南農(nóng)大完成植物重復(fù)基因數(shù)據(jù)庫

近日，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)張紹鈴教授團隊系統(tǒng)鑒定了梨等141種植物基因組的不同類型重復(fù)基因，構(gòu)建了植物重復(fù)基因數(shù)據(jù)庫，揭示了重復(fù)基因進化的普遍規(guī)律。相關(guān)成果近日在線發(fā)表于國際知名學(xué)術(shù)期刊《基因組生物學(xué)》。

重復(fù)基因即基因復(fù)制產(chǎn)生的兩個同源基因，植物通過復(fù)制基因，能夠豐富自身基因庫，抵御外界復(fù)雜多變的環(huán)境，還能增加進化變異的機會，實現(xiàn)物種分化和多樣性。隨著近年來測序技術(shù)的升級，測序成本大幅降低，越來越多的植物基因組被破譯，目前已完成全基因組測序的植物超過200種，包括單細(xì)胞綠藻、苔蘚類植物、蕨類植物、裸子植物以及被子植物，但對于鑒定不同種類植物的重復(fù)基因，仍缺乏一個通用方法。

南農(nóng)大張紹鈴教授團隊此前系統(tǒng)鑒定了梨基因組中的重復(fù)基因，以此為基礎(chǔ)，團隊開發(fā)了一個具有普遍適用性的生物信息學(xué)方法，并深入分析了141種植物的基因組。團隊利用141種植物基因組中包含的所有蛋白序列，構(gòu)建了大規(guī)模的植物直系同源基因家族，包含大豆、水稻、小麥、玉米等大宗糧食作物，以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花卉等園藝作物，今后將陸續(xù)拓展其他植物類別。

（新華網(wǎng)）