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      豬繁殖與呼吸綜合征病毒非結(jié)構(gòu)蛋白2研究進(jìn)展

      2018-03-02 08:23:29徐志文
      關(guān)鍵詞:毒力毒株亞型

      趙 軍,徐志文,2,朱 玲,2,*

      (1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,四川 成都 611130; 2.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物疫病與人類健康四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,四川 成都 611130)

      PRRSV是單股正鏈RNA病毒,屬尼多病毒目動(dòng)脈炎病毒科(Arteriviridae)、動(dòng)脈炎病毒屬(Arterivirus)。其基因組全長約15.4 kb,包含10個(gè)ORFs,分別為ORF1a、1b、2a、2b以及ORF3- 5、ORF5a、ORF6- 7。ORF1a在病毒復(fù)制中,先被翻譯成ppla多聚蛋白,ORF1b通過核糖體轉(zhuǎn)移碼轉(zhuǎn)移成pplab多聚蛋白。之后分別被水解為Nsp1- 8和Nsp9- 12等至少16種非結(jié)構(gòu)蛋白[1-3]。PRRSV感染早期Nsp1β、Nsp2、Nsp4、Nsp7α、Nsp7β、Nsp8定位于細(xì)胞核周圍,原位標(biāo)記顯示它們共定位的位置為病毒RNA復(fù)制場所[4]。

      Nsp2基因是PRRSV遺傳流行病學(xué)監(jiān)測和演化的重要基因,當(dāng)前PRRSV多亞型毒株在Nsp2基因區(qū)段均有不同程度的基因插入和缺失。所以關(guān)于Nsp2蛋白與PRRSV毒力、致病性的關(guān)系、對細(xì)胞的侵襲能力的研究越來越多,也越來越深入。Nsp2是PRRSV最大的復(fù)制蛋白,其基因長度約為2.9 kb,不同毒株序列之間變異明顯且基因全長不一。Nsp2保守性最差,美洲型毒株和歐洲型毒株序列比對顯示,氨基酸序列同源性僅為32%,抗原表位眾多,而表位集中區(qū)域容易發(fā)生基因變異。

      目前已鑒定Nsp2有4個(gè)主要功能區(qū):N端的半胱氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域(PL2);功能尚未清楚的中間高變區(qū);近C端的高親水性跨膜區(qū);功能尚不明確的C端富含半胱氨酸殘基保守區(qū)。Nsp2蛋白具有順式和反式2種酶切活性,所以酶切后能夠產(chǎn)生7種Nsp2亞型(Nsp2a、Nsp2b、Nsp2c、Nsp2d、Nsp2e、Nsp2f、Nsp2TF)。其中Nsp2TF是最近發(fā)現(xiàn)的能影響PRRSV復(fù)制的新亞型(約占Nsp2的2/3)。這些Nsp2使用相同的N末端和不同的C末端[3,5]。Nsp2是一個(gè)與病毒相關(guān)的PRRSV蛋白,研究表明PRRSV的復(fù)制過程中會(huì)出現(xiàn)大小不一的Nsp2亞類,它們共享PL2區(qū)域的227個(gè)氨基酸的N端。產(chǎn)生的這些不同分子量的Nsp2可能存在不同的功能,大分子Nsp2亞型蛋白在感染早期出現(xiàn),對病毒的早期復(fù)制可能發(fā)揮著關(guān)鍵作用[6-7]。Nsp2以多個(gè)亞型存在于病毒包膜上,在病毒包裝時(shí)與病毒的包膜融合有關(guān),還存在于細(xì)胞突起上,與細(xì)胞之間的聯(lián)系密切相關(guān),其所誘導(dǎo)的體液免疫所產(chǎn)生的抗體與結(jié)構(gòu)蛋白N蛋白形成的免疫水平相當(dāng)。其N末端具有保守的催化N末端半胱氨酸和組氨酸殘基的活性,并被認(rèn)為具有半胱氨酸蛋白酶的活性[8]。此外,Nsp2還是Nsp4絲氨酸蛋白酶的輔助因子,與細(xì)胞和組織嗜性有關(guān),在病毒復(fù)制過程中,參與多聚蛋白的裝配[9]。

