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      代謝組學(xué)分析提高谷氨酸棒桿菌L-瓜氨酸產(chǎn)量

      2018-07-24 02:13:20娟,許琳,郝
      生物加工過程 2018年4期
      關(guān)鍵詞:瓜氨酸甲酰胞內(nèi)

      許 娟,許 琳,郝 寧

      (南京工業(yè)大學(xué) 生物與制藥工程學(xué)院,江蘇 南京 211800)

      代謝組學(xué)(metabolomics)是以機(jī)體內(nèi)所有代謝物為研究對象,利用高通量分析方法,研究生物體系對內(nèi)外擾動(dòng)響應(yīng)情況的學(xué)科[1],致力于全面分析代謝網(wǎng)絡(luò)調(diào)控及其關(guān)聯(lián)性[2-3]。代謝組學(xué)是組學(xué)研究的終點(diǎn),它以細(xì)胞內(nèi)所有分子量小于1 000的代謝物為對象,進(jìn)行系統(tǒng)的定性、定量分析,以其代謝物的變化繼而挖掘生物體系的代謝表型改變,最接近于生物表型。目前代謝組學(xué)研究廣泛應(yīng)用于微生物領(lǐng)域。

      L-瓜氨酸首次在西瓜中分離得到[4],是人體尿素循環(huán)的重要參與物質(zhì)。L-瓜氨酸可以提高免疫系統(tǒng)功能、舒張血管、維持正常的膽固醇和血糖水平、治療關(guān)節(jié)炎癥[5-9]。因此在食品、醫(yī)藥等行業(yè),L-瓜氨酸應(yīng)用越來越廣泛[10]。

      谷氨酸棒桿菌是氨基酸發(fā)酵生產(chǎn)行業(yè)最常用的工業(yè)菌種。本研究利用基于氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)分析手段的代謝組學(xué)方法,以實(shí)驗(yàn)室保藏的谷氨酸棒桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC 13032和改造后的L-瓜氨酸高產(chǎn)菌CorynebacteriumglutamicumATCC 13032ΔargGΔargR-pXMJ19-argB(ec) (CIT4)為研究對象,分析確定影響瓜氨酸合成的關(guān)鍵代謝物質(zhì)與代謝途徑,確定瓜氨酸合成的限定條件,通過挖掘胞內(nèi)L-瓜氨酸合成的不足性,提出優(yōu)化添加前體物質(zhì)的方案,以期理性有效地提高谷氨酸棒桿菌生產(chǎn)L-瓜氨酸的產(chǎn)量。

      1 材料與方法

      1.1 菌株

      C.glutamicumATCC 13032、C.glutamicumATCC 13032ΔargGΔargR- pXMJ19-argB(ec) (CIT4),南京工業(yè)大學(xué)微生物保藏室保存。

      1.2 試劑和儀器

      吡啶、N-甲基-N-(三甲基硅氧烷基) 三氟乙酰胺(MSTFA)等衍生化試劑,Sigma-Aldrich 公司;甲醇、乙腈等(AR),上海凌峰化學(xué)試劑有限公司。

      Trace GC 2000 DSQ型氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS),美國Agilent 公司;QYN100-2型氮?dú)鉂饪s儀,上海喬躍電子有限公司;D5321型高速冷凍離心機(jī),德國Eppendorf公司;Ultimate 3000型高效液相色譜儀,DioNex中國有限公司。

      1.3 培養(yǎng)基

      固體培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨 10、酵母粉 5、NaCl 10、瓊脂 20。

      發(fā)酵培養(yǎng)基M1(1 L):葡萄糖80 g、KH2PO41.0 g、K2HPO4·3H2O 1.0 g、FeSO4·7H2O 0.02 g、MnSO4·H2O 0.02 g、ZnCl21 mg、VB1200 μg;pH 7.0。

      發(fā)酵培養(yǎng)基M2(1 L):葡萄糖80 g、KH2PO41.0 g、K2HPO4·3H2O 1.0 g、FeSO4·7H2O 0.02 g、MnSO4·H2O 0.02 g、ZnCl21 mg、VB1 200 μg;pH 7.0。

      在發(fā)酵過程中,于12 h補(bǔ)加終質(zhì)量濃度為1.0 g/L的谷氨酸和鳥氨酸,24 h補(bǔ)加終質(zhì)量濃度分別為1.5、1.5和2.0 g/L的α-酮戊二酸、氨甲酰磷酸以及谷氨酰胺,36 h補(bǔ)加終質(zhì)量濃度為1.0 g/L的丙酮酸。

