肖曉蓉　李燕　肖麗英

[摘要] 細菌是人口腔微生物的優(yōu)勢種群，不斷有新的種屬被發(fā)現(xiàn)和命名。本文介紹2009—2012年從人口腔分離的5個新菌屬和16個新菌種的主要生物學特性。

[關鍵詞] 新菌屬； 新菌種； 人口腔

[中圖分類號] R 780.2 [文獻標志碼] A [doi] 10.7518/hxkq.2013.02.026

細菌是人口腔內微生物的優(yōu)勢種群，與口腔健康和疾病密切相關。隨著醫(yī)學理論和技術的發(fā)展和完善，人口腔內不斷有新的細菌種屬被發(fā)現(xiàn)和命名，其在微生物系統(tǒng)內的分類位置也會發(fā)生變動。了解這些新的種屬有助于全面了解口腔微生物的分類現(xiàn)狀，對口腔基礎和臨床研究也具有重要意義。新的細菌種屬被發(fā)現(xiàn)后，在《國際微生物分類進化學雜志》（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology）上發(fā)表后才能被業(yè)界認可，本文即介紹2009—2012年發(fā)表在該期刊上，從人口腔分離的5個新菌屬和16個新菌種的主要生物學特性。

1 新菌屬

1.1 錐形桿菌屬（Pyramidobacter）（Downes，et al.

2009）[1]

命名：因在培養(yǎng)基上形成錐形樣菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；蛋白胨-酵母提取物-葡萄糖（peptone yeast ex-tract glucose，PYG）肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、少量的異戊酸和痕跡量到少量的丙酸、異丁酸、琥珀酸、苯乙酸。

模式種：魚腥味錐形桿菌（Pyramidobacter pisco-lens），DNA的G+C摩爾分數(shù)為59%，分離自人的口腔。

1.2 擬普雷沃菌屬（Alloprevotella）（Downes，et al.

2012）[2]

命名：因與普雷沃菌有相似性而被命名為擬普雷沃菌屬。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；發(fā)酵碳水化合物的終末代謝產(chǎn)物是乙酸和琥珀酸。

模式種：坦納擬普雷沃菌（Alloprevotella tanne-rae），DNA的G+C摩爾分數(shù)為45%～47%，分離自人的口腔。

1.3 依賴桿菌屬（Fretibacterium）（Vartoukian，et al.

2012）[3]

命名：因其良好的生長需要依靠助生菌，如具核梭桿菌，故被命名為依賴桿菌屬。

特性：革蘭陰性彎曲桿菌，專性厭氧、有動力；PYG肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和中等量的丙酸。

模式種：苛求依賴桿菌（Fretibacterium fastidio-sum），DNA的G+C摩爾分數(shù)為63%。

1.4 毛絨厭氧桿菌屬（Lachnoanaerobaculum）（Hed-

berg，et al. 2012）[4]

命名：因專性厭氧且在培養(yǎng)基上形成毛絨樣菌落而被命名為毛絨厭氧桿菌屬。

特性：專性厭氧的芽胞桿菌，革蘭染色陽性，但

易脫色而成革蘭染色陰性；在血瓊脂平板上，菌落外形為可變的斑點和擴散狀，邊緣為嚙蝕狀或須根狀；在PYG肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和丁酸。

模式種：于默奧毛絨厭氧桿菌（Lachnoanaero-

baculum umeaense），菌種號為CCUG 58757T（DSM 23576T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為35%～38%，分離自人的口腔、小腸、血和羊水。

1.5 口腔桿菌屬（Stomatobaculum）（Sizova，et al.

2012）[5]

命名：因最初的分離處為口腔而得名口腔桿菌屬，屬毛螺菌科（family Lachnospiraceae）。

特性：革蘭陽性長桿菌，嚴格厭氧、無動力、無芽胞；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×（4～40） μm，彎曲的絲狀體可長達200 μm；主要的終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乳酸、異戊酸和乙酸。

模式種：長口腔桿菌（Stomatobaculum longum）。

2 新菌種

2.1 魚腥味錐形桿菌（Pyramidobacter piscolens）（Dow-

nes，et al. 2009）[1]

命名：因培養(yǎng)物有特別的魚腥味而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為（0.7～0.8） μm×（0.8～2.2） μm；在苛求厭氧瓊脂（fastidious anaerobe agar，F(xiàn)AA）中厭氧培養(yǎng)7 d后，形成有明顯的魚腥味的錐體狀菌落。

模式株：W5455T（DSM 21147T，CCUG 55836T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為59%，分離自人口腔的牙源性膿腫。

2.2 口腔放線菌（Actinomyces oris）（Henssge，et al.

