吳禮平陳鵬剛曾紀輝
(1.楊凌職業(yè)技術(shù)學院,陜西楊凌 712100;2.延安職業(yè)技術(shù)學院,陜西延安 716000;3.西安派特動物醫(yī)院,陜西西安 716100)
寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)應用探討
吳禮平1陳鵬剛2曾紀輝3
(1.楊凌職業(yè)技術(shù)學院,陜西楊凌 712100;2.延安職業(yè)技術(shù)學院,陜西延安 716000;3.西安派特動物醫(yī)院,陜西西安 716100)
寵物診療活動中會產(chǎn)生大量的不同類型數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)具有大數(shù)據(jù)一般意義上的“4V”特征:數(shù)據(jù)體量大、種類繁多、流動速度快和價值密度低;同時,寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)還具有一些自身的特性。寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)可以應用于疾病診療、藥物研發(fā)、疫病防控和行業(yè)監(jiān)管等多個領(lǐng)域。要充分挖掘?qū)櫸镝t(yī)療大數(shù)據(jù)的價值,首先應最大程度地實現(xiàn)寵物醫(yī)院管理信息化,在此基礎(chǔ)上充分實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。物聯(lián)網(wǎng)為寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)提供了豐富而便捷的來源,云計算是大數(shù)據(jù)分析和處理的最佳方式。大數(shù)據(jù)時代對用戶隱私及權(quán)利保護提出了新的要求。
大數(shù)據(jù);寵物醫(yī)療;云計算;物聯(lián)網(wǎng)
人類活動的過程,就是不斷產(chǎn)生數(shù)據(jù)的過程。據(jù)估計,人類社會從出現(xiàn)文明到2003年,總共創(chuàng)造出5EB(1EB=1018字節(jié),即109GB)的數(shù)據(jù),現(xiàn)在僅用2d就能創(chuàng)造出相同的數(shù)據(jù)量[1]。2010年,全球數(shù)據(jù)量跨入了ZB(1ZB=103EB)時代。為處理這些海量數(shù)據(jù),大數(shù)據(jù)技術(shù)應運而生。所謂大數(shù)據(jù)技術(shù),就是對海量的數(shù)字、文本、圖像、音頻和視頻等數(shù)據(jù)進行采集、分析、加工和利用的技術(shù)集合,其目的在于從龐大的數(shù)據(jù)集合中找尋有價值的數(shù)據(jù)和知識,通過分析挖掘為各行業(yè)提供有用的數(shù)據(jù)和知識[2]。目前對大數(shù)據(jù)還沒有形成統(tǒng)一的權(quán)威定義,但是,大數(shù)據(jù)具有公認的“4V”特征:數(shù)據(jù)體量巨大(Volume)、數(shù)據(jù)種類繁多(Variety)、流動速度快(Velocity)和價值密度低(Value)[3]。在寵物疾病診療的各個環(huán)節(jié)中可以產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),應用大數(shù)據(jù)技術(shù)可以在寵物醫(yī)療領(lǐng)域產(chǎn)生出巨大的價值。
寵物診療機構(gòu)在工作過程的各個環(huán)節(jié)都會產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),如臨床檢查、化驗、治療,以及寵物用品、藥品進出及庫存等數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)可分為以下幾種類型。
(1)以自然語言描述的文本。如臨床病歷中的癥狀描述、寵物主人的陳述等。這類數(shù)據(jù)對儲存空間要求低但處理過程比較復雜。一份典型的病歷文件中,這種描述性文本一般只需要幾KB到幾十KB的存儲空間,但在處理這種文本數(shù)據(jù)時,需要用到智能分詞、數(shù)據(jù)清洗、語義分析等技術(shù)?,F(xiàn)在多數(shù)寵物醫(yī)院已經(jīng)開始使用電子病歷,采集這些病歷數(shù)據(jù)幾乎無需增加成本。
