王倩 楊眉 馮瑞麗 王嬌 文鐵橋

（上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 分子神經(jīng)生物學(xué)實驗室，上海 200444）

人源DCF1基因原核表達載體構(gòu)建及蛋白分離純化

王倩 楊眉 馮瑞麗 王嬌 文鐵橋

（上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 分子神經(jīng)生物學(xué)實驗室，上海 200444）

為了深入研究DCF1（Dendritic Cell Factor 1）基因的作用，以質(zhì)粒pcDNA3.1-DCF1-TAT為模板體外擴增得到片段DCF1-TAT，將測序正確的目的片段克隆入原核表達載體pET32a，轉(zhuǎn)化大腸桿菌Rosetta（DE3），異丙基-β-D-硫代半乳糖苷（IPTG）誘導(dǎo)表達，并優(yōu)化表達條件。以尿素溶解包涵體蛋白，并優(yōu)化溶解條件，通過Ni離子親和層析柱進行純化，再透析復(fù)性目的蛋白。用SDS-PAGE檢測目的蛋白的表達和純化結(jié)果，并用Western blot進行驗證。結(jié)果表明，重組表達載體pET32a-DCF1-TAT構(gòu)建成功，并在大腸桿菌Rosetta中成功表達。融合蛋白主要以包涵體形式存在，經(jīng)過尿素溶解，Ni離子親和層析柱純化獲得高純度的目的蛋白。SDS-PAGE和Western blot檢測結(jié)果顯示蛋白分子量大小與預(yù)期結(jié)果相符。

人源DCF1基因 PTD TAT

DCF1是一種膜蛋白，早先發(fā)現(xiàn)它在神經(jīng)干細胞的分化中起著重要的作用［1］。新近研究表明DCF1過量表達能有效地抑制惡性膠質(zhì)瘤U251細胞系的增殖、遷移、侵襲能力并且促進細胞凋亡［2］。惡性膠質(zhì)瘤是人類腫瘤中最具致命性的腦腫瘤，預(yù)后性最差，生存中期約為14個月［3］。顱內(nèi)腫瘤好發(fā)人群主要在20-50歲之間，復(fù)發(fā)率高，給社會帶來很大的壓力。當(dāng)前治療膠質(zhì)瘤的策略主要有外科手術(shù)、放射療法、化學(xué)療法、基因治療。為了避免這些治療方法的缺陷，重組蛋白藥物已經(jīng)被運用到臨床試

驗中。

蛋白質(zhì)不能自由進入細胞，阻礙了蛋白藥物的發(fā)展。對于腦膠質(zhì)瘤，大分子蛋白治療藥物的運輸常常被血腦屏障阻礙。然而，研究表明含有PTD（Protein transduction domain）的融合蛋白能夠穿透細胞膜和血腦屏障［4，5］。PTD是具有蛋白轉(zhuǎn)導(dǎo)功能的蛋白轉(zhuǎn)導(dǎo)域，由特定的蛋白質(zhì)功能域引領(lǐng)其所承載的蛋白質(zhì)穿過膜性結(jié)構(gòu)并在細胞內(nèi)積累。自然界存在3種PTD，目前運用較多的是來自人類Ⅰ型免疫缺陷病毒的TAT蛋白轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域［8］。為此本研究構(gòu)建了原核表達載體pET32a-DCF1-TAT，使用以大腸桿菌為宿主細胞的原核表達體系，在大腸桿菌Rosetta（DE3）中實現(xiàn)DCF1-TAT融合蛋白表達，旨在為深入研究DCF1蛋白功能奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

感受態(tài)大腸桿菌HB101，質(zhì)粒pET32a和pcDNA3.1-DCF1-TAT由本實驗室保存；大腸桿菌Rosetta（DE3）菌株由吉永華教授實驗室惠贈；限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和HindⅢ，T4 DNA連接酶，蛋白Marker等購自TaKaRa；異丙基β-D-硫代半乳糖苷（IPTG）購自Sigma；Ni離子親和層析柱購自Millipore；膠回收試劑盒購自生工生物工程公司。

1.2 方法

1.2.1 大腸桿菌表達載體pET32a-DCF1-TAT的構(gòu)建 以質(zhì)粒pcDNA3.1-DCF1-TAT為模板，利用PCR體外擴增DCF1-TAT片段，設(shè)計引物序列為：上游引 物：5'-AAAGGATCCATGGCGGCGCCGAAGGGG AGCC-3'；下游引物：5'-AAAAAGCTTTCTTCGTCGC TGTCTCCGCTTCTTCCTGCCATAAATTTCAGAATGA GC-3'（下劃線分別為BamH I和Hind Ⅲ限制性內(nèi)切酶序列）。將PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳，膠回收試劑盒回收目的片段。