      當(dāng)前,PRRS對養(yǎng)豬業(yè)造成的沖擊正逐漸加重,特別是2013年以后國內(nèi)多地相繼報(bào)道發(fā)現(xiàn)Nsp2缺失131aa的NADC30類似毒株,使得國內(nèi)PRRSV的防控變得更加復(fù)雜。Nsp2是不同亞型毒株之間變異最明顯也最沒有規(guī)律的蛋白,當(dāng)前對地區(qū)PRRSV的流行病學(xué)調(diào)查及毒株遺傳進(jìn)化分析多以Nsp2基因?yàn)榘谢颉,F(xiàn)有的研究結(jié)果表明,當(dāng)前NADC30類似毒株多發(fā)現(xiàn)于河北、河南、山東、遼寧等省,南方地區(qū)還未見報(bào)道,但基于當(dāng)前交通便利、生豬流動(dòng)大等現(xiàn)狀,NADC30類似毒株何時(shí)能傳入南方,能造成多大困擾還未可知。因此,針對新流行毒株的檢測及其變異后的Nsp2在病毒復(fù)制、致病力和參與免疫調(diào)控方面的研究是很有必要的。

      1 Nsp2的高變異性

      Nsp2在非結(jié)構(gòu)蛋白中變異性最大,點(diǎn)突變、插入和缺失是PRRSV Nsp2的常見突變。對中國的PRRSV進(jìn)行調(diào)查分析,Nsp2基因具有廣泛的變異性[10]。2006年,我國爆發(fā)了高致病性PRRS(HP- PRRS),2008年,美國報(bào)道發(fā)現(xiàn)一種新亞型的HP- PRRSV(NADC30),通過Nsp2的基因序列比較結(jié)果顯示,HP- PRRSV和經(jīng)典PRRSV比較在Nsp2高變區(qū)存在30 aa左右的連續(xù)缺失[11],而NADC30類型毒株較HP- PRRSV在Nsp2高變區(qū)存在131 aa左右的不連續(xù)缺失[12-14],從GenBank中收錄的HP- PRRSV、經(jīng)典PRRSV、NADC30類型毒株遺傳進(jìn)化樹分析顯示,NADC30毒株與國內(nèi)主流毒株HP- PRRSV、經(jīng)典PRRSV分屬2個(gè)大的分支,而HP- PRRSV、經(jīng)典PRRSV屬于同一進(jìn)化分支(圖1)。

      野毒株自然缺失時(shí)有報(bào)道:本實(shí)驗(yàn)室毛汐語等[15]2012年分離的SC2012自然減毒株,在aa485~aa498區(qū)間連續(xù)缺失14個(gè)氨基酸;Gao等[16]首次報(bào)導(dǎo)了PRRSV Nsp2天然缺失的病毒株HB- 2(SH)/2002,在aa471~aa482區(qū)間連續(xù)缺失12個(gè)氨基酸;Liu等[17]分離的2株歐洲型PRRSV在Nsp2的aa282~aa348區(qū)間連續(xù)缺失68個(gè)氨基酸,同時(shí)還分離出4株北美型PRRSV在aa322~aa432、aa483、aa504~aa522區(qū)間連續(xù)缺失31個(gè)氨基酸[18];Ji等[19]分離的GZgy15- 1毒株在Nsp2的aa488~aa516區(qū)間缺失29個(gè)氨基酸。另外還發(fā)現(xiàn),在FJLYDX04株的aa599~aa603序列中有5個(gè)堿基的插入,這是中國第一株報(bào)道Nsp2存在插入的病毒株[20]。此外,病毒株HZ- 31的Nsp2區(qū)含有59個(gè)不連續(xù)缺失,分別為aa467~aa474、aa498~aa519和aa533~aa361,但它的481位未像其他HP- PRRSV株一樣缺失,在遺傳系統(tǒng)中分析,它是獨(dú)立于JXA1和EM2007的一個(gè)單獨(dú)分支[21]。