2009）[6]

命名：因分離自口腔得名為口腔放線菌；該菌種包括原先鑒定為內氏放線菌血清型Ⅱ、Ⅲ、NV，和黏性放線菌血清型Ⅱ的菌株。

特性：與內氏放線菌基因型Ⅱ型相同，通過atpA或metG基因序列檢測可與其他相關菌種相鑒別。

模式株：ATCC 27044T（CCUG 34288T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為66%，分離自人的痰液。

2.3 約翰森放線菌（Actinomyces johnsonii）（Henssge，

et al. 2009）[6]

命名：以美國分子分類學家John L. Johnson的名字命名為約翰森放線菌，以表彰他在口腔放線菌菌種遺傳學關系方面進行的大量研究；該菌種包括原先鑒定為內氏放線菌血清型WVA 963型和內氏放線菌基因型WVA 963型的菌株。

特性：與內氏放線菌基因型WVA 963型（Johnson et al. 1990）相同，通過atpA或metG基因序列檢測可與其他相關菌種相鑒別。

模式株：ATCC 49338T（CCUG 34287T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為67%，分離自健康兒童的齦溝。

2.4 產(chǎn)酸丙酸桿菌（Propionibacterium acidifaciens）

（Downes and Wade. 2009）[7]

命名：因該菌種產(chǎn)生丙酸而得名產(chǎn)酸丙酸桿菌。

特性：革蘭陽性桿菌，厭氧、無芽胞、無動力、多形態(tài)；細胞大小為（0.7～0.8） μm×（1.2～4） μm；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是大量的丙酸和乙酸，以及中等量的琥珀酸。

模式株：C3M_31T（DSM 21887T，CCUG 57100T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為70%，分離自人口腔的齲損部位。

2.5 彩虹普雷沃菌（Prevotella micans）（Downes，et

al. 2009）[8]

命名：因形成閃爍的彩虹樣菌落而得名為彩虹普雷沃菌。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為0.7 μm×（1.5～5.0） μm；在FAA瓊脂培養(yǎng)皿上培養(yǎng)5 d后，形成彩虹色菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)物中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、異戊酸和琥珀酸，以及痕跡量到少量的異丁酸。

模式株：E 7.56T（DSM 21469T，CCUG 56105T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為46%，分離自人的口腔。

2.6 桔紅色普雷沃菌（Prevotella aurantiaca）（Saka-

moto，et al. 2010）[9]

命名：因產(chǎn)生桔紅色菌落而得名。

特性：革蘭陰性球桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×1.6 μm或0.8 μm×（0.9～1.0） μm；在艾格森-蓋克?。‥ggerth-Gagnon，EG）瓊脂培養(yǎng)基上形成淺棕色到深棕色菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、異戊酸和琥珀酸，以及很少量的異丁酸。

模式株：OMA 31T（JCM 15754T，CCUG 57723T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為39.7%，分離自牙周炎患者的牙周袋。

2.7 解糖普雷沃菌（Prevotella saccharolytica）（Downes，

et al. 2010）[10]

命名：因具有酵解糖的特性而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，不產(chǎn)生色素；菌細胞大小為（0.6～0.7） μm×

（0.9～5） μm；主要的終末代謝產(chǎn)物是中等量的乙酸

和琥珀酸。

模式株：D033B-12-2T（DSM 22473T，CCUG

57944T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為44%，分離自人口腔的牙菌斑；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是781（http：//www.homd.org）。

2.8 深黑色普雷沃菌（Prevotella fusca）（Downes and

Wade. 2011）[11]

命名：因在培養(yǎng)基上形成深黑色菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為0.8 μm×（1.2～6.0） μm；在FAA培養(yǎng)皿上延長培養(yǎng)時間，菌落中央可形成深黃色到深褐色的色素；在PYG肉湯培養(yǎng)基中主要的終末代謝產(chǎn)物是琥珀酸、中等量的乙酸和少量的乳酸。

模式株：W1435T（DSM 22504T，CCUG 57946T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為43%，分離自人口腔的齦下菌斑；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是782（http：//www.homd.org）。

2.9 靶心普雷沃菌（Prevotella scopos）（Downes and

Wade. 2011）[11]

命名：因模式株的成熟菌落形成標志性的靶心樣菌落而得名靶心普雷沃菌。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為0.7 μm×（0.9～3.0） μm；在FAA培養(yǎng)皿上延長培養(yǎng)時間，菌落中央可見深褐色的色素，形成靶心樣菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中主要的終末代謝產(chǎn)物是琥珀酸、中等量的乙酸和痕跡量的異戊酸、乳酸。

模式株：W2052T（DSM 22613T，CCUG 57945T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為41%，分離自人口腔種植體。

2.10 褐色類香味菌（Myroides phaeus）（Yan，et al.