將擴增的DCF1-TAT片段和pET32a空載用限制性內(nèi)切酶BamH I和Hind Ⅲ雙酶切，膠回收目的片段并用T4 DNA連接酶于16℃過夜連接。把連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入大腸桿菌HB101感受態(tài)細胞，均勻涂于帶Amp+抗性的LB固體培養(yǎng)基上，于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)15 h。挑取單菌落接種到含100 mg/L Amp+的LB液體培養(yǎng)基（胰蛋白胨10 g/L；酵母提取物5 g/L；氯化鈉10 g/L）中，于37℃、230 r/min搖床中培養(yǎng)過夜。使用SDS堿裂解法小量制備質(zhì)粒DNA，進行BamH I、Hind Ⅲ雙酶切和測序鑒定。

1.2.2 誘導(dǎo)表達 將鑒定正確的重組質(zhì)粒pET32a-DCF1-TAT熱激轉(zhuǎn)化到Rosetta感受態(tài)細胞中，再鋪于帶Amp+抗性的LB固體培養(yǎng)基上，于37℃培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng)。次日挑取單菌落接種于2 mL含100 mg/L Amp+的LB液體培養(yǎng)基中，于37℃、230 r/min搖床中培養(yǎng)過夜。將培養(yǎng)好的菌液按照1∶50的比例接種到50 mL含100 mg/L Amp+的LB液體培養(yǎng)基中，37℃震蕩培養(yǎng)2 h以上，至對數(shù)生長期OD600約為0.5時，停止培養(yǎng)。

1.2.2.1 誘導(dǎo)濃度的確定 待菌液OD600約等于0.5時，向溶液中加入IPTG溶液至其終濃度分別為0、0.1、0.6和1.0 mmol/L，放于37℃、230 r/min搖床培養(yǎng)4 h。4℃、8 000 r/min離心2 min，收集菌體，SDS-PAGE電泳（濃縮膠濃度為4%，分離膠濃度為12%）檢測不同濃度誘導(dǎo)的融合蛋白表達情況，確定最適IPTG誘導(dǎo)濃度X。

1.2.2.2 誘導(dǎo)時間的確定 以最適誘導(dǎo)濃度X，溫度37℃，轉(zhuǎn)速230 r/min為固定條件，設(shè)置3個不同梯度的誘導(dǎo)時間4、6和8 h分別進行誘導(dǎo)，SDSPAGE電泳檢測不同時間誘導(dǎo)的融合蛋白表達情況，確定最適IPTG誘導(dǎo)時間Y。

確定誘導(dǎo)條件為：溫度37℃，轉(zhuǎn)速230 r/min，IPTG濃度X，誘導(dǎo)時間Y。在此條件下大量培養(yǎng)轉(zhuǎn)化菌株，于4℃、5 000×g離心15 min，收集菌體沉淀，保存于-20℃中備用。

1.2.2.3 融合蛋白的可溶性分析 用適量超聲緩沖液（50 mmol/L Tris-HCl，pH8.0，100 mmol/L NaCl，1 mmol/L PMSF）重懸菌體，300 W，超聲5 s，停7 s冰浴超聲破碎菌體。4℃、5 000×g離心15 min，分別收集菌體沉淀和上清溶液，SDS-PAGE電泳檢測融合蛋白在菌體沉淀和上清溶液中的溶解情況。

1.2.3 純化包涵體蛋白

1.2.3.1 制備細胞抽提物 收集并稱重菌體沉淀，按每克（濕重）菌體加3 mL細胞裂解緩沖液Ⅰ（50 mmol/L Tris-HCl，1 mmol/L EDTA，100 mmol/L NaCl，pH8.0）的比例重懸菌體，再加入4 μL 100 mmol/L

PMSF和80 μL 10 g/L溶菌酶，攪動20 min。每克（濕重）菌體加入4 mg脫氧膽酸，繼續(xù)攪動。懸液37℃放置，不用磨光玻璃棒攪動，使其變黏時每克（濕重）菌體加入20 μL 1 mg/mL DNaseⅠ。裂解液室溫放置，直至不再黏稠。