      表1分離株Nsp2變異情況

      Table1Nsp2 variation of isolated strains

      毒株Strain分離年限Isolationtime分離國家Isolationcountry氨基酸缺失(插入)Aminoaciddeletion(insertion)突變位點(diǎn)Positionrelativetocomparedstrain參考毒株ReferencePRRSVstrain基因類型Genotype登錄號(hào)AccessionNo.HB-2(SH)/20022002China12aa471~482VR-2332NorthAmerican-JXA12006China1aa,29aa483,504~522VR-2332NorthAmericanEF112445GDQY22007China35aa,29aa470~505,532~560VR-2332NorthAmericanGU454850Em20072007China68aa499~566VR-2332NorthAmericanEU262603SC20122012China14aa485~498JXA1NorthAmericanKM189443NADC302011China131aa—JXA1NorthAmericanJN654459HENAN-XINX2013China131aa303,323~433,501~519JXA1NorthAmericanKF611905HZ-312013China8aa,22aa,29aa467~474,498~519,533~561JXA1NorthAmericanKC445138GZgy15-12015China29aa488~516JXA1NorthAmericanKT358728CHsx14012015China111aa323~433JXA1NorthAmericanKP86162515LY02-FJ2015China11aa322~432,483,504~522JXA1NorthAmericanKU215417HNhx2016China111aa,1aa,19aa323~433,483,501~519JXA1NorthAmericanKX766379FJQEU142014China68aa282~348LVEuropeanKP860913

      圖1 不同基因類型遺傳進(jìn)化分析Fig.1 Genetic evolution analysis of different gene types

      2 Nsp2與PRRSV毒力

      從經(jīng)典PRRSV、HP- PRRSV和NADC30類PRRSV的Nsp2變異的情況分析,研究人員們一直懷疑Nsp2的氨基酸缺失導(dǎo)致了HP- PRRSV毒力的增強(qiáng),但是現(xiàn)已通過多個(gè)強(qiáng)、弱毒株基因片段置換試驗(yàn)證明其與毒力并無關(guān)聯(lián)。Zhou等[22]在HP- PRRSV反向遺傳操作平臺(tái)的基礎(chǔ)上通過分別置換強(qiáng)毒株JXwn6和弱毒株HB- 1/3.9的相對應(yīng)的Nsp2區(qū)域,然后恢復(fù)病毒測定病毒的致病力,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,互相置換了Nsp2相應(yīng)區(qū)域的恢復(fù)毒株與親本株的致病力無異。

      Li等[23]在HP- PRRSV反向遺傳操作平臺(tái)的基礎(chǔ)上通過分別置換強(qiáng)毒株JXwn6和弱毒株HB- 1/3.9的5’UTR+ORF1a和ORF1b以及M和N蛋白,然后恢復(fù)病毒測定病毒致病力,結(jié)果表明置換ORF1a的恢復(fù)病毒不管是強(qiáng)毒株還是弱毒株,毒力沒有相應(yīng)減弱或增強(qiáng)。這2個(gè)試驗(yàn)充分表明HP- PRRSV的Nsp2連續(xù)缺失30 aa并不是其毒力增強(qiáng)的主要原因。

      3 Nsp2與PRRSV復(fù)制

      病毒的復(fù)制有時(shí)需要利用宿主蛋白,但是自身的一些非結(jié)構(gòu)蛋白也會(huì)參與病毒的復(fù)制過程。PRRSV是正鏈RNA病毒,復(fù)制過程在細(xì)胞質(zhì)靠近細(xì)胞核的雙層囊泡中進(jìn)行,而對Nsp2的亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示其定位于細(xì)胞核周圍,與雙層囊泡的位置相一致,是病毒復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵區(qū)域[24]。王鳳雪等[25]通過將HP- PRRSV弱毒株TJM株的Nsp2穩(wěn)定轉(zhuǎn)染到Marc- 145細(xì)胞中,建立了穩(wěn)定表達(dá)Nsp2蛋白的細(xì)胞系,通過接種病毒測定病毒含量發(fā)現(xiàn)Nsp2蛋白能夠促進(jìn)PRRSV的增殖。在對Nsp2影響PRRSV復(fù)制的深入研究中發(fā)現(xiàn),Nsp2的aa323~aa433和aa628~aa747雖不是PRRSV復(fù)制的關(guān)鍵位點(diǎn),但在PRRSV復(fù)制過程中起到了重要的作用[26]。進(jìn)一步通過截?cái)嗟鞍姿矔r(shí)表達(dá)的方式探索Nsp2中缺失的氨基酸與PRRSV復(fù)制是否有關(guān),發(fā)現(xiàn)TJM株Nsp2中缺失的120 aa中的aa628~aa727能夠抑制病毒的增殖[27]。在對Nsp2的N端的半胱氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域(PL2)和功能尚不明確的C端富含半胱氨酸殘基保守區(qū)病毒復(fù)制的影響的試驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),在C末端插入EGFP蛋白并不能對病毒的復(fù)制造成影響,EGFP蛋白能正常表達(dá),但是對N端的研究表明,PL2的反向切割活性在病毒復(fù)制過程中是非常重要的。進(jìn)一步對其精確的位點(diǎn)的研究發(fā)現(xiàn),PL2的核心域(aa47~aa180)和直接下游區(qū)域(aa181~aa323)是病毒復(fù)制必不可少的[28-29]。