2012）[12]

命名：因產(chǎn)生褐色菌落而得名褐色類香味菌。

特性：直桿菌，菌細胞大小為（0.4～0.5） μm×

（0.7～1.2） μm；在LB（Luria-Bertani）瓊脂培養(yǎng)基上形成圓形、突起、邊緣規(guī)則的黃色到褐色菌落。

模式株：MY15T（DSM 23313T，LMG 25566T），

DNA的G+C摩爾分數(shù)為34.3%，分離自兒童的唾液。

2.11 韋格斯卡多維亞菌（Scardovia wiggsiae）（Dow-

nes，et al. 2011）[13]

命名：以美國微生物學家Lois Wiggs的名字命名，以表彰他在厭氧微生物學研究中的貢獻。

特性：革蘭陽性多形態(tài)桿菌，厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為（0.6～0.7） μm×（1.6～4） μm；

在FAA培養(yǎng)皿上培養(yǎng)7 d后，形成圓形，邊緣完整，或邊緣呈臼齒樣、波浪形的不規(guī)則菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和少量到中等量的乳酸。

模式株：C1A_55T（DSM 22547T，CCUG 58090T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為55%，分離自人的口腔及其他臨床樣本；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類編號是195（http：//www.homd.org）。

2.12 灰色擬普雷沃菌（Alloprevotella rava）（Downes，

et al. 2012）[2]

命名：因在血瓊脂培養(yǎng)平板上形成灰色菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無動力；細胞大小為（0.5～0.6） μm×（1.0～5.0） μm，偶而可長達

10 μm；在PYG肉湯培養(yǎng)基的終末代謝產(chǎn)物主要是琥珀酸和中等量的乙酸，在蛋白胨-酵母提取物（pep-tone yeast extract，PY）肉湯培養(yǎng)基中也可檢出痕跡量到少量的異戊酸。

模式株：81/4-12T（DSM 22548T，CCUG 58091T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為47%，分離自人的口腔；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是302（http：//www.homd.org）。

2.13 苛求依賴桿菌（Fretibacterium fastidiosum）（Var-

toukian，et al. 2012）[3]

命名：因對營養(yǎng)物的特殊要求而被命名為苛求依賴桿菌。

特性：革蘭陰性彎曲桿菌，專性厭氧、有動力；菌細胞大小為（1.0～1.5） μm×（2.0～13.0） μm；PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和中等量的丙酸。

模式株：SGP1T（DSM 25557T，JCM 16858T），

DNA的G+C摩爾分數(shù)為63%，分離自牙周炎患者的齦下菌斑。

2.14 口腔毛絨厭氧桿菌（Lachnoanaerobaculum orale）

（Hedberg，et al，2012）[4]

命名：因分離自口腔得名口腔毛絨厭氧桿菌。

特性：革蘭陽性芽胞桿菌，專性厭氧；菌細胞大小5～20 μm，常呈聚集狀；在血瓊脂平板上的菌落呈擴散狀，或形成中心為錐體狀、邊緣為須根狀的球形菌落；主要終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乙酸和乳酸。

模式株：N1（CCUG 60305T，DSM 24553T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為38%，分離自健康青年人的唾液。

2.15 長口腔桿菌（Stomatobaculum longum）（Sizova，

et al. 2012）[5]

命名：因菌細胞為長長的形狀而得名。

特性：革蘭陽性長桿菌，嚴格厭氧、無動力、無芽胞；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×（4～40） μm，彎

曲的絲狀體可長達200 μm；在基礎厭氧培養(yǎng)基（BM）、胰化酪蛋白-酵母提取物（trypticase peptone yeast ex-tract，TY）培養(yǎng)基和胰化酪蛋白-葡萄糖-酵母提取物（trypticase peptone-glucose yeast extract，TYG）培養(yǎng)

基中可產(chǎn)生黑色素；主要的終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乳酸、異戊酸和乙酸。

模式株：DSM 24645T（230HM-480），DNA的G+C摩爾分數(shù)為55.05%～55.3%，分離自人的齦下菌斑。

2.16 當別町韋榮菌（Veillonella tobetsuensis）（Mashi-

ma，et al. 2012）[14]

命名：因菌種分離自日本北海道當別町得名當別町韋榮菌。

特性：革蘭陰性球菌，嚴格厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞直徑為（0.3～0.7） μm，可見旋渦形表

面；厭氧培養(yǎng)條件下的主要代謝終末產(chǎn)物是乙酸和丙酸；通過dnaK和rpoB基因序列分析，可與其他韋榮菌菌種相鑒別。

模式株：B16T（JCM 17976T，ATCC BAA-2400T），分離自健康成人的舌生物膜。

[參考文獻]

[1] Downes J， Vartoukian SR， Dewhirst FE， et al. Pyramidobacter pis-

colens gen. nov.， sp. nov.， a member of the phylum ‘Synergistetes

isolated from the human oral cavity[J]. Int J Syst Evol Microbiol，

2009， 59（5）：972-980.

