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      DNA修復(fù)基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌患者含鉑方案化療預(yù)后的關(guān)系

      2012-11-20 08:32:26金藝?guó)P蔣靜涵黃群聯(lián)劉東華皖南醫(yī)學(xué)院附屬弋磯山醫(yī)院呼吸內(nèi)科安徽蕪湖400
      中國(guó)老年學(xué)雜志 2012年9期
      關(guān)鍵詞:核苷酸中位生存期

      金藝?guó)P 蔣靜涵 黃群聯(lián) 王 瑩 劉東華 (皖南醫(yī)學(xué)院附屬弋磯山醫(yī)院呼吸內(nèi)科,安徽 蕪湖 400)

      治療晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的主要手段之一是采用以鉑類藥物為基礎(chǔ)的聯(lián)合化療,但不同個(gè)體對(duì)其敏感性差異較大,預(yù)后也不同。其中,DNA修復(fù)能力是影響療效的重要原因〔1〕。核苷酸切除修復(fù)途徑是鉑類藥物引起DNA損傷的主要修復(fù)途徑,切除修復(fù)交叉互補(bǔ)基因1(ERCC1)和著色性干皮病基因D(XPD)在核苷酸切除修復(fù)中起著重要作用。本文采用DNA測(cè)序和限制性酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)兩種方法檢測(cè)晚期NSCLC患者ERCC1和XPD基因型,研究不同基因型與NSCLC患者應(yīng)用含鉑方案化療后生存期之間的關(guān)系,探討ERCC1和XPD的單核苷酸多態(tài)性(SNP)是否可以作為預(yù)測(cè)鉑類藥物化療預(yù)后的指標(biāo),為腫瘤的個(gè)體化治療提供依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 對(duì)象 73例NSCLC患者選自2007年11月至2009年11月皖南醫(yī)學(xué)院附屬弋磯山醫(yī)院住院患者,均經(jīng)病理學(xué)或細(xì)胞學(xué)確診。其中男59例,女14例;年齡24~82〔平均(52.7±18.9)〕歲,≤60歲22例,>60歲51例;鱗狀細(xì)胞癌42例,腺癌29例,差分化癌2例;按1988年國(guó)際肺癌分期標(biāo)準(zhǔn):Ⅲ期26例,Ⅳ期47例。患者均經(jīng)CT掃描具有可測(cè)量的腫瘤病灶,化療前檢測(cè)血常規(guī)、肝腎功能均正常,心電圖無(wú)明顯異常,卡氏功能狀況評(píng)分均>60分。所有病例均于化療前抽取外周靜脈血2 ml,置于乙二胺四乙酸鈉(EDTA)抗凝管,凍存于 -20℃冰柜。

      1.2 方法

      1.2.1 化療方案及療效評(píng)價(jià) 所有患者化療前簽署化療知情同意書,接受以順鉑(cisplatin,DDP)為基礎(chǔ)的化療。具體方案:DDP/紫杉醇(15 例)、DDP/長(zhǎng)春瑞濱(11 例)、DDP/吉西他濱(34例)、DDP/多西紫杉醇(13例)。具體用法:DDP 30 mg/m2,第2 ~4 天;長(zhǎng)春瑞濱(Navelbine)25 mg/m2,第 1、8天;吉西他濱(Gemcitabine)1 000 mg/m2,第1、8 天;紫杉醇(paclitaxel)175 mg/m2,第1天(維持3 h);多西紫杉醇(docetaxel)60 mg/m2,第1天(維持1 h);均經(jīng)靜脈滴注。上述治療方案每3~4 w重復(fù),均在2~3個(gè)周期后評(píng)價(jià)療效。療效評(píng)價(jià)參照WHO實(shí)體瘤(1981年)標(biāo)準(zhǔn)分為完全緩解(CR)、部分緩解(PR)、穩(wěn)定(SD)和進(jìn)展(PD)。以 CR +PR +SD為臨床獲益。

