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      干旱脅迫下棉花幼苗轉(zhuǎn)錄因子BES1/BZR1對(duì)外源油菜素內(nèi)酯的響應(yīng)表達(dá)特征

      2015-07-05 07:03:18安汶鎧張富春
      西北植物學(xué)報(bào) 2015年7期
      關(guān)鍵詞:營(yíng)養(yǎng)液磷酸化棉花

      安汶鎧,常 丹,張富春

      (新疆大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆生物資源基因工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,烏魯木齊830046)

      棉花作為新疆的主要經(jīng)濟(jì)作物,干旱是制約新疆棉區(qū)棉花產(chǎn)量和品質(zhì)的主要環(huán)境因素之一。油菜素內(nèi)酯(Brassinosteroid,BR)作為一種影響植物生長(zhǎng)發(fā)育和抗逆的植物內(nèi)源激素,在提高植物抗鹽、抗旱、耐高溫以及調(diào)節(jié)植物衰老等生理功能方面發(fā)揮重要作用[1-2]。研究表明BR能夠廣泛參與植物各種生理過(guò)程,調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育以及對(duì)逆境條件下的生理響應(yīng)[3-6]。經(jīng)過(guò)BR噴施處理后,植物葉片含水量增加,葉片水勢(shì)提高,且植物的蒸騰作用明顯降低,這樣既保持了細(xì)胞膨壓,又能夠緩解干旱脅迫,改善植物細(xì)胞中的水分狀況,提高植物在干旱脅迫下的生存能力。近年來(lái),隨著B(niǎo)R 促進(jìn)植物抗逆性研究的深入,BR已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于農(nóng)林業(yè)的生產(chǎn)中[7-12]。

      BZR1/BES1是BR 信號(hào)通路中一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,與BR 結(jié)合后使得BRI1的羧端磷酸化,調(diào)控BKI1(BRI1kinase inhibitor1)從質(zhì)膜上解離下來(lái),使BRI1 與共受體BAK1(BRI1-associated receptor kinase)結(jié) 合[13-14],并 形 成 異 源 二 聚 體,進(jìn) 而通過(guò)相互磷酸化完全激活BR 信號(hào)通路[15],異二聚體BRI1-BAK1可使得BSK 激活,BSK 又能夠活化BSU11(BRI 1suppressor 1),BSU1 可 使 下 游 的BIN2 (Brassinosteroid-insensitive 2)失 活[16],而B(niǎo)IN2則影響B(tài)ZR1/BES1的磷酸化[17]。Kim 等發(fā)現(xiàn)磷酸化后的BZR1/BES1 失去了核輸出以及與DNA 結(jié)合的能力,并且可被蛋白酶降解,被激活的BSU1可以使BIN2的Tyr磷酸化位點(diǎn)去磷酸化從而抑制其活性,使得BZR1/BES1 被蛋白磷酸2A(PP2A)去磷酸化,最終在細(xì)胞核內(nèi)大量積累[18]。核內(nèi)聚集的BZR1/BES1能夠與下游基因啟動(dòng)子上特定區(qū)域結(jié)合,激活轉(zhuǎn)錄,從而調(diào)節(jié)BR 靶基因的表達(dá),最終調(diào)節(jié)植物的生長(zhǎng)、發(fā)育和抗逆性能[19]。因此研究BR 信號(hào)通路中基因BZR1/BES1的表達(dá)調(diào)控機(jī)理顯得尤為重要。

      本研究以新疆的主栽棉花品種‘新陸早17號(hào)’的幼苗為材料,根據(jù)亞洲棉‘石系亞1號(hào)’的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中轉(zhuǎn)錄因子BES1/BZR1基因的開(kāi)放閱讀框序列[20],通過(guò)PCR 克隆獲BES1/BZR1轉(zhuǎn)錄因子基因,命名為GhBES1/BZR1(GenBank登錄號(hào)KP272000);在生物信息學(xué)分析的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步探討干旱脅迫下用油菜素內(nèi)酯及油菜素內(nèi)酯抑制劑(Z)處理棉花后,Gh-BES1/BZR1的表達(dá)變化規(guī)律,研究外源噴施植物激素BR對(duì)干旱脅迫下棉花GhBES1/BZR1表達(dá)的影響,揭示BR提高棉花抗旱能力的分子機(jī)制,為棉花生產(chǎn)中合理使用BR提供依據(jù)。