(2)格式化數(shù)據(jù)。如各種化驗產(chǎn)生的數(shù)據(jù)?,F(xiàn)代的很多化驗儀器都能與計算機互聯(lián)并通訊,這些數(shù)據(jù)的采集便捷,而且處理格式化數(shù)字數(shù)據(jù)比處理文本數(shù)據(jù)要便捷的多。處方數(shù)據(jù)、藥品用品進出及庫存等數(shù)據(jù)雖然混合了文本與數(shù)字等,但也可以看成是格式化數(shù)據(jù),經(jīng)過簡單的預處理,就能很好地被計算機所識別并分析,為后續(xù)的大數(shù)據(jù)處理奠定基礎(chǔ)。
(3)圖片音頻和視頻數(shù)據(jù)。如影像診斷產(chǎn)生的X線片、透視影像、B超聲像圖、內(nèi)窺鏡影像,以及臨床拍攝的癥狀、病理照片等。這類數(shù)據(jù)保存時要占據(jù)大量的存儲空間,以一張X線片為例,未經(jīng)壓縮的圖片可能達到幾百MB甚至幾個GB,壓縮之后也在10MB左右,而動態(tài)的錄像數(shù)據(jù)占據(jù)的存儲空間還要高1~2個數(shù)量級。這類數(shù)據(jù)處理復雜,雖然目前照片識別幾分析技術(shù)已在超聲、X線診斷等專門領(lǐng)域內(nèi)開始使用,但局限性仍然較大。
除臨床診療過程為寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)提供來源外,用戶使用搜索引擎而產(chǎn)生的關(guān)鍵詞搜索記錄、社交網(wǎng)絡中關(guān)于寵物疾病的消息也為寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)提供了豐富的來源。
寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)具有大數(shù)據(jù)一般意義上的“4V“特征。第一,數(shù)據(jù)體量大,一份典型的電子病歷,其中的圖片和影像數(shù)據(jù)壓縮后包含的數(shù)據(jù)也可能達到是100MB,一個大型寵物醫(yī)院如果每天接診200個病例,則一天可產(chǎn)生大約20GB的數(shù)據(jù),一年則高達7.2TB,這為大數(shù)據(jù)的存儲提出了比較高的要求。第二,數(shù)據(jù)種類繁多,涵蓋了自然語言文本、數(shù)字、格式化文本和數(shù)字、圖片、視頻、音頻等多種類型。第三,流動速度快,寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)每天都在不停地產(chǎn)生,數(shù)據(jù)不斷更新,新的檢查手段和診療技術(shù)的使用,這些都使得寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)來源多變。同時由于疾病的動態(tài)性,同一病例在新的時間點會產(chǎn)生新的數(shù)據(jù);由于檢測儀器之間的差異,寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)也表現(xiàn)出且具有較大的異質(zhì)性,比如同一檢測項目,不同儀器存在不同的誤差,或者對檢測結(jié)果的顯示方式也不統(tǒng)一。第四,價值密度低,大數(shù)據(jù)需要足夠大的數(shù)據(jù)量,最好是“全數(shù)據(jù)”,只有“大而全”,才能有效地發(fā)掘出其中的規(guī)律。單個的或孤立的數(shù)據(jù),其價值較低,難以從中發(fā)現(xiàn)潛在的規(guī)律。
寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)也具有其自身的一些特性。由于樣本來源、樣本測定方法及數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)存儲格式的多樣化,導致在使用寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)時存在諸多不確定性。其次,由于臨床疾病的影響因素多,環(huán)境、遺傳、食物、藥物、管理等因素都可能會和某些疾病產(chǎn)生相關(guān)性,因此寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)具有顯著的高維度特點,因此在大數(shù)據(jù)分析的時候需要對多維數(shù)據(jù)進行疊加、索引和學習。
與傳統(tǒng)的邏輯推理研究不同,大數(shù)據(jù)研究是對數(shù)量巨大的數(shù)據(jù)做統(tǒng)計性的搜索、比較、聚類和分類等歸納,進行相關(guān)性分析。大數(shù)據(jù)研究的一個重要發(fā)展趨勢就是研究方法由假設(shè)驅(qū)動向數(shù)據(jù)驅(qū)動的轉(zhuǎn)變[4]。
