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      亞麻類萌發(fā)素蛋白基因LuGLP1-13的克隆及表達(dá)分析

      2017-02-24 10:00:02于瑩袁紅梅程莉莉趙東升陳晶吳建忠張樹權(quán)吳廣文
      中國(guó)麻業(yè)科學(xué) 2017年1期
      關(guān)鍵詞:鹽堿亞麻克隆

      于瑩,袁紅梅,程莉莉,趙東升,陳晶,吳建忠,張樹權(quán),吳廣文

      (黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所,哈爾濱,150086)

      亞麻類萌發(fā)素蛋白基因LuGLP1-13的克隆及表達(dá)分析

      于瑩,袁紅梅,程莉莉,趙東升,陳晶,吳建忠,張樹權(quán),吳廣文*

      (黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所,哈爾濱,150086)

      類萌發(fā)素蛋白(Germin-like proteins,GLPs)是一類防御應(yīng)答蛋白,在植物抗病過(guò)程中發(fā)揮重要作用。前期研究工作發(fā)現(xiàn)一個(gè)類萌發(fā)素蛋白基因(Lus10003267)在亞麻鹽堿脅迫下數(shù)字基因表達(dá)譜(DGE)數(shù)據(jù)中顯著上調(diào),推測(cè)該基因可能與亞麻鹽堿應(yīng)答脅迫有關(guān)。本研究利用亞麻L(zhǎng)us10003267基因序列和RT-PCR方法克隆了亞麻類萌發(fā)素蛋白基因,命名為L(zhǎng)uGLP1-13,其CDS長(zhǎng)687bp,編碼228個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析表明,該蛋白質(zhì)分子量為24.3ku,等電點(diǎn)為5. 77,不穩(wěn)定系數(shù)為23.64,是一種較穩(wěn)定的酸性蛋白。該蛋白具有信號(hào)肽序列,是一種胞外分泌蛋白。多序列比對(duì)及進(jìn)化分析表明,該蛋白具有典型的GLPs家族特征,與蓖麻、毛果楊及胡楊的GLPs家族蛋白親緣關(guān)系相對(duì)最近。熒光定量PCR結(jié)果表明,亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在鹽堿脅迫下被顯著誘導(dǎo)表達(dá)(尤其在堿性鹽脅迫下),推測(cè)該基因可能參與亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫的過(guò)程,這一結(jié)果為進(jìn)一步研究亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的功能和耐鹽堿分子機(jī)制提供了理論依據(jù)。

      亞麻;類萌發(fā)素蛋白;基因克??;鹽堿脅迫;表達(dá)分析

      Thompson等于1980年在研究小麥胚芽特定蛋白時(shí)首次發(fā)現(xiàn)了萌發(fā)素蛋白(Germin proteins)[1]。隨后,許多與小麥萌發(fā)素蛋白結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì)被發(fā)現(xiàn),這類蛋白質(zhì)被命名為類萌發(fā)素蛋白(Germin-like proteins,GLPs)。GLPs是一類由多基因編碼的位于細(xì)胞外基質(zhì)的糖蛋白,通過(guò)離子鍵結(jié)合為穩(wěn)定的低聚物而存在于細(xì)胞外基質(zhì)中[2-3]。GLPs主要以結(jié)構(gòu)蛋白、受體和酶的形式參與植物體內(nèi)各種生理生化反應(yīng)。GLPs能夠清除植物體內(nèi)過(guò)多的活性氧物質(zhì)(Reactive oxygen species,ROS),反應(yīng)產(chǎn)生的H2O2可通過(guò)信號(hào)級(jí)聯(lián)途徑誘導(dǎo)植物的防御反應(yīng),還可通過(guò)纖維素交聯(lián)作用增強(qiáng)細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)。

      GLPs作為病程相關(guān)蛋白(Pathogenesis-related proteins,PRs)家族的成員,與植物應(yīng)答生物脅迫與非生物脅迫密切相關(guān)[4]。GLPs除了具有草酸鹽氧化酶和超氧化物歧化酶等酶類的結(jié)構(gòu)和功能外,還具有受體和結(jié)構(gòu)蛋白的功能。近年來(lái),對(duì)植物GLPs功能的研究多集中在擬南芥等模式植物上。目前,亞麻GLPs基因的克隆及功能分析還沒(méi)有相關(guān)報(bào)道。對(duì)于GLPs參與植物應(yīng)答鹽堿脅迫功能的研究主要集中在中性鹽脅迫方面,堿性鹽脅迫方面還沒(méi)有相關(guān)報(bào)道。

