朱華樑

9月12日，浪潮聯(lián)合英特爾在北京發(fā)布新一代基因一體機浪潮GeneEngine M2。該基因一體機由浪潮研發(fā)，集成基因分析解決方案BIGstack，融合英特爾最新的計算與加速技術，實測數(shù)據(jù)顯示出全基因組分析性能較上一代產(chǎn)品可最大提升3倍以上。

浪潮新一代基因一體機GeneEngine M2基于英特爾BIGstack架構，內(nèi)置最新的GATK3.8版本和Cromwell/WDL流程管理系統(tǒng)，實測數(shù)據(jù)顯示，采用雙路新一代Intel Xeon Gold處理器的浪潮基因一體機M2，關鍵業(yè)務流程序列比對和查找突變運行時間較上一代分別縮短23%和37%，而采用基于Intel Arrial10芯片的浪潮F10A FPGA卡搭配FalconComputing加速GATK的浪潮基因一體機M2，全基因分析流程時間較上一代可提升3.4倍。

當前，隨著高通量測序技術的飛速發(fā)展，單次測序數(shù)據(jù)量得到大幅提升，這為后端的基因數(shù)據(jù)計算處理帶來很大挑戰(zhàn)。以2017年illumina推出NovaSeq為例，單次運行40小時即可最多檢測 48 個人類基因組伴隨產(chǎn)生 6Tb 數(shù)據(jù)，而之前要完成單人的全基因組數(shù)據(jù)處理一般需要5天時間，基于浪潮新一代基因一體機M2，采用BIGstack集成方案配合最新的計算加速技術，使得全基因組數(shù)據(jù)處理時間可以大大縮短。

浪潮人工智能和高性能服務器產(chǎn)品部總經(jīng)理劉軍表示：“新一代浪潮基因一體機可以更快更好地滿足處理客戶本地基因數(shù)據(jù)分析的需求，并提供更好的用戶體驗和出色的性能，從解決基因分析的效率問題入手，進一步加速精準醫(yī)療的發(fā)展。”endprint