楊晶
摘要摘要:隨著醫(yī)學(xué)研究的深入與計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,單模態(tài)醫(yī)學(xué)影像技術(shù)已經(jīng)無(wú)法滿(mǎn)足相關(guān)科研需求。當(dāng)前,針對(duì)小動(dòng)物領(lǐng)域的多模態(tài)醫(yī)學(xué)影像配準(zhǔn)技術(shù)研究日趨深入。設(shè)計(jì)了一種用于實(shí)現(xiàn)多模態(tài)圖像配準(zhǔn)的小動(dòng)物床,該小動(dòng)物床能夠兼容多種醫(yī)學(xué)影像設(shè)備,并配有保溫裝置以及呼吸門(mén)控裝置,床上固定有圖像配準(zhǔn)標(biāo)記裝置,通過(guò)圖像配準(zhǔn)軟件技術(shù)實(shí)現(xiàn)多模態(tài)圖像配準(zhǔn)及融合。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該小動(dòng)物床滿(mǎn)足基本功能要求,可以實(shí)現(xiàn)多模態(tài)圖像配準(zhǔn)及融合。
關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞:多模態(tài)成像;小動(dòng)物床;圖像配準(zhǔn)
DOIDOI:10.11907/rjdk.151155
中圖分類(lèi)號(hào):TP319
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào)文章編號(hào):16727800(2015)004008103
0引言
醫(yī)學(xué)成像技術(shù)在臨床和科研領(lǐng)域具有極為重要的作用。按照成像內(nèi)容不同,臨床和實(shí)驗(yàn)室常用的醫(yī)療成像設(shè)備可以分為解剖結(jié)構(gòu)成像和功能成像兩大類(lèi)[1]。解剖結(jié)構(gòu)成像設(shè)備,如X射線(xiàn)計(jì)算機(jī)斷層成像(CT,computed tomography)和核磁共振成像 (MRI,magnetic resonance imaging)等,能提供精確的解剖結(jié)構(gòu)信息;功能成像設(shè)備,如正電子發(fā)射型電子計(jì)算機(jī)斷層顯像(PET,positron emission tomography)和單光子發(fā)射計(jì)算機(jī)斷層成像(SPECT,single photon emission computed tomography)等,在功能成像、代謝以及受體分布等方面具有明顯優(yōu)勢(shì)[2]。然而,隨著生命科學(xué)研究的發(fā)展,單模態(tài)醫(yī)學(xué)影像已經(jīng)無(wú)法滿(mǎn)足臨床及科研需求。將兩種及兩種以上模態(tài)圖像融合起來(lái)可以?xún)?yōu)勢(shì)互補(bǔ),同時(shí)獲得病變部位的功能代謝信息和組織結(jié)構(gòu)信息[3]。但由于專(zhuān)用小動(dòng)物一體機(jī)價(jià)格高,維護(hù)、操作復(fù)雜,因此制約了其廣泛使用[4]。由于小動(dòng)物體重較輕,本文設(shè)計(jì)一種可以在多系統(tǒng)間自由移動(dòng)的小動(dòng)物床,床上固定有用于確定空間剛體轉(zhuǎn)換矩陣的標(biāo)記物,以實(shí)現(xiàn)多模態(tài)醫(yī)學(xué)圖像融合。為避免小動(dòng)物體溫變化、呼吸運(yùn)動(dòng)等因素對(duì)圖像造成影響,小動(dòng)物床的設(shè)計(jì)還需增加保溫裝置、呼吸門(mén)控裝置以及麻醉裝置。
1設(shè)備與方法
1.1小動(dòng)物床設(shè)計(jì)
1.1.1小動(dòng)物床及標(biāo)記裝置
本文設(shè)計(jì)一種多系統(tǒng)兼容的小動(dòng)物床,如圖1所示。小動(dòng)物床外觀(guān)呈圓柱體,一端封閉,另一端為固定有插板(圖中陰影部分,用于放置小動(dòng)物)的可活動(dòng)擋板。床體采用亞克力材料,不影響圖像采集重建質(zhì)量。針對(duì)小動(dòng)物體積大小不同,本文設(shè)計(jì)3種型號(hào)的小動(dòng)物床,圓柱底面半徑分別為50mm、60mm、70mm。掃描過(guò)程中,小動(dòng)物床放置在系統(tǒng)掃描平臺(tái)上,并用自制的固定套夾予以固定。