      前期研究工作中,亞麻(Linum usitatissimum L.)鹽堿脅迫下數(shù)字基因表達(dá)譜(DGE)測(cè)序結(jié)果顯示,一個(gè)亞麻類萌發(fā)素蛋白基因(Lus10003267)的表達(dá)在鹽堿脅迫下顯著上調(diào)(尤其是堿性鹽脅迫下),推測(cè)該基因可能與亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫相關(guān)。本研究利用亞麻類萌發(fā)素蛋白基因序列及RT-PCR方法,克隆了亞麻類萌發(fā)素蛋白基因,并利用生物信息學(xué)方法分析了該基因及其編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位及進(jìn)化關(guān)系等信息,結(jié)合熒光定量PCR方法對(duì)該基因在不同鹽堿脅迫時(shí)間及不同鹽堿脅迫濃度下的表達(dá)模式進(jìn)行了分析,旨在為進(jìn)一步研究該基因的功能和亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫的分子機(jī)制奠定理論基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 試驗(yàn)材料及鹽堿脅迫處理

      亞麻種子黑亞19號(hào)由黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所提供。黑亞19號(hào)是從16份亞麻品種篩選出來(lái)的較耐鹽堿的亞麻品種[5]。將亞麻播種于裝有蛭石的花盆中,每隔3 d澆一次1/2 MS營(yíng)養(yǎng)液,待生長(zhǎng)三周后(苗高約10 cm),采用水培方式對(duì)亞麻幼苗進(jìn)行鹽堿脅迫處理。分別采用不同鹽堿脅迫濃度(50 mM、75 mM、100 mM NaCl,5 mM、10 mM、15 mM Na2CO3,30 mM、40 mM、50 mM NaHCO3)處理亞麻材料24 h;分別采用100 mM NaCl、15mM Na2CO3和50 mM NaHCO3分別處理1 h、6 h和24 h。脅迫處理后,全植株取樣,液氮速凍,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.1.2 試劑

      總RNA提取采用北京原平皓生物技術(shù)有限公司植物RNA快速提取試劑盒(HF109-02),反轉(zhuǎn)錄采用東洋紡(上海)生物科技有限公司ReverTra Ace qPCR RT Kit試劑盒(FQS-301),熒光定量PCR采用東洋紡(上海)生物科技有限公司SYBR Green Realtime PCR Master Mix試劑盒(QPK-201T),PCR擴(kuò)增采用東洋紡(上海)生物科技有限公司KOD Plus Neo試劑盒(Lot:266600),電泳指示物(DNA Marker)購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司(TAKARA)。

      1.2 方法

      1.2.1 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的克隆

      提取亞麻總RNA(具體步驟詳見(jiàn)說(shuō)明書),用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA的完整性,紫外分光光度計(jì)(Nanodrop)測(cè)定其純度和濃度。反轉(zhuǎn)錄進(jìn)行第一鏈cDNA的合成(具體步驟詳見(jiàn)說(shuō)明書),得到的cDNA保存于-20℃冰箱中備用。根據(jù)網(wǎng)上公布的亞麻GLP基因(Lus10003267)的序列,利用Primer5.0軟件設(shè)計(jì)特異引物(表1)。PCR反應(yīng)體系(20μl):2μl 10×Buffer(含Mg2+),1μl上游引物(10μmol/L),1μl下游引物(10μmol/L),2μl dNTP(10 mmol/L),1μl cDNA模板(20 ng/μl),1μl Taq酶(5U),12μl ddH2O。PCR反應(yīng)程序:94℃5 min;94℃30 s,60℃30 s,72℃2 min(30個(gè)循環(huán));72℃10 min。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,引物合成及基因測(cè)序工作由蘇州金唯智生物科技有限公司完成。

      表1 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因克隆及熒光定量PCR所用引物Tab.1 Primer sequences of flax LuGLP1-13 gene and actin gene

      1.2.2 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因序列生物信息學(xué)分析

      利用在線程序protparam(http://www.expasy.org/tools/protparam.html)對(duì)LuGLP1-13蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)進(jìn)行分析。利用在線程序SOPMA(http://npsa-pbil.ibcp.Fr)對(duì)LuGLP1-13蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)。利用在線程序CELLO v.2.5 server(http://cello.life.nctu.edu.tw/)對(duì)LuGLP1-13蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位進(jìn)行分析。利用在線程序SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對(duì)LuGLP1-13蛋白質(zhì)進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè)。利用DNAMAN軟件對(duì)亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白質(zhì)序列進(jìn)行多序列比對(duì)分析。利用MEGA v5軟件將41個(gè)其他植物GLPs蛋白質(zhì)與亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白質(zhì)構(gòu)建進(jìn)化樹。

