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      基于改進(jìn)模糊C均值算法的頸動脈超聲圖像分割

      2018-01-19 06:16:24張琦珺滕建輔
      關(guān)鍵詞:輪廓頸動脈灰度

      李?鏘,張琦珺,關(guān)?欣,滕建輔

      ?

      基于改進(jìn)模糊C均值算法的頸動脈超聲圖像分割

      李?鏘,張琦珺,關(guān)?欣,滕建輔

      (天津大學(xué)微電子學(xué)院,天津 300072)

      超聲圖像分割;內(nèi)中膜厚度測量;模糊C均值;隱馬爾可夫隨機(jī)場模型;感興趣區(qū)域

      心血管疾病(cardiovascular diseases,CVDs)是危害人類生命健康的首要因素,需早期發(fā)現(xiàn)、合理干預(yù).CVDs的初期表現(xiàn)為在多種致病因素的作用下,動脈壁中內(nèi)中膜厚度(intima media thickness,IMT)增加的現(xiàn)象.頸部主動脈(common carotid artery,CCA)血管是動脈硬化的常見部位,其位置靠近皮膚表層且近似與皮膚平行,容易測量.相關(guān)研究[1]表明:CCA血管壁的IMT可以作為評估心血管疾病早期病變程度的重要指標(biāo).超聲成像具有實時性、可重復(fù)性、無侵入、成本低、成像快速等優(yōu)點(diǎn),是臨床中頸動脈檢查的首選成像方式.相對其他醫(yī)學(xué)成像方式超聲圖像噪聲較多,由于超聲回波散射的影響,實驗研究中通常選取成像效果較好的遠(yuǎn)端血管壁的內(nèi)中膜結(jié)構(gòu)進(jìn)行測量.超聲圖像中頸動脈血管具有如下特性:①健康血管的內(nèi)中膜厚度在一定距離內(nèi)比較均勻,且血管形態(tài)近似平直;②血管成像橫貫圖像;③遠(yuǎn)端血管壁處于圖像中心靠下的位置;④血管壁和管腔的灰度分別呈現(xiàn)較亮、較暗的特點(diǎn).

      IMT手動測量方法非常耗時,且測試結(jié)果受測量者主觀判斷的影響很大,不適合實驗研究.從1988年P(guān)ignoli等[2]首次提出計算機(jī)輔助IMT測量算法開始,專家學(xué)者提出了多種自動測量方法代替人工手動測量.分析已有的算法,IMT測量通常可分為2個主要步驟:①提取感興趣區(qū)域(region of interesting,ROI);②獲取內(nèi)中膜輪廓.計算機(jī)輔助IMT測量的實現(xiàn)方法涉及多種圖像處理的原理和技術(shù),主要有邊緣檢測[2-3]、活動輪廓模型[4-6]、動態(tài)規(guī)劃[7-8]、霍夫變換[9]、隨機(jī)場模型[10]、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[11-12]及模糊聚類[13]等.在Xu等[9]提出的方案中,使用霍夫變換建立初始內(nèi)中膜輪廓,并采用改進(jìn)的雙Snake(Dual Snake,DS)模型演化初始輪廓,獲取最終的內(nèi)中膜邊界;隨機(jī)場模型的方法是利用鄰近像素進(jìn)行統(tǒng)計建模的方法,Xiao等[10]利用馬爾可夫隨機(jī)場模型迭代初始標(biāo)號場,分割頸動脈圖像;Menchón-Lára等[11]提出一種基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的全自動IMT測量算法,并在此基礎(chǔ)上將自動編碼和深度學(xué)習(xí)引入算法,提升IMT測量的效率[12].從總體上看,計算機(jī)輔助的IMT測量方法精度越來越高,實時性越來越好,人工參與程度越來越低,隨著各方面技術(shù)的發(fā)展,利用計算機(jī)輔助診斷治療的目標(biāo)也越來越近.

      傳統(tǒng)模糊C均值(fuzzy C means,F(xiàn)CM)算法結(jié)合了模糊技術(shù),可以有效地處理醫(yī)學(xué)影像中存在的部分容積效應(yīng),但分割過程存在效率較低、對噪聲敏感等問題,導(dǎo)致使用傳統(tǒng)FCM算法分割超聲頸動脈圖像時不能獲得可靠的分割結(jié)果,因此本文提出一種結(jié)合隱馬爾可夫隨機(jī)場模型(hidden Markov random field,HMRF)和FCM的頸動脈自動分割方法,分割過程無需人工干預(yù).算法包括2個關(guān)鍵步驟:①基于先驗知識自動提取感興趣區(qū)域;②采用基于HMRF改進(jìn)的FCM算法分割圖像,獲取最終內(nèi)中膜輪廓.步驟①是自動分割的前提,步驟②是自動分割的關(guān)鍵.