目前,圖像配準(zhǔn)方法主要有:基于圖像內(nèi)部信息和基于標(biāo)記物的匹配[5]?;跇?biāo)記物的匹配又可分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記。由于功能成像(如PET、SPECT)圖像分辨率較低,采用基于圖像內(nèi)部信息的配準(zhǔn)方法無(wú)法保證配準(zhǔn)的準(zhǔn)確度以及精度;而基于體內(nèi)標(biāo)記的方法容易受到小動(dòng)物呼吸的影響,體內(nèi)標(biāo)記會(huì)對(duì)小動(dòng)物疾病模型的研究產(chǎn)生干擾。因此,本文采用基于體外標(biāo)記的方法進(jìn)行圖像配準(zhǔn)。小動(dòng)物床四周固定4根導(dǎo)管(外徑:2.0mm,內(nèi)徑:1.4mm)作為標(biāo)記裝置,其中3根導(dǎo)管相互平行,另外1根導(dǎo)管彎曲纏繞在小動(dòng)物床上側(cè)??紤]小動(dòng)物成像區(qū)域的空間信息,標(biāo)記裝置需覆蓋整個(gè)成像視野范圍。4根導(dǎo)管內(nèi)注射多模態(tài)成像設(shè)備混合示蹤劑,即可在多種成像設(shè)備上分別顯像,以此作為標(biāo)記裝置計(jì)算兩種設(shè)備間的空間轉(zhuǎn)換關(guān)系。
1.1.2麻醉及保溫裝置
為保證圖像融合的準(zhǔn)確度,小動(dòng)物在掃描過(guò)程中必須保持靜止,故小動(dòng)物床配有氣體麻醉裝置?;旌虾蟮漠惙闅怏w與氧氣通過(guò)氣體麻醉接口導(dǎo)入小動(dòng)物呼吸道,以保證小動(dòng)物在掃描過(guò)程中處于麻醉狀態(tài)。在麻醉期間小動(dòng)物的體溫調(diào)節(jié)機(jī)能受到抑制,會(huì)出現(xiàn)體溫下降,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。為此,小動(dòng)物床還配有氣體保溫裝置。該裝置可以自由設(shè)定溫度,通過(guò)溫度傳感器控制加熱。暖空氣通過(guò)保溫裝置接口持續(xù)通入,在小動(dòng)物床腔體內(nèi)循環(huán)后,經(jīng)通風(fēng)口排出。
1.1.3呼吸門(mén)控裝置
針對(duì)解剖結(jié)構(gòu)成像設(shè)備,小動(dòng)物床還配備有呼吸門(mén)控裝置,以減弱小動(dòng)物呼吸對(duì)圖像造成的影響。本文采用內(nèi)在回顧性呼吸門(mén)控方式與外在回顧性呼吸門(mén)控方式相結(jié)合的方法減弱呼吸對(duì)圖像造成的影響。
內(nèi)在門(mén)控方式指從投影數(shù)據(jù)中獲得門(mén)控信息[6,7]。將每幀投影圖的中間一行像素取出組成一張正弦圖,圖2(a)和(b)分別為未經(jīng)過(guò)內(nèi)在呼吸門(mén)控校正和經(jīng)過(guò)校正的小鼠CT投影圖中平面正弦圖。可以看出,經(jīng)過(guò)校正后,呼吸運(yùn)動(dòng)造成的條狀偽影明顯減弱(白色箭頭所指區(qū)域),圖像變得更加光滑。
外在門(mén)控方式采用傳感器探測(cè)小動(dòng)物呼吸過(guò)程中腹部周期性收縮舒張信號(hào)[8],本文通過(guò)Graseby 呼吸傳感器及壓差傳感器來(lái)獲取小動(dòng)物的呼吸信號(hào)。圖3為Graseby 呼吸傳感器,將其軟泡沫填充部分用醫(yī)用膠帶固定在小動(dòng)物的胸腹部,并將相應(yīng)管道連接到壓差傳感器的正輸入端(見(jiàn)圖4)。當(dāng)小動(dòng)物呼吸時(shí),其胸腹部會(huì)有較大的起伏運(yùn)動(dòng),從而對(duì)傳感器造成一定的擠壓,造成管道中的氣流變化,管道中氣流變化引起壓差傳感器輸入端的電壓變化,最終通過(guò)壓差傳感器將壓差信號(hào)轉(zhuǎn)化為電流信號(hào)。
圖5(a)和(b)分別為未經(jīng)呼吸門(mén)控校正與經(jīng)過(guò)校正的小鼠CT斷層圖像。箭頭所指為小鼠的肋骨結(jié)構(gòu),圓形頭所指為肺部組織與軟組織的邊界,菱形頭所指為氣管??梢钥闯?,經(jīng)過(guò)呼吸門(mén)控校正過(guò)的圖像更加清晰,圖像質(zhì)量有較大提高。