3.1 疾病診療
傳統(tǒng)的疾病診斷,其正確率受寵物醫(yī)生個人知識、經(jīng)驗的制約,即使采用聯(lián)合會診的方式,也只用到了若干位醫(yī)師的知識和經(jīng)驗,疾病診斷的準確性和治療方案的合理性會受到一定的影響。而且,僅僅依據(jù)個人或團隊有限的疾病診治案例,難以發(fā)現(xiàn)其中的某些規(guī)律,或者只能得出錯誤的因果關(guān)聯(lián)。大數(shù)據(jù)技術(shù)可以從根本上改變這種現(xiàn)狀,通過數(shù)據(jù)共享,一個寵物醫(yī)師可以便捷地提取和篩選各地寵物醫(yī)院累積的病歷資料,更易發(fā)現(xiàn)其中的規(guī)律。寵物醫(yī)師可以通過調(diào)取該寵物的既往病歷數(shù)據(jù)來輔助疾病診療,甚至可以通過寵物的身份數(shù)據(jù)來了解該寵物的家族病史,實現(xiàn)個性化醫(yī)療。在人醫(yī)領(lǐng)域,國外已開始出現(xiàn)利用大數(shù)據(jù)輔助醫(yī)療決策的嘗試,如紀念斯隆-凱特琳癌癥中心與沃森超級計算機合作研發(fā)的治療決策工具,利用了60萬份醫(yī)療證據(jù),150萬條患者記錄,42種醫(yī)療雜志,和大約200萬頁臨床試驗的文本數(shù)據(jù)[5]。
3.2 藥物研發(fā)
目前我國寵物藥品產(chǎn)業(yè)市場前景廣闊,但與發(fā)達國家相比,在寵物藥品生產(chǎn)能力及發(fā)展水平存在較大差距。我國正積極調(diào)整優(yōu)化獸藥產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu),寵物藥品研發(fā)、生產(chǎn)及推廣將得到極大的發(fā)展[6]。按照傳統(tǒng)的藥物研發(fā)流程,一種新藥從研發(fā)到推向市場的時間大約需要13年。對于藥品研發(fā)機構(gòu)而言,最迫切的需求有兩個方面:正確的決策、及時的反饋。醫(yī)藥研發(fā)部門或公司在新藥研發(fā)階段,可以通過大數(shù)據(jù)分析來自互聯(lián)網(wǎng)上的各種藥品需求趨勢,確定更為有效的投入產(chǎn)出比,合理配置研發(fā)資源[7]。另一方面,傳統(tǒng)的藥物副作用分析主要采用臨床試驗法、藥物副作用報告分析法等,這些方法受到樣本數(shù)小、采樣分布有限等因素影響,難以全面反映藥物副作用造成的影響??梢灶A見,如果應用醫(yī)療大數(shù)據(jù)系統(tǒng),從海量病歷數(shù)據(jù)中挖掘到與某種藥物相關(guān)的不良反應,就可以克服傳統(tǒng)方式的不足,所獲得的結(jié)果更具有說服力[8]。
3.3 疫病防控
在寵物領(lǐng)域,威脅最大的疫病是犬瘟熱、犬細小病毒病,以及狂犬病等。動物疫病,尤其是人獸共患病的防控,傳統(tǒng)方法主要是病例監(jiān)測,通過養(yǎng)殖企業(yè)、診療機構(gòu)上報病例數(shù)據(jù),并逐級上報,如此到最終進行分析匯總,會產(chǎn)生1~2周的時間延遲[9]。但是大數(shù)據(jù)分析技術(shù)可以顛覆傳統(tǒng)的疫病監(jiān)測手段,典型案例就是谷歌公司通過分析用戶搜索關(guān)鍵詞預測流感疫情趨勢。根據(jù)目前的條件,應用大數(shù)據(jù)進行疫病監(jiān)測可以通過3種途徑:一是基于用戶使用搜索引擎搜索特定關(guān)鍵詞集合的搜索記錄,如谷歌公司的流感監(jiān)測,它定期發(fā)布的全球流感趨勢,已成為許多國家流感監(jiān)測的重要參考[9]。其二是基于社交網(wǎng)絡。與基于搜索引擎只能獲得用戶輸入的若干關(guān)鍵詞相比,社交網(wǎng)絡如國內(nèi)的微博,國外的twitter、facebook上,有用戶更完整的語義描述和個人信息。其三是基于診療機構(gòu)、養(yǎng)殖企業(yè)的聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)采集終端,如聯(lián)網(wǎng)并參與數(shù)據(jù)共享的寵物醫(yī)院管理信息系統(tǒng)?;谒阉饕娴囊卟”O(jiān)測目前雖存在一些技術(shù)缺陷,譬如由于媒體對于流感季節(jié)嚴重性的報道導致用戶對流感關(guān)鍵詞搜索頻率升高而引發(fā)2013年谷歌流感趨勢預測出現(xiàn)偏差,但大數(shù)據(jù)預測仍然具有廣闊的發(fā)展前景,至少在時間延遲方面,谷歌的流感預測將時間延遲從傳統(tǒng)的1~2周縮短至1d,隨著預測算法的改進,預測的準確性勢必也會得到提升。
