侯曉暉 陳祥盛
摘要:通過PCR擴(kuò)增獲得了飛虱科3屬5種昆蟲的16 S rDNA序列,對(duì)DNA序列進(jìn)行測(cè)定,分析了其序列組成及變異。采用Mega 4.0軟件,利用鄰接法(NJ)和最大簡(jiǎn)約法(MP)進(jìn)行5種飛虱的系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)果顯示構(gòu)建的MP和NJ分子系統(tǒng)樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)一致,3個(gè)簇角飛虱屬物種中華簇角飛虱(Belocera. sinensis)、褐額簇角飛虱(B. fuscifrons)和爬竹簇角飛虱(B. ampelocalamus)單獨(dú)聚為一支,與偏角飛虱屬海南偏角飛虱(Neobelocera hainanensis)的親緣關(guān)系較近,與短頭飛虱屬顯脊短頭飛虱(Epeurysa distincta)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),分子生物學(xué)分析結(jié)果與形態(tài)學(xué)研究結(jié)果一致。
關(guān)鍵詞:飛虱科;簇角飛虱屬(Belocera);16 S rDNA;系統(tǒng)發(fā)育
中圖分類號(hào):Q969.35文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2012)15-3355-03
Evolutionary Relationships among Three Belocera Species Inferred from 16 S rDNA Sequences
HOU Xiao-hui1,2,CHEN Xiang-sheng1
(1. Institute of Entomology, Guizhou University/Guizhou Key Laboratory for Plant Pest Management of Mountainous Region, Guiyang 550025, China; 2. Zunyi Medical College, Zunyi 563003, Guizhou, China)
Abstract: The 16 S rDNA sequences of 5 plant hoppers belonging to 3 genus in the family of Delphacidae were obtained by PCR and then sequenced. The sequence composition and mutation were analyzed. Molecular phylogenetic trees were constructed by maximum parsimony method(MP) and neighbor-joining method(NJ) using Mega 4.0 software. The result showed that the topologies of MP tree and NJ tree constructed were the same. Belocera Sinensis, B. fuscifrons and B. ampelocalamus were clustered into one group, which had closer relationship to Neobelocera hainanensis while further distance from Epeurysa distincta. These results were identical with those of morphology research.
Key words: Delphacidae; Belocera; 16 S rDNA; phylogeny
飛虱科(Delphacidae)隸屬于半翅目(Hemiptera)蠟蟬總科(Fulgoroidea)[1]。該科昆蟲許多種類是重要的農(nóng)林害蟲,它們通過刺吸汁液、產(chǎn)卵或傳播植物病毒病等方式為害水稻、玉米、蘆葦、甘蔗、竹子等,給農(nóng)林生產(chǎn)造成巨大損失[2]。其中簇角飛虱屬(Belocera)為外形比較獨(dú)特的一個(gè)屬,其觸角矢狀,嚴(yán)重危害竹類植物[2,3]。該屬目前記錄5種,均為東洋種,僅中國云南、貴州、海南、廣東、臺(tái)灣等地有分布記載[2,4,5]。與簇角飛虱屬外形相似,同樣具備矢狀觸角的偏角飛虱屬(Neobelocera)也為害竹類植物,且與簇角飛虱屬的分布極其相似[1,2,5]。為了更好地進(jìn)行兩近緣屬的分類研究,選取飛虱科簇角飛虱屬、偏角飛虱屬及外類群短頭飛虱屬的5個(gè)物種,利用其16 S rDNA序列片段進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,探討兩屬間及種間的分子進(jìn)化關(guān)系,以期為實(shí)際生產(chǎn)中害蟲的鑒定提供一定的科學(xué)依據(jù)。
1材料與方法
1.1實(shí)驗(yàn)材料
簇角飛虱屬中華簇角飛虱(B. sinensis)、褐額簇角飛虱(B. fuscifrons)和爬竹簇角飛虱(B. ampelocalamus),偏角飛虱屬海南偏角飛虱(N. hainanensis)及短頭飛虱屬顯脊短頭飛虱(Epeurysa distincta),采集地信息見表1,采樣后保存于無水乙醇中備用[6]。
1.2基因組DNA的提取
將保存于無水乙醇中的供試蟲體研磨碎,采用柱式動(dòng)物基因組DNA抽提試劑盒提取總DNA,測(cè)定濃度后調(diào)整為1~2 ng/μL,保存于-20 ℃冰箱備用。
1.3PCR 擴(kuò)增及產(chǎn)物檢測(cè)
16 S rDNA序列的引物設(shè)計(jì)參照文獻(xiàn)[6]的方法,引物序列為16S-PF 5′-GCCTGTTTAT CAAAAA
