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      全文檢索引擎技術(shù)在電子病歷中的應(yīng)用

      2015-05-04 17:54趙景越徐松青蔡連忠
      關(guān)鍵詞:電子病歷全文檢索

      趙景越++徐松青++蔡連忠

      摘要:針對(duì)醫(yī)院臨床電子病歷數(shù)據(jù)大量積累無(wú)法快速、高效地服務(wù)于臨床醫(yī)療、醫(yī)學(xué)科研、以及病例管理的現(xiàn)象,提出研究更高效的電子病歷檢索方法,采用全文索引搜索引擎技術(shù),以關(guān)鍵字為索引,把電子病歷統(tǒng)一轉(zhuǎn)換成XML形式,最后生成病歷檢索索引文件方式,建立電子病歷全文檢索系統(tǒng)。系統(tǒng)通過(guò)實(shí)際數(shù)據(jù)測(cè)試表明,該檢索方法準(zhǔn)確率較高、檢索速度快。

      關(guān)鍵詞:電子病歷 全文檢索 XML

      中圖分類號(hào):R197.324 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1007-9416(2014)12-0089-02

      1 引言

      隨著信息化技術(shù)的飛速發(fā)展,計(jì)算機(jī)技術(shù)越來(lái)越多地應(yīng)用到了醫(yī)療領(lǐng)域。近年來(lái)醫(yī)療行業(yè)大力加強(qiáng)信息化建設(shè),建立和完善以電子病歷為核心的醫(yī)院信息系統(tǒng)。電子病歷作為臨床信息的載體以及醫(yī)院信息系統(tǒng)的核心構(gòu)成了醫(yī)療衛(wèi)生決策等系統(tǒng)的基礎(chǔ)。目前很多醫(yī)院患者電子病歷內(nèi)容存儲(chǔ)比較分散,例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲(chǔ)在HIS里、檢驗(yàn)結(jié)果存儲(chǔ)在LIS系統(tǒng),手麻等檢查報(bào)告存儲(chǔ)在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中,如果要獲取患者全部病歷信息只能通過(guò)患者ID號(hào)來(lái)查詢,然后通過(guò)病歷的存儲(chǔ)規(guī)則來(lái)找到相應(yīng)的病歷,再通過(guò)顯示規(guī)則加以排列顯示。每次得到的信息都是分散的,而且存儲(chǔ)方式各不相同,存在于病歷文本中的大量非結(jié)構(gòu)化的信息也不能作為檢索條件,因而很多醫(yī)療數(shù)據(jù)不能為醫(yī)療工作者充分利用,大大降低臨床數(shù)據(jù)利用效率。因此,為了滿足醫(yī)生臨床診療需求、科研輔助需要,醫(yī)院電子病歷管理系統(tǒng)的現(xiàn)行檢索查詢處理方式問(wèn)題亟待解決。為此,我們提出了,將所有病歷文件統(tǒng)一轉(zhuǎn)換,統(tǒng)一識(shí)別,再采用以基于關(guān)鍵字的全文檢索引擎技術(shù),建立電子病歷全文檢索系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)方便、快捷地為臨床醫(yī)療、醫(yī)學(xué)科研及病歷管理等方面工作提供服務(wù)。

      2 全文檢索引擎簡(jiǎn)介

      全文檢索是指計(jì)算機(jī)索引程序通過(guò)掃描文章中的每一個(gè)詞,并收集文章內(nèi)容到本地,對(duì)文章內(nèi)容及分詞建立索引,經(jīng)過(guò)加工處理建立信息數(shù)據(jù)庫(kù)和索引數(shù)據(jù)庫(kù),指明該詞在文章中出現(xiàn)文章和次數(shù),當(dāng)用戶查詢時(shí),檢索程序就根據(jù)事先建立的索引進(jìn)行查找,并將查詢結(jié)果反饋給用戶的檢索方式,從而對(duì)用戶提出的各種檢索作出響應(yīng),提供用戶所需的信息或相關(guān)指針。

      3 電子病歷數(shù)據(jù)處理

      目前由于醫(yī)院意識(shí)到電子病歷在醫(yī)院信息系統(tǒng)建設(shè)中的核心重要性,紛紛加強(qiáng)電子病歷信息化建設(shè),實(shí)現(xiàn)病歷記錄貫穿于患者在醫(yī)院就診的各個(gè)環(huán)節(jié)中,實(shí)現(xiàn)以統(tǒng)一視圖方式展現(xiàn)患者臨床病歷信息。但由于國(guó)內(nèi)醫(yī)療信息化建設(shè)歷史原因,很多醫(yī)院病人電子病歷內(nèi)容存儲(chǔ)比較分散,例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲(chǔ)在HIS里、檢驗(yàn)結(jié)果存儲(chǔ)在LIS系統(tǒng),手麻等檢查報(bào)告存儲(chǔ)在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中;為此有必要進(jìn)行統(tǒng)一整合,將分散在院內(nèi)各系統(tǒng)的電子病歷信息轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一形式的文件存儲(chǔ)于電子病歷庫(kù)中。