      1.2.3 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因表達(dá)模式分析

      以組成型表達(dá)亞麻Actin基因作為內(nèi)參對(duì)照,根據(jù)克隆得到的LuGLP1-13基因序列,利用Primer5.0軟件設(shè)計(jì)亞麻熒光定量PCR引物(表1),由蘇州金唯智生物科技有限公司合成。先通過(guò)普通PCR擴(kuò)增判斷引物的特異性,擴(kuò)增產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳。選擇最佳退火溫度,確保沒(méi)有引物二聚體產(chǎn)生后,按該退火溫度進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增。應(yīng)用ABI7500熒光定量PCR儀,以各取樣點(diǎn)的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系(20μl):10μl50×SYBRGreen Mix,0.1μl 50×ROX,1μl cDNA模板(20 ng/μl),2μl dNTP(10 mmol/L),1μl上游引物(10μmol/L),1μl下游引物(10μmol/L),4.9μl ddH2O。反應(yīng)程序:95℃1min,95℃30 s,58℃30 s,72℃30 s,35個(gè)循環(huán),于72℃收集熒光,反應(yīng)結(jié)束后分析熒光值變化曲線和融解曲線,得到相應(yīng)的Ct值。采用以各取樣時(shí)間點(diǎn)亞麻Actin基因的量為標(biāo)準(zhǔn)來(lái)確定目標(biāo)基因的相對(duì)表達(dá)量。每個(gè)反應(yīng)做3個(gè)試驗(yàn)重復(fù)和3個(gè)技術(shù)重復(fù),根據(jù)Ct值的大小,采用2-△△CT算法[6]計(jì)算表達(dá)量;采用SPSS16.0軟件中的單因素方差分析法(One-Way Anova)對(duì)表達(dá)量進(jìn)行差異顯著性分析,P<0.05表示差異顯著,P<0.01表示差異極顯著。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的克隆

      從鹽堿脅迫處理后的亞麻全植株中提取總RNA,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖1A),用紫外分光光度計(jì)測(cè)定280 nm,260 nm和230 nm波長(zhǎng)下吸光值,同時(shí)計(jì)算A260/A280和A260/A230的比值。結(jié)果表明,28S rRNA電泳條帶的亮度大于18S rRNA條帶,兩條條帶很清晰的分開(kāi),所得到的RNA比較完整??俁NA濃度為112 ng/μl,A260/A280為1.95,A260/A230為2.05,所提取的RNA基本上沒(méi)有雜質(zhì)的污染,可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。將提取的RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,利用基因特異引物和RT-PCR方法,以cDNA為模板做PCR擴(kuò)增得到目的基因產(chǎn)物,并進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖1B)。結(jié)果表明,克隆得到1個(gè)約700 bp的目的條帶,將PCR產(chǎn)物切膠回收并測(cè)序。測(cè)序結(jié)果顯示所得條帶為687 bp,后續(xù)的生物信息學(xué)分析表明,此序列編碼GLP蛋白,故命名為L(zhǎng)uGLP1-13。

      圖1 亞麻總RNA電泳圖及LuGLP1-13基因的PCR擴(kuò)增電泳圖Fig.1 Electrophoretogram of total RNA of flax and LuGLP1-13 gene amplification

      2.2 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因及編碼蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析

      2.2.1 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因及編碼蛋白質(zhì)序列分析

      將亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的測(cè)序結(jié)果與網(wǎng)上公布的Lus10003267的序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明LuGLP1-13基因與Lus10003267的mRNA序列在編碼區(qū)第600個(gè)核苷酸的位置存在1個(gè)SNP的差異(T變?yōu)镃),該SNP并沒(méi)有導(dǎo)致氨基酸序列的變化。LuGLP1-13基因長(zhǎng)度為687 bp,編碼228個(gè)氨基酸。理化性質(zhì)分析結(jié)果表明LuGLP1-13蛋白質(zhì)分子量為24.3 ku,等電點(diǎn)為5.77,不穩(wěn)定系數(shù)為23.64,說(shuō)明它是一種較穩(wěn)定的酸性蛋白質(zhì)。信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果表明LuGLP1-13的N端具有信號(hào)肽,可能的剪切位點(diǎn)位于第22和第23個(gè)氨基酸殘基之間,亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示它定位在細(xì)胞外或細(xì)胞膜上,推測(cè)LuGLP1-13蛋白質(zhì)是一種胞外分泌蛋白(圖2)。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明LuGLP1-13蛋白質(zhì)中α-螺旋(H)、β-折疊(E)、延伸鏈(T)和無(wú)規(guī)則卷曲(C)所占百分比分別為22.37%、30.7%、12.72%和34.21%,屬于混合型蛋白。