1.2.3.2 洗滌和變性溶解包涵體蛋白 將細胞裂解物于4℃、8 000×g離心15 min，棄去上清。菌體重懸于水中，4℃、8 000×g離心15 min。沉淀用包涵體洗滌緩沖液（20 mmol/L Tris-HCl pH8.0，0.5 mol/L NaCl，2 mol/L尿素）重懸后，攪拌25 min，于4℃、8 000×g離心15 min，棄去上清，重復(fù)1次。再用適量的50 mmol/L Tris-HCl pH8.0溶液洗滌1遍，于4℃、8 000×g離心15 min，棄去上清。設(shè)置尿素濃度梯度和溶解時間梯度確定最佳溶解包涵體條件：用含不同濃度尿素的包涵體溶解緩沖液（20 mmol/L Tris-HCl pH8.0，0.5 mol/L NaCl，4、6、8和10 mol/L尿素）重懸菌體，室溫攪拌溶解1、2和5 h，4℃、8 000×g離心15 min，分別收集上清溶液。

1.2.3.3 包涵體蛋白純化與復(fù)性 將Ni離子親和層析柱用雙蒸水洗兩遍，加入200 μL填料，再用Binding buffer（300 mmol/L KCl，50 mmol/L KH2PO4，10 mmol/L imidazole，1 mmol/L PMSF）洗兩次。加入9 mL蛋白上清溶液，依次用20、40和60 mmol/L imidazole溶液洗1次，最后用250 mmol/L imidazole溶液洗脫。

將收集的洗脫流出液用稀釋液（20 mmol/L Tris-HCl，pH8.0）按照1∶10的比例稀釋并裝入透析袋，用含適量甘油的0.01 mol/L PBS（pH8.0）透析48 h，每4-8 h更換1次PBS溶液，最后用雙蒸水透析2次，每次6 h。再用超濾濃縮管濃縮透析后的溶液，-80℃保存。采用Western blot的方法對復(fù)性后的蛋白質(zhì)進行檢測分析。

2 結(jié)果

2.1 表達載體的構(gòu)建

以質(zhì)粒pcDNA3.1-DCF1-TAT為模板體外擴增的DNA片段分子量大小理論值為1 023 bp，圖1-A結(jié)果顯示1 kb附近的條帶為所需的目的DNA片段。將擴增得到的DCF1-TAT片段與空載pET32a用限制性內(nèi)切酶BamH I和Hind Ⅲ雙酶切，結(jié)果（圖1-B）顯示，膠回收酶切后的片段與線性載體，連接，進一步鑒定重組質(zhì)粒是否連接正確。7個樣品中有6個樣品可以酶切出與目的片段大小相符的約1 kb的DNA片段（圖1-C），挑取2號對應(yīng)的菌液樣品測序，測序結(jié)果表明已將DCF1-TAT片段成功克隆入pET32a載體中。

圖1 構(gòu)建表達載體pET32a-DCF1-TAT

2.2 優(yōu)化誘導(dǎo)表達融合蛋白的條件

在大腸桿菌的最適生長溫度（37℃）條件下，分別設(shè)置0、0.1、0.6和1.0 mmol/L IPTG濃度梯度。隨著IPTG濃度的增加，在相同上樣量的情況下，57 kD的蛋白條帶逐漸變粗，且其中0-0.6 mmol/L IPTG誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)含量顯著增加，而0.6-1.0 mmol/L誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)含量增加趨勢緩慢（圖2-A）。IPTG濃度過低不利于蛋白表達，過高則會影響菌體生長，選擇最優(yōu)誘導(dǎo)濃度為0.6 mmol/L進行誘導(dǎo)。

在4、6和8 h三個時間梯度誘導(dǎo)時發(fā)現(xiàn)，誘導(dǎo)6 h的57 kD融合蛋白表達量最多（圖2-B），選擇最優(yōu)誘導(dǎo)時間為6 h。

超聲破碎誘導(dǎo)后的菌體，發(fā)現(xiàn)目的蛋白幾乎不溶于上清溶液，而是存在于破碎后的菌體沉淀中（圖2-C）。該蛋白形成了包涵體，必須將包涵體蛋白變