1.2圖像配準(zhǔn)技術(shù)實(shí)現(xiàn)
在將小動(dòng)物連同小動(dòng)物床從一種成像設(shè)備轉(zhuǎn)移到另一種設(shè)備的過(guò)程中,小動(dòng)物處于麻醉狀態(tài)無(wú)法移動(dòng),兩種設(shè)備采集圖像序列間只發(fā)生了旋轉(zhuǎn)、平移變換,不存在形變。故本文采用基于體外標(biāo)記點(diǎn)匹配的剛體變換模型進(jìn)行圖像匹配。
體外標(biāo)記點(diǎn)在兩組圖像序列斷層平面上顯示為4個(gè)不共線(xiàn)的點(diǎn),由于三角形穩(wěn)定性高于四邊形,將四邊形對(duì)角線(xiàn)相連接即可確定4個(gè)小三角形,通過(guò)三角形全等匹配即可確定相匹配的斷層,從而確定相匹配的標(biāo)記點(diǎn)。
在數(shù)據(jù)網(wǎng)格空間建立三維空間直角坐標(biāo)系,以圖像斷層平面為XY平面,軸方向?yàn)閆方向。記設(shè)備1上的某個(gè)標(biāo)記點(diǎn)為P=(x,y,z)t,設(shè)備2上的某個(gè)標(biāo)記點(diǎn)為P′=(x′,y′,z′)t。計(jì)算剛體轉(zhuǎn)換矩陣也即確定P與P' 之間的關(guān)系。該關(guān)系可以用如下多項(xiàng)式方程來(lái)估計(jì)[9]:
通過(guò)高斯-喬丹消去法即可求出A,也即兩種設(shè)備間的轉(zhuǎn)換矩陣。所謂圖像融合及配準(zhǔn),就是選擇一個(gè)圖像序列作為參考序列,將另一個(gè)圖像序列映射到參考序列空間。為減少圖像映射過(guò)程中信息的損失,通常以分辨率較高的圖像作為參考圖像序列,通過(guò)剛體轉(zhuǎn)換矩陣將低分辨率圖像映射至參考圖像坐標(biāo)系,實(shí)現(xiàn)圖像配準(zhǔn)。
2動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果
為驗(yàn)證多模態(tài)小動(dòng)物床及配準(zhǔn)技術(shù)的可行性,本文以小動(dòng)物PET和小動(dòng)物CT兩種醫(yī)學(xué)影像設(shè)備為例,進(jìn)行圖像配準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)。以一只體重20g健康小鼠作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,掃描前,向小鼠體內(nèi)注射18F-FDG(18F-fluorodeoxyglucose,18F-氟代脫氧葡萄糖)和生理鹽水混合溶液(15μCi/ml),而后進(jìn)行5分鐘的氣體預(yù)麻醉。同時(shí),向小動(dòng)物床外側(cè)四根導(dǎo)管內(nèi)注射18F-FDG和生理鹽水混合溶液(10 μCi/ml )。為不影響PET圖像質(zhì)量,標(biāo)記物內(nèi)放射性含量應(yīng)低于小鼠體內(nèi)注射的示蹤劑含量。經(jīng)過(guò)預(yù)處理的小鼠被固定在小動(dòng)物床上,在PET儀器上進(jìn)行10分鐘掃描;然后將小鼠連同小動(dòng)物床一同平移至CT設(shè)備上,固定好并進(jìn)行第二次掃描(24min)。將掃描后所得的兩組圖像序列導(dǎo)入圖像配準(zhǔn)融合系統(tǒng),即可自動(dòng)實(shí)現(xiàn)小動(dòng)物PET/CT圖像融合。圖6從左至右分別為獨(dú)立設(shè)備采集到的小動(dòng)物CT圖像、小動(dòng)物PET圖像和配準(zhǔn)后經(jīng)過(guò)偽彩色處理的PET與CT融合圖像;從上至下分別為圖像橫斷面、矢狀面、冠狀面??梢钥闯觯瑑煞N設(shè)備采集到的標(biāo)記物能夠很好匹配。通過(guò)將二者圖像相結(jié)合,CT圖像能夠?yàn)镻ET圖像提供更豐富的空間分辨信息,從圖中可以精確地判斷感興趣器官或病灶的位置(肝臟、腎臟、膀胱等)。該系統(tǒng)還可以實(shí)現(xiàn)窗寬、窗位調(diào)節(jié),以突出感興趣組織結(jié)構(gòu);系統(tǒng)還具有保存圖像序列、調(diào)節(jié)偽彩色編碼顯示等功能。
