夏文睿等
摘要 [目的]了解MeCWINCV5在植物生長發(fā)育、激素調(diào)節(jié)和逆境脅迫應(yīng)答中的功能。[方法]采用PCR方法從木薯基因組中分離MeCWINCV5基因啟動子序列,考察MeCWINCV5對植物生長發(fā)育、激素調(diào)節(jié)和逆境脅迫應(yīng)答的影響。[結(jié)果]分析顯示啟動子的長度為1 170 bp,含有TATA box和CAAT box等多個典型的真核生物啟動子基本元件元件,還存在大量逆境脅迫誘導(dǎo)相關(guān)的順式調(diào)控元件,如HSE、MBS、SARE、GAREmotif和TATC-box等多個與植物逆境脅迫相關(guān)的元件。[結(jié)論]MeCWINCV5基因啟動子與逆境脅迫有關(guān),在木薯抵御逆境脅迫的生理過程中具有重要作用。
關(guān)鍵詞 木薯;細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶;啟動子;逆境脅迫;順式調(diào)控元件
中圖分類號 S632 文獻標(biāo)識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)11-03179-03
Abstract [Objective] In order to study the promoter MeCWINCV5 in cassava which play important roles in plant growth and development,hormone regulations and stress responses.[Method] An 1 170 bp promoter region upstream of the MeCWINCV5 gene was isolated from cassava genomic DNA using PCR methods.[Result] Sequence analysis found that it contains a typical TATA box and CAAT box,and several cisacting elements that relate plant stress responses,such as HSE,MBS,SARE,GAREmotif,TATCbox transcription factor.[Conclusion] It is suggested that MeCWINCV5 gene may play important roles in response to various stresses.
Key words Cassava; Cell wall acid invertase; Promoter; Stress responsiveness; Cisacting element
木薯是全球最重要的糧食作物之一,但是塊根中積累的淀粉含量遠遠低于理論產(chǎn)量。蔗糖在淀粉積累過程中作為溝通源器官和庫器官的橋梁,而在源葉中合成的蔗糖從葉(源)到塊根(庫)的長途運輸過程主要由蔗糖轉(zhuǎn)化酶(INV)來調(diào)控完成[1-3]。蔗糖轉(zhuǎn)化酶根據(jù)其最適pH值分為中性轉(zhuǎn)化酶 (neutral invertase,NI)和酸性轉(zhuǎn)化酶 (acid invertase,AI)[4]。細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶催化蔗糖的分解是韌皮部卸載的關(guān)鍵步驟[5]。在庫器官中提高細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶的活性有利于蔗糖在庫器官中的積累,也是植物源庫器官蔗糖代謝的關(guān)鍵酶[6]。研究者通過研究木薯細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動子上的生長激素相關(guān)元件和逆境相關(guān)反應(yīng)元件與啟動子的相互作用來探討木薯細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動子對轉(zhuǎn)化酶基因的調(diào)控作用[7]。筆者采用PCR方法從木薯基因組中分離MeCWINCV5基因啟動子序列,考察MeCWINCV5對植物生長發(fā)育、激素調(diào)節(jié)和逆境脅迫應(yīng)答的影響,以期為MeCWINCV5的合理開發(fā)利用提供依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料 華南木薯8號,由實驗室采購。
1.2 方法
