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      PCR檢測對蝦白斑綜合征病毒的組織特異性

      2017-07-25 09:37:59張燕飛簡賀君謝俊剛
      安徽農(nóng)學通報 2017年13期

      張燕飛+簡賀君+謝俊剛

      摘 要:該研究提取了95%酒精保存的病蝦組織(鰓、肌肉、表皮、附肢和復眼)的基因組總DNA,并進行了對蝦白斑綜合征病毒的PCR檢測。瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,病蝦組織(鰓、肌肉、表皮、附肢和復眼)有輕微的跑帶現(xiàn)象,鰓和肌肉比表皮、附肢和復眼的基因組總DNA電泳條帶亮。PCR檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn),對蝦不同組織的陽性檢出率高低順序如下:鰓>肌肉=表皮>附肢>復眼。研究結(jié)果說明,鰓和肌肉可作為對蝦白斑綜合征病毒PCR檢測的合適部位。

      關(guān)鍵詞:對蝦白斑綜合征病毒;PCR;組織特異性

      中圖分類號 S945 文獻標識碼 A 文章編號 1007-7731(2017)13-0132-02

      對蝦白斑綜合癥病毒(White spot syndrome virus,WSSV),屬線頭病毒科(Nimaviridae)白斑病毒屬(Whispovirus)。該病毒曾被誤以為桿狀病毒,曾被稱為皮下及造血壞死桿狀病毒等[1]。對蝦白斑綜合病毒可以引起對蝦嚴重的傳染病-白斑綜合征(俗稱白斑?。?,20世紀90年代以來一直嚴重威脅著全世界對蝦的養(yǎng)殖安全。該病毒誘發(fā)疾病的特點是發(fā)病急、發(fā)病率高、死亡速度快。病蝦停止攝食,部分瀕死蝦甲殼出現(xiàn)白色斑點,白斑綜合征因此得名。世界動物衛(wèi)生組織(OIE)將其列為強制通報疫病,我國將其列為一類動物疫病[1]。近年來,隨著養(yǎng)殖環(huán)境的惡化,對蝦病毒性疾病頻繁暴發(fā),嚴重影響了對蝦養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。

      對蝦養(yǎng)殖是廣東省沿海地區(qū)的一個重要產(chǎn)業(yè),由于WSSV致病性強、危害性大、流行范圍廣,建立特異、敏感、快速的檢測系統(tǒng)極為重要。WSSV檢測方法有多種,如現(xiàn)場快速診斷、常規(guī)組織學、電鏡、免疫學、PCR和原位雜交等。PCR具有特異性和敏感性都很高的特點,是檢測WSSV的重要手段。因此,本文對PCR檢測對蝦白斑綜合征病毒的組織特異性進行分析,為實現(xiàn)對蝦養(yǎng)殖中對白斑綜合征病毒的監(jiān)控打下基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 病料 病蝦取自廣東省江門市對蝦養(yǎng)殖場,病蝦為疑似白斑綜合癥、瀕死的南美白對蝦,用95%乙醇保存,運回實驗室用于檢測。

      1.2 試劑和引物 Tissue DNA Kit D3396購自美國OMEGA公司;Easy PureTM Quick Gel Extraction Kit和Easy PureTM Plasmid MiniPrep Kit購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;Ex Taq DNA聚合酶、dNTP、10×buffer、氯化鎂(25mmol/L)和電泳樣品緩沖液均購自TaKaRa公司;引物由上海生物工程有限公司合成(表1)。

      1.4 基因組總DNA的檢測 將6μL基因組總DNA和2μL電泳樣品緩沖液混勻后,加入凝膠孔中,5V/cm電泳約30min,用凝膠成像儀拍照并判斷結(jié)果。

      1.5 PCR鑒定 PCR反應總體積為100μL,其中含10×buffer 10μL、dNTP 2μL、氯化鎂10μL、引物F1和R1各2.5μL、滅菌雙蒸水62μL和待測樣品10μL。將以上反應混合液混勻后稍離心,設置反應條件為:94℃預變性4min,然后94℃ 1min,55℃ 1min,72℃ 2min,30個循環(huán);72℃延伸10min,最后4℃保溫。同時設立陽性、陰性和空白對照。取反應產(chǎn)物5μL于含有溴化乙錠的0.8%瓊脂糖凝膠。第一次PCR后,如結(jié)果為陽性,根據(jù)陽性的強弱作10~1000稀釋,如結(jié)果為陰性,則不作稀釋,取10μL作為第二次PCR反應的模板。同時設立陽性、陰性和空白對照。按照1.6分別加入反應組分及引物F2和R2各2.5μL,進行第二次PCR。