3.4 行業(yè)監(jiān)管
寵物診療行業(yè)在我國正在走向規(guī)范化,但仍存在許多問題,最突出的問題主要有:部分生物制品無產(chǎn)品批準文號和產(chǎn)品批號、處方不規(guī)范,以及人藥獸用等[10]。傳統(tǒng)的監(jiān)管主要采取人工抽查,效率低,執(zhí)法成本高。使用大數(shù)據(jù)分析,通過監(jiān)控寵物醫(yī)院藥品采購數(shù)據(jù)、處方中的藥物使用情況,并追溯藥品經(jīng)銷、生產(chǎn)環(huán)節(jié),通過比對合法生產(chǎn)、銷售的藥品,與寵物診療機構(gòu)采購、使用的藥品數(shù)據(jù),能快速便捷地發(fā)現(xiàn)其中的違規(guī)行為。通過采集并分析寵物診療機構(gòu)的醫(yī)療廢棄物數(shù)據(jù),還可以進一步提高監(jiān)管效率,并及時發(fā)現(xiàn)醫(yī)療廢棄物處理過程中的違規(guī)行為。
大數(shù)據(jù)技術(shù)不是全新的技術(shù),也不是孤立的技術(shù),而是在新的時代背景下在原有數(shù)據(jù)分析技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一整套技術(shù)集合,這需要一系列的其他技術(shù)支撐。
4.1 寵物醫(yī)院管理信息化是大數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ)
大、中型寵物醫(yī)院普遍使用了各類寵物醫(yī)院管理信息系統(tǒng),但是在小型寵物醫(yī)院以及寵物診所,仍然只是部分地使用或者完全沒有使用這類系統(tǒng)。病歷、處方?jīng)]有完全實現(xiàn)信息化,醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析將無從開始。因此,全面推廣使用寵物醫(yī)院管理信息系統(tǒng)將十分必要。傳統(tǒng)的寵物醫(yī)院管理信息系統(tǒng)多為單機版軟件,以收費為中心將寵物醫(yī)療各個環(huán)節(jié)組織起來。為充分利用大數(shù)據(jù)的價值,寵物醫(yī)院管理系統(tǒng)必須實現(xiàn)聯(lián)網(wǎng)運行、以電子病歷為中心的轉(zhuǎn)變。
4.2 數(shù)據(jù)共享是發(fā)揮大數(shù)據(jù)優(yōu)勢的必備條件
與發(fā)達國家相比,我國寵物醫(yī)療行業(yè)興起的時間不長,規(guī)?;膶櫸镝t(yī)院起步較晚,同時牽涉到用戶隱私、商業(yè)機密等問題,寵物醫(yī)療數(shù)據(jù)僅限于寵物醫(yī)院內(nèi)部使用。但是單個寵物醫(yī)院所累積的醫(yī)療數(shù)據(jù)并不能體現(xiàn)大數(shù)據(jù)“大而全”的特點,只能成為價值較低的“數(shù)據(jù)孤島”。聯(lián)網(wǎng)和共享勢在必行,不僅是在寵物醫(yī)院之間,還應囊括寵物主人、寵物、監(jiān)管部門。在國內(nèi),2015年10月中愛科技發(fā)布了“聯(lián)寵6.0”互聯(lián)網(wǎng)智能寵物醫(yī)療管理軟件,該軟件在數(shù)據(jù)互聯(lián)和共享方面做出了積極的努力:通過微信及客戶端將寵物主人聯(lián)接起來,實現(xiàn)了遠程智能預約;通過院長定制版APP,實現(xiàn)了寵物醫(yī)院的遠程智能化管理;通過知識分享,搭建了寵物醫(yī)師自我學習及同行交流平臺[11]。該軟件是邁向?qū)櫸镝t(yī)療大數(shù)據(jù)應用的一個里程碑。
4.3 云計算是大數(shù)據(jù)分析的最佳方式
桌面計算可以完全勝任傳統(tǒng)的“小數(shù)據(jù)”的處理、統(tǒng)計和分析,但對于具有“4V”特征的寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析,需要性能更為強大的云計算環(huán)境。云計算也不是全新的技術(shù),也是對現(xiàn)有技術(shù)的綜合利用?!霸啤笨梢哉J為是以虛擬化、面向服務的計算和網(wǎng)格計算等成熟技術(shù)為基礎(chǔ),以大規(guī)模資源共享為目標,采用共享資源池的模式進行構(gòu)建的大型服務集群。與傳統(tǒng)的桌面計算相比,云計算提倡效用計算(Utility Computing),并采用多重租賃的方式提供計算服務[12]。