      1?預(yù)處理

      CCA超聲圖像如圖1所示.方框區(qū)域從上到下的結(jié)構(gòu)依次為管腔、內(nèi)膜、中膜和外膜,其中管腔-內(nèi)膜邊界(lumen-intima interface,LII)與中膜-外膜邊界(media-adventitia interface,MAI)間的距離為IMT.

      本文提出的頸動脈超聲圖像分割流程如圖2所示,其中ROI提取和圖像濾波為預(yù)處理階段,隨后在處理后的圖像上進(jìn)行IMT測量,該測量過程的具體實現(xiàn)為:建立初始內(nèi)中膜輪廓、使用改進(jìn)算法分割圖像并經(jīng)計算獲取IMT.

      圖1?CCA超聲圖像

      圖2?頸動脈超聲圖像分割流程

      1.1?提取ROI

      ROI提取可以提高圖像分割效率,根據(jù)ROI提取過程是否有人工干預(yù),可將現(xiàn)有的IMT測量算法分為兩類:半自動(semi-automatic,SA)測量算法和全自動(fully automatic,F(xiàn)A)測量算法.目前ROI自動提取算法大多僅依據(jù)圖像灰度信息實現(xiàn),這樣的方法存在一定的失誤率,為了在復(fù)雜的背景下快速、準(zhǔn)確地提取ROI,本文提出了一種結(jié)合圖像灰度信息和血管形態(tài)信息的ROI提取算法.算法的具體步驟?如下.

      步驟1?圖像裁剪.原始超聲頸動脈圖像中包含儀器信息、病人信息等對IMT測量無用的文字標(biāo)識,需要去除.文字標(biāo)識位置固定,根據(jù)遠(yuǎn)端血管壁位于圖像中下方的位置特性,選取320×300像素大小的區(qū)域,作為待處理圖像.圖3(a)是裁剪后的超聲圖像.

      ???(1)

      步驟3?閾值處理.理想情況下,超聲圖像血管壁和管腔的灰度差別較大.根據(jù)圖像灰度統(tǒng)計規(guī)律,使用最大類間差(OTSU)算法[14]自動獲取最優(yōu)閾值,然后利用該閾值分割邊緣圖獲取二值圖像,如圖3(c)所示.

      步驟4?形態(tài)學(xué)閉運(yùn)算.為了連接包含大量邊緣的區(qū)域,采用閉形態(tài)學(xué)算子填補(bǔ)二值圖像的孔洞.

      步驟5?驗證區(qū)域.采用連通分量分析法提取二值圖像中各區(qū)域的最小外接矩形和重心坐標(biāo).依據(jù)血管形態(tài)信息篩選檢測到的區(qū)域:血管壁橫跨圖像,所在連通域的外接矩形寬度近似等于圖像寬度;遠(yuǎn)端血管壁區(qū)域重心相對較低,重心縱坐標(biāo)數(shù)值較大.圖3(d)中用“+”號標(biāo)記可能的血管壁區(qū)域,其中紅色“+”號標(biāo)記的區(qū)域為真正的感興趣區(qū)域.

      步驟6?ROI提取.健康頸動脈血管的IMT約在0.5~1.0,mm的范圍內(nèi),對應(yīng)超聲圖像中的約8~16個像素點(diǎn),考慮到血管可能存在彎曲和病變的情況,以遠(yuǎn)端血管壁區(qū)域外接矩形的位置為標(biāo)準(zhǔn),向上、向下分別取20、60個像素,作為ROI的上、下邊界.圖3(e)是遠(yuǎn)端血管壁的ROI圖像.

      1.2?圖像濾波

      ??(2)

      2?IMT測量

      2.1?基于HMRF改進(jìn)的FCM算法

      1973年Dunn[16]提出了基于模糊技術(shù)的FCM聚類算法,隨后被Bezdek等推廣,1999年Ahmed將改進(jìn)的FCM算法應(yīng)用到圖像分割領(lǐng)域,之后出現(xiàn)了許多應(yīng)用于圖像分割的改進(jìn)FCM算法.FCM將模糊技術(shù)融入K均值聚類算法,從本質(zhì)上講FCM算法是通過最小化像素到聚類中心的加權(quán)距離實現(xiàn)圖像分割,該加權(quán)距離又被稱為目標(biāo)函數(shù),其表達(dá)式為

      ???(3)

      ???(4)

      ???(5)

      其中改進(jìn)的距離函數(shù)為

      ???(6)

      ???(7)

      ???(8)

      ?????(9)

      ?????(10)

      ?????(11)

      由式(9)和式(10)可推出

      ??(12)

      至此,可以得到改進(jìn)的距離函數(shù)為

      ???(13)

      2.2?建立初始內(nèi)中膜輪廓

      閾值處理后的二值圖像中包含有效的邊緣信息,利用這一信息追蹤初始內(nèi)中膜邊界.具體步驟如下.