3結(jié)語(yǔ)
本文設(shè)計(jì)了一種多模態(tài)醫(yī)學(xué)影像設(shè)備兼容的小動(dòng)物床,小動(dòng)物床配備有圖像配準(zhǔn)融合匹配標(biāo)記裝置、氣體麻醉接口、保溫裝置、呼吸門(mén)控裝置。小動(dòng)物床材料普通易得,可重復(fù)使用;載有小動(dòng)物的床體可以在多種醫(yī)學(xué)影像設(shè)備間輕松移動(dòng),操作簡(jiǎn)單方便;小動(dòng)物床具有通用性,可以通過(guò)替換標(biāo)記裝置內(nèi)的混合造影劑實(shí)現(xiàn)兩種及兩種以上醫(yī)學(xué)影像設(shè)備的圖像配準(zhǔn)及融合。
本文還實(shí)現(xiàn)了軟件自動(dòng)圖像融合,從橫斷面、矢狀面、冠狀面3個(gè)角度顯示原始圖像以及融合后圖像。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:多模態(tài)小動(dòng)物床可以實(shí)現(xiàn)獨(dú)立的小動(dòng)物PET和小動(dòng)物CT圖像融合,且具有較高的配準(zhǔn)精度。如何利用該方法實(shí)現(xiàn)兩種以上醫(yī)學(xué)圖像的配準(zhǔn)及融合,是下一步主要研究方向。
參考文獻(xiàn)參考文獻(xiàn):
[1]ZANZONICO P B, NEHMEH S A.Introduction to clinical and laboratory (smallanimal) image registration and fusion[J].Engineering in Medicine and Biology Society, 2006, EMBS'06.28th Annual International Conference of the IEEE.IEEE, 2006: 15801583.
[2]周偉, 尹端沚, 汪勇先.小動(dòng)物 PET[J].核技術(shù), 2006, 29(3):207213.
[3]TOWNSEND D W, CHERRY S R.Combining anatomy and function: the path to true image fusion[J].European Radiology, 2001, 11(10): 19681974.
[4]陳雪祺, 王榮福.PET/CT 在動(dòng)物領(lǐng)域的研究進(jìn)展[J].中國(guó)醫(yī)學(xué)裝備, 2013, 10(1): 5559.
[5]郭變芳.三維醫(yī)學(xué)圖像剛體配準(zhǔn)[D].武漢:華中科技大學(xué),2009.
[6]CHAVARR,AS C, VAQUERO J J, SISNIEGA A, et al.Extraction of the respiratory signal from smallanimal CT projections for a retrospective gating method[J].Physics in Medicine and Biology, 2008, 53(17): 46834695.
[7]WALTERS E B, PANDA K, BANKSON J A, et al.Improved method of in vivo respiratorygated microCT imaging[J].Physics in Medicine and Biology, 2004, 49(17): 41634172.
[8]FORD N L, NIKOLOV H N, NORLEY C J D, et al.Prospective respiratorygated microCT of free breathing rodents[J].Medical Physics, 2005, 32(9): 28882898.
[9]JAN M L, CHUANG K S, CHEN G W, et al.A threedimensional registration method for automated fusion of micro PETCTSPECT wholebody images[J].IEEE Transactions on Medical Imaging, 2005, 24(7): 886893.
責(zé)任編輯(責(zé)任編輯:陳福時(shí))