1.2.1 華南木梳8號基因組DNA的提?。–TAB 法)[8]。取 1.000 g經(jīng)暗培養(yǎng) 2~3 d的幼嫩木薯葉片(去葉脈),經(jīng)液氮研磨后加入預(yù)熱至65 ℃的CTAB提取緩沖液中提取,上清液加等體積氯仿-異戊醇(24∶1,V/V)混勻后離心;上清液用等體積苯酚-氯仿-異戊醇(25∶24∶1,V/V/V)和氯仿-異戊醇(24∶1,V/V)反復(fù)抽提。加入1/10體積NaAc(3 mol/L,pH5.2)和2倍體積冷乙醇以沉淀 DNA(2 h),分別用70%、80%乙醇洗滌沉淀并加入100 μl TE緩沖液回溶DNA沉淀,同時加入2 μl RNase,置37 ℃處理2 h。再用等體積的苯酚-氯仿-異戊醇(25∶24∶1,V/V/V)和氯仿-異戊醇(24∶1,V/V)分別抽提,吸取上清液,重新沉淀DNA,用濃度70%乙醇,清洗風(fēng)干,加入適量體積的去離子水回溶。
1.2.2 木薯細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶MeCWINCV5基因啟動子。根據(jù)課題組已經(jīng)克隆得到的木薯細胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶基因MCWINV5序列(GeneBank:X291159)和phytozome植物基因序列預(yù)測庫的木薯MCWINV5基因序列,設(shè)計引物如下,CW5F:5ATGAGCTCTAATGCAGTCCGAC
AC3和CW5R: 5GTGGATCCGATCGAAGAAAAAAG3,PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性2 min,98 ℃變性10 s,56 ℃退火延伸150 s,共35個循環(huán),72 ℃延伸10 min。
1.2.3 生物信息學(xué)分析。將測序得到的片段序列與MeCWINCV5基因的序列比對,確定擴增的啟動子序列的正確性。利用PLACE(http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/)和PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線軟件分析啟動子序列,預(yù)測順式作用元件位點[9]。
2 結(jié)果與分析
2.1 啟動子片段的擴增與克隆 根據(jù)已經(jīng)克隆得到的木薯細胞壁轉(zhuǎn)化酶基因MeCWINV5(GeneBank:X291159)序列和phytozome植物基因序列預(yù)測庫的木薯MeCWINV5基因序列設(shè)計引無為CW5F:5ATGAGCTCTAATGCAGTCCGACAC3和CW5R:5GTGGATCCGA TCGAAGAAAAAAG3,從華南8號木薯組培苗中擴增得到一段長為1 300 bp的序列,命名為cw5(圖1)。將片段與pMD19T進行連接,通過菌液PCR,篩選獲得陽性單克隆測序后,將其與MeCWINV5基因CDs區(qū)序列和phytozome植物基因序列預(yù)測庫中相應(yīng)序列進行比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)此片段含有MeCWINV2基因從ATG起始的長為130 bp的CDs序列和ATG上游長為1 170 bp的潛在啟動子序列(圖2)。
3 結(jié)論與討論
試驗采用PCR的方法對華南木薯8號MeCWINV5基因啟動子進行了克隆,得到一段長為1 170 bp的啟動子序列,對該片段序列進行分析,發(fā)現(xiàn)此片段上含有CAAT box和TATA box等多個典型的真核生物啟動子元件,并且含有熱脅迫響應(yīng)的答元件HSE,干旱誘導(dǎo)相關(guān)元件MBS,水楊酸響應(yīng)元件SARE,赤霉素反應(yīng)元件GAREmotif、TATCbox和脅迫防御元件TCrich repeats等多個順式作用元件。在擬南芥[10],煙草[11],大豆[12]等植物轉(zhuǎn)化酶基因啟動子已驗證上述激素調(diào)控和脅迫,由此可以看出MeCWINV5可能參與多種信號傳播,并且在木薯逆境脅迫應(yīng)答中起到了重要作用。由于細胞壁轉(zhuǎn)化酶MeCWINV5基因在植物生命活動中和逆境脅迫起到越來越重要的作用,而被人們所關(guān)注,近年來關(guān)于細胞壁轉(zhuǎn)化酶基因的研究有了一定的進展,但是大部分停留在對啟動子的克隆以及序列分析階段,其作用機制依然空缺,啟動子在基因上游部分,調(diào)控基因的表達,預(yù)測基因的功能,如果能進一步對啟動子序列進行研究,就可以為研究基因功能和啟動子作用元件分析提供方向和依據(jù)。
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