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      卡斯帕酶-3抑制劑的高通量篩選及活性化合物F03ZA-575的初步研究

      2010-12-01 04:46:54李韶菁任曉董悅生張華鄭智慧路新華段海清
      關(guān)鍵詞:工作液底物抑制劑

      李韶菁,任曉,董悅生,張華,鄭智慧,路新華,段海清

      卡斯帕酶-3(Caspase-3)作為最重要的成員和關(guān)鍵的執(zhí)行分子,在凋亡信號(hào)傳導(dǎo)的許多途徑中發(fā)揮著重要的功能。許多常見(jiàn)病與多發(fā)病(病毒性感染例如感冒、關(guān)節(jié)炎等)、心腦血管疾?。ɡ缒X卒中、心肌梗死等)、腫瘤、腦神經(jīng)退行性疾?。ɡ缭缋闲园V呆癥、帕金森病等)的發(fā)生,都與卡斯帕酶-3的異?;顒?dòng)有關(guān),因此,Caspase-3 被認(rèn)為是一個(gè)很有前景的藥物治療靶位點(diǎn)。高效、高選擇性的抑制劑將可能為治療上述與Caspase-3相關(guān)的疾病提供新的途徑[1-3]。

      目前國(guó)外一些大公司已競(jìng)相開(kāi)展了此類藥物的研發(fā)工作,其中,美國(guó) Aventis公司和Vertex公司共同開(kāi)發(fā)的治療風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和膿血癥的卡斯帕酶的抑制劑 VX740(Pralnacasan)和VX799 已完成 II 期臨床研究;美國(guó) Idun 制藥公司開(kāi)發(fā)的卡斯帕酶的抑制劑(代號(hào):IDN6556和IDN6734)主要用于治療急性心肌梗死,急性酒精中毒引起的肝衰竭;美國(guó) Idun公司正在開(kāi)發(fā)中的另一類卡斯帕酶的抑制劑 IDN5370 可預(yù)防缺血性腦卒中引起的腦神經(jīng)元的大量死亡及由此引起的偏癱和失語(yǔ)等后遺癥[1]。我們以 Caspase-3 為靶點(diǎn),建立了一個(gè) Caspase-3 抑制劑的高通量篩選模型,應(yīng)用此模型對(duì)微生物來(lái)源的共計(jì) 10026個(gè)次級(jí)代謝產(chǎn)物提取物進(jìn)行了篩選,其中一株真菌產(chǎn)生的化合物 F03ZA-575 對(duì)來(lái)源于人的Caspase-3 酶具有明顯的抑制活性,本文報(bào)道了該化合物的有關(guān)研究結(jié)果。

      1 材料和方法

      1.1 主要材料

      1.1.1 試劑 人源 Caspase-3 酶儲(chǔ)液由華北制藥集團(tuán)新藥研究開(kāi)發(fā)中心利用基因工程技術(shù)在大腸桿菌 E.Coli 中表達(dá)并分離得到,–20 ℃ 凍存?zhèn)溆?;底?Ac-DEVD-AMC 購(gòu)自美國(guó) Sigma公司;其余化學(xué)試劑均為分析純或色譜純?cè)噭?/p>

      1.1.2 主要儀器 Victor21420 多功能測(cè)定儀為美國(guó) PE公司產(chǎn)品;低溫離心濃縮儀為德國(guó) Christ公司產(chǎn)品;中壓層析分離制備系統(tǒng)為瑞士 BUCHI公司產(chǎn)品;HPLC 高壓液相分析和半制備系統(tǒng)為美國(guó) Waters公司產(chǎn)品;500 MHz 核磁共振為美國(guó)Inova公司產(chǎn)品。

      1.1.3 實(shí)驗(yàn)菌種與提取物 放線菌株及真菌菌株由華北制藥集團(tuán)新藥研究開(kāi)發(fā)有限責(zé)任公司天然藥物室微生物菌種庫(kù)提供;篩選用放線菌及真菌發(fā)酵代謝產(chǎn)物樣品由微生物代謝產(chǎn)物庫(kù)提供。