      1.4 胞內(nèi)代謝物的提取

      1)取樣點(diǎn)取發(fā)酵液10 mL,迅速加入20 mL-80 ℃預(yù)冷的60%(體積分?jǐn)?shù))甲醇- 0.9%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))NaCl溶液,離心收集菌體,并用10 mL 0.9%NaCl洗菌2次,凍于液氮中。

      2)加入0.5 mL -20 ℃預(yù)冷的70%甲醇,渦旋混勻,液氮反復(fù)凍融3次后8 000 r/min 冷凍離心5 min,取上清于新管中。

      3)再加入0.5 mL-20 ℃預(yù)冷的甲醇-乙腈-水溶液(體積比為2∶ 2∶ 1),渦旋混勻后,8 000 r/min 冷凍離心5 min,吸取上清與之前的清液混合。

      1.5 樣品衍生化

      取150 μL提取液并加入30 μL內(nèi)標(biāo)混合液(0.2 mg/mL核糖醇),混勻后N2吹干;在干燥的樣品中加入40 μL甲氧胺鹽酸鹽的吡啶溶液(120 mg/mL),40 ℃水浴反應(yīng)30 min;再加入80 μLN-甲基-N-(三甲基硅氧烷基)三氟乙酰胺(MSTFA),30 ℃水浴反應(yīng)90 min。

      1.6 代謝物的檢測

      GC-MS檢測條件參照文獻(xiàn)[11]。

      1.7 代謝物數(shù)據(jù)的分析

      將GC-MS所得的質(zhì)譜峰導(dǎo)入到AMDIS軟件,并與NIST數(shù)據(jù)庫比對,對質(zhì)譜峰進(jìn)行定性分析;將質(zhì)譜峰面積與內(nèi)標(biāo)峰面積對比進(jìn)行定量分析,使得代謝物含量標(biāo)準(zhǔn)化。所有定量化的多維數(shù)據(jù)導(dǎo)入到Expander(version 6.0)軟件中,進(jìn)行聚類分析得到熱圖。然后將分析結(jié)果帶入SIMCA-P(version 11.0)軟件中,得到主成分分析(PCA)和偏最小二乘判別分析(PLS)分析圖,并且利用載荷圖、T-test以及變量重要性因子(VIP)找出生物標(biāo)志物[12]。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 標(biāo)準(zhǔn)菌與重組菌發(fā)酵過程比較

      對L-瓜氨酸生成過程的相關(guān)發(fā)酵參數(shù)監(jiān)測,從而考察菌體中各個(gè)發(fā)酵參數(shù)變化的趨勢,借此系統(tǒng)地考察標(biāo)準(zhǔn)菌ATCC 13032和重組菌CIT4的差異性,結(jié)果見圖1。

      圖1 ATCC 13032與CIT4菌株發(fā)酵參數(shù)曲線 Fig.1 Fermentation parameters of C.glutamicum CIT4

      由圖1可知:2株菌的生長曲線,將細(xì)胞生長分為延滯期(0~24 h)、對數(shù)生長期(24~36 h)、穩(wěn)定期(36~48 h)和衰退期(48~60 h)。與標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC13032相比,CIT4菌株生長期有所延長,并且L-瓜氨酸質(zhì)量濃度為18.50 g/L,而標(biāo)準(zhǔn)菌ATCC 13032沒有L-瓜氨酸的生成。

      2.2 發(fā)酵過程中胞內(nèi)代謝物的分析

      基于GC-MS代謝輪廓分析的方法,進(jìn)一步研究比較兩種菌體的胞內(nèi)物質(zhì)動(dòng)態(tài)代謝差異。在發(fā)酵的4個(gè)階段,分別從C.glutamicumATCC 13032和C.glutamicumCIT4中取樣,共定量檢測出124種化合物,其中86種被鑒定,包括19種氨基酸、28種有機(jī)酸、12種糖類和糖醇及9種脂類、4種醇類、5種胺類及9種其他類型代謝物,結(jié)果見圖2。由圖2可知:在重組菌CIT4中,發(fā)酵至24 h后,胞內(nèi)谷氨酸、4-氨基丁酸、L-賴氨酸、纈氨酸的代謝水平較高,說明此時(shí)CIT4菌株胞內(nèi)氮代謝比ATCC 13032菌株中的旺盛[13],氮元素作為組成微生物中幾乎所有的生物大分子的必需組分,尤其在氨基酸代謝中起著極為關(guān)鍵性的作用,因而對L-瓜氨酸的合成產(chǎn)生關(guān)鍵影響[14]。