      步驟1?區(qū)域定位.提取對應(yīng)二值圖像的ROI,內(nèi)中膜邊界所在區(qū)域橫跨圖像,其外接矩形寬度近似等于圖像寬度,利用這一先驗信息定位并標(biāo)記兩條內(nèi)中膜邊界所在區(qū)域.

      步驟2?獲取初始輪廓.根據(jù)最小二乘原理分別對已定位的邊緣區(qū)域內(nèi)的像素進(jìn)行擬合,建立LII和MAI的初始輪廓.圖4(a)為初始內(nèi)中膜輪廓,其中上方的虛線為LII初始邊界,下方的虛線為MAI初始邊界.

      需要注意的是,內(nèi)中膜所在區(qū)域的灰度值相對外膜較小,同時超聲圖像較低的分辨率使得二值圖像中LII所在區(qū)域存在不完整甚至消失的情況,此時需要選取MAI區(qū)域進(jìn)行邊界擬合得到初始MAI,并將MAI向上平移到梯度值之和最大的位置作為初始LII的估計.

      圖4?IMT測量

      2.3?獲取最終內(nèi)中膜輪廓

      步驟1?建立初始標(biāo)號場.為實現(xiàn)內(nèi)中膜分割,首先需要建立待分割圖像的初始標(biāo)號場.根據(jù)預(yù)估的初始內(nèi)中膜輪廓位置,將管腔區(qū)域標(biāo)記為1,內(nèi)中膜區(qū)域標(biāo)記為2,其他區(qū)域標(biāo)記為3.初始標(biāo)號場如圖4(b)所示.

      步驟2?獲取初始聚類中心.根據(jù)待測圖像的灰度直方圖峰值檢測思想獲取圖像峰值,通過相似性計算篩選關(guān)聯(lián)圖中像素最多的(聚類數(shù)目)個峰值,計算峰值區(qū)間內(nèi)灰度值的加權(quán)平均作為初始聚類中心.

      步驟3?獲取最終內(nèi)中膜輪廓.使用本文提出的改進(jìn)FCM分割圖像.將頸動脈分割為管腔、內(nèi)中膜和外膜3個部分,如圖4(c)所示,根據(jù)分割結(jié)果標(biāo)記最終內(nèi)中膜輪廓,最終輪廓在圖4(d)中給出.

      2.4?IMT計算

      超聲圖像中的遠(yuǎn)端血管壁通常近似水平,因此采用平均絕對距離(mean absolute distance,MAD)計算IMT,即標(biāo)記為MAI和LII的像素點(diǎn)縱坐標(biāo)差的平均值.

      ???(14)

      3?實驗結(jié)果

      3.1?實驗數(shù)據(jù)

      本文實驗采用的超聲圖像庫由塞浦路斯神經(jīng)研究院(Cyprus Institute of Neurology of Nicosia,Cyprus)提供,共包含來自不同測試者的80張超聲圖像,測試者年齡段分布為26~95歲,平均年齡為54歲.超聲圖像由美國Advanced Technology Laborato-ries 生產(chǎn)的ATL HDI-3000超聲掃描儀采集.該儀器配備了64個高分辨率單元和38,mm的寬帶陣列,采用多元超聲掃描技術(shù),掃描頭的工作頻率范圍為4~7,MHz,傳輸焦距范圍為0.8~1.1,cm,聲學(xué)孔徑為10×8,mm.所采集的圖像分辨率為576像素×768像素,像素灰度級為256,像素密度為16.66像素/mm.為保證IMT測量的準(zhǔn)確性,曼海姆公約建議應(yīng)該在沒有斑塊的遠(yuǎn)端血管壁測量,因此圖像庫中不包含出現(xiàn)斑塊等嚴(yán)重病變的情況.

      3.2?IMT分割質(zhì)量評價方法

      實驗中采用絕對誤差來評估不同測量結(jié)果的一致性,即

      ???(15)

      Person相關(guān)系數(shù)來衡量數(shù)據(jù)集合之間的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)越大,兩個數(shù)據(jù)集合間的相似性越強(qiáng). Pearson相關(guān)系數(shù)定義為

      ???(16)

      3.3?改進(jìn)FCM算法性能分析

      在本文提出的自動IMT測量算法中使用HMRF建立圖像的空間模型,為FCM算法分割圖像提供空間約束.