      圖2 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的信號(hào)肽預(yù)測(cè)及亞細(xì)胞定位分析Fig.2 Signal peptide prediction and subcellular localization of LuGLP1-13 gene in flax

      2.2.2 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的序列比對(duì)及進(jìn)化分析

      將亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白質(zhì)序列與擬南芥AtGLP1-13(GL113_ARATH)[7]、花生AhGLP1-1(ADD71877)[8]、大麥HvGLP1a(ABG46232)[9]、豌豆PsGLP(CAB65369)[10]、杜鵑RmGLP1(BAG75122)[11]的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行多重序列比對(duì)(圖3)。結(jié)果表明,六種植物的GLPs均具有三個(gè)高度保守的寡肽,分別命名為Box A、Box B、BoxC。Box A、B、C的保守氨基酸序列分別為QDXCVA-、G-N-PH-HPR--EX--XX-G、GXXHFQ-N-G,其中“-”表示任意氨基酸,“X”為疏水氨基酸。Box B和Box C中的三個(gè)組氨酸(His,H)和一個(gè)谷氨酸(Glu,E)殘基能結(jié)合金屬離子,與GLPs的SOD活性密切相關(guān)。在N端都具有一個(gè)信號(hào)肽,用于蛋白定位,因?yàn)镚LPs屬于胞外分泌蛋白。

      圖3 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白與其他植物GLPs蛋白的多重序列比對(duì)Fig.3 Multiple alignment of amino acid sequence of LuGLP1-13 and other plant GLPs

      將亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白序列與41個(gè)植物GLPs蛋白序列構(gòu)建進(jìn)化樹(圖4)。這41個(gè)GLPs蛋白來(lái)自13個(gè)不同物種,其中擬南芥的成員有26個(gè)。進(jìn)化樹分析表明LuGLP1-13蛋白與GLP亞家族1的蛋白都聚類到了一個(gè)大類中,與亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白親緣關(guān)系最近的蓖麻、毛果楊和胡楊的GLP蛋白,可能是由于亞麻與蓖麻、毛果楊和胡楊都屬于金虎尾目,所以蛋白的序列結(jié)構(gòu)相近。

      圖4 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.4 Phylogenetic tree of the amino acid sequence of LuGLP1-13 and GLPs from other plant species

      2.3 亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因鹽堿脅迫下的表達(dá)模式分析

      利用熒光定量PCR方法對(duì)亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在不同鹽堿脅迫種類不同鹽堿脅迫時(shí)間下的表達(dá)模式進(jìn)行了研究(圖5)。結(jié)果表明,亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在100 mM NaCl脅迫下呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢(shì),6 h表達(dá)量最高,表達(dá)量大約是對(duì)照的100倍,1 h和6 h的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著(圖5A)。在15 mM Na2CO3和50 mM NaHCO3脅迫下該基因的表達(dá)隨脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)而增加,24 h的表達(dá)量分別是對(duì)照的1500倍及6000倍。其中15mM Na2CO3脅迫6h和24 h的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著;50mM NaHCO3脅迫6h的表達(dá)量與對(duì)照相比差異顯著,脅迫24 h的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著(圖5B-C)。

      圖5 不同鹽堿脅迫時(shí)間下亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的表達(dá)模式分析Fig.5 Expression levels of LuGLP1-13 gene under different saline-alkaline stress time

