P443 使用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜法對流感嗜血桿菌進行莢膜分型//Viktor M?nsson, Janet R. Gilsdorf, Gunnar Kahlmeter,等
莢模型流感嗜血桿菌具有型特異性。采用PCR方法對菌株進行莢膜分型是可靠的,但一種更加有效的方法或許更有用。本研究對使用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜法(MALDI-TOF)對菌株莢膜分型進行評估。本調(diào)查涵蓋所有莢膜型分離株(a-f 型和無法分型;n=258)和同基因莢膜轉(zhuǎn)化株(a-d 型)。質(zhì)譜的主成分分析與生物標志物分析結(jié)果顯示呈聚集性,且峰值與莢膜型特異性基因譜系一一對應(yīng)。我們使用31株選擇株建立了一個莢膜分型數(shù)據(jù)模型,用余下的227株分離株對該模型進行驗證,結(jié)果顯示該模型對61株a-f型菌株的分型的靈敏度為100%,特異度為92.2%。為進一步提高特異度,我們建立了包含50株菌株的擴大數(shù)據(jù)模型,使用126株臨床分離株對擴大模型進行盲法驗證,結(jié)果顯示擴大模型對28株b、e、f型莢膜菌株分型的靈敏度為100%,特異度為100%??梢?,使用MALDI-TOF質(zhì)譜法對流感嗜血桿菌進行莢膜分型是十分精確的。
P453 以色列在引入7價和13價肺炎疫苗后出現(xiàn)肺炎鏈球菌12F血清型//Assaf Rokney, Shalom Ben-Shimol, Zinaida Korenman,等
以色列分別于2009年和2010年開始實施7價和13價肺炎疫苗的接種工作。在疫苗引進后的七年來,我們對由肺炎鏈球菌12F血清型(Sp12F)引起的侵襲性肺炎(IPD)進行了前瞻性、人群為基礎(chǔ)的、全國性的動態(tài)監(jiān)測。結(jié)果顯示,2009年7月至2016年6月期間共發(fā)生侵襲性肺炎 4 573次,其中434次(9.5%)由12F血清型引起。小于5歲年齡組由12F血清型引起的侵襲性肺炎發(fā)病率上升最顯著,2009至2010年為1.44/10萬,而2011至2012年高于3.9/10萬;其它年齡組也均有不同程度的上升。在2011至2016年期間,12F血清型為引發(fā)侵襲性肺炎的主要血清型,多對青霉素不敏感(MIC>0.06 μg/mL;MIC50=0.12),且主要為序列型3774,該型僅在以色列發(fā)現(xiàn)(在2000年至2009年間占90%)。實施疫苗接種以來,12F血清型作為優(yōu)勢株所引發(fā)的侵襲性肺炎持續(xù)、急劇上升,該單一血清型的擴張可能不僅僅是一個短暫的暴發(fā)。
P471 風險評估工具在流感大流行前準備工作中的應(yīng)用// Stephen A. Burke, Susan C. Trock
2010年,美國疾病預防控制中心開發(fā)了一種流感風險評估工具(IRAT),用于系統(tǒng)地捕獲和評估當前未在人類中流行的甲型流感病毒相關(guān)信息。流感風險評估工具使用一個多屬性相加模型生成每種病毒的總風險評分。雖然流感風險評估工具不是用來預測下一次甲流大流行,但它能為大流行前準備工作提供決策。
P478 印度應(yīng)用死因推斷量表來確定耐多藥肺結(jié)核患者治療期間死亡的根本原因//Poonam Ramesh Naik, Patrick K. Moonan, Abhay Subhashrao Nirgude,等
在耐多藥肺結(jié)核患者(MDR TB)中,僅不足50%的患者完成治療療程,大多數(shù)耐多藥肺結(jié)核患者因治療過程中死亡而未完成治療。為明確肺結(jié)核本身造成耐多藥肺結(jié)核患者死亡的比例,在2016年1-12月,我們使用結(jié)構(gòu)化的死因推斷工具對死者家屬進行調(diào)查。成立的委員會對死因推斷、死亡證明以及可以從家庭成員獲取的其它醫(yī)學記錄進行綜合分析,以探明患者的根本死因。結(jié)果發(fā)現(xiàn),肺結(jié)核是66%(47/71)死亡患者的根本死因。此外,經(jīng)過綜合分析,我們認為6名因自殺、2名因肺栓塞而死亡的患者的根本死因也是肺結(jié)核。治療過程中死亡意味著治療程序的失敗,制定適當、及時的干預措施的首要環(huán)節(jié)是對死亡原因進行準確了解。