性溶解于上清，才能進行后續(xù)的純化蛋白操作。

圖2 融合蛋白的誘導(dǎo)表達

2.3 包涵體蛋白的純化與Western blot鑒定

經(jīng)4、6、8和10 mol/L尿素溶解包涵體1 h后，上清溶液中均未出現(xiàn)蛋白條帶，增加溶解時間至2 h后，包涵體蛋白開始溶解，8 mol/L和10 mol/L尿素溶解量相對較多且相近（圖3-A），選擇8 mol/L尿素進行溶解。將溶解時間增至5 h發(fā)現(xiàn)，近50%包涵體蛋白已經(jīng)溶解于上清溶液中，且用250 mmol/L imidazole溶液純化效率高，洗脫流出液中已經(jīng)沒有雜蛋白，全部為目的包涵體蛋白（圖3-B）。Western blot對復(fù)性的包涵體目的蛋白檢測顯示（圖3-C），57 kD的條帶與預(yù)期蛋白分子量大小相符。

3 討論

DCF1又稱作跨膜蛋白59（TMEM59，Transmembrane protein 59），是一種與樹突細胞的分化和遷移有關(guān)的信號分子［6，7］。DCF1編碼的蛋白分子量大小為42 kD，該蛋白能夠在大腸桿菌和神經(jīng)干細胞中成功表達［8］。目前對于DCF1詳細的功能還不是很清楚，但是據(jù)先前的研究表明，它可能與神經(jīng)系統(tǒng)中，β淀粉樣前體蛋白APP的糖基化和神經(jīng)干細胞的分化調(diào)控有關(guān)［8，9］。此外，本實驗室先前研究結(jié)果顯示，過表達DCF1后，U251惡性膠質(zhì)瘤細胞線粒體發(fā)生腫脹，嵴結(jié)構(gòu)破壞并大部分消失，線粒體膜電位下降，細胞ATP含量減少。線粒體相關(guān)抗凋亡蛋白Bcl-2表達下調(diào)，促凋亡蛋白Bax表達上調(diào)，凋亡執(zhí)行蛋白半胱天冬酶 Caspase-3 被活化［2］。

圖3 純化包涵體目的蛋白

為了進一步研究該蛋白對腫瘤細胞的功能，獲得高純度的目的蛋白十分重要。將克隆得到的DCF1-TAT片段連接入pET32a融合表達載體，成功構(gòu)建載體pET32a-DCF1-TAT。為了獲得大量的目的蛋白，對誘導(dǎo)劑IPTG的濃度和誘導(dǎo)時間兩個表達條件進行優(yōu)化。與對照組相比，經(jīng)過IPTG誘導(dǎo)的融合

蛋白DCF1-TAT為特異性表達，并且蛋白表達量隨IPTG濃度的增加而增加，其中IPTG濃度在0.1-0.6 mmol/L范圍內(nèi)增加顯著，在0.6-1.0 mmol/L范圍內(nèi)增加緩慢。而蛋白表達量卻不與誘導(dǎo)時間呈現(xiàn)正相關(guān)關(guān)系，在誘導(dǎo)6 h的時候出現(xiàn)最大值。所以確定的最優(yōu)表達條件是0.6 mmol/L IPTG，誘導(dǎo)培養(yǎng)6 h。

在最優(yōu)表達條件下培養(yǎng)轉(zhuǎn)化菌可以提高融合蛋白的表達量，但是重組外源基因在大腸桿菌中高水平表達時，往往又會形成細胞內(nèi)不溶性表達的無活性的包涵體固體顆粒。Georgiou等［10-12］發(fā)現(xiàn)天然的蛋白質(zhì)在大腸桿菌中大量表達時，如內(nèi)酰氨酶和堿性磷酸酶的過量表達，都形成了包涵體，前者的包涵體在外周質(zhì)，后者的包涵體存在于細胞質(zhì)中。本試驗中融合蛋白幾乎不溶于上清溶液，主要以包涵體蛋白形式存在。選用強變性劑尿素溶解包涵體，通過設(shè)置尿素濃度梯度和溶解時間，發(fā)現(xiàn)包涵體蛋白隨溶解時間的增加而逐漸溶解于上清溶液中，并且在8 mol/L尿素溶液中溶解量較多。但是由于尿素在堿性環(huán)境中長期保存后，容易分解成異氰酸鹽導(dǎo)致多肽鏈自由基甲基化，溶解時間不宜過長，所以確定的最優(yōu)溶解時間為5 h，尿素溶解濃度為8 mol/L。

pET32a載體帶有6個His標(biāo)簽，是最常用的純化蛋白的融合標(biāo)簽，具有相對分子質(zhì)量小、不影響目的蛋白的功能，免疫原性相對較低、純化操作簡單、成本較低等優(yōu)點［13，14］。溶解后的包涵體蛋白中還含有大部分的雜蛋白，為了減少雜蛋白對后續(xù)蛋白復(fù)性過程中的影響，優(yōu)先進行蛋白純化。試驗發(fā)現(xiàn)，250 mmol/L imidazole溶液能夠洗脫下高純度的目的蛋白，但是大部分目的蛋白在低濃度imidazole溶液洗滌時便會隨雜蛋白流出，可能是變性后多肽伸展完全致使親和效率降低，所以我們多次回收流出液并重復(fù)純化，得到大量的純度較高的目的蛋白。