      1 材料和方法

      1.1 實(shí)驗(yàn)材料

      棉花‘新陸早17號(hào)’種子由新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所瑪納斯實(shí)驗(yàn)站提供。挑選籽粒飽滿(mǎn)大小一致的棉花種子,用70%乙醇消毒1min,蒸餾水沖洗3~4次,用15%過(guò)氧化氫浸種5h,再用蒸餾水沖洗3~4次,播種到固體MS培養(yǎng)基中,進(jìn)行無(wú)菌培養(yǎng),10d 后將棉花幼苗轉(zhuǎn)至Hoagland 營(yíng)養(yǎng)液[21]中繼續(xù)進(jìn)行液體培養(yǎng),每隔5~7d換1次營(yíng)養(yǎng)液,以5~6片真葉期的棉花幼苗為實(shí)驗(yàn)材料。

      1.2 方 法

      1.2.1 實(shí)驗(yàn)材料的處理 待棉花幼苗生長(zhǎng)至5~6片真葉期時(shí),用2.5% PEG-6000干旱脅迫處理24 h后,分別用水、BR(0.5mg/L)和Z(1.0mg/L,BR抑制劑)噴施。具體處理組為:(1)Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+蒸餾水為對(duì)照組(CK);(2)含2.5%PEG-6000的Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+蒸餾水(PEG);(3)Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+0.5mg/L BR(BR);(4)含2.5%PEG-6000的Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+0.5 mg/L BR(PEG+BR);(5)含2.5% PEG-6000的Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+0.5 mg/L BR+1.0 mg/L Z(PEG+BR+Z);(6)含2.5%PEG-6000的Hoagland營(yíng)養(yǎng)液+1.0 mg/L Z(PEG+Z)。每隔3h進(jìn)行1次噴灑處理,在0、3、6、12、24h時(shí)采集不同處理的不同棉花幼苗底部倒數(shù)第3~4片的10個(gè)葉片,分別稱(chēng)取0.1g棉花幼苗葉片,迅速凍于液氮中備用。

      1.2.2 棉花幼苗總RNA 的提取和cDNA的合成 取0.1g棉花幼苗葉片在液氮中充分研磨,采用植物總RNA 提取試劑盒(北京百泰克公司)提取棉花總RNA,接著進(jìn)行定量和電泳檢測(cè)。采用Revert Aid First Strand cDNA Synthesis Kit(大連TaKa-Ra公司)試劑盒合成cDNA。

      1.2.3 GhBES1/BZR1 基因的擴(kuò)增和鑒定 根據(jù)亞洲棉‘石系亞1號(hào)’轉(zhuǎn)錄因子BES1/BZR1的開(kāi)放閱讀框序列,設(shè)計(jì)擴(kuò)增開(kāi)放閱讀框的上游引物(5′-GCGCTGCTTTGAGGAAGGTATTG-3′)和 下 游引 物(5′-CTGACAGTGTTTGCTTGATGTGATGCTC-3′),以棉花幼苗葉片的cDNA 為模板,使用ExTaq酶PCR 擴(kuò)增目的基因,擴(kuò)增條件為94 ℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,58℃退火30s;72℃延伸90s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),回收目的基因片段,與pMD18-T 載體連接,并轉(zhuǎn)化E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞。挑選菌液進(jìn)行PCR 及質(zhì)粒酶切鑒定的陽(yáng)性克隆,送上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序。

      1.2.4 GhBES1/BZR1 蛋白生物信息學(xué)分析 利用ExPASy ProtParam(http://expasy.org/tools/pi_tool.html)分析GhBES1/BZR1蛋白的理化性質(zhì)及疏水性;用NCBI CDD 數(shù)據(jù)庫(kù)分析蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域,用SignalP4.0Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP)軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的信號(hào)肽;Cell-PLoc 2.0PSORT(http://psort.ims.u-tokyo.a(chǎn)c.jp/form.html)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位;GOR4(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl)軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu);NetPhos(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos)分析蛋白質(zhì)的磷酸化位點(diǎn);NPS Prosite Scan(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/pattern_prosite.pl)分析蛋白活性位點(diǎn);用MEGA 5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)[22-23]。

