1979年，曹文軒開始發(fā)表文學(xué)作品，其中短篇小說《弓》和《啞?！贩謩e獲得1982年《兒童文學(xué)》、《少年文藝》優(yōu)秀作品獎。

1988年4月，他的短篇小說《再見了，我的小星星》獲得第一屆全國優(yōu)秀兒童文學(xué)獎。1988年5月，憑借學(xué)術(shù)著作《中國八十年代文學(xué)現(xiàn)象研究》獲北京大學(xué)首屆青年優(yōu)秀科研成果一等獎；同年10月，獲中國當代文學(xué)研究會第二屆文學(xué)評論科研獎。

1992年12月，曹文軒憑借長篇小說《山羊不吃天堂草》獲第三屆宋慶齡兒童文學(xué)獎金獎，并于次年2月獲中國作家協(xié)會全國兒童文學(xué)作品集評獎一等獎；1993年11月，短篇小說《藍花》獲冰心兒童文學(xué)獎新作獎。1995年2月，短篇小說集《紅葫蘆》獲中國臺灣《中國時報》1994年度十大童書獎及“好書大家讀”年度短篇小說類創(chuàng)作最佳獎，《山羊不吃天堂草》獲“好書大家讀”年度長篇小說類創(chuàng)作最佳獎。

1998年2月，中短篇小說《三角地》獲“好書大家讀”年度最佳少年兒童讀物獎，長篇小說《草房子》獲“好書大家讀”年度最佳少年兒童讀物獎，同年8月《草房子》獲第九屆冰心文學(xué)獎大獎，次年10月獲第四屆國家圖書獎；1999年10月，憑借長篇小說《紅瓦》獲第四屆國家圖書獎二等獎；1999年6月，憑借改編電影《草房子》獲第八屆中國電影童牛獎優(yōu)秀編劇獎，同年10月，獲得第十九屆中國電影金雞獎最佳劇本獎。

2000年5月，長篇小說《草房子》再獲第四屆全國優(yōu)秀兒童文學(xué)獎及第五屆宋慶齡兒童文學(xué)獎小說類金獎；同年電影《草房子》獲得第十四屆德黑蘭國際電影節(jié)評審團特別大獎“金蝴蝶獎”。

2002年9月，任中國作家協(xié)會兒童文學(xué)委員會委員。

2003年9月，當選為北京作家協(xié)會副主席。

2003年10月，長篇小說《根鳥》獲第六屆宋慶齡兒童文學(xué)獎佳作獎；2004年2月，提名中國安徒生獎；同年5月，獲得國際安徒生獎提名[12]；同年10月，長篇小說《細米》獲中國作家協(xié)會第六屆全國兒童文學(xué)獎；2005年12月，長篇小說《青銅葵花》獲中國臺灣《中國時報》2005年十大好書，于次年3月獲“好書大家讀”年度長篇小說類創(chuàng)作最佳獎。《青銅葵花》還獲了“五個一工程”獎、國家圖書獎、第七屆中國作協(xié)全國優(yōu)秀兒童文學(xué)獎、冰心文學(xué)大獎。

2007年5月，成為中國作家協(xié)會第六屆全國委員會委員。

2010年11月，小說《黃琉璃》獲第八屆全國優(yōu)秀兒童文學(xué)獎獎。

2016年4月4日，曹文軒摘得國際兒童讀物聯(lián)盟（IBBY）2016年度“國際安徒生獎”；同年5月，他在《人民文學(xué)》雜志6月刊上全文發(fā)表長篇小說《蜻蜓眼》，該作于2017年12月獲得首屆“吳承恩長篇小說獎”。