本試驗成功克隆、誘導(dǎo)表達并純化包涵體蛋白，摸索出一套改進的構(gòu)建DCF1蛋白的原核表達體系，獲取大量的包涵體目的蛋白。該蛋白可以用于下一階段的細胞穿透試驗，為進一步研究DCF1蛋白的功能提供了前提條件，也為治療腫瘤提供新的思路。

4 結(jié)論

成功構(gòu)建原核表達載體pET32a-DCF1-TAT。優(yōu)化并得到融合蛋白DCF1-TAT的最佳誘導(dǎo)表達條件：0.6 mmol/L IPTG誘導(dǎo)6 h。該融合蛋白以包涵體形式存在，經(jīng)過8 mol/L尿素溶液溶解、250 mmol/L imidazole溶液洗脫純化，SDS-PAGE和Western bolt檢測結(jié)果顯示，獲取了純度較高的包涵體目的蛋白。

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（責(zé)任編輯 李楠）

《農(nóng)業(yè)展望》征訂啟事

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本刊著重于對主要農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)、供需、價格、進出口的分品種分析與預(yù)測，密切關(guān)注當(dāng)前農(nóng)業(yè)經(jīng)濟發(fā)展進程中一些重大的關(guān)鍵性或熱點、焦點問題，重點報道對農(nóng)業(yè)經(jīng)濟形勢、農(nóng)業(yè)科技與農(nóng)業(yè)、農(nóng)產(chǎn)品貿(mào)易的分析和展望，既強調(diào)對農(nóng)業(yè)經(jīng)濟領(lǐng)域的短期分析，也側(cè)重于對農(nóng)業(yè)政策、產(chǎn)業(yè)發(fā)展、農(nóng)業(yè)貿(mào)易、農(nóng)產(chǎn)品供需和糧食安全等的長期展望，并且每期都以一定篇幅刊載國內(nèi)外主要農(nóng)產(chǎn)品數(shù)據(jù)信息。

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Construction of a Humanized DCF1 Gene Prokaryotic Expression Vector and Protein Purification

Wang Qian Yang Mei Feng Ruili Wang Jiao Wen Tieqiao
（Laboratory of Molecular Neural Biology，School of Life Sciences，Shanghai University，Shanghai 200444）

In order to further study the role of human DCF1 gene, the target fragment DCF1-TAT was amplified from plasmid pcDNA3.1-DCF1-TAT by PCR, and then cloned into a prokaryotic expression vector pET32a to construct the recombinant plasmid pET32a-DCF1-TAT, which was then transformed into Escherichia coli Rosetta（DE3）cells to express the fusion protein and induced to express by isopropyl-β-D-thiogalactoside（IPTG）, and meanwhile the expression condition was optimized. The inclusion body was dissolved by urea after the optimization of dissolution condition, purified by Ni ion affinity chromatography, and renatured by dialysis. SDS-polyaerylamide gel electrophoresis（SDSPAGE）and Western blot analysis were used to detect the fusion protein. The results indicated that the recombinant expression vector pET32a-DCF1-TAT was constructed and expressed in Rosetta successfully. The fusion protein existed in the form of inclusion body, and the target protein was obtained with high purity through the dissolution of urea and purification of affinity chromatography. SDS-PAGE and Western blot analysis showed that the molecular weight of fusion protein was in the expected line.

Humanized DCF1 gene PTD TAT

10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.12.033

2014-05-16

國家自然科學(xué)基金項目（81271253）

王倩，女，研究方向：分子神經(jīng)生物學(xué)；E-mail：happywangni@163.com

文鐵橋，男，教授，博士生導(dǎo)師，研究方向：神經(jīng)干細胞分化調(diào)控機制及信號傳導(dǎo)途徑、神經(jīng)退行性疾病等；E-mail：tqwen@staff.shu.edu.cn