      紅色代表代謝物濃度高;綠色代表代謝物濃度低圖2 CIT4與ATCC 13032胞內(nèi)代謝物的熱圖Fig.2 Heat map representation of metabolites in CIT4 and ATCC 13032

      2.3 多元統(tǒng)計(jì)分析胞內(nèi)關(guān)鍵物質(zhì)

      為了深入比較C.glutamicumATCC 13032與C.glutamicumCIT4的總代謝物輪廓的差異性,將GC-MS檢測到的近百種的代謝物的動(dòng)態(tài)變化使用主成分分析(principal component analysis,PCA)進(jìn)行分析。在無監(jiān)督的PCA分析,通過線性變換以減少多個(gè)變量的維度并在新的多變量空間中表示其樣本分布[15]。圖3為CIT4與ATCC 13032樣品的主成分分析結(jié)果。

      圖3(a)為PCA得分圖,分析結(jié)果的得分圖可以直接展示出胞內(nèi)代謝的變化情況。PCA模型的R2(X)值為0.931 6,表明了PCA具有較好(>0.8)的可信度。一個(gè)點(diǎn)表示一個(gè)代謝通量,從而可以直觀區(qū)分各個(gè)體系,并且CIT4與ATCC 13032的兩組數(shù)據(jù)存在著明顯的離散分組的現(xiàn)象,這說明兩株菌在相同培養(yǎng)基中不同的培養(yǎng)階段下胞內(nèi)物質(zhì)存在著顯著的差異。

      圖3(b)的PCA載荷圖,通過GC-MS測得的86種胞內(nèi)代謝物在載荷圖各有分布,以各物質(zhì)到原點(diǎn)的距離來判斷其對L-瓜氨酸生成的作用程度,變量離原點(diǎn)越遠(yuǎn),反映其在發(fā)酵過程中的變化越大,對目標(biāo)產(chǎn)物L(fēng)-瓜氨酸合成的貢獻(xiàn)越大。

      圖4為偏最小二乘法(PLS)分析的變量重要因子(VIP)圖,VIP表示所鑒定的代謝物對兩株菌中L-瓜氨酸合成差異的貢獻(xiàn)率,并且VIP值越大則表示其與L-瓜氨酸合成的相關(guān)程度越大,對 L-瓜氨酸的貢獻(xiàn)率也就越大[16]。其中,VIP值大于1的代謝物是影響L-瓜氨酸的積累的關(guān)鍵物質(zhì)。由圖4結(jié)果并結(jié)合PCA載荷圖分析可知,對L-瓜氨酸合成影響最顯著的10種生物標(biāo)志物為葡萄糖、α-酮戊二酸(Akg)、丙酮酸(Pyr)、磷酸、乳酸(Lac)、琥珀酸(Suc)、蘋果酸、富馬酸、賴氨酸(Lys)和谷氨酸(Glu)。

      圖3 CIT4與ATCC 13032樣品的主成分分析結(jié)果Fig.3 Principal component analysis of CIT4 and ATCC13032(a)PCA score plot t[1]-t[2] and(b)PCA derived loading plot p[1]-p[2]

      圖4 偏最小二乘法( OPLS-DA PLS) 得出的與 L-瓜氨酸含量最相關(guān)的胞內(nèi)代謝物VIP圖(置信區(qū)間:0.95)Fig.4 Variable importance factor(VIP)plot of the orthogonal to partial least squares-discriminant analysis (OPLS-DA PLS)model generated from the most correlated intracellular metabolites with L-Citrulline (confidence interval:0.95)

      2.4 關(guān)鍵代謝物和代謝途徑分析

      為了進(jìn)一步探究L-瓜氨酸累積的機(jī)制、深入地分析這10種關(guān)鍵的生物標(biāo)志物與關(guān)鍵代謝途徑之間的作用關(guān)系,將獲得的生物標(biāo)志物回歸到L-瓜氨酸合成代謝網(wǎng)絡(luò)中,包括中心碳代謝和氨基酸代謝等合成途徑,探究限制L-瓜氨酸累積的原因,挖掘2株菌代謝物的不足之處,并以此指導(dǎo)發(fā)酵培養(yǎng)基的條件優(yōu)化,增加L-瓜氨酸的產(chǎn)量。