[2] Downes J， Dewhirst FE， Tanner AC， et al. Alloprevotella rava gen.

nov.， sp. nov.， isolated from the human oral cavity， and reclassifi-

cation of Prevotella tannerae（Moore， Johnson & Moore， 1994） as

Alloprevotella tannerae gen. nov.， comb. Nov.[J]. Int J Syst Evol

Microbiol， 2012. http：//ijs.sgmjournals.org/content/early/2012/06/29/

ijs.0.041376-0.long.

[3] Vartoukian SR， Downes J， Palmer RM， et al. Fretibacterium fas-

tidiosum gen. nov.， sp. nov.， isolated from the human oral cavity

[J]. Int J Syst Evol Microbiol， 2012. http：//ijs.sgmjournals.org/con-

tent/early/2012/07/13/ijs.0.041038-0.long.

[4] Hedberg ME， Moore ER， Svensson-Stadler L， et al. Lachnoanae-

robaculum gen. nov.， a new genus in the Lachnospiraceae： Cha-

racterization of Lachnoanaerobaculum umeaense gen.nov.， sp. nov.，

isolated from the human small intestine， and Lachnoanaerobacu-

lum orale sp. nov.， isolated from saliva， and reclassification of Eu-

bacteriumsaburreum（Prevot 1966） Holdeman and Moore 1970 as

Lachnoanaerobaculum saburreum comb. nov.[J]. Int J Syst Evol

Microbiol， 2012， 62（11）：2685-2690.

[5] Sizova MV， Muller P， Panikov N， et al. Stomatobaculum longum

gen. nov.， sp. nov.， an obligately anaerobic bacterium from the hu-

man oral cavity[J]. Int J Syst Evol Microbiol， 2012. http：//ijs.sgm-

journals.org/content/early/2012/07/23/ijs.0.042812-0.long.

[6] Henssge U， Do T， Radford DR， et al. Emended description of Ac-

tinomyces naeslundii and descriptions of Actinomyces oris sp. nov.

and Actinomyces johnsonii sp. nov.， previously identified as Acti-

nomyces naeslundii genospecies 1， 2 and WVA 963[J]. Int J Syst

Evol Microbiol， 2009， 59（3）：509-516.

[7] Downes J， Wade WG. Propionibacterium acidifaciens sp. nov.， iso-

lated from the human mouth[J]. Int J Syst Evol Microbiol， 2009，

59（11）：2778-2781.

[8] Downes J， Liu M， Kononen E， et al. Prevotella micans sp. nov.，

isolated from the human oral cavity[J]. Int J Syst Evol Microbiol，

2009， 59（4）：771-774.

[9] Sakamoto M， Suzuki N， Okamoto M. Prevotella aurantiaca sp. nov.，

isolated from the human oral cavity[J]. Int J Syst Evol Microbiol，

2010， 60（3）：500-503.

[10] Downes J， Tanner AC， Dewhirst FE， et al. Prevotella saccharoly-

tica sp. nov.， isolated from the human oral cavity[J]. Int J Syst

Evol Microbiol， 2010， 60（10）：2458-2461.

[11] Downes J， Wade WG. Prevotella fusca sp. nov. and Prevotella

scopos sp. nov.， isolated from the human oral cavity[J]. Int J Syst

Evol Microbiol， 2011， 61（4）：854-858.

[12] Yan S， Zhao N， Zhang XH. Myroides phaeus sp. nov.， isolated

from human saliva， and emended descriptions of the genus My-

roides and the species Myroides profundi Zhang et al. 2009 and

Myroides marinus Cho et al. 2011[J]. Int J Syst Evol Microbiol，

2012， 62（4）：770-775.

[13] Downes J， Mantzourani M， Beighton D， et al. Scardovia wiggsiae

sp. nov.， isolated from the human oral cavity and clinical material，

and emended descriptions of the genus Scardovia and Scardovia

inopinata[J]. Int J Syst Evol Microbiol， 2011， 61（1）：25-29.

[14] Mashima I， Kamaguchi A， Miyakawa H， et al. Veillonella tobet-

suensis sp. nov.， a novel anaerobic， gram-negative coccus isolated

from human tongue biofilm[J]. Int J Syst Evol Microbiol， 2012. http：

//ijs.sgmjournals.org/content/early/2012/07/23/ijs.0.042515-0.long.

（本文編輯 吳愛華）