      1.2.2 臨床評(píng)價(jià) 總生存期(OS)為最終評(píng)價(jià)指標(biāo)。OS為從確診日起至患者死亡(死于原發(fā)腫瘤或并發(fā)癥)的日期;在數(shù)據(jù)截止尚生存的患者,以末次隨訪時(shí)間作為截尾數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

      1.2.3 DNA抽提擴(kuò)增 采用標(biāo)準(zhǔn)酚-氯仿提取法抽提外周靜脈血DNA〔2〕。4℃保存?zhèn)溆?。引物參照文獻(xiàn)設(shè)計(jì)(表1),由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。PCR總反應(yīng)體積50 μl:模板 DNA 2 μl,Taq 酶 2.5 U,10 × buffer 5 μl,MgCl21.5 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L。上 游 及 下 游 引 物 各10 pmol/L,加ddH2O至總體積50 μl。反應(yīng)在PTC-150型熱循環(huán)儀(美國(guó)MJ公司)上進(jìn)行,98℃ 5 min蛋白變性后,加入Taq酶(TIANGEN公司產(chǎn)品),進(jìn)入熱循環(huán)。ERCC1反應(yīng)條件為:94℃變性30 s;56℃退火30 s;72℃ 延伸1 min,共33個(gè)循環(huán),最后72℃延伸4 min。XPD反應(yīng)條件為:94℃變性30 s;59℃退火30 s;72℃延伸1 min,共33個(gè)循環(huán),最后72℃延伸4 min。取10 μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加樣,1.5%瓊脂糖凝膠電泳60 min(電壓100 V),溴乙啶(EB)染色,紫外燈下檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,數(shù)碼相機(jī)攝片保存,PCR產(chǎn)物4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      表1 PCR擴(kuò)增引物、退火溫度、PCR產(chǎn)物大小

      1.2.4 基因分型

      1.2.4.1 DNA測(cè)序 PCR產(chǎn)物經(jīng)DNA凝膠純化試劑盒(Axygen公司產(chǎn)品)純化回收,30 μl純化后的 PCR產(chǎn)物連同其上游引物由南京金斯瑞生物科技有限公司采用雙脫氧法在ABI-3730XL測(cè)序儀上進(jìn)行單向測(cè)序。

      1.2.4.2 PCR-RFLP法進(jìn)行基因型分析 取10 μl ERCC1 C118T的PCR純化產(chǎn)物與2 μl BsrDⅠ(New England BioLabs公司)65℃水浴消化4 h,8 μl XPD Lys751Gln的PCR純化產(chǎn)物與2 μl限制性核酸內(nèi)切酶Pst I(New England BioLabs公司)于37℃水浴消化3 h,用2.0%瓊脂糖凝膠電泳分離酶切片段,80 V電泳40 min,EB染色確定各基因型。同時(shí),為保證基因分型的準(zhǔn)確性,隨機(jī)挑選10例(13.7%)進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

      1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 應(yīng)用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,采用Kaplan-Meier法進(jìn)行單因素生存分析、χ2檢驗(yàn)和Log-rank檢驗(yàn)。

      2 結(jié)果

      2.1 ERCC1、XPD基因型與臨床特征的關(guān)系 患者性別、年齡、不同的組織學(xué)類型和臨床分期間ERCC1、XPD基因型差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見(jiàn)表2。

      2.2 測(cè)序結(jié)果與PCR-RFLP方法結(jié)果 ERCC1 C118T、XPD Lys751Gln DNA測(cè)序結(jié)果與PCR-RFLP法結(jié)果圖一致,且各等位基因符合Hardy-Weinberg平衡定律。見(jiàn)圖1~圖7。