      2.4.1 中心碳代謝

      圖5為中心碳代謝胞內(nèi)代謝物相對含量。由圖5可知:發(fā)酵至24 h后,菌株CIT4中L-瓜氨酸開始累積,此時(shí)丙酮酸迅速被利用,其相對含量由24 h的28迅速下降到48 h的7,與此同時(shí),胞內(nèi)乳酸的相對含量也從35迅速下降到12。而標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC 13032中丙酮酸和乳酸都有一定的累積。這說明CIT4中更多的丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙酰CoA,代謝流向主要集中于三羧酸循環(huán)(TCA)過程中,而乳酸作為生成L-瓜氨酸的主要副產(chǎn)物,競爭糖酵解途徑(EMP)的碳流量。α-酮戊二酸是TCA循環(huán)途徑中的一個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),是連接碳-氮代謝的關(guān)鍵代謝中間體[17]。在24 ~48 h階段,L-瓜氨酸大量合成,CIT4中α-酮戊二酸的相對含量由23下降至4,琥珀酸、富馬酸以及蘋果酸的含量也迅速下降。ATCC 13032中這幾種物質(zhì)含量均比CIT4高,并且呈上升趨勢。這表明在CIT4中的α-酮戊二酸更多的用于合成氨基酸代謝的前體物質(zhì)谷氨酸。ATCC 13032中α-酮戊二酸、檸檬酸、琥珀酸的相對含量較高,說明其TCA循環(huán)較為活躍,導(dǎo)制碳源被轉(zhuǎn)化為CO2釋放到細(xì)胞體外,消耗更多的碳資源。在發(fā)酵前期,CIT4 戊糖磷酸途徑(HMP)中核糖-5-磷酸和赤蘚糖-4-磷酸(E4P)相對含量都要比ATCC 13032菌株高,HMP途徑代謝活躍,為L-瓜氨酸合成提供大量的還原力NADPH。而在發(fā)酵后期,隨著瓜氨酸的積累,細(xì)胞停止生長,磷酸戊糖途徑的代謝通量大大降低。此結(jié)果表明,葡萄糖-6-磷酸分支點(diǎn)周圍的磷酸戊糖途徑的通量分布隨著瓜氨酸產(chǎn)量的增加而降低[18]。

      G6P—葡萄糖-6-磷酸;3PG—3-磷酸甘油酸;Ppa—磷酸吡哆醛;X5P—木酮糖-5-磷酸圖5 中心碳代謝胞內(nèi)代謝物相對含量Fig.5 Central carbon metabolism intracellular metabolite relative content

      2.4.2 氨基酸代謝

      圖6為氨基酸代謝胞內(nèi)代謝物相對含量。由圖6可知,CIT4中氨基酸代謝水平整體高于ATCC 13032菌株。谷氨酸作為合成瓜氨酸的前體,其在CIT4菌株中的代謝水平和代謝速率均明顯高于ATCC 13032菌株,說明CIT4胞內(nèi)谷氨酸代謝途徑利用比標(biāo)準(zhǔn)菌更加高效。重組菌CIT4在C.glutamicumATCC 13032的基礎(chǔ)上為解除反饋?zhàn)瓒羟贸薬rgR基因,為了截?cái)喙习彼崂猛緩角贸薬rgG基因。在谷氨酸棒桿菌中N-乙酰谷氨酸激酶(NAGK)作為關(guān)鍵酶受到瓜氨酸的反饋抑制作用,因此構(gòu)建N-乙酰谷氨酸激酶基因(argB)表達(dá)質(zhì)粒,得到菌株C.glutamicumATCC 13032-ΔargG-ΔargR- pXMJ19-argB(ec)(CIT)。因此,在重組菌CIT4中截?cái)喙习彼崂猛緩?,打通合成途徑,解除了反饋?zhàn)瓒糇饔?,?shí)現(xiàn)了L-瓜氨酸的積累,而原始菌C.glutamicumATCC 13032 不能積累L-瓜氨酸。