P492 2014-2015年加拿大安大略省多倫多市應(yīng)用基因組測序方法定義機構(gòu)暴發(fā)流感的研究// Derek R. MacFadden, Allison McGeer, Taryn Athey,等
目前對機構(gòu)暴發(fā)流感的臨床定義是否適合尚不清楚。我們對加拿大多倫多2014-2015年流感季節(jié)期間發(fā)生的機構(gòu)暴發(fā)流感進行了回顧性的基因組測序和流行病學分析。通過對38個報告暴發(fā)流感的長期護理機構(gòu)進行調(diào)查,我們對每個機構(gòu)最早提交的2份A型(H3N2)流感陽性樣本進行測序?;蚪M測序結(jié)果顯示,同一暴發(fā)流感機構(gòu)提交的病例樣本在基因序列上大多高度相關(guān)。而包括監(jiān)測樣本在內(nèi)的所有樣本的檢測結(jié)果表明,流感暴發(fā)的傳染源很可能來自廣泛傳播的病毒譜系。通過多數(shù)基因組和血凝素特異性基因的兩兩距離分析能識別流感暴發(fā)時同一機構(gòu)的樣本和不同機構(gòu)的樣本之間的差別閾值;曲線下面積是0.93~0.95。在識別長期護理機構(gòu)暴發(fā)流感時,常規(guī)基因組測序不太可能在目前臨床定義的基礎(chǔ)上提供額外的幫助;但在傳染源調(diào)查中測序可能起到重要作用。
P506 2012-2015年南非肺炎支原體的流行病學和分子學鑒定及特征// Maimuna Carrim, Nicole Wolter, Alvaro J. Benitez,等
2012-2015年期間,我們用PCR方法對南非患有嚴重呼吸系統(tǒng)疾病(SRI)、流感樣疾病患者(ILI)以及對照組的呼吸道樣本進行肺炎支原體檢測,隨后對陽性樣本進行培養(yǎng)和分子鑒定。嚴重呼吸系統(tǒng)疾病患者的肺炎支原體感染率為1.6%,流感樣疾病患者為0.7%,對照組為0.2%(P<0.001)。肺炎支原體陽性者中年齡小于5歲(校正OR=7.1;95%CI=1.7~28.7)和艾滋病病毒感染(校正OR=23.8;95%CI=4.1~138.2)與疾病的嚴重性有關(guān)。嚴重呼吸系統(tǒng)疾病患者中肺炎支原體的歸因危險度為93.9%(95%CI=74.4%~98.5%),流感樣疾病患者中為80.7%(95%CI=16.7%~95.6%)。支原體肺炎患者年平均住院率為28 /10萬。我們觀察到的所有樣本均對大環(huán)內(nèi)酯類藥物敏感,基因型為P1-Ⅰ型、P1-Ⅱ型和一種具有多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列3/6/6/2,3/5/6/2和4/5/7/2的Ⅱ型變異株。
P558 2014-2015年法屬波利尼西亞的登革熱和基孔肯雅熱病毒抗體的血清陽性率調(diào)查// Maite Aubry, Anita Teissier, Michael Huart,等
2014-2015年期間,我們調(diào)查研究了法屬波利尼西亞的登革熱和基孔肯雅熱病毒抗體血清陽性率。學齡兒童登革熱病毒抗體陽性率約為60%,一般人群的陽性率大于83%;2013年寨卡疫情發(fā)生之前,基孔肯雅熱病毒抗體陽性率小于3%,而寨卡疫情發(fā)生后為76%。登革熱病毒群體免疫可能影響寨卡病毒感染和發(fā)病機制。
P562 2011-2015年意大利再現(xiàn)腸道血清型那波利沙門氏菌的分子流行病學分析//Michela Sabbatucci, Anna Maria Dionisi, Patrizio Pezzotti等
在歐洲,人群感染腸道血清型那波利沙門氏菌(Salmonella enterica serovar Napoli)是罕見的。然而,2014-2015年,在意大利沙門氏菌病例中此類感染卻占了5.9%,但其感染源尚屬未知。我們通過分析監(jiān)測數(shù)據(jù)以及比較菌株的遺傳相似性,發(fā)現(xiàn)受污染的蔬菜和地表水可能是人群的感染源。
P579 俄羅斯結(jié)核性脊椎炎患者結(jié)核分枝桿菌的全基因組分析//Ekaterina Chernyaeva, Mikhail Rotkevich, Ksenia Krasheninnikova等
在俄羅斯,通過對71例結(jié)核性脊椎炎患者體內(nèi)的結(jié)核分枝桿菌進行全基因組分析,詳細描述了病原菌株的分布和耐藥表型,并發(fā)現(xiàn)其與已知耐藥突變顯著關(guān)聯(lián)。除了已知的基因因素,我們還發(fā)現(xiàn)了新的遺傳因素也與細菌毒性、致病性和耐藥性相關(guān)。