      圖1顯示在ERCC1 C118T多態(tài)性位點(diǎn)堿基C沒(méi)有發(fā)生突變,只有 C一個(gè)波峰;PCR-RFLP法顯示1個(gè)片段(199 bp),為C/C基因型。圖2顯示ERCC1 C118T多態(tài)性位點(diǎn)已突變?yōu)閴A基T,只有 T一個(gè)波峰;PCR-RFLP法顯示2個(gè)片段(120和79 bp),為T/T基因型。圖3顯示在ERCC1 C118T多態(tài)性位點(diǎn)有堿基 C和 T兩個(gè)波峰出現(xiàn);PCR-RFLP法顯示3個(gè)片段(199、120和 79 bp)為 C/T基因型。圖 4顯示在 XPD Lys751Gln多態(tài)性位點(diǎn)堿基A沒(méi)有突變,只有A一個(gè)波峰;PCR-RFLP法顯示2個(gè)片段(189、131 bp),為A/A(Lys/Lys)基因型。圖5顯示在XPD Lys751Gln1多態(tài)性位點(diǎn)一處堿基A沒(méi)有突變,只有A一個(gè)波峰;另一處堿基A和 C兩個(gè)波峰出現(xiàn);PCR-RFLP法顯示4個(gè)片段(189、131、126和 63 bp),為 A/C(Lys/Gln)基因型。本研究中未發(fā)現(xiàn)C/C(Gln/Gln)基因型。

      表2 患者一般情況與ERCC1、XPD基因型的關(guān)系〔n(%)〕

      2.3 ERCC1、XPD基因型分布 73例晚期 NSCLC ERCC1 C118T存在三種等位基因型,其基因頻率分別為:C/C型基因頻率53.4%(39/73),C/T型基因頻率 38.4%(28/73),T/T型基因頻率8.2%(6/73)。本研究只檢測(cè)到XPD Lys751Gln兩種等位基因型,其基因頻率分別為:A/A型83.6%(61/73),A/C型16.4%(12/73),未檢測(cè)到純合基因突變型C/C型。

      2.4 ERCC1和XPD基因型與NSCLC患者臨床預(yù)后的關(guān)系隨訪截止時(shí)間為2011年9月,全部患者中位生存期為18個(gè)月。ERCC1 C118T CC型中位生存期〔(19.803±4.604)個(gè)月〕與CT型中位生存期〔(15.993±4.283)個(gè)月〕、TT型中位生存期〔(16.233±1.369)個(gè)月〕之間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=12.855,P=0.000;(χ2=8.602,P=0.003);而 CT 型中位生存期與TT型中位生存期差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.701,P=0.402)。XPD A/A型中位生存期、A/C型中位生存期〔(18.044±4.831)、(18.075±4.667)個(gè)月〕差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.034,P=0.854)。見(jiàn)圖 8,圖 9。

      圖1 ERCC1 C118T C/C基因型測(cè)序

      圖2 ERCC1 C118T T/T基因型測(cè)序

      圖3 ERCC1 C118T C/T基因型測(cè)序

      圖4 XPD密碼子751 A/A基因型測(cè)序

      圖5 XPD密碼子Lys751Gln A/C基因型測(cè)序

      圖6 ERCC1 C118T經(jīng)限制性內(nèi)切酶BsrD I作用后的瓊脂糖凝膠電泳圖

      圖7 XPD Lys751Gln經(jīng)限限制性內(nèi)切酶Pst I作用后的瓊脂糖凝膠電泳圖

      圖8 ERCC1不同基因型的NSCLC患者總生存期生存曲線

      圖9 XPD不同基因型的NSCLC患者總生存期生存曲線

      3 討論

      循證醫(yī)學(xué)研究證實(shí),NSCLC的化療以鉑類為基礎(chǔ),含鉑方案優(yōu)于不含鉑方案〔3〕。已有研究表明各種以鉑類為基礎(chǔ)的聯(lián)合方案在有效率和生存期上均無(wú)顯著差異〔4〕,但患者對(duì)它們的敏感性差異顯著,預(yù)后也不同。藥理遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究表明,腫瘤基因的SNP及其分子表達(dá)水平與化療療效和毒性反應(yīng)密切相關(guān)。