      2.5 代謝輪廓分析指導(dǎo)下的發(fā)酵特性理性強(qiáng)化

      2.5.1 中心碳代謝途徑

      以CIT4為實(shí)驗(yàn)菌株,在已有的發(fā)酵培養(yǎng)基M1中,考察外源添加中心碳代謝前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響,結(jié)果見圖7。由圖7可知:添加丙酮酸均可有效提高L-瓜氨酸的累積,在36 h添加1.0 g/L的丙酮酸累積量達(dá)到最高,從原來的18.50 g/L提高到19.37 g/L。這是因?yàn)楸岬募尤胧沟锰剂鞲嗟牧飨騎CA循環(huán),增加了丙酮酸生成乙酰CoA的代謝水平,減少了乙酸和乳酸等副產(chǎn)物的合成,從而提高了α-酮戊二酸的積累量。

      在24 h添加1.5 g/L的α-酮戊二酸時(shí),L-瓜氨酸的積累量最高,從原來的18.50 g/L增加到19.53 g/L。這表明外源添加促使更多的碳流經(jīng)由TCA循環(huán)進(jìn)入谷氨酸和L-瓜氨酸的合成途徑,這是因?yàn)棣?酮戊二酸是TCA循環(huán)中一個(gè)關(guān)鍵中間物質(zhì),它可以生成L-瓜氨酸不可或缺的前體物質(zhì)谷氨酸。同時(shí)也發(fā)現(xiàn),更多的α-酮戊二酸用于合成谷氨酸,使得TCA循環(huán)中α-酮戊二酸節(jié)點(diǎn)下游的代謝通量持續(xù)下降,TCA循環(huán)不暢,影響了菌體生長和維持所需的能量和必需物質(zhì),菌體生長速率和糖耗速率減慢。

      圖6 氨基酸代謝胞內(nèi)代謝物相對含量Fig.6 Amino acid metabolism intracellular metabolite relative content

      圖7 在CIT4中外源添加中心碳代謝前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響Fig.7 Effects of adding precursors of central carbon metabolism on L-citrulline production in CIT4

      2.5.2 氨基酸代謝途徑

      根據(jù)對氨基酸代謝途徑中關(guān)鍵代謝物的動(dòng)態(tài)監(jiān)測與分析,為了提高重組菌CIT4 L-瓜氨酸的產(chǎn)量,考察外源添加氨基酸代謝物前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響,結(jié)果見圖8。作為L-瓜氨酸的前體物質(zhì),谷氨酸為其提供了第1個(gè)氮原子,外源添加谷氨酸對發(fā)酵產(chǎn)L-瓜氨酸的有重要影響。由圖8可知:谷氨酸的添加使得L-瓜氨酸的積累量有一定的提高,在12 h添加1.0 g/L的谷氨酸時(shí),其產(chǎn)量為19.65 g/L。當(dāng)谷氨酸質(zhì)量濃度超過2.0 g/L時(shí),L-瓜氨酸的產(chǎn)量沒有明顯增加,且菌體生長時(shí)間延長,分析其原因可能是谷氨酸含量增加,使得TCA循環(huán)中α-酮戊二酸向谷氨酸合成下降,使得TCA循環(huán)更為活躍,從而增加菌體的生長。在精氨酸系列氨基酸代謝途徑中,鳥氨酸在鳥氨酸氨甲酰磷酸轉(zhuǎn)移酶(OTC,EC 2.1.3.3)催化下合成L-瓜氨酸。

      鳥氨酸的加入增強(qiáng)了其與氨甲酰磷酸(Cps)的結(jié)合,繼而促進(jìn)L-瓜氨酸的合成。在12 h添加1.0 g/L的鳥氨酸時(shí),L-瓜氨酸的產(chǎn)量為19.57 g/L(圖8(b))。

      2.5.3 氨甲酰磷酸代謝途徑

      在氨甲酰磷酸代謝途徑中,通過氨甲酰磷酸合成酶(UPS)催化谷氨酰胺、CO2和ATP合成L-瓜氨酸的前體物質(zhì)氨甲酰磷酸??疾焱庠刺砑影奔柞A姿岽x前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響,結(jié)果見圖9。由圖9可知:外源添加氨甲酰磷酸可以促進(jìn)鳥氨酸與其結(jié)合生成L-瓜氨酸,在24 h添加1.5 g/L的氨甲酰磷酸時(shí),L-瓜氨酸的積累量最高,從原來的18.50提高到19.35 g/L。