      利用熒光定量PCR方法對(duì)亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在不同鹽堿脅迫種類不同鹽堿脅迫濃度下的表達(dá)模式進(jìn)行了研究(圖6)。結(jié)果表明,亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在不同濃度NaCl脅迫下呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢(shì),在50 mM時(shí)表達(dá)量最高,表達(dá)量大約是對(duì)照的25倍,50 mM與75 mM時(shí)的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著(圖6A)。在不同濃度Na2CO3和NaHCO3脅迫下該基因的表達(dá)隨脅迫濃度的增高而增加,最高表達(dá)量分別是對(duì)照的1500倍及6000倍,其中10 mM Na2CO3脅迫時(shí)的表達(dá)量與對(duì)照相比差異顯著,15 mM Na2CO3脅迫時(shí)的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著;40 mM NaHCO3和50 mM NaHCO3脅迫時(shí)的表達(dá)量與對(duì)照相比差異極顯著(圖6B-C)。亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在鹽堿脅迫下的表達(dá)模式分析表明,該基因受到鹽堿脅迫的誘導(dǎo)表達(dá),尤其是堿性鹽脅迫,其可能參與了亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫的過(guò)程。

      圖6 不同鹽堿脅迫濃度下亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的表達(dá)模式分析Fig.6 Expression levels of LuGLP1-13 gene under different saline-alkaline stress concentrate

      3 討論

      GLPs屬于cupins蛋白家族,幾乎存在于所有植物中,而且家族成員眾多,如擬南芥(Arabidopsis thaliana)有32個(gè)成員,水稻(Oryza sativa)有42個(gè)成員,大麥(Hordeum vulgare)有21個(gè)成員[9]。雖然GLPs家族成員的蛋白質(zhì)序列相似度不高,但都具有共同的結(jié)構(gòu)特征,如Box A、Box B和Box C三個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)區(qū),其中的三個(gè)組氨酸構(gòu)成了萌發(fā)素蛋白的酶活性位點(diǎn),可用來(lái)結(jié)合金屬離子,成熟的GLPs在N端都有一個(gè)能幫助蛋白質(zhì)分泌到細(xì)胞外的信號(hào)肽[2,12]。本研究通過(guò)RTPCR技術(shù)獲得了一個(gè)亞麻的類萌發(fā)素蛋白基因LuGLP1-13,生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)該基因所編碼的蛋白在N末端具有一段信號(hào)肽序列,還具有Box A、Box B和Box C三個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)區(qū)和三個(gè)組氨酸殘基,初步推斷LuGLP1-13基因是典型的植物GLPs蛋白家族基因。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明該蛋白與蓖麻、毛果楊和胡楊等類萌發(fā)素蛋白屬于相同的進(jìn)化分支。