      1.2.5 不同處理GhBES1/BZR1基因的表達(dá) 根據(jù)GhBES1/BZR1的cDNA 序列設(shè)計(jì)上游引物(5′-TGGGATGAAATGAATGCTGGGC-3′)和下游引物(5′-AGTGTAAGTTCGAGATCATCAGCTGC-3′),以18S基因作為內(nèi)參基因,設(shè)計(jì)上游引物(5′-CAACTTGCGTTCAAAGACTCGATGGTT-3′)和下游引物(5′-CAAGGAATCGAAACGAAAGAAGG-3′)。以處理組棉花幼苗葉片的cDNA 為模板,取1.0μL cDNA,qRT-PCR 參照帶有ROX 的Platinum SYBR Green qPCR SuperMix-UDG(美國(guó)Invitrogen公司)試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。RT-PCR 反應(yīng)參數(shù)為:94 ℃預(yù)變性15s;94 ℃變性30s;59 ℃退火30s;72 ℃延 伸45s;40 個(gè) 循 環(huán)。采 用ABI PRISM 7500實(shí)時(shí)定量PCR 儀進(jìn)行檢測(cè),數(shù)據(jù)采用2-ΔΔCT法進(jìn)行分析[24]。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 GhBES1/BZR1基因的克隆和鑒定

      以棉花‘新陸早17號(hào)’幼苗葉片的cDNA 為模板,以根據(jù)BES1/BZR1基因開(kāi)放閱讀框序列設(shè)計(jì)的特異性引物,通過(guò)PCR 進(jìn)行GhBES1/BZR1 開(kāi)放閱讀框的擴(kuò)增。結(jié)果表明PCR 擴(kuò)增出與預(yù)測(cè)長(zhǎng)度一致的條帶(圖1),測(cè)序結(jié)果表明開(kāi)放閱讀框?yàn)?60bp,編碼319 個(gè)氨基酸,提交NCBI 基因庫(kù)(GenBank登錄號(hào)KP272000),所獲得的GhBES1/BZR1基因?yàn)檎_的目的基因。

      2.2 GhBES1/BZR1蛋白的理化特性和結(jié)構(gòu)分析

      通過(guò)在線EXPASY 的ProtParam 軟件對(duì)BES1/BZR1基因編碼蛋白的理化性質(zhì)進(jìn)行分析表明,GhBES1/BZR1蛋白的理論分子量為34.3kD,理論等電點(diǎn)為8.95。利用在線NCBI的保守結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)(conserved domain database,CDD)對(duì)Gh-BES1/BZR1蛋白的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果說(shuō)明GhBES1/BZR1蛋白含有一個(gè)DUF822 保守結(jié)構(gòu)域,而DUF822為基因未知功能的植物蛋白,此家族由未知功能的幾個(gè)植物蛋白的N 末端區(qū)域組成。利用SignalP4.0Server軟件對(duì)GhBES1/BZR1 蛋白進(jìn)行信號(hào)肽的預(yù)測(cè)。結(jié)果說(shuō)明GhBES1/BZR1蛋白的N 端不存在剪切位點(diǎn),表明其不包含信號(hào)肽,推測(cè)GhBES1/BZR1蛋白為非分泌蛋白。利用在線EXPASY 的ProtParam 軟 件 對(duì)GhBES1/BZR1 蛋白的疏水性/親水性進(jìn)行預(yù)測(cè)。推測(cè)GhBES1/BZR1蛋白是一種可溶性蛋白。利用在線軟件GOR4對(duì)GhBES1/BZR1 蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,GhBES1/BZR1蛋白主要由α-螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲、延伸鏈構(gòu)成(表1)。其中無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)最多,占據(jù)整條鏈的62.07%。α-螺旋占了24.76%,其余的全為延伸鏈。

      圖1 GhBES1/BZR1基因的PCR 擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of GhBES1/BZR1gene M.DL2000;1,2.GhBES1/BZR1

      表1 GhBES1/BZR1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Table 1 GhBES1/BZR1protein of secondary structure prediction

      2.3 GhBES1/BZR1 蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)及活性位點(diǎn)的分析

      磷酸化是生物體內(nèi)的一種重要調(diào)節(jié)方式,主要在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和蛋白調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮作用[25]。利用NPS(network protein sequence analysis)的Prosite Scan對(duì)GhBES1/BZR1蛋白進(jìn)行活性位點(diǎn)分 析。如 表2 所 示,GhBES1/BZR1 有3 類(lèi) 磷 酸 化位點(diǎn)和1類(lèi)N-糖基化位點(diǎn)、1類(lèi)酰胺化位點(diǎn)和1類(lèi)豆蔻酰化位點(diǎn)。

      2.4 GhBES1/BZR1蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

      通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)檢索GhBES1/BZR1同源蛋白序列,使用MEGA 5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。其結(jié)果表明GhBES1/BZR1 蛋白和可可聚類(lèi)在一起(圖2),Blast比對(duì)編碼棉花和可可這兩種植物同源蛋白的序列相似度達(dá)到99%。