      L-谷氨酰胺是胞內(nèi)碳氮代謝的重要節(jié)點(diǎn)和重要的氨基供體,能夠參與多種細(xì)胞生長必需物質(zhì)的合成[19]。外源添加谷氨酰胺可以增加氨甲酰磷酸代謝的水平,促使合成更多的氨甲酰磷酸,并且可以競爭谷氨酸的代謝通量,減少副產(chǎn)物脯氨酸的生成,為L-瓜氨酸的累積提供更多的氮源,減少了副產(chǎn)物合成途徑的代謝流,繼而提高L-瓜氨酸的合成。在24 h添加2.0 g/L的谷氨酰胺時(shí),L-瓜氨酸的產(chǎn)量最高,達(dá)到19.58 g/L。由此可見,氨甲酰磷酸和谷氨酰胺的加入都有利于細(xì)胞的生長,特別是在0 h添加谷氨酰胺時(shí)菌體量最大,這可能是因?yàn)? h添加的谷氨酰胺更多的用于細(xì)胞的合成代謝和生長。

      圖8 在CIT4中外源添加氨基酸代謝物前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響Fig.8 Effects of adding precursors of amino acid metabolism on L-citrulline production

      圖9 在CIT4中外源添加氨甲酰磷酸代謝前體對L-瓜氨酸產(chǎn)量的影響Fig.9 Effects of adding precursors of Carbamate phosphate metabolism on L-citrulline production

      2.5.4 組合優(yōu)化培養(yǎng)基發(fā)酵產(chǎn)物監(jiān)測和強(qiáng)化效果驗(yàn)證

      在原有的發(fā)酵培養(yǎng)基M1基礎(chǔ)上,得到總的添加策略及優(yōu)化操作條件的新型培養(yǎng)基M2:在發(fā)酵延遲期(12 h)添加1.0 g/L的谷氨酸和鳥氨酸;在對數(shù)初期(24 h)分別添加1.5、1.5和2.0 g/L的α-酮戊二酸、氨甲酰磷酸以及谷氨酰胺。在對數(shù)中期(36 h)添加1.0 g/L的丙酮酸,結(jié)果見圖10。由圖10可知:L-瓜氨酸的產(chǎn)量從原來的18.50 g/L增加到20.86 g/L,相比原來增加12.8%。與此同時(shí),還可發(fā)現(xiàn)在發(fā)酵結(jié)束時(shí)(60 h),檢測到乳酸、纈氨酸和賴氨酸等副產(chǎn)物的含量也減少,并且菌體生長時(shí)間增加。

      圖10 CIT4在不同培養(yǎng)基(M1 和 M2)條件下 L-瓜氨酸產(chǎn)量的動(dòng)態(tài)變化Fig.10 The dynamic changes of L-citrulline production in CIT4 under M1 and M2 media

      3 結(jié)論

      利用基于GC-MS的代謝組學(xué)方法研究了谷氨酸棒桿菌原始菌ATCC 13032和重組菌CIT4胞內(nèi)代謝輪廓的差異性,從代謝水平系統(tǒng)的分析高產(chǎn)L-瓜氨酸的原因。通過PCA和PLS多元統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果表明:葡萄糖、α-酮戊二酸、丙酮酸、磷酸、乳酸、琥珀酸、蘋果酸、富馬酸、賴氨酸和谷氨酸這10種代謝物為潛在的生物標(biāo)志物。同時(shí),從中心碳代謝途徑、氨基酸代謝途徑和氨甲酰磷酸代謝途徑三個(gè)方面,定時(shí)定量補(bǔ)加不同生物標(biāo)志物,研究重組菌CIT4發(fā)酵過程中L-瓜氨酸的累積量的變化。最終確定組合優(yōu)化培養(yǎng)基:在重組菌CIT4發(fā)酵延遲期(12 h)添加1.0 g/L的谷氨酸和鳥氨酸;在對數(shù)初期(24 h)分別添加1.5、1.5和2.0 g/L的α-酮戊二酸、氨甲酰磷酸以及谷氨酰胺;在對數(shù)中期(36 h)添加1.0 g/L的丙酮酸,于發(fā)酵末期(60 h)產(chǎn)物L(fēng)-瓜氨酸的產(chǎn)量從原來的18.50 g/L增加到20.86 g/L,相比原來增加12.8%。

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