雷正達(dá) 莊斌 稅丹 張益書(shū) 景南鑫 李莉 龔洋
摘要:通過(guò)微流控技術(shù)與透射式技術(shù)的比較研究,將公豬精液檢測(cè)設(shè)計(jì)為加樣超微芯片和數(shù)據(jù)分析處理的主機(jī)組成,以及大數(shù)據(jù)、人工智能平臺(tái)的整合,完善了豬精液品質(zhì)快速檢測(cè)的智能系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了豬精液品質(zhì)檢測(cè)的智能化、大數(shù)據(jù)、互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)與養(yǎng)豬業(yè)的深度融合。
關(guān)鍵詞:豬精液;品質(zhì)檢測(cè);超微芯片;大數(shù)據(jù)云平臺(tái)
中圖分類號(hào):S828.3 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B 文章編號(hào):2095-9737(2018)10-0006-03
1 背景
我國(guó)生豬養(yǎng)殖量居世界第一,出欄肥豬占世界的50.6%,母豬存欄達(dá)4423萬(wàn)頭[1],占全球總量的60%以上。由于豬肉是我國(guó)消費(fèi)量最大的肉類食品,約占肉類消費(fèi)總量的65%左右,因此豬肉的品質(zhì)、產(chǎn)量等都會(huì)直接影響國(guó)民生活水平[2]。人工授精技術(shù)(AI)是一種有著重要實(shí)踐意義的生殖輔助技術(shù)。豬的人工授精技術(shù)始于20世紀(jì)30年代,目前中國(guó)每年大約有3000萬(wàn)頭母豬進(jìn)行人工授精,受孕率達(dá)80%~90%,與自然交配的產(chǎn)仔率和產(chǎn)仔數(shù)相差無(wú)幾,甚至更高[3]。由于其不僅可以充分發(fā)揮優(yōu)秀種公豬的遺傳潛力,還可以減少種公豬的飼養(yǎng)數(shù)量、降低飼養(yǎng)成本、減少性傳播疾病、提高母豬的受胎率和窩產(chǎn)仔數(shù)、提高生產(chǎn)效率、獲得更高的經(jīng)濟(jì)效益等,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于集約化、規(guī)模化、標(biāo)準(zhǔn)化的大型養(yǎng)殖場(chǎng)和家庭農(nóng)場(chǎng)。
在豬的人工授精過(guò)程中,公豬精液的品質(zhì)是關(guān)系到母豬受精率和產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)鍵因素。精子密度越大、活力越強(qiáng)、畸形精子越少,說(shuō)明公豬精液質(zhì)量越好,配種后母豬的受精率和產(chǎn)仔數(shù)越高,反之越低。因此在人工授精前,首先要評(píng)定精液的質(zhì)量,從而才能保證有足夠數(shù)量和活力的精子。同時(shí),通過(guò)對(duì)精液質(zhì)量評(píng)定還能監(jiān)控公豬健康狀況和繁殖潛力,從而可優(yōu)化個(gè)體遺傳潛力,發(fā)揮最大繁殖能力。
目前我國(guó)公豬精液檢測(cè)90%以上采用“生物顯微鏡檢測(cè)法”,雖然國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)的制定也是以此方法為參照,但此法具有較大的局限性。除了檢測(cè)主要采用量筒、顯微鏡等儀器進(jìn)行,每一指標(biāo)單獨(dú)檢測(cè),對(duì)設(shè)備要求低但檢測(cè)步驟繁瑣之外,更為突出的問(wèn)題有以下幾點(diǎn):①檢測(cè)過(guò)程是靠人的肉眼分辨計(jì)數(shù),人為因素影響較大,準(zhǔn)確性差;②從采精到精液稀釋,再到檢測(cè)結(jié)果出來(lái),時(shí)間需30~50min,不能實(shí)現(xiàn)快速檢測(cè),耗工耗時(shí);③由于公豬精液中的營(yíng)養(yǎng)有限,精液原液超過(guò)30min,精子因營(yíng)養(yǎng)不足,其活力顯著下降,在實(shí)際檢測(cè)中有很大的局限性,也會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性;④不能實(shí)現(xiàn)采精和配種前現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè);⑤不能實(shí)現(xiàn)互聯(lián)和大數(shù)據(jù)的累存和精液質(zhì)量跟蹤。