      2.5 干旱脅迫下不同處理GhBES1/BZR1基因的表達(dá)分析

      采用qRT-PCR 方法,以18S作為內(nèi)參基因,分別檢測(cè)不同處理和不同時(shí)間棉花幼苗葉片Gh-BES1/BZR1的表達(dá)變化(圖3)。

      實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,處理3h時(shí),PEG-6000處理相對(duì)于水處理的GhBES1/BZR1 基因表達(dá)量極顯著地上調(diào)了3.9倍(P<0.01),PEG-6000處理下噴灑BR(PEG+BR)相對(duì)于其他處理基因的表達(dá)量最高,而PEG+BR 處理下再?lài)姙R 抑制劑(PEG+BR+Z)相對(duì)于PEG+BR 處理有顯著性的降低(P<0.05)。說(shuō)明PEG 處理下噴施BR 能夠顯著提高GhBES1/BZR1的表達(dá),而噴施BR 抑制劑后Gh-BES1/BZR1的表達(dá)顯著降低。處理6h時(shí),PEG+BR 處理的基因表達(dá)量相對(duì)于其他處理是最高,除PEG 處理和PEG+BR 處理外,其它處理下該基因的表達(dá)量都有所上升,PEG+BR 處理的基因表達(dá)量有所下降,但相互之間都無(wú)顯著性差異(P >0.05)。說(shuō)明在6h直接噴施BR 和在PEG-6000處理下噴施BR 均能夠顯著提高GhBES1/BZR1,而噴施BR 抑制劑后GhBES1/BZR1的表達(dá)也顯著降低。處理12h時(shí),各處理的GhBES1/BZR1表達(dá)量相對(duì)于6h處理都有所下降,而PEG+BR 處理的基因表達(dá)量依然最高,并顯著性地高于PEG-6000處理和PEG+BR+Z 處理(P<0.05),分別是其1.3和1.6倍。處理24h時(shí),PEG+BR 處理的基因表達(dá)量降低,直接噴施BR 處理的基因表達(dá)量達(dá)到最高。而PEG+Z和PEG+BR+Z處理的基因表達(dá)量只有BR 處理組的1/7 左右。說(shuō)明隨著PEG處理時(shí)間的延長(zhǎng),在PEG 處理下噴施BRGhBES1/BZR1的表達(dá)明顯下降,而噴施BR 抑制劑后Gh-BES1/BZR1的表達(dá)更加顯著降低,已經(jīng)低于對(duì)照組,說(shuō)明隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),BR 抑制劑極大地降低了GhBES1/BZR1的表達(dá)。

      表2 GhBES1/BZR1在NPS中活性位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析Table 2 The prediction analysis of GhBES1/BZR1active site in NPS

      圖3 干旱脅迫下不同處理‘新陸早17號(hào)’棉花幼苗葉片中GhBES1/BZR1的相對(duì)表達(dá)不同小寫(xiě)字母表示同一時(shí)間不同處理下差異顯著(P<0.05)Fig.3 Relative expression of GhBES1/BZR1 in the seedling leaves of cotton‘XLZ17’for the different treatments under drought stress Different letters represent significant differences among treatments under the same time(P<0.05)

      3 討 論

      BR 作為一種重要的植物內(nèi)源激素,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育和抵御干旱方面發(fā)揮作用。BES1/BZR1作為BR 信號(hào)通路中的一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,其編碼的BES1/BZR1蛋白是植物防御的一種內(nèi)源信號(hào)分子,當(dāng)植物受到各種脅迫時(shí),可以誘導(dǎo)防御基因的表達(dá)去抵御外界的脅迫,并直接影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育同時(shí)調(diào)節(jié)植物的生理代謝過(guò)程[26-27]。