      類萌發(fā)素蛋白作為一種植物防御應(yīng)答蛋白,在植物抗病過(guò)程中起重要作用。因此,對(duì)植物GLPs功能的研究大多集中在抗病方面。近年來(lái)的研究表明,GLPs也是一類參與植物對(duì)逆境脅迫響應(yīng)的重要基因,可受多種非生物脅迫的誘導(dǎo)。Komatsu等研究發(fā)現(xiàn),大豆在淹水脅迫時(shí),四個(gè)大豆GLPs前體表達(dá)下調(diào)[13]。Pinheiro等研究發(fā)現(xiàn),白羽扇豆在連續(xù)干旱13 d后一個(gè)GLP(gi1171937)表達(dá)量開(kāi)始積累[14]。Membré等研究發(fā)現(xiàn),三個(gè)擬南芥GLPs基因(AtGER1、AtGER2、AtGER3)分別在煙草中異源表達(dá)后都增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因煙草對(duì)高溫脅迫的抗性[15]。Lu等研究發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)GmGER9的轉(zhuǎn)基因煙草與對(duì)照相比具有較高的耐鹽能力[16]。本研究的熒光定量PCR結(jié)果顯示,亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因的表達(dá)受到鹽堿脅迫的誘導(dǎo)。在中性鹽NaCl脅迫下,呈先升高后降低的趨勢(shì)。在堿性鹽Na2CO3和NaHCO3脅迫下呈上調(diào)表達(dá)的趨勢(shì),而且表達(dá)量明顯高于NaCl脅迫,說(shuō)明該基因在亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫過(guò)程中發(fā)揮重要作用,尤其是堿性鹽脅迫下。不同鹽堿脅迫時(shí)間的研究結(jié)果表明,LuGLP1-13基因一般在鹽堿脅迫后6 h時(shí)表達(dá)量迅速增加,說(shuō)明該基因的表達(dá)不是亞麻對(duì)鹽堿脅迫瞬間的應(yīng)激反應(yīng)。不同鹽堿脅迫濃度的研究結(jié)果表明,在低濃度時(shí)LuGLP1-13基因的表達(dá)量隨濃度的增加而增大(如Na2CO3和NaHCO3脅迫),高濃度時(shí)隨濃度的增加而減少(如NaCl脅迫),說(shuō)明該基因的表達(dá)在一定的鹽堿脅迫濃度下達(dá)到一個(gè)相對(duì)平衡,平衡破壞后表達(dá)量會(huì)下降。推測(cè)該基因參與亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫的途徑是鹽堿脅迫在脅迫初期會(huì)形成離子脅迫和滲透脅迫,同時(shí)植物體內(nèi)會(huì)積累大量ROS,脅迫后期引起氧化脅迫(蛋白質(zhì)的氧化和脂質(zhì)的過(guò)氧化)。鹽堿脅迫初期,LuGLP1-13基因的表達(dá)量會(huì)增加,主要通過(guò)SOD、OXO、AGPPase等抗氧化系統(tǒng)幫助亞麻進(jìn)行體內(nèi)解毒,清除ROS,從而緩解脅迫帶來(lái)的損傷。但當(dāng)脅迫到達(dá)一定濃度和時(shí)間后,LuGLP1-13基因的表達(dá)量會(huì)下降,因?yàn)閬喡轶w內(nèi)的平衡遭到嚴(yán)重破壞,已經(jīng)不能通過(guò)大量表達(dá)該基因進(jìn)行損傷的修復(fù),同時(shí)大量表達(dá)可能會(huì)給植物帶來(lái)更大的負(fù)擔(dān),所以后期表達(dá)量會(huì)下降。因此,GLPs可能在植物應(yīng)答鹽堿脅迫的過(guò)程中扮演著重要的角色,但這還需要我們提供更多的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)加以證明。對(duì)亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因今后可以在以下幾方面展開(kāi)深入研究:(1)利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)及RNA干擾技術(shù)對(duì)亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因功能進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證;(2)結(jié)合酵母雙雜交系統(tǒng)或GST-pulldown技術(shù),對(duì)LuGLP1-13基因參與亞麻鹽堿脅迫應(yīng)答調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的上下游元件進(jìn)行篩查,從而確定亞麻L(zhǎng)uGLP1-13基因在調(diào)控通路中的作用;(3)對(duì)亞麻GLP基因家族其他成員進(jìn)行研究,分析各成員在亞麻應(yīng)答鹽堿脅迫過(guò)程中的作用。

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      Cloning and Expression Analysis of LuGLP1-13 Gene of Flax

      Yu Ying,Yuan Hongmei,Cheng Lili,Zhao Dongsheng,Chen Jing,Wu Jianzhong,Zhang Shuquan,Wu Guangwen
      (Institute of Industrial Crops,Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150086,China)

      Germin-like proteins(GLPs)is a kind of defense response gene,which plays an important role in the process of plant disease resistance.In the previous study,a GLPs gene(Lus10003267)was significantly up-regulated under saline-alkaline stress by digital gene expression in flax,suggesting that this genemay be participated in saline-alkaline stress response.In this study,the Lus10003267 gene was cloned by RT-PCR and named as LuGLP1-13.The CDS of this gene was 687bp,encoding 228 amino acids.Bioinformatics analysis showed that themolecular weight of the protein was 24.3ku,the isoelectric point was 5.77,and the unstable coefficient was 23.64,which was a relatively stable acidic protein.LuGLP1-13 has a signal peptide sequence,which is a kind of extracellular proteins.Multiple sequence alignment and phylogenetic analysis showed that the protein has a typical GLPs family characteristic,and it had the closest relationship with Ricinus communis,Populus trichocarpa and Populus euphratica GLPs.The results of qRT-PCR showed that the LuGLP1-13 gene wassignificantly induced under saline-alkaline stress(especially the alkaline salt stress),suggesting that this genemay be involved in the response process to saline-alkaline stress.This study provided theoretical basis for further study on the function of LuGLP1-13 gene and themolecularmechanism of salinealkaline tolerance in flax.

      flax;germin-like proteins;gene cloning;saline-alkaline stress;expression analysis

      S563.2

      :A

      1671-3532(2017)01-0012-07

      2016-09-07

      黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士科研啟動(dòng)金(201507-41);國(guó)家麻類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-19-S03)

      于瑩(1981-),助理研究員,博士,主要從事亞麻分子育種研究。E-mail:yuying_1981_0451@163.com

      *

      :吳廣文(1964-),研究員,主要從事亞麻遺傳育種研究。E-mail:wuguangwenflax@163.com

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