CAT-3′;16S-PR 5′-CCGGTCTGAACTCAGATCA-3′,由生工生物工程(上海)有限公司合成。PCR反應(yīng)體系為25 μL,內(nèi)含10 mmol/L Tris(pH 8.3),50 mmol/L KCl,0.01%Triton X-100,2.0 mmol/L MgCl2,
0.2 mmol/L dNTPs,0.2 mmol/L引物,1.0 U Taq酶以及1 μL DNA模板。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋海梗?℃預(yù)變性7 min;95 ℃變性50 s,50 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其片段大小、純度及含量。
1.4PCR產(chǎn)物回收與測(cè)序
瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,對(duì)于擴(kuò)增效果良好且足量的PCR產(chǎn)物采用柱式膠回收試劑盒進(jìn)行回收純化,樣品濃度達(dá)100 ng/μL以上時(shí),送寶生物工程(大連)有限公司測(cè)序。
1.5序列分析及分子系統(tǒng)樹的重建
利用Clustal X 2.0對(duì)獲得的序列進(jìn)行比對(duì),其參數(shù)設(shè)置為默認(rèn)參數(shù)[7],使用MEGA 4.0軟件分析各物種間16 S rDNA的堿基組成、遺傳距離和轉(zhuǎn)換/顛換值等[8],在Kimura-2-parameter模型的基礎(chǔ)上,用鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)和最大簡(jiǎn)約法(Maximum parsimony,MP)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。在重建系統(tǒng)樹時(shí),以顯脊短頭飛虱的16 S rDNA序列作為外類群,同時(shí)應(yīng)用Bootstrap[9]自舉檢驗(yàn)1 000次檢驗(yàn)系統(tǒng)樹中各結(jié)點(diǎn)的置信值。
2結(jié)果與分析
2.15種飛虱16 S rDNA序列堿基組成及序列變異
研究中獲得的5種飛虱16 S rDNA序列已登錄GenBank,登錄號(hào)見表2。利用Mega 4.0軟件對(duì)所測(cè)16 S rDNA序列進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果表明,這5種飛虱的16 S rDNA序列平均長度為477 bp(包括Gap),其中A、T、G、C含量分別為37.3%、40.8%、14.1%、7.8%,A+T的平均含量為78.1%,G+C的平均含量為21.9%;共檢測(cè)到變異位點(diǎn)123個(gè),其中簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)59個(gè),自裔位點(diǎn)64個(gè),約占總序列的25.8%。供試5種飛虱16 S rDNA序列間顛換高于轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換數(shù)/顛換數(shù)平均值為0.48。
2.2系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果
從各物種16 S rDNA序列的遺傳距離(表2)來看,同屬物種間的遺傳距離較小,3種簇角飛虱間的遺傳距離為0.153~0.291;屬間遺傳距離較大,為0.401~0.964,其中3個(gè)簇角飛虱屬物種與海南偏角飛虱的遺傳距離為0.401~0.526,與顯脊短頭飛虱的遺傳距離均較遠(yuǎn),為0.759~0.964。
根據(jù)序列分析結(jié)果,分別采用最大簡(jiǎn)約法(MP)和鄰接法(NJ)構(gòu)建5種飛虱的分子系統(tǒng)樹,得到一致的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(圖1、圖2),Bootstrap 1 000次檢驗(yàn)系統(tǒng)樹各支均得到較高的支持率。從圖1和圖2中可以看出,簇角飛虱屬3個(gè)種聚為一支,與海南偏角飛虱有較近的親緣關(guān)系,短頭飛虱屬的顯脊短頭飛虱與其他4種飛虱的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
3討論
3.1屬間親緣關(guān)系
如前所述,偏角飛虱屬與簇角飛虱屬形態(tài)較為相似,關(guān)系密切。由遺傳距離分析結(jié)果來看,簇角飛虱屬物種與偏角飛虱屬間的遺傳距離為0.401~0.526,遠(yuǎn)高于屬內(nèi)物種之間的遺傳距離。另外,簇角飛虱屬與偏角飛虱屬雖親緣關(guān)系較近且互為姐妹群,但仍各自構(gòu)成一單系群,故兩者作為獨(dú)立的屬級(jí)階元是成立的;而簇角飛虱屬與短頭飛虱屬親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),這與形態(tài)學(xué)研究結(jié)果非常吻合[2,5,9,10]。
3.2屬內(nèi)親緣關(guān)系
目前,中國已報(bào)道5種簇角飛虱[10],其形態(tài)特征較相似,本研究涉及了其中3種,其中爬竹簇角飛虱與褐額簇角飛虱間的遺傳距離為0.153,而中華簇角飛虱與兩者的遺傳距離分別為0.291和0.283,表明其與這兩個(gè)物種的親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),這一結(jié)果與形態(tài)分類的結(jié)果相吻合[10]。
綜上所述,本研究分析結(jié)果與丁錦華等[2]、Hou[11]形態(tài)學(xué)分類的結(jié)果一致,這為用分子手段與形態(tài)學(xué)分類方法相結(jié)合,進(jìn)行飛虱科昆蟲種屬的鑒定奠定了一定的基礎(chǔ)。
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