      通過(guò)對(duì)棉花‘新陸早17號(hào)’GhBES1/BZR1 基因序列的生物信息學(xué)分析表明,該基因編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列與可可編碼的BES1/BZR1氨基酸序列的相似性達(dá)99%,且與可可的BES1/BZR1聚在進(jìn)化樹(shù)的同一分支上,這表明其進(jìn)化上與可可具有趨同性。利用NPS的Prosite Scan 對(duì)BES1/BZR1蛋白進(jìn)行活性位點(diǎn)分析結(jié)果表明,GhBES1/BZR1有3類(lèi)磷酸化,這可能是與GhBES1/BZR1蛋白的磷酸化參與調(diào)解干旱脅迫的信號(hào)通路有關(guān)。蛋白質(zhì)的疏水性通常依據(jù)蛋白的GRAVY 值預(yù)測(cè),而GRAVY 值通常分布在-2~2之間,正值表明蛋白為疏水蛋白,負(fù)值表明為親水蛋白。預(yù)測(cè)顯示Gh-BES1/BZR1蛋白的GRAVY 值為-4.211,說(shuō)明GhBES1/BZR1 蛋白是一種可溶性蛋白,結(jié)果與BES1/BZR1蛋白不與膜結(jié)合在細(xì)胞核內(nèi)與特定啟動(dòng)子發(fā)揮作用的結(jié)果相一致[13]。表明該蛋白可能是一種能夠通過(guò)磷酸化和去磷酸化在BR 信號(hào)通路中發(fā)揮作用的可溶性蛋白。

      BR 在作物上的應(yīng)用主要是浸種或外源噴等,有關(guān)BR 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的重要組分如GhBES1/BZR1基因表達(dá)變化對(duì)作物抗旱性的影響鮮見(jiàn)報(bào)道。根據(jù)河南棉花所對(duì)亞洲棉進(jìn)行干旱脅迫下的轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),BR 信號(hào)通路中BES、BKI、BRI 等基因的表達(dá)上調(diào),其中PEG 模擬干旱脅迫3h后,亞洲棉‘石系亞1 號(hào)’葉中GhBES1/BZR1 表達(dá)量上調(diào)了2.7 倍[20]。本研究結(jié)果中,PEG-6000模擬干旱脅迫,PEG+BR 處理3h 時(shí)GhBES1/BZR1基因的表達(dá)量分別是PEG 和PEG+BR+Z處理的1.9倍和1.7倍。BR 處理6和12h時(shí),GhBES1/BZR1表達(dá)量相對(duì)于3h時(shí)都有明顯下降,但噴施BR 表達(dá)量明顯高于沒(méi)有噴施BR 處理組,而B(niǎo)R+Z處理GhBES1/BZR1表達(dá)量降低,這說(shuō)明噴施BR能夠誘導(dǎo)GhBES1/BZR1表達(dá)上調(diào),而B(niǎo)R 抑制劑Z能夠干涉BR 的作用致使GhBES1/BZR1表達(dá)下降。噴施BR 處 理 下3h 時(shí),GhBES1/BZR1 表 達(dá)量快速升高,表明在干旱脅迫下噴施BR 能夠讓GhBES1/BZR1表達(dá)快速升高以響應(yīng)干旱脅迫。而噴 施BR 6、12 和24h 相 對(duì) 于3h 處 理GhBES1/BZR1表達(dá)有所下降,則表明在干旱脅迫下噴施BR對(duì)于GhBES1/BZR1表達(dá)的影響在時(shí)間上沒(méi)有持久性,伴隨著時(shí)間的延長(zhǎng)誘導(dǎo)作用逐漸減弱,與植物激素作用快的特性相一致。在沒(méi)有干旱脅迫而單獨(dú)噴施BR 處理24h時(shí),GhBES1/BZR1表達(dá)量遠(yuǎn)高于干旱脅迫下噴施BR 處理。說(shuō)明干旱脅迫下噴施BR 可快速誘導(dǎo)GhBES1/BZR1 表達(dá),但在沒(méi)有干旱脅迫下噴施BR 誘導(dǎo)GhBES1/BZR1表達(dá)明顯存在一定的滯后性,證明干旱脅迫下噴施BR 是Gh-BES1/BZR1快速表達(dá)誘導(dǎo)因素。

      總之,從棉花‘新陸早17號(hào)’幼苗中克隆獲得的轉(zhuǎn)錄因子GhBES1/BZR1,在BR 信號(hào)通路的基因調(diào)控中發(fā)揮重要作用,在干旱脅迫下外源噴施BR及BR 抑制劑Z對(duì)棉花GhBES1/BZR1基因表達(dá)有明顯的影響。表明BR 是促進(jìn)干旱脅迫下Gh-BES1/BZR1表達(dá)的主要誘因,干旱脅迫和非干旱脅迫噴施BR 能夠直接影響GhBES1/BZR1表達(dá)水平升高的速率。進(jìn)一步探討外源噴施BR 對(duì)棉花GhBES1/BZR1表達(dá)的影響,有助于闡明BR 調(diào)控棉花抗旱性的分子機(jī)理。

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