國(guó)外已有公司研發(fā)公豬精液智能檢測(cè)設(shè)備,其原理是經(jīng)染色(與傳統(tǒng)顯微鏡染色原理相同)圖像識(shí)別法。該方法通過(guò)監(jiān)測(cè)活動(dòng)精子被收集區(qū)域的熒光強(qiáng)度,可以同時(shí)分析活動(dòng)精子密度和活動(dòng)力。熒光染色一段時(shí)間之后,其熒光強(qiáng)度被用來(lái)量化活動(dòng)精子的密度。此外,精子的運(yùn)動(dòng)也有助于積累熒光信號(hào)。但其也有如下局限性:①進(jìn)口價(jià)格昂貴,每臺(tái)售價(jià)在30萬(wàn)元以上,養(yǎng)豬場(chǎng)很難接受;②不能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的快速分析;③不能實(shí)現(xiàn)平臺(tái)的數(shù)據(jù)儲(chǔ)存;④不能實(shí)現(xiàn)歷史數(shù)據(jù)的快速調(diào)閱和數(shù)據(jù)跟蹤;⑤設(shè)備體積較大,現(xiàn)場(chǎng)使用不便等。
隨著精液保存技術(shù)的發(fā)展,以及國(guó)外凍精液引入,傳統(tǒng)的精液品質(zhì)檢測(cè)評(píng)估方法和手段已經(jīng)不能夠滿足豬人工授精的需要。我國(guó)母豬平均產(chǎn)仔數(shù)與發(fā)達(dá)國(guó)家相比具有較大差距,這與我國(guó)對(duì)公豬精液沒(méi)有實(shí)行每批次檢測(cè),精液解凍后、配種前沒(méi)有實(shí)行檢測(cè)和質(zhì)量監(jiān)控有很大關(guān)系。因此我國(guó)急需更先進(jìn)的公豬精液品質(zhì)檢測(cè)評(píng)估的先進(jìn)儀器,以進(jìn)一步提高人工授精在養(yǎng)豬生產(chǎn)中的作用,從而提高生產(chǎn)成績(jī)和效率。
2 智能檢測(cè)系統(tǒng)研究方法與路線的探索
2.1 前端信息采集的微流控技術(shù)路線
目前,基于微流控芯片技術(shù)的精液品質(zhì)智能檢測(cè)設(shè)備在人類精液方面的研究較為深入,并已形成產(chǎn)品,以此為參考選擇微流控技術(shù)中較為主流的兩種分析方法進(jìn)行研究,即跑道式的阻抗脈沖信號(hào)分析法和透射式的高速拍攝圖像視覺(jué)分析法。微流控芯片是微型全分析系統(tǒng)的一種,可在微納尺度上集成多種功能單元,且能提供相對(duì)封閉的接近生理狀態(tài)的生長(zhǎng)微環(huán)境。由于能夠?qū)崿F(xiàn)在整體可控的微小平臺(tái)上將多種單元操作技術(shù)規(guī)模集成、靈活組合,微流控芯片已成為一種最具發(fā)展?jié)摿Φ募?xì)胞研究平臺(tái)[4]。微流控裝置主要由三部分組成:玻璃基片,刻有微通道的PDMS,三個(gè)儲(chǔ)液池以及保持在不同的液面高度的液柱。圖1(a)顯示的為微流控裝置的細(xì)節(jié)圖。儲(chǔ)液池的橫截面面積(20mm×20mm)選擇要盡可能的大以減小每個(gè)裝載液柱高度的變化(最多5%的變化)。流場(chǎng)的驅(qū)動(dòng)力由三個(gè)液柱高度的差異產(chǎn)生,在儲(chǔ)液池A中是10mm高的緩沖試劑溶液,儲(chǔ)液池B中是4mm高的純精液,儲(chǔ)液池C中是1mm高的緩沖試劑溶液。交界處的放大圖片如圖1(b)所示,通道B和C與通道A相交成45度角。精子流通道B的設(shè)計(jì)是7mm長(zhǎng),500μm寬。其他尺寸細(xì)節(jié)如圖1(c)所示。
以跑道式的阻抗脈沖信號(hào)分析法進(jìn)行設(shè)計(jì),則在生物芯片中設(shè)計(jì)一個(gè)長(zhǎng)的微流道,當(dāng)精液樣本被滴人充滿試劑的芯片之后,精液中的精子細(xì)胞就在微通道中游動(dòng),利用精子的逆流特性O(shè)SS分離判定活動(dòng)精子,根據(jù)庫(kù)爾特電阻抗原理令精子通過(guò)特定位置傳感器,此時(shí)電阻發(fā)生變化,產(chǎn)生電脈沖。精子通過(guò)孔道期間電壓降低的時(shí)間追蹤包含豐富的信息:感應(yīng)脈沖的振幅呈現(xiàn)精子的體積,持續(xù)時(shí)間可評(píng)估出游過(guò)速度,疊加在脈沖信號(hào)的電壓波動(dòng)可以計(jì)算出拍頻,利用這一原理和信息測(cè)算精子數(shù)量和活力。