      1.6 瓊脂糖電泳 將6μL樣品和2μL電泳樣品緩沖液混勻后,加入凝膠孔中,5V/cm電泳15~30min,用凝膠成像儀拍照并判斷結(jié)果。第一次PCR擴增,陽性對照會得到一條大小1447bp的DNA片段,陰性和空白對照沒有該核酸條帶,第二次PCR后,陽性對照會得到一條大小941bp的DNA片段,陰性和空白對照沒有該核酸條帶。待測樣品2次PCR均能得到和陽性對照同樣大小的DNA片段,送上海生物工程有限公司測序,并與NCBI上的對蝦白斑病毒序列進行比對,序列相似性在98%以上判為陽性;若兩次PCR均無目的帶或測序不對者判為陰性。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 基因組總DNA的檢測結(jié)果 為了檢測組織提取的基因組總DNA降解情況,將提取的DNA進行瓊脂糖凝膠電泳。結(jié)果顯示鰓、肌肉、表皮、附肢和復眼都有輕微的跑帶現(xiàn)象,鰓和肌肉比表皮、附肢和復眼的基因組總DNA條帶亮。

      2.2 PCR檢測結(jié)果 應用上述方法對50尾病蝦的不同組織進行PCR檢測,凝膠電泳和測序結(jié)果顯示,鰓的陽性檢出率為98%;肌肉和表皮的陽性檢出率均為90%;附肢的陽性檢出率為76%;復眼的陽性檢出率為70%(表2)。

      3 討論

      用凝膠電泳對不同組織提取的基因組總DNA質(zhì)量進行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)鰓、肌肉、表皮、附肢和復眼都有輕微的跑帶現(xiàn)象,鰓和肌肉比表皮、附肢和復眼的基因組總DNA條帶亮。試驗中存在跑帶現(xiàn)象,這說明用95%乙醇保存的樣品基因組總DNA有輕微降解。用液氮保存樣品,基因組總DNA降解最少。然而,大容積液氮罐在野外取樣中攜帶不便,存在氣體外泄、人員凍傷等隱患,小容積液氮罐氣體容易揮發(fā),保持時間短。因此液氮凍存不適用于長途野外樣品采集工作。95%乙醇溶液配制簡單,攜帶方便,是較佳的野外取樣保存方法。

      本次研究中發(fā)現(xiàn),對蝦不同組織的陽性檢出率高低順序如下:鰓>肌肉=表皮>附肢>復眼。有研究指出WSSV先感染宿主血細胞,再通過血液循環(huán)將病毒粒子傳播到宿主體內(nèi)的其他組織[2]。WSSV感染的細胞主要分布在外胚層和中胚層起源的組織,如鰓、表皮、肌肉、前腸、后腸、胃、性腺、淋巴組織、心臟、觸角腺以及神經(jīng)系統(tǒng)的相關(guān)細胞等。由于甲殼動物特殊的攝食和呼吸方式,水中的病毒粒子可以經(jīng)鰓部感染宿主,而鰓也被公認是WSSV感染較嚴重的部位。在本次研究中,復眼的陽性檢出率最低。Lo等[3]對帶復眼的眼柄進行PCR檢測,結(jié)果為陰性,只有去除復眼的眼柄才為陽性,因此他推測對蝦的復眼可能含有某種抑制劑,導致結(jié)果出現(xiàn)假陰性。

      通過本研究,建議在野外可用95%乙醇保存對蝦白斑綜合征病料樣品,鰓和肌肉可作為WSSV PCR檢測的合適部位。

      參考文獻

      [1]陳愛平,江育林,錢冬,等.白斑綜合征[J].中國水產(chǎn),2010(10):64-65.

      [2]Di Leonardo V A,Bonnichon V,Roch P,et al.Comparative WSSV infection routes in the shrimp genera Marsupenaeus and Palaemon[J].Journal of Fish Diseases,2005,28(9):565-569.

      [3]Lo C F,Leu J H,Ho C H,et al.Detection of baculovirus associated with white spot syndrome(WSBV)in penaeid shrimps using polymerase chain reaction[J].Diseases of Aquatic Organism,1996,25:133-141. (責編:張宏民)

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