      除Nsp2直接影響病毒的復(fù)制以外,還存在其他途徑影響病毒增殖,細(xì)胞中的一些蛋白質(zhì)也能通過與Nsp2互作來影響PRRSV的復(fù)制,Nsp2招募Bcl2相關(guān)抗凋亡基因6(BAG6)蛋白并利用該蛋白幫助NSP2定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)促進(jìn)雙層膜泡的形成[30]。細(xì)胞中的14- 3- 3蛋白家族是常見的蛋白家族,通過激光共聚焦和過表達(dá)最終確定14- 3- 3蛋白能夠作用Nsp2促進(jìn)PRRSV的增殖[31]。Nsp2利用N端的半胱氨酸蛋白酶的去泛素化酶活性抑制凋亡誘導(dǎo)分子1(AIF1)的泛素化降解,從而促進(jìn)PRRSV復(fù)制過程中胞內(nèi)ATP的合成[32]。同時(shí)也有研究表明病毒復(fù)制過程中自身產(chǎn)生的miRNA(微小核糖核酸)能夠直接靶向Nsp2基因來抑制病毒的增殖,形成負(fù)調(diào)控[33]。

      總之,通過由簡到繁、由全蛋白到關(guān)鍵位點(diǎn)的對Nsp2影響、參與病毒復(fù)制的研究表明,Nsp2的高變區(qū)域依舊有一些關(guān)鍵位點(diǎn)能夠影響病毒的復(fù)制,其N- 末端和C- 末端的一部分區(qū)域在病毒復(fù)制過程中是至關(guān)重要的。

      4 Nsp2與免疫調(diào)控

      Nsp2蛋白是病毒蛋白中最大的蛋白,它參與多肽的組合和病毒的復(fù)制等復(fù)雜的過程,并富含抗原表位[34]。近年來,關(guān)于PRRSV對豬免疫抑制的報(bào)道主要集中在對各種細(xì)胞因子的抑制及促進(jìn)方面,以間接反映宿主免疫反應(yīng)情況。Beura等[35]發(fā)現(xiàn),PRRSV的4個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白對IFN- β啟動(dòng)子(IRF- 3)的活性起到有效的抑制作用。依據(jù)它們的影響大小,排序?yàn)镹sp1、Nsp2、Nsp11和Nsp4。Li等[36]證明,Nsp2通過抵抗IFN調(diào)節(jié)因子3(IRF- 3)的活性進(jìn)而強(qiáng)烈地抑制由仙臺(tái)病毒誘導(dǎo)的IFN- β產(chǎn)生。有研究顯示,Nsp2蛋白在PRRSV感染細(xì)胞的胞質(zhì)內(nèi)分布,并與RIG- I信號(hào)通路中的一個(gè)銜接分子MAVS和能夠激活細(xì)胞內(nèi)I型IFN信號(hào)通路的信號(hào)分子LSml4A共定位,但不影響IRF- 3或NF- κB入核,表明PRRSV對先天免疫的影響可能在細(xì)胞核內(nèi)[6]。Sun等[37]證明,Nsp2的卵巢腫瘤蛋白酶(OTU)區(qū)域具有泛素連接酶活性,這個(gè)區(qū)域可以通過對IκBα聚泛素化而抑制IκBα的降解,而IκBα是NF- κB的抑制因子,從而抑制NF- κB的活性而抑制IFN- I的產(chǎn)生。而Fang等[38]證明,PRRSV WUH3株Nsp2蛋白的過量表達(dá)能夠誘導(dǎo)IκBα降解,激活NF- κB。并且確定了Nsp2的高變區(qū)(aa179~aa782)對于激活NF- κB是不可缺少的,并且它所刺激的活性與Nsp2全長基本一致。非結(jié)構(gòu)蛋白還可以誘導(dǎo)產(chǎn)生IFN- γ和IL- 10。Burgara- Estrella等[39]通過動(dòng)物試驗(yàn)確定PRRSV Nsp2的非保守多肽(589SLYKLLLEV597)可以引起豬的免疫反應(yīng),并產(chǎn)生IFN- γ。Xing等[26]通過缺失多株P(guān)RRSV Nsp2高變區(qū)的片段研究其對機(jī)體免疫誘導(dǎo)的影響,發(fā)現(xiàn)缺失aa322~aa434、aa531~aa561和aa531~aa561、aa627~aa748的恢復(fù)毒株誘導(dǎo)IL- 1β、IL- 6和TNF- α的能力降低,但aa531~aa561、aa627~aa748缺失株卻能強(qiáng)烈誘導(dǎo)IL- 12(P40)的表達(dá)。