這一研究成果應(yīng)用到豬精液品質(zhì)檢測(cè)領(lǐng)域,則出現(xiàn)較難克服的問(wèn)題,如豬精子個(gè)頭較大,活動(dòng)能力較強(qiáng),運(yùn)動(dòng)速度更快,容易在跑道人口處堵塞等。雖然可再通過(guò)改變介質(zhì)密度和黏度等的手段改善這個(gè)問(wèn)題,但還需進(jìn)一步更深入地探索研究。
2.2 前端信息采集的透射式技術(shù)路線
以透射式的高速拍攝圖像視覺(jué)分析法進(jìn)行設(shè)計(jì),則當(dāng)精液樣本滴人芯片進(jìn)樣口后,精液中的精子細(xì)胞在微通道中游動(dòng),均勻填滿精子計(jì)數(shù)板采樣區(qū)域,通過(guò)光學(xué)超清顯微鏡頭組和配套的高清攝像頭,運(yùn)用全智能電控進(jìn)行自動(dòng)對(duì)焦自動(dòng)尋軌,拍攝樣本圖片及短視頻采集精子的外觀信息及運(yùn)動(dòng)信息,使用機(jī)器視覺(jué)和圖像處理技術(shù)進(jìn)行各種運(yùn)算來(lái)抽取目標(biāo)的特征。通過(guò)CCD采集圖像;進(jìn)行除噪、平滑等預(yù)處理;進(jìn)行圖像分割,二值化處理;進(jìn)行邊緣檢測(cè)來(lái)提取特征。同時(shí),正態(tài)高斯動(dòng)態(tài)圖像智能算法,精準(zhǔn)識(shí)別精子運(yùn)動(dòng)軌跡。從而對(duì)精子進(jìn)行密度、活力、運(yùn)動(dòng)性分析、形態(tài)學(xué)分析。通過(guò)設(shè)置多個(gè)進(jìn)樣池,每個(gè)進(jìn)樣池檢測(cè)時(shí)為定點(diǎn)拍照、短視頻拍攝,逐幀分析,判斷精子活力。這一方案實(shí)現(xiàn)了對(duì)豬原精液、稀釋后的精液、解凍后配種前精液的快速檢測(cè)、智能分析、操作便捷、快速高效之目的。
2.3 大數(shù)據(jù)分析和人工智能云平臺(tái)搭建
隨著移動(dòng)互聯(lián)網(wǎng)、物聯(lián)網(wǎng)和云計(jì)算的迅速發(fā)展,開(kāi)啟了據(jù)庫(kù)技術(shù)的成熟和普及、高內(nèi)存高性能的存儲(chǔ)設(shè)備和存儲(chǔ)介質(zhì)的出現(xiàn),大量檢測(cè)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析、云端儲(chǔ)存、快速調(diào)閱成為可能。我們研發(fā)的豬精液智能檢測(cè)設(shè)備系統(tǒng)通過(guò)創(chuàng)新統(tǒng)計(jì)分析方法和數(shù)學(xué)模型的建立,對(duì)每頭公豬精液檢測(cè)數(shù)據(jù)(實(shí)時(shí)檢測(cè)的全部數(shù)據(jù))實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)生成統(tǒng)計(jì)分析判斷結(jié)果,數(shù)據(jù)永久儲(chǔ)存,數(shù)據(jù)溯源跟蹤,實(shí)時(shí)快速查閱。
該系統(tǒng)平臺(tái)原理是通過(guò)國(guó)內(nèi)基于Nginx改進(jìn)的前端代理服務(wù)器Tengine,集成創(chuàng)新開(kāi)發(fā)的socket集群,該socket集群采用基于Java開(kāi)發(fā)socket server,集成開(kāi)源的Zookeeper做服務(wù)注冊(cè),服務(wù)配置和服務(wù)選擇,提供高可用的,高吞吐的后端socket數(shù)據(jù)服務(wù),保證數(shù)據(jù)不會(huì)丟失。同時(shí),采用的是開(kāi)源mysql搭配開(kāi)源NOSQL redis和mongodb,通過(guò)定義三層數(shù)據(jù)熱區(qū)(常用,一般,歸檔)來(lái)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)快速訪問(wèn)和大數(shù)據(jù)量的存儲(chǔ)平衡。由于該移動(dòng)應(yīng)用通過(guò)采用HTML5框架,加入Jquery mobile等組件,共同搭建可以同時(shí)運(yùn)行在蘋果iOS和安卓Android應(yīng)用程序,使得用戶可以得到統(tǒng)一應(yīng)用的界面和操作習(xí)慣。整個(gè)云平臺(tái)的運(yùn)行流程見(jiàn)圖2。