      可擴(kuò)展標(biāo)記語(yǔ)言(eXtensible Markup Language,簡(jiǎn)稱XML)就是建立并實(shí)現(xiàn)該統(tǒng)一轉(zhuǎn)換模型的一個(gè)有效手段。XML是一種置標(biāo)語(yǔ)言,置標(biāo)指計(jì)算機(jī)所能理解的信息符號(hào),通過(guò)此種標(biāo)記,計(jì)算機(jī)之間可以處理包含各種信息的文章等。它與HTML一樣,都是SGML(標(biāo)準(zhǔn)通用標(biāo)記語(yǔ)言)。XML是互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境中跨平臺(tái)的,依賴于內(nèi)容的技術(shù),是當(dāng)前處理結(jié)構(gòu)化文檔信息的有力工具。XML同時(shí)也是一種簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)語(yǔ)言,使用一系列簡(jiǎn)單的標(biāo)記描述數(shù)據(jù),而這些標(biāo)記可以用方便的方式建立。

      為此將要先定義、規(guī)范病歷內(nèi)容的結(jié)構(gòu),然后將臨床各系統(tǒng)中關(guān)于患者的病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行抽取、整合、轉(zhuǎn)換成電子病歷架構(gòu)的符合格式,生成描述患者病歷的XML文件,作為患者病歷存儲(chǔ)檢索管理的基本單位。

      4 系統(tǒng)設(shè)計(jì)( 圖1)

      系統(tǒng)將來(lái)自各系統(tǒng)(HIS、電子病歷、LIS等)的臨床科研數(shù)據(jù)進(jìn)行采集,并生成對(duì)應(yīng)的XML格式,再根據(jù)XML格式數(shù)據(jù)建立全文索引,形成全文索引庫(kù);完成臨床科研數(shù)據(jù)積累;完成數(shù)據(jù)收集后,系統(tǒng)提供全文索引查詢功能,根據(jù)查詢結(jié)果,系統(tǒng)可以直接顯示該病歷文件詳細(xì)信息,還可以關(guān)聯(lián)顯示該患者對(duì)應(yīng)的病案,方便科研人員隨時(shí)調(diào)閱分析。

      5 系統(tǒng)測(cè)試

      5.1 服務(wù)器端軟件環(huán)境

      服務(wù)器采用Sun公司的JDK 1.5.0版本,應(yīng)用容器采用開(kāi)源免費(fèi)JBOSS4.0.4版本。

      服務(wù)器操作系統(tǒng)采用微軟的Windows Server 2008企業(yè)版。

      服務(wù)器數(shù)據(jù)庫(kù)采用SQL Server 2008企業(yè)版及SQL JDBC驅(qū)動(dòng)。

      客戶端支持通用瀏覽器,本案例測(cè)試中采用了IE8。

      5.2 服務(wù)器端硬件環(huán)境

      服務(wù)器采用的CPU為Inter Core2 Quad CPU Q8200 2.33GHz,內(nèi)存4GB,硬盤1TGB

      5.3 測(cè)試結(jié)果

      針對(duì)醫(yī)院測(cè)試庫(kù)中2萬(wàn)名患者,約120萬(wàn)份電子病歷文件,轉(zhuǎn)換生成XML文件,建立索引,形成全文索引庫(kù),輸入條件“男”、“骨折”、“髖部”,如圖2:

      系統(tǒng)在2秒左右時(shí)間搜索到滿足條件的文檔78761份,并按檢索條件關(guān)聯(lián)度進(jìn)行排序,以患者姓名、性別、年齡、病歷類別作為標(biāo)題,同時(shí)簡(jiǎn)略顯示關(guān)鍵詞在文件中位置并加以警示;單擊標(biāo)題便可以瀏覽病歷詳細(xì)信息。通過(guò)上述查詢測(cè)試可以看出,本系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了電子病歷一體化,檢索定位準(zhǔn)確率高,達(dá)到了系統(tǒng)應(yīng)用的性能要求。

      6 結(jié)語(yǔ)

      根據(jù)以上測(cè)試結(jié)果可以看出系統(tǒng)性能出眾,滿足當(dāng)前設(shè)計(jì)要求;不僅能基于關(guān)鍵字快速檢索,大大提高病歷檢索速度,同時(shí)實(shí)現(xiàn)查詢結(jié)果與電子病歷無(wú)縫對(duì)接,直接通過(guò)滿足條件的查詢結(jié)果可以打開(kāi)病歷文件,瀏覽該患者病案內(nèi)容(護(hù)理文書、醫(yī)師病歷、檢查結(jié)果、檢驗(yàn)結(jié)果、醫(yī)囑等),大大提高臨床科研效率。

      參考文獻(xiàn)

      [1]基于語(yǔ)義的電子病歷智能全文檢索[J].醫(yī)療衛(wèi)生裝備,2008.

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