      5 Nsp2的可插入位點(diǎn)與分子標(biāo)簽

      Nsp2的非必需區(qū)域能夠插入表達(dá)外源蛋白,目前關(guān)于對Nsp2插入外源蛋白的位點(diǎn)和外源蛋白的種類做了很多的研究。同時(shí)由于Nsp2的高突變導(dǎo)致其不同亞型之間插入和缺失突變非常嚴(yán)重,能夠利用其毒株之間的插入和缺失來區(qū)分毒株亞型,同樣也起到分子標(biāo)簽的作用[40]。

      Kim等[41]通過在Nsp2非關(guān)鍵區(qū)進(jìn)行缺失并插入肽標(biāo)簽,發(fā)現(xiàn)拯救病毒株毒力顯著降低,并能被特異抗原包被的ELISA試劑盒檢測,再次驗(yàn)證了Nsp2是用來發(fā)展標(biāo)記疫苗和弱毒苗的潛在靶基因。Xu等[42]在對疫苗毒HuN4- F112 Nsp2復(fù)制非關(guān)鍵區(qū)缺失25個(gè)氨基酸,并插入新城疫病毒N蛋白免疫顯性B細(xì)胞表位49個(gè)氨基酸作為一種基因標(biāo)記疫苗,在動(dòng)物體內(nèi)能同時(shí)產(chǎn)生對抗NDV NP及PRRSV的特異性抗體,而且缺乏針對缺失的25個(gè)氨基酸的抗體,免疫豬獲得很好的免疫保護(hù),該疫苗可以作為一種有效的對抗PRRSV的基因標(biāo)記苗。

      Yu等[43]利用反向遺傳操作平臺(tái)將豬的粒細(xì)胞- 巨噬細(xì)胞集落刺激因子(GM- CSF)插入到HuN- F112的ORF1b與ORF2a之間作為分子標(biāo)記,后續(xù)試驗(yàn)表明GM- CSF能夠穩(wěn)定地隨著病毒復(fù)制而表達(dá),說明在這一區(qū)域能夠允許外源蛋白的插入。

      6 展望

      隨著對PRRSV Nsp2蛋白的深入研究,Nsp2在病毒復(fù)制、致病性、機(jī)體相互作用方面的作用也越來越清晰。Nsp2基因在不同亞型中的特征性變異,為PRRSV變異亞型的鑒定提供依據(jù),同時(shí),這些研究也揭示了Nsp2氨基酸的變異不是PRRSV的毒力改變的主要因素,但是Nsp2蛋白在PRRSV的復(fù)制、免疫調(diào)控等方面扮演著重要的角色。Nsp2 能夠直接影響病毒的復(fù)制,并且Nsp2也能通過與細(xì)胞中的一些蛋白質(zhì)互作來影響PRRSV的復(fù)制。Nsp2對IFN- β啟動(dòng)子(IRF- 3)的活性起到有效的抑制作用,從而抑制病毒誘導(dǎo)宿主產(chǎn)生IFN- β。Nsp2的卵巢腫瘤蛋白酶(OUT)區(qū)域可以通過對IκBα聚泛素化而抑制IκBα的降解,從而抑制NF- κB的活性而抑制IFN- I的產(chǎn)生。Nsp2的高變區(qū)(aa179~aa782)對于激活NF- κB是不可缺少的。同時(shí),Nsp2非必需區(qū)域的高變性為PRRSV作為載體插入外源蛋白和分子標(biāo)簽提供了可能。對Nsp2蛋白的功能研究有助于闡明PRRSV非結(jié)構(gòu)蛋白參與免疫調(diào)控網(wǎng)絡(luò),同時(shí)Nsp2蛋白的遺傳變異研究有助于相關(guān)重組疫苗的研究和分子標(biāo)簽的應(yīng)用,為疫苗株和野毒株的鑒定提供參照。

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