周豪 夏冬 夏志強 宋娟 宋芹芹 史冰田 劉宓 劉露 武桂珍 韓俊
241002蕪湖,皖南醫(yī)學院公共衛(wèi)生學院(周豪、劉露);102206北京,中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所(夏冬、夏志強、宋娟、宋芹芹、史冰田、劉宓、韓俊、武桂珍),傳染病預防控制國家重點實驗室(夏冬、夏志強、宋娟、宋芹芹、史冰田、劉宓、韓?。?/p>
鼻病毒(rhinovirus,RV)是一種引起人類病毒性呼吸道感染最主要的病毒性病原體,不僅能引起普通感冒,還能導致急、慢性支氣管炎等其他呼吸系統(tǒng)感染疾?。?]。近年來有資料表明RV感染與哮喘和肺炎等疾病也有一定關系[2-3]。RV屬小RNA病毒科(picornaviridae)中的一類,病毒核心為單股線型RNA,外有蛋白衣殼,無包膜,病毒直徑為27~30 nm,呈二十面立體對稱結構[4]。RV在呼吸道標本中均有較高的檢出率,主要通過呼吸道傳播,也可通過飛沫直接傳播,患者及病毒攜帶者為主要傳染源[5-6]。
注:柱形圖代表發(fā)文量,線型圖代表相對研究興趣指數(shù),灰色線為相對研究興趣指數(shù),黑色線為相對研究興趣指數(shù)的擬合趨勢線圖1 1970—2018年間鼻病毒研究文獻的分布Note: The bars represent the number of papers, the curves represent the relative interest index,the grey line is the relative research interest index,The black line is the fitting trend line of relative research interest indexFig.1 Number of papers related with rhinovirus distributed yearly between 1970 and 2018
PubMed是一個檢索型數(shù)據(jù)庫,是由美國國立生物技術信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)開發(fā)的用于檢索 MEDLINE、PreMED-LINE數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。MEDLINE是美國國立醫(yī)學圖書館(U.S.national library of medicine)最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫,內(nèi)容涉及醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)學、衛(wèi)生保健和基礎醫(yī)學。收錄了全世界70多個國家和地區(qū)的4 000余種生物醫(yī)學期刊,現(xiàn)有書目文摘條目1 000萬余條[7]。GoPubMed是一個可以對PubMed數(shù)據(jù)庫中收錄的文獻進行定量統(tǒng)計分析的工具,可以對檢索結果進行時間、作者、機構、地區(qū)、出版物等進行全方位分析,從而得出文獻增長趨勢、文獻發(fā)表地域分布、期刊分布、作者合作網(wǎng)絡等信息,有助于揭示文獻分布規(guī)律,追蹤熱點課題以及預測學科發(fā)展[8]。本研究利用GoPubMed這一檢索工具,對PubMed數(shù)據(jù)庫中收錄的有關RV研究的相關文獻進行統(tǒng)計,分析了RV的全球研究現(xiàn)狀以及發(fā)展趨勢,從而為進一步開展RV的研究提供參考依據(jù)。
選擇PubMed數(shù)據(jù)庫中收錄的RV相關研究文獻作為檢索對象,登錄 GoPubMed網(wǎng)站(http://www.gopubmed.com),以“RV”為主題詞(“rhinovirus”[mesh])檢索文獻,檢索起始時間為1970年1月1日,截止時間為2018年4月16日。通過GoPubMed數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站在線統(tǒng)計功能對RV研究文獻統(tǒng)計分析及EXCEL2007和SPSS 20.0軟件對檢索結果進行數(shù)據(jù)分析。探究PubMed數(shù)據(jù)庫中收錄有關RV研究文獻的情況,包括文獻發(fā)表的時間分布、地域分布、期刊分布、相對研究興趣指數(shù)(RRI)及高產(chǎn)作者等內(nèi)容,給出可視化的分析結果。
2.1 RV文獻發(fā)表的年度分布 本研究共檢索出RV研究文獻共5 367篇,發(fā)文量呈現(xiàn)總體遞增趨勢,初期論文數(shù)量較少,在1970—1998年間,年均發(fā)表文獻不足百篇。2011年開始快速增長,2011—2014年顯著增長,其中2014—2015年文獻量最多,均超過300篇,2014年以322篇位居第一。雖然2014年后發(fā)文量有所下降,但是每年發(fā)文數(shù)仍超過250篇,遠高于2010年之前的年發(fā)文量。從近10年發(fā)文量總體來看,發(fā)文量較以往顯著增長,提示RV研究已逐漸引起人們的重視(圖1)。
注:紅點代表該地區(qū)RV相關研究發(fā)文量,紅點越密集,說明該地區(qū)RV相關研究發(fā)文量越多圖2 鼻病毒研究論文的全球分布Note: The red dot represents the amount of research papers about RV in this region, and the more the red dot means the more the research papers about RV in this regionFig.2 Rhinovirus articles distributed globally from 1970 to 2018
