(qū)域很可能是親脂性氣味物質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)。

      利用NCBI BLAST network server在Gen—Bank/EMBL中進(jìn)同源性搜索發(fā)現(xiàn),在GenBank/EMBL中登錄的有完整序列的昆蟲GOBPl基因共11種?;谛蛄械耐葱员容^發(fā)現(xiàn)(表1),昆蟲GOBPl氨基酸序列具有明顯的同源性,平均相似度在62.3%左右。

      通常物種間的親緣越近,GOBPl的核苷酸和氨基酸序列的同源性也會越高。從LstiGOBPl與其他11種已知蛾類的進(jìn)化樹可以看出,草地螟與它們在進(jìn)化水平上相隔很遠(yuǎn)。因此,相對其他11種蛾類來說,草地螟與它們的親緣較遠(yuǎn)。

      3討論

      本試驗(yàn)利用RT-PCR結(jié)合RACE技術(shù)從草地螟觸角RNA中克隆了編碼草地螟GOBPl的基因,根據(jù)測序結(jié)果推導(dǎo)的氨基酸序列具有氣味結(jié)合蛋白的典型特征,屬于GOBPl蛋白亞族,并依據(jù)慣例將它命名為LstiGOBP1。

      鱗翅目昆蟲觸角中的普通氣味結(jié)合蛋白(GOB—Ps)的基因序列高度同源,氨基酸和核苷酸序列都非常保守。在LstiGOBPl蛋白序列中包含7個(gè)半胱氨酸位點(diǎn),其中6個(gè)半胱氨酸的空間分布在不同的物種間始終恒定(圖6)。半胱氨酸普遍遵循著這樣一個(gè)規(guī)則,X18-Cys-X30-Cys-X3-Cys-X42-Cys-X8-10-Cys-X8-Cys-X24-26,其中X代表任意氨基酸。而這6個(gè)保守的半胱氨酸在LstiGOBPl的空間分布恰好符合X15-Cys-X30-Cys-X3-Cys-X42-Cys-X10-Cys-X8-Cys-X27,很顯然,LstiGOBP1的N末端還不十分完整。

      在對草地螟普通氣味結(jié)合蛋白家族的兩個(gè)成員(GOBPl和GOBP2)的分析中(另文發(fā)表),發(fā)現(xiàn)GOBPl基因并沒有GOBP2基因那樣在分科水平上高度保守,而是呈現(xiàn)出離散的特點(diǎn),例如97—100、117—122氨基酸之間具有明顯的差異,這可能反映了LstiGOBPl在進(jìn)化中的變異與功能的分化。Krieger提出氣味結(jié)合蛋白的種類在昆蟲觸角中是極其龐大的觀點(diǎn),而Vogt也認(rèn)為OBPs的種類和變異恰好反映了昆蟲間化感行為的多樣性。

      可以通過二硫鍵的聯(lián)結(jié)信息來了解翻譯后的蛋白修飾情況。經(jīng)SCRATCH預(yù)測LstiGOBPl的蛋白序列,二硫鍵的發(fā)生位點(diǎn)分別在Cysl6-Cys51、Cys105-Cys119和Cys94-Cys114。而Leal在對家蠶信息素結(jié)合蛋白基因的二硫鍵結(jié)構(gòu)的研究中發(fā)現(xiàn),該蛋白中存在3個(gè)二硫鍵,分別位于Cys19-Cys54、Cys50-Cys108和Cys97-Cys117??紤]到LstiGOBP1蛋白序列還不完整,所以與Leal的研究結(jié)果是一致的。但僅僅在第2個(gè)二硫鍵的構(gòu)成上有所不同,在LstiGOBP1蛋白序列中,由第5(Cys105)與第7(Cys119)共同形成了二硫鍵。這種差異很可能決定了GOBP1結(jié)合氣味因子的形狀和種類。此外,在多數(shù)已研究的蛾類中,都存在著第7個(gè)半胱氨酸,而且它的位點(diǎn)也是十分保守的(圖6)。

      GOBPs的三維結(jié)構(gòu)目前還不十分清楚,但是其疏水和親水結(jié)構(gòu)域在載體蛋白中的特性分布非常重要,Krieger預(yù)測的疏水結(jié)構(gòu)域通常在第40~60個(gè)氨基酸之間,這可能是用來結(jié)合氣味化合物的區(qū)域。Steinbrecht的研究小組證實(shí)GOBPs在觸角中是專一表達(dá)的,分布在含有特殊識別功能的受體細(xì)胞的感覺器中,它們只對食物和寄主氣味有特殊反應(yīng),但不包括信息素分子。Feng也證實(shí)GOBPl具有更廣泛地結(jié)合綠色植物和有花植物的氣味分子的功能。LstiGOBP1同樣包含了交替變化的疏水和親水結(jié)構(gòu)域,這種結(jié)構(gòu)決定了其結(jié)合氣味分子并運(yùn)送的功能。

      通常GOBP1成熟蛋白包含144~146個(gè)氨基酸,而氨基酸數(shù)目的恒定也維持GOBP1蛋白的功能穩(wěn)定。N末端親水性區(qū)域通常有18~26個(gè)氨基酸,該肽段揭示了信號肽的性能特征信息。目前,在LstiGOBP1序列中還未包含完整的N末端信息,5RACE試驗(yàn)正在開展之中。

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