      1.2 方法

      1.2.1 Caspase-3 酶活力測(cè)定方法的建立和優(yōu)化

      1.2.1.2 Caspase-3 酶測(cè)活溶液的配制 Caspase-3酶測(cè)活緩沖液含 20 mmol/L HEPES(4-羥乙基哌嗪乙磺酸),0.1% CHAPS[3-3-(膽酰氨丙基)二甲氨基丙磺酸內(nèi)鹽],100 mmol/L NaCl,10 mmol/L DTT(二硫蘇糖醇),10% 蔗糖,1 mmol/L EDTA,pH 7.5。熒光底物 Ac-DEVD-AMC 儲(chǔ)液:稱取 2.5 mg Ac-DEVD-AMC 粉末,加 0.74ml DMSO 溶解,配制成 10 mmol/L的儲(chǔ)液。Ac-DEVD-AMC 工作液:準(zhǔn)確吸取所需量的Ac-DEVD-AMC 儲(chǔ)液,加測(cè)活緩沖液稀釋成濃度為1 μmol/L的工作溶液(用前臨時(shí)配制)。

      1.2.1.3 Caspase-3 酶活力測(cè)定方法的建立和優(yōu)化 在96 孔板上分別固定一種底物的濃度,研究底物或 Caspase-3 濃度的變化與酶活性的關(guān)系。在最佳底物濃度條件下,觀察不同的反應(yīng)溫度與酶活性的關(guān)系,在此基礎(chǔ)上確定酶的加入量與酶反應(yīng)曲線的線性范圍。

      1.2.2 微生物來(lái)源的Caspase-3 酶抑制的篩選 在96 孔板的樣品測(cè)定孔中,分別加入 2 μl的待測(cè)樣品、55 μl 酶工作液,對(duì)照孔和空白孔分別以 2 μl DMSO和55 μl 測(cè)活緩沖液代替酶液,其余與樣品孔相同。37 ℃ 保溫 15 min,各孔中加入濃度為1 μmol/L的底物工作液 45 μl。離心 2 min 并振搖混勻,測(cè)定各孔在以 355 nm 為激發(fā)波長(zhǎng),以460 nm 為發(fā)射波長(zhǎng)下的熒光強(qiáng)度值(F1),37 ℃ 保溫 120 min 后,再測(cè)定各孔在同樣條件下的熒光強(qiáng)度值(F2)。

      樣品對(duì) Caspase-3 酶抑制率的計(jì)算公式為:

      選取抑制率大于80%的樣品為陽(yáng)性樣品。

      1.2.3 陽(yáng)性真菌 F03ZA-575 產(chǎn)生的對(duì) Caspase-3酶具有抑制作用的活性物質(zhì)的分離

      1.2.3.1 陽(yáng)性菌株 F03ZA-575的來(lái)源 陽(yáng)性菌株 F03ZA-575 為真菌,來(lái)源于華北制藥集團(tuán)新藥研究開(kāi)發(fā)中心(微生物藥物國(guó)家工程研究中心)微生物菌種庫(kù),采自我國(guó)云南省。

      1.2.3.2 菌株 F03ZA-575的培養(yǎng) 將菌株F03ZA575 斜面接種于含種子培養(yǎng)基(含 2.0% 淀粉;0.2% 豆餅粉;0.6% 麥芽粉;0.3% 酵母粉;NaCl 0.2%;FeSO4·7H2O 0.1%;0.2% CaCO3,pH 7.0)的500ml 三角瓶中,27 ℃ 培養(yǎng) 3 d,按 10%的接種量接種于固體發(fā)酵培養(yǎng)基(大米 97.5%,黃豆餅粉 2.5%),27 ℃ 靜止培養(yǎng) 8 d。

      1.2.3.3 菌株 F03ZA-575 發(fā)酵液的提取分離 F03ZA-575 固體發(fā)酵培養(yǎng)物 2000 g,加入4000ml的乙酸乙酯,萃取得到褐色 F03ZA-575粗提物 4.2 g,粗提物活性測(cè)定結(jié)果為IC50=18.7μg/ml。