近幾年來云計算發(fā)展迅速,涌現(xiàn)了一批代表性的商業(yè)云計算平臺,提供IaaS(Infrastructure as a Service,基礎(chǔ)設(shè)施即服務)、PaaS(Platform as a Service,平臺即服務)和SaaS(Software as a Service,軟件即服務)三種典型的服務模式。在云計算平臺上,以MapReduce和Hadoop為代表的非關(guān)系數(shù)據(jù)分析技術(shù),憑借其適合非結(jié)構(gòu)處理、大規(guī)模并行處理和簡單易用等優(yōu)勢,成為大數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的主流技術(shù)。云計算與大數(shù)據(jù)兩種技術(shù)深度融合,大數(shù)據(jù)為云計算提供了廣闊的應用空間,云計算也正在進入以“分析即服務(AaaS)”為主要標志的Cloud 2.0時代[3]。
4.4 物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)為寵物醫(yī)療大數(shù)據(jù)提供了廣泛的來源
物聯(lián)網(wǎng)是依托多種信息獲取技術(shù),包括傳感器、傳感器網(wǎng)絡、RFID(射頻識別)、條形碼、二維碼、多媒體采集技術(shù)等,采集各種信息,通過網(wǎng)絡設(shè)施實現(xiàn)信息傳輸、協(xié)同和處理,實現(xiàn)廣域或大范圍的人與物、物與物之間信息交換需求的互聯(lián)、互通和互操作[13]。通過掃描條形碼、二維碼及RFID標簽,可以實現(xiàn)寵物藥品、用品、醫(yī)療廢棄物等信息的快速錄入。RFID、NFC(Near Field Communication,近場通信)以及低功耗藍牙等技術(shù)還可以應用在寵物身份識別上,通過增加內(nèi)置傳感器,可以讓寵物主人、寵物醫(yī)師迅速獲取寵物的身份信息、生命體征數(shù)值等。目前智能手環(huán)等智能可穿戴設(shè)備已在人類生活中廣泛應用,這些設(shè)備通常使用低功耗藍牙等技術(shù)實現(xiàn)與智能手機的通信,通過手機內(nèi)的APP獲取各類數(shù)據(jù),經(jīng)過特定算法可以計算出每日能量消耗、營養(yǎng)需求以及健康狀態(tài)。這些可穿戴設(shè)備中的傳感器及通信技術(shù),有望在短期內(nèi)遷移到動物領(lǐng)域。
4.5 隱私及權(quán)利保護等方面的立法需要跟進
在大數(shù)據(jù)的采集、傳輸、清洗、存儲及分析過程中,用戶隱私及商業(yè)機密問題是亟需解決的問題。除了使用技術(shù)手段,通過程序自動化地將用戶隱私信息從原始醫(yī)療記錄數(shù)據(jù)中過濾掉之外,更重要的措施應該是通過加強立法。后者尤其適用于寵物醫(yī)院經(jīng)營管理方面的商業(yè)機密數(shù)據(jù)。必須規(guī)定,只有寵物醫(yī)師、寵物醫(yī)院才能使用寵物診療數(shù)據(jù);必須是提供醫(yī)療服務的寵物醫(yī)師和寵物醫(yī)院才能接觸和使用被服務的寵物主人的個人信息;必須有明確授權(quán)才能接觸寵物醫(yī)院的商業(yè)數(shù)據(jù)。
綜上所述,大數(shù)據(jù)技術(shù)雖然還不能完全取代傳統(tǒng)的基于小樣本抽樣統(tǒng)計和分析,但是大數(shù)據(jù)技術(shù)已經(jīng)顯示出其獨特的優(yōu)勢。通過大數(shù)據(jù)分析能更快速、更簡單地發(fā)現(xiàn)寵物醫(yī)療過程中的相關(guān)性,為寵物疾病診療、藥物研發(fā)等提供方向性和策略上的參考,有助于提高動物疫病防控能力和行業(yè)監(jiān)管效率?;ヂ?lián)網(wǎng)尤其是移動互聯(lián)網(wǎng),以及物聯(lián)網(wǎng)、云計算與大數(shù)據(jù)的結(jié)合,未來會有更多的寵物主人、寵物醫(yī)院及寵物被聯(lián)接起來,實現(xiàn)更大程度的信息共享,推動整個行業(yè)的進一步發(fā)展。同時,加強數(shù)據(jù)分析專業(yè)人才的培養(yǎng),改進分析技術(shù)和方法,完善信息管理機制,加強隱私及權(quán)利保護,也是伴隨大數(shù)據(jù)而來的迫切需求。
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吳禮平(1980—),講師,執(zhí)業(yè)獸醫(yī)師、程序員,從事寵物臨床診療方向的教學及科研工作。