本研究同時分析了RV的相對研究興趣指數(shù)(relative research interest,RRI),RRI是指當年這一研究領域的加權論文數(shù)量(weighted publications per year,WPPY)在PubMed中所有研究領域加權論文集合(all weighted publications per year in PubMed,AWPPY)中所占的比例,RRI=WPPY/AWPPY。 其中某一研究領域在某一年的加權論文數(shù)量=某一年發(fā)表的論文總數(shù)×相關系數(shù)。本研究結果顯示關于RV國際研究的相對研究興趣指數(shù)出現(xiàn)兩個高峰,指數(shù)超過0.000275。1974—1975年為第一個高峰,此后出現(xiàn)下降,1983年后,指數(shù)逐漸上升,2014年達到高峰,并持續(xù)維持。
RV研究的發(fā)文量以及相對研究興趣指數(shù)近年來均呈顯著上升趨勢,從而可以預測RV研究將持續(xù)升溫并且逐漸成為病毒學研究熱點之一。
2.2 RV文獻發(fā)表的地域分布特點 檢索出的5 367篇RV文獻分布于全球117個國家和地區(qū),其中美國東部、歐洲及日本發(fā)表文獻的密度較高。發(fā)表文獻量最多的是美國,共1 803篇;第2位是英國,共436篇;中國排第6位,共152篇(圖2、圖3)。RV發(fā)文量按城市分類排名中,排第1位的是維也納,共175篇。排名前五的城市分別是維也納、麥迪遜、倫敦、夏洛茨維爾、土爾庫,北京排在第8位,共61篇文章(圖4)。
圖3 不同國家發(fā)表RV文章數(shù)量Fig.3 Quantities of rhinovirus articles published in countries
圖4 鼻病毒研究文獻的城市分布Fig.4 Cities distribution of papers related with rhinovirus
2.3 RV文獻發(fā)表的重要期刊分析 對RV研究文章發(fā)表的期刊進行排名。前20的期刊是以J Virol、PLoSOne、J Med Virol等國際雜志為主的英文期刊。其中JVirol刊登249篇,Plos One刊登146篇,J Med Virol發(fā)表122篇,JClin Virol發(fā)表115篇(表1)。
表1 發(fā)表鼻病毒文章的期刊排名Tab.1 Ranking of rhinovirus related journal
2.4 發(fā)表RV文獻主要作者 為了解國際上重點研究RV的專業(yè)人員,本研究通過GoPubMed檢索工具對發(fā)表RV研究文獻的作者進行統(tǒng)計分析。分析結果顯示發(fā)表RV研究文獻數(shù)量排名前5名的作者分別為 Tyrrell D、Johnston S、Gwaltney J、Hayden F、Rossmann M。發(fā)文量排名前20位的作者見表2,其中未見國內(nèi)作者。
表2 發(fā)表鼻病毒研究文獻數(shù)量的作者排名Tab.2 Quantity of authors’articles related with rhinovirus
2.5 RV重要研究團隊合作網(wǎng)絡特點 GoPubMed檢索工具建立可視化圖形。研究人員合作網(wǎng)絡圖中點線表示1次合作,虛線表示2次合作,直線表示3~5次合作,粗直線表示6次合作,連線越多,線型越復雜說明該作者的研究地位越重要。通過可視化圖形可以發(fā)現(xiàn)RV研究團隊中有5個作者群的聯(lián)系非常緊密,其中 Tyrrell D、Johnston S和 Gwaltney J分別形成各自的合作研究團隊,而且3位作者的發(fā)文量也位居前3位。結果提示發(fā)文量高的作者往往在關系網(wǎng)中也具有重要地位(圖5)。
圖5 鼻病毒研究團隊之間關聯(lián)圖Fig.5 Interaction network of groups related with rhinovirus
2.6 RV研究主題詞詞頻分布 檢索工具分析這些文獻中主題詞,從中得出高頻主題詞的詞頻,通過SPSS20.0統(tǒng)計出這些主題詞出現(xiàn)的頻次,百分比以及累計百分比,從而分析出RV研究的熱點和重點。排名前20位的與RV研究有關的高頻主題詞分布情況如表3所示。其中 Rhinovirus、Humans、Viruses、Respiratory tract infections、Child 等主題詞出現(xiàn)的頻率位居前5位。從中可以分析出RV感染、復制、核酸診斷、混合感染、對哮喘的影響和藥物治療等均為RV的研究重點。
表3 鼻病毒研究主題詞高頻詞文獻分布Tab.3 Distribution of high frequency subject words related with rhinovirus
RV是呼吸道感染中最常見的病原體。RV感染引起的主要癥狀表現(xiàn)為感冒,30% ~60%的成年人及10%~30%的嬰幼兒感冒均由RV感染引起的。其中許多病例發(fā)展為支氣管炎、哮喘、肺炎等疾病,而且RV感染會引起哮喘、慢性阻塞性肺病的加重。因此,RV的研究越來越引起人們重視[9]。
PubMed是一個生物醫(yī)學相關的論文及相關信息的搜尋數(shù)據(jù)庫。雖然提供了比較完善的檢索功能,但是并沒有提供對檢索結果的分析統(tǒng)計功能,而GoPubMed正好彌補了這一功能。GoPubMed的數(shù)據(jù)源與 PubMed數(shù)據(jù)庫完全一致,因而可以對Pubmed檢索結果進行統(tǒng)計分析,為科研工作者提供了極大的方便[10]。
通過以上檢索結果發(fā)現(xiàn)RV發(fā)文量總體呈現(xiàn)上升趨勢,說明RV研究日益受到科研工作者的重視。發(fā)文量主要集中在歐美地區(qū),中國發(fā)文量及北京發(fā)文量雖然均位于國家和城市發(fā)文量排名前十,但與發(fā)文量排名第一的國家(美國)和城市(維也納),差距比較明顯。RV發(fā)文量排名前20的期刊中未見中國期刊,排名前20的高產(chǎn)作者以及研究人員合作網(wǎng)絡中也均未見國內(nèi)作者。以上幾點說明我國RV研究與歐美地區(qū)存在較大差距,因此我國的科研工作者需要加強RV相關領域研究,積極參與RV研究國際合作。進一步提高我國在應對RV的防控與治療方面的水平與實力。
本研究從不同的角度揭示了RV的研究現(xiàn)狀和研究方向,為RV研究者及研究機構提供了一定參考,也為RV的預防與控制提供了科學依據(jù)。
利益沖突無