      1.2.3.4 活性組分的硅膠柱層析精制 取 4 g 粗提物,加少量甲醇溶解,使用硅膠柱(Φ3.6cm×40 cm)氯仿-甲醇梯度洗脫,收集洗脫液,40ml/管,共收集 120 管。合并目標(biāo)活性組分,濃縮抽干后得黃色固體 1.1 g。

      1.2.3.5 活性組分的LH-20 柱分離純化 活性粗品用甲醇溶解后進(jìn)行 LH-20 柱分離純化,收集洗脫液,20ml/管收集洗脫液共收集 50 管。檢測(cè)各管的活性同時(shí)對(duì)照 HPLC 分析結(jié)果(色譜柱:Kromasil 10 μm,Φ250 mm×4.6 mm),合并目標(biāo)活性組分,濃縮抽干后得淺黃色固體 78 mg。

      1.2.3.6 活性組分的結(jié)晶精制 取上述淺黃色固體 40 mg,溶于氯仿,然后向氯仿溶液中緩慢滴加甲醇使白色沉淀緩緩析出。離心,過(guò)濾并減壓蒸干,得到活性組分 F03ZA-575(白色固體)21 mg。

      2 結(jié)果

      2.1 Caspase-3 酶活力的影響因素

      2.1.1 反應(yīng)體系中底物 Ac-DEVD-AMC 對(duì)酶活力的影響 保持反應(yīng)體系中其他組分濃度不變,改

      圖1 底物濃度對(duì)卡斯帕酶-3 活性的影響Figure1 The effect of substrate concentration on Caspase-3 activity

      變底物 Ac-DEVD-AMC的工作液濃度,觀察其對(duì)酶促反應(yīng)體系的影響,見(jiàn)圖 1。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,Caspase-3 酶的活力隨底物濃度的增加而增加,當(dāng)工作液的濃度在0.6 μmol/L 以上時(shí),酶活力達(dá)到最大。因此,選擇底物工作液的濃度為1 μmol/L 已能滿足活性測(cè)定要求。

      2.1.2 反應(yīng)體系溫度對(duì)酶活力的影響 在反應(yīng)體系中保持上述選定的各組分的濃度不變,觀察反應(yīng)體系溫度對(duì)酶促反應(yīng)體系的影響,見(jiàn)圖 2。結(jié)果表明,用該方法測(cè)定 Caspase-3 酶的活力,37 ℃ 時(shí)達(dá)到最大值,因此選擇 37 ℃ 為測(cè)活溫度。

      圖2 反應(yīng)溫度對(duì)卡斯帕酶-3活性的影響Figure2 The effect of reaction temperature on Caspase-3 activity

      2.1.3 Caspase-3 酶反應(yīng)曲線 在上述最佳底物濃度和最佳反應(yīng)溫度條件下,通過(guò)改變 Caspase-3酶的加入量測(cè)得的Caspase-3 酶活曲線見(jiàn)圖 3。由圖 3 可見(jiàn),Caspase-3 酶液的加入量在0~2 μl 范圍內(nèi)呈現(xiàn)出較好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù) r=0.9946,據(jù)此選定反應(yīng)體系中 Caspase-3 酶的加入量為2 μl。

      圖3 酶活性曲線Figure3 The enzyme activity curve

      2.2 已知 Caspase-3 酶抑制劑陽(yáng)性化合物對(duì)酶促反應(yīng)體系的驗(yàn)證

      用已知 Caspase-3 抑制劑陽(yáng)性化合物 ACDEVD-CHO[6]對(duì)酶促反應(yīng)體系進(jìn)行了驗(yàn)證,結(jié)果顯示其對(duì)篩選體系可以產(chǎn)生劑量依賴的抑制關(guān)系,確定了該篩選模型的可行性。

