金崇富 王金玉 張跟喜等
摘要:以IGF1、IGF2基因作為影響雞生產(chǎn)性能的候選基因,采用DNA測序和PCR-SSCP技術分析2個基因的單核苷酸多態(tài)性及互作效應。結果表明,IGF1基因P1位點與IGF2基因P2位點對12、16周齡雞的質(zhì)量存在互作效應。
關鍵詞:雞;遺傳多樣性;IGF1R基因;IGFBP-3基因;互作效應
中圖分類號:S831.2文獻標志碼: A文章編號:1002-1302(2015)11-0285-02
收稿日期:2014-11-27
基金項目:江蘇省重點實驗室開放課題(編號:K13032);江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金[編號:CX(13)3044]。
作者簡介:金崇富(1985—),男,江蘇建湖人,碩士研究生,助理研究員,主要從事動物遺傳育種與繁殖研究。Email:jincf001@sina.com。
通信作者:陳應江,副研究員,主要從事畜牧業(yè)研究。胰島素樣生長因子(IGFs)是人體最重要的生長因子之一。IGF家族由2個多肽類生長因子(IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ)、2類受體(IGF-ⅠR、IGF-ⅡR)、7種結合蛋白(IGFBP1-7)組成,它們是動物生長軸上的重要因子,具有強烈的促生長和分化作用[1]。類胰島素樣生長因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)是介導生長素作用的物質(zhì),在研究生長素的促生長作用時被發(fā)現(xiàn)并深入研究。類胰島素樣生長因子-Ⅱ(insulin-like growth factor-Ⅱ,IGF2)是調(diào)節(jié)動物生命活動最重要的多肽生長因子之一[2],是生長激素發(fā)揮作用的中間信使,進而發(fā)揮促進生長發(fā)育的作用[3]。
王慧華研究發(fā)現(xiàn),IGF1基因G49754A/G49778A位點對京海黃雞的初生質(zhì)量有顯著影響[2]。Amills等在IGF-Ⅰ基因的5′-UTR發(fā)現(xiàn),HinfI-RFLP與107 d雞的日增質(zhì)量存在相關性[4]。楊鳳萍等在京海黃雞IGF2基因中檢測到外顯子2發(fā)生G→C突變,并與其生產(chǎn)性狀具有顯著相關性[5]。李源等研究發(fā)現(xiàn),IGF2基因C2C2型個體的12、16周齡質(zhì)量極顯著大于C1C2型個體(P<0.01)[3]。
在分析多基因調(diào)控的數(shù)量性狀時,須同時分析多個位點,以便得到基因與性狀之間的真實相關性,從而在利用DNA標記進行輔助選擇時獲得更大的遺傳進展[6]。以江蘇省鹽城市地方草雞為研究對象,分析IGF1、IGF2基因的互作效應,以期為鹽城市地方草雞生產(chǎn)性狀的分子遺傳機制研究提供依據(jù)。
1材料與方法
1.1試驗材料
在江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學研究所生態(tài)養(yǎng)殖基地的母雞群中,翅靜脈采集138份血樣,每份1.5 mL,以ACD抗凝并于 -20 ℃ 保存?zhèn)溆?。用DNA提取試劑盒抽提基因組DNA。
1.2引物設計
1.3PCR-SSCP分析
將2.5 μL PCR產(chǎn)物添加至7.5 μL變性緩沖液中,98 ℃變性10 min,隨后迅速冰浴5 min。將變性的PCR產(chǎn)物點樣添加至10%聚丙烯酰胺凝膠中,于140 V電壓電泳12 h。電泳結束后進行銀染顯色并拍照記錄結果。
1.4IGF1、IGF2基因綜合標記
采用SPSS軟件的廣義線性模型(GLM)綜合分析IGF1、IGF2基因的互作效應,選取互作效應顯著的雞,對其生產(chǎn)性狀進行基因型組合,并對不同基因型組合間的差異進行最小二乘(LSD)分析。
2結果與分析
2.1PCR-SSCP分析結果
采用PCR-SSCP分析P1、P2引物擴增片段。P1擴增片段有3種帶型,定義為AA、AB、BB(圖1);P2擴增片段有3種帶型,定義為CC、CD、DD(圖2)。
2.2序列分析結果
由引物P1的PCR產(chǎn)物片段測序結果(圖3)可知,BB型與AA型相比在160 bp處發(fā)生了G→A突變。由引物P2的PCR產(chǎn)物片段測序結果(圖4)可知,DD型與CC型相比在1 087 bp處發(fā)生了G→A突變。
2.3IGF1、IGF2基因?qū)ιa(chǎn)性狀的互作效應
由IGF1、IGF2基因?qū)ιa(chǎn)性狀的互作效應(表1)可知,IGF1、IGF2基因?qū)}城市地方草雞的12、16周齡質(zhì)量存在互作效應。
3結論與討論
培育具有綜合性能的優(yōu)良家禽品種已成為現(xiàn)代家禽育種的重要目標。由于家禽的很多經(jīng)濟性狀是由多基因控制的數(shù)量性狀,可通過分子標記選擇世代中含有多個目標基因的個體,再從中選出優(yōu)良個體,實現(xiàn)有利基因的聚合,使品種具有更優(yōu)良的生產(chǎn)性能。
通過分子標記將多個影響家禽生產(chǎn)性狀的基因聚合,此方面的研究尚不多見。侯啟瑞在京海黃雞群體中對IGF1與IGF2、LYZ與gag-env分別進行聚合分析,發(fā)現(xiàn)其存在互作效應[7]。趙秀華在京海黃雞群體中對IGFBP-1、IGFBP-2、STAT5基因進行3基因互作效應分析,結果表明,3基因合并效應>2基因合并效應>單基因效應,且組合基因型效應不是單基因型效應的簡單相加,其效果優(yōu)于單基因型效應[8]。李國輝等以白耳雞為試驗對象,檢測GH、POU1F1、PRL基因的單核苷酸多態(tài)性,分析3個基因的單基因效應與聚合基因型效應[9]。本研究中鹽城市地方草雞IGF1、IGF2基因?qū)ζ?2、16周齡質(zhì)量具有互作效應;在生產(chǎn)中,可通過選擇這2個基因的SNPs進行分子標記輔助育種,其風險低于單基因選擇。
參考文獻:
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