      為了比較傳統(tǒng)FCM算法與改進(jìn)后FCM算法的分割性能,并說明改進(jìn)算法的穩(wěn)定性,實驗中選取了幾種典型的、成像形態(tài)不理想的血管圖像:血管彎曲程度較高(Ⅰ)、血管壁內(nèi)中膜成像不連續(xù)(Ⅱ)、內(nèi)中膜存在組織間干擾(Ⅲ)以及內(nèi)中膜厚度較薄(Ⅳ).

      在相同的環(huán)境下分別使用兩種算法分割這些血管圖像,分割結(jié)果如圖5所示.對比兩種算法的分割結(jié)果,傳統(tǒng)FCM算法在幾種情況下均存在分割不完整甚至完全失效的情況,從分割結(jié)果無法提取完整內(nèi)中膜邊界信息;相比較來說,本文提出的改進(jìn)FCM算法在4種血管形態(tài)不理想的情況下都能得到較可靠的分割結(jié)果,且由分割結(jié)果能夠容易地獲取較完整的內(nèi)中膜輪廓.實驗結(jié)果表明本文提出的基于HMRF模型改進(jìn)的FCM算法對血管形態(tài)魯棒,適應(yīng)性較強(qiáng),其性能相對傳統(tǒng)算法有較大改進(jìn).

      圖5?不同形態(tài)血管的分割結(jié)果對比

      3.4?IMT測量結(jié)果分析

      用于算法的性能評估的真實IMT數(shù)據(jù)庫,即真實值(ground truth,GT)通過手動測量的方法獲取:由兩名專家(Ex1和Ex2)對圖像庫中的80張頸動脈超聲圖像分別進(jìn)行兩次IMT測量,兩次測量的時間間隔為10,a,取4次測量的平均值作為GT-IMT.

      表1?IMT手動測量結(jié)果

      Tab.1?IMT results of manual measurement

      表2?IMT自動測量結(jié)果

      Tab.2?IMT results of automatic measurement

      圖6?GT-IMT與AS-IMT結(jié)果的散點(diǎn)圖

      圖7?GT-IMT和AS-IMT的Bland-Altman圖

      表3?與已有的算法比較

      Tab.3?Comparison with previous algorithms

      本文設(shè)計的IMT自動測量算法基于血管壁的灰度和形態(tài)特征自動提取ROI,實現(xiàn)了IMT的全自動測量;在圖像分割時,使用HMRF建立圖像的空間模型,并引入FCM算法為聚類過程提供空間約束,改進(jìn)算法圖像噪聲的魯棒性較強(qiáng),在多種復(fù)雜的圖像條件下都能獲得較準(zhǔn)確的分割結(jié)果.與其他幾種算法相比,本文提出的全自動頸動脈超聲圖像分割方法的誤差更小,分割結(jié)果精度相對較高.

      4?結(jié)?語

      本文提出一種基于改進(jìn)FCM算法的超聲頸動脈內(nèi)中膜厚度檢測方法,該方法依據(jù)先驗信息自動提取ROI,減輕了人工提取ROI的負(fù)擔(dān),并采用基于HMRF改進(jìn)的FCM算法分割遠(yuǎn)端血管壁圖像,獲取較準(zhǔn)確內(nèi)中膜輪廓,改進(jìn)FCM算法結(jié)合了FCM算法和HMRF的優(yōu)勢,對圖像噪聲及血管形態(tài)魯棒.本文算法由Matlab開發(fā),在配置為Windows 8.1 Intel Core i7-4790 CPU @3.60,GHz的計算機(jī)上運(yùn)行.實驗中平均每張圖像的處理時間為0.680,2,s,其中ROI提取階段平均耗時0.205,5,s,內(nèi)中膜分割階段平均耗時0.262,7,s,分割算法具有較高的運(yùn)行效率.實驗結(jié)果表明,本文提出的頸動脈內(nèi)中膜自動測量方法分割結(jié)果較準(zhǔn)確,可以為頸動脈內(nèi)中膜厚度的臨床輔助診斷提供幫助.

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      (責(zé)任編輯:王曉燕)

      Segmentation of Carotid Intima Media in Ultrasound Images Using Improved Fuzzy C Means Algorithm

      Li Qiang,Zhang Qijun,Guan Xin,Teng Jianfu

      (School of Microelectronics,Tianjin University,Tianjin 300072,China)

      ultrasound image segmentation;intima-media thickness(IMT)measurement;fuzzy C means(FCM);hidden Markov random field(HMRF)model;region of interest(ROI)

      10.11784/tdxbz201612044

      2016-12-19;

      2017-03-08.

      李?鏘(1974—??),男,博士,教授,liqiang@tju.edu.cn.

      張琦珺,zqjyx@tju.edu.cn.

      國家自然科學(xué)基金資助項目(61471263).

      the National Natural Science Foundation of China(No.,61471263).

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