3 豬精液品質(zhì)智能檢測(cè)系統(tǒng)的產(chǎn)品性能
通過(guò)不同技術(shù)路線的探索研究,采用前端信息采集的透射式技術(shù)路線和大數(shù)據(jù)分析和人工智能云平臺(tái)組合,實(shí)現(xiàn)了豬精液品質(zhì)檢測(cè)的智能化、大數(shù)據(jù)、互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)與養(yǎng)豬業(yè)的深度融合。
該系統(tǒng)的檢測(cè)參數(shù)如表1所示,能達(dá)到的性能技術(shù)指標(biāo)如表2所示。整個(gè)系統(tǒng)全智能運(yùn)行,減少人為誤差,提高數(shù)據(jù)精確度,減少測(cè)試樣本浪費(fèi),做到精準(zhǔn)檢測(cè);智能分析,分析報(bào)告詳細(xì),全面反映精子質(zhì)量,把握公豬生產(chǎn)性能,提高母豬產(chǎn)仔率;快捷高效,操作便捷,無(wú)需專業(yè)人員;智能聯(lián)合,全網(wǎng)通數(shù)據(jù)模塊,無(wú)縫對(duì)接農(nóng)場(chǎng)管理軟件,構(gòu)建質(zhì)量回溯通道。
4 結(jié)論
通過(guò)微流控技術(shù)與透射式技術(shù)的比較研究,將公豬精液檢測(cè)設(shè)計(jì)為加樣超微芯片和數(shù)據(jù)分析處理的主機(jī)組成,采用直接圖像法,當(dāng)精液樣本滴人芯片進(jìn)樣口后,精液中的精子細(xì)胞在微通道中游動(dòng),均勻填滿精子計(jì)數(shù)板采樣區(qū)域,通過(guò)光學(xué)超清顯微鏡頭組和配套的高清攝像頭拍攝樣本短視頻,從而對(duì)精子進(jìn)行密度、活力、運(yùn)動(dòng)性分析、形態(tài)學(xué)分析的技術(shù)路線,以及大數(shù)據(jù)、人工智能平臺(tái)的整合,完善了豬精液品質(zhì)快速檢測(cè)的智能系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了豬精液品質(zhì)檢測(cè)的智能化、大數(shù)據(jù)、互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)與養(yǎng)豬業(yè)的深度融合。
這一系統(tǒng)的建立,不僅提高公豬精液品質(zhì)檢測(cè)的精度,且快捷高效,還能實(shí)現(xiàn)公豬原精液、稀釋精液、配種精液(配種前精液)每批次、每頭份檢測(cè),這必將提高母豬的產(chǎn)仔數(shù)和生產(chǎn)成績(jī),無(wú)疑對(duì)我國(guó)養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)是一大貢獻(xiàn)。
參考文獻(xiàn):
[1]2014年國(guó)家統(tǒng)計(jì)局?jǐn)?shù)據(jù)
[2]李小金,錢坤,劉林清,等.基于RNA-seq技術(shù)對(duì)不同品種豬背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋[J].西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2016,44(6):1-8.
[3]王佳輝,黃宣凱,秦曉文.目前國(guó)內(nèi)外豬人工授精新技術(shù)及新產(chǎn)品[J].現(xiàn)代畜牧科技,2016(3):52.
[4]Laws M J,Taylor R N,Sidell N,et al.Gap junction communica-tion between uterine stromal cells plays a critical role in pregnan-cy-associated neovascularization and embryo survival[J].De-velopment.2008,135(15):2659-2668.