      ERCC1基因的表達(dá)產(chǎn)物與DNA修復(fù)酶缺乏互補(bǔ)基因F(XPF)形成緊密的ERCC1-XPF異二聚體,是特異性的核酸內(nèi)切酶,具有識(shí)別和切除 DNA 5'端的雙重作用〔5〕。ERCC1 C118T可發(fā)生核苷酸 C→T改變,雖然兩者編碼的都是天門冬氨酸(asparagine,Asn),但C→T轉(zhuǎn)換可能與密碼子選擇減半、ERCC1 mRNA產(chǎn)物及隨后的蛋白翻譯降低有關(guān),降低了DNA修復(fù)能力(DNA repair capacity,DRC)〔6〕。

      本研究顯示,NSCLC患者外周血中ERCC1 C118T C/C型的總生存時(shí)間較C/T型、T/T型延長(zhǎng),提示ERCC1 C118T C/C型的NSCLC患者接受以鉑類為基礎(chǔ)的化療可能生存獲益。這個(gè)結(jié)果與Su等〔7〕研究結(jié)果一致。錢曉萍等〔8〕研究腫瘤石蠟組織中ERCC1 codon118 SNP與接受鉑類藥物化療NSCLC患者臨床預(yù)后之間的關(guān)系,結(jié)果顯示C/C基因型患者的中位生存時(shí)間為25.0個(gè)月,而C/T及T/T基因型患者的中位生存時(shí)間僅為10.5個(gè)月,兩者有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,認(rèn)為ERCC1 codon118基因SNP可作為判斷NSCLC患者鉑類藥物化療的預(yù)后指標(biāo)。而Zhou等〔9〕研究結(jié)果顯示攜帶ERCC1 C118T C/T型、T/T型患者的總生存期較C/C型明顯延長(zhǎng)(17.5個(gè)月、13.5個(gè)月)。究其原因,可能與病理分期以Ⅳ期為主有關(guān),有必要加大樣本量進(jìn)一步研究證實(shí)ERCC1基因型與臨床預(yù)后的關(guān)系。

      XPD基因產(chǎn)物具有ATP依賴的5'→3'DNA解旋酶活性。XPD蛋白是轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物Ⅱ型轉(zhuǎn)錄因子H(transcription factorⅡH,TFⅡH)的核心組分,并且參與核苷酸切除修復(fù)和基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程〔10〕。XPD在DNA修復(fù)過(guò)程中通過(guò)NER途徑去除多種因素導(dǎo)致的DNA損傷(如:鉑-DNA加合物)來(lái)發(fā)揮作用。該基因第751密碼子A→C改變導(dǎo)致Lys→Gln氨基酸替代。Lys751Gln(A→C)為有義突變導(dǎo)致氨基酸改變,從而影響DNA修復(fù)途徑。本研究顯示XPD Lys751Gln A/A型的中位總生存時(shí)間與A/C型比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與陳君臣等〔11〕的研究結(jié)果一致。

      綜上所述,本研究證實(shí)ERCC1 C118T多態(tài)性與NSCLC患者鉑類藥物化療后的生存期有關(guān),在一定程度上可作為鉑類藥物化療后生存期的預(yù)測(cè)指標(biāo)。

      1 魏 嘉,劉寶瑞.DNA修復(fù)基因單核苷酸多態(tài)性與鉑類藥物抵抗研究進(jìn)展〔J〕.中華腫瘤雜志,2006;28(3):161-3.

      2 黃培堂譯.分子克隆實(shí)驗(yàn)指南〔M〕.第3版.北京:科學(xué)出版社,2002:467-70.

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      8 錢曉萍,劉寶瑞,嚴(yán)文躍,等.ERCC1codon118單核苷酸多態(tài)性與小細(xì)胞肺癌鉑類化療的臨床預(yù)后研究〔J〕.現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué),2011;19(10):1997-2001.

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      11 陳君臣,劉志良,成 健,等.XPD基因單核苷酸多態(tài)性與晚期非小細(xì)胞肺癌對(duì)鉑類藥物敏感性的關(guān)系〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2011;31(7):1114-7.

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