      2.3 微生物來(lái)源的Caspase-3 酶抑制劑的篩選結(jié)果

      利用上述 Caspase-3 酶抑制劑高通量篩選方法,對(duì)來(lái)源于放線菌、真菌的共 10026個(gè)發(fā)酵液提取物樣品進(jìn)行了篩選,初篩得到陽(yáng)性樣品 47個(gè)(陽(yáng)性率 0.6%),復(fù)篩得到陽(yáng)性樣品 10個(gè)(陽(yáng)性率 0.1%)。

      2.4 化合物 F03ZA-575的結(jié)構(gòu)解析

      化合物 F03ZA-575的1H-NMR和13C-NMR的測(cè)定數(shù)據(jù)及與Duclauxin 文獻(xiàn)報(bào)道數(shù)據(jù)的比較見(jiàn)表1,化學(xué)結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖 4。

      表1 F03ZA-575和Duclauxin的核磁共振(CDCl3)數(shù)據(jù)Table1 NMR data (CDCl3) of F03ZA-575 and Duclauxin

      圖4 F03ZA-575的化學(xué)結(jié)構(gòu)Figure4 The chemical structure of F03ZA-575

      2.5 化合物 F03ZA-575 對(duì) Caspase-3 酶抑制活性的測(cè)定結(jié)果

      化合物 F03ZA-575 對(duì) Caspase-3 酶抑制活性的測(cè)定結(jié)果見(jiàn)圖 5,從該圖可以看出,化合物F03ZA-575 對(duì) Caspase-3 酶呈現(xiàn)出劑量依賴的抑制作用,其 IC50值為12.5μg/ml。

      3 討論

      圖5 F03ZA-575 對(duì) Caspase-3 酶的抑制活性曲線Figure5 The inhibitory activity curve of F03ZA-575 to Caspase-3

      Caspase-3 作為Caspases 家族中最重要的成員之一,是哺乳動(dòng)物細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵蛋白酶。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),Caspase-3 除與心腦血管疾病、腫瘤的發(fā)生有一定的關(guān)系外,在神經(jīng)退行性疾病的病理過(guò)程中也起著很重要的作用。Caspase-3 在這些疾病的病理過(guò)程中,不僅僅是起著凋亡的效應(yīng)器作用,還能直接與老年性癡呆癥、帕金森癥、亨廷頓舞蹈病、脊椎小腦失調(diào)等疾病的致病蛋白質(zhì)分子相互作用,參與這些疾病的致病機(jī)制[9-11]。因此,Caspase-3 也是治療神經(jīng)退行性疾病的一個(gè)新的重要的靶位點(diǎn),尋找 Caspase-3 高效、高選擇性的抑制劑將為治療神經(jīng)退行性疾病提供新的途徑[2]。

      利用 E.coli 表達(dá)的人 Caspase-3 酶,建立了一種基于96-孔板的Caspase-3 酶抑制劑的高通量篩選模型,通過(guò)反應(yīng)前后熒光強(qiáng)度的變化檢測(cè)樣品對(duì) Caspase-3 酶的抑制活性。該方法具有快速準(zhǔn)確、靈敏度高的特點(diǎn),特別適合于大量樣品的篩選。利用該篩選模型,通過(guò)對(duì) 10026個(gè)微生物發(fā)酵提取物中的篩選,從一株真菌產(chǎn)生的發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到了一個(gè)對(duì) Caspase-3 酶有較強(qiáng)抑制活性的化合物,結(jié)構(gòu)解析確認(rèn)該化合物與Duclauxin的結(jié)構(gòu)相同。Duclauxin 最早是由 Shibata等[7-8,12]報(bào)道的具有抗癌活性的化合物,但對(duì)該化合物的抗癌機(jī)制未見(jiàn)有很詳細(xì)和深入的報(bào)道,本文首次報(bào)道了 Duclauxin 對(duì)來(lái)源于人的Caspase-3 酶的抑制活性,將對(duì) Duclauxin 在抗腫瘤作用機(jī)制和與Caspase-3 酶有關(guān)的其他疾病治療方面的深入研究,提供有用的信息。

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