陶建萍 蔡永林
近年來,我國肺炎鏈球菌感染發(fā)病率逐漸升高,同時,歐美等其他國家也出現(xiàn)了較為明顯的肺炎鏈球菌感染性疾病發(fā)病率增長的現(xiàn)象。β內(nèi)酰胺類抗生素是臨床治療肺炎鏈球菌感染的常用藥,而肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類抗菌藥物現(xiàn)象的出現(xiàn)則嚴重影響了這類藥物的應用及治療效果。因此,本研究將與兒童耐β內(nèi)酰胺類肺炎鏈球菌耐藥相關基因有關的研究綜述如下。
作為社區(qū)獲得性肺炎、中耳炎等感染疾病的主要致病菌,肺炎鏈球菌以兒童、老年人為易感人 群[1]。這種致病菌以蛋白質(zhì)、肽聚糖及多糖等為主要成分[2]。除了社區(qū)獲得性肺炎等常見感染性疾病外,這種致病菌還可能誘發(fā)腦膜炎、膿胸等嚴重侵襲性肺炎鏈球菌病[3]。上述疾病的發(fā)生均會影響患者的日常生活,甚至可能威脅人們的生命安全。
近年來,隨著抗生素濫用現(xiàn)象的加劇,肺炎鏈球菌耐藥變得越來越普遍。RR Reinert[4]認為,肺炎鏈球菌對青霉素等β內(nèi)酰胺類抗菌藥物產(chǎn)生耐藥的作用機制主要與青霉素結合蛋白有關。機體細菌青霉素結合蛋白因相關因素影響發(fā)生突變,造成青霉素結合蛋白結構產(chǎn)生變化,同時,上述變化導致這種蛋白對抗生素的親和力水平發(fā)生顯著降低,進而誘發(fā)β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥,影響β內(nèi)酰胺類抗菌藥物的治療效果。
兒童是肺炎鏈球菌的高危感染人群。研究提示,兒童肺炎鏈球菌對亞胺培南、青霉素等的耐藥率處于上升狀態(tài),提示肺炎鏈球菌耐藥菌株不斷增加,耐藥性不斷增強。2017年CHINET 中國細菌耐藥性監(jiān)測研究顯示[5],4511 株非腦膜炎分離肺炎鏈球菌根據(jù)青霉素藥敏試驗結果,其中3212 株兒童株中PSSP、PISP和PRSP的檢出率分別為86.8%、11.0%、2.2%。若未及時干預,β內(nèi)酰胺類抗菌藥物治療兒童肺炎鏈球菌疾病的效果將受到極大影響,進而影響患兒的治療安全性。
3.1 菌株篩選菌株篩選無疑是分析兒童耐β內(nèi)酰胺類肺炎鏈球菌耐藥相關基因的關鍵。臨床肺炎鏈球菌疾病治療中常用的β內(nèi)酰胺類抗菌藥物較多,如頭孢呋辛鈉、莫西沙星、頭孢吡肟及青霉素鈉等。為了保障菌株篩選質(zhì)量,整個篩選過程除了需要嚴格參照《全國臨檢操作規(guī)程》實施操作外,還應盡量選用E-test 法實施檢測[6]。
3.2 細菌總DNA 提取確定兒童耐β內(nèi)酰胺類肺炎鏈球菌耐藥基因是抑制肺炎鏈球菌對β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥的關鍵環(huán)節(jié)。分析耐藥相關基因時,篩選出菌株后,可采用煮沸法、水浴離心處理法獲取肺炎鏈球菌耐藥基因的基因組DNA 模板[7]。
3.3 制備引物與基因檢測制備引物時,為了確保耐藥相關基因分析效率,可將GenBank 登錄肺炎鏈球菌R6 株全基因序列作為參照依據(jù)。而行基因檢測時,應分別以隨機抽樣法選擇數(shù)量接近的β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥菌株等。Huang Yong等[8]認為,應將PBP2b 基因、PBP1a 二等青霉素結合蛋白基因、青霉素耐藥相關基因、肺炎鏈球菌非青霉素結合蛋白基因納入耐藥相關基因分析的范疇,而基因檢測方法則應選用PCR 法。
3.4 PCR 擴增及基因測序PCR 擴增緩解中,為了確保最終耐藥相關基因分析結果的準確性,應分別設置陰性對照組(選用肺炎鏈球菌ATCC 49619DNA模板)、空白對照(無DNA 模板),由此判斷PCR 反應的特異性。朱奇峰[9]指出:耐藥相關基因分析中,假陽性結果、假陰性結果的產(chǎn)生可影響最終分析結果的準確性,因此,PCR 擴增試驗應分別針對每個樣本的PCR 反應重復1次,以確保最終耐藥相關基因分析結果可作為肺炎鏈球菌對β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥抑制工作的參照依據(jù)。基因測序時,需將標準β內(nèi)酰胺類抗菌藥物敏感菌株作為測序結果的參照依據(jù)[10],最終根據(jù)所分析基因的變異率信息及氨基酸置換模式,判斷其是否與肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類抗菌藥物有關[11]。
3.5 相關基因分析結果
3.5.1 PBP 基因 事實上,面對當前臨床日益增長的肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類抗生素問題,探討肺炎鏈球菌耐藥機制及耐藥相關基因勢在必行。柏曉輝[12]將由青霉素結合蛋白改變誘發(fā)的肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類抗生素作為重點,分析這種致病菌的耐藥相關基因,結果表明:青霉素結合蛋白基因變異發(fā)生于SSN 序列及其周圍區(qū)域、STMK 序列,青霉素結合蛋白基因(PBPs)變異是造成肺炎鏈球菌感染患兒β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥的主要原因。韓嬌等[13]通過對肺炎鏈球菌感染患兒耐藥相關基因的分析指出:肺炎鏈球菌對β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥與PBP2x、PBP1a、PBP2b 變異有關,且當基因保守序列及周圍變異位點數(shù)量增加時,β內(nèi)酰胺類抗生素最小抑菌濃度參數(shù)也將隨之產(chǎn)生變化,二者呈正相關。
張春玲等[14]研究中詳細探討了肺炎鏈球菌耐藥基因—PBP2b的氨基酸置換模式,在PBP 耐藥基因中,PBP2b 基因最先發(fā)生變異,氨基酸置換主要發(fā)生于T431/Q432-F437 序列中(置換氨基酸數(shù)量為6~7個)。Matsumoto Ayumi等[15]的研究也驗證了上述觀點,并指出:PBP2b 耐藥基因中保守序列448SSN 可能是導致肺炎鏈球菌感染患兒對青霉素耐藥的主要原因。該保守序列中,氫鍵為青霉素R1 側鏈碳基與序列中450Asn的連接媒介,而在該保守序列后,氫鍵的媒介作用可受到Thr451-Ala 突變機制的干擾,同時,這一機制還會造成PBP2b 基因?qū)η嗝顾剡@種β內(nèi)酰胺類抗生素的親和力下降,進而影響其治療肺炎鏈球菌干擾患兒的效果。俞春松等[16]的研究也闡述了類似觀點。
季偉等[17]指出:PBP2x 氨基酸置換為造成肺炎鏈球菌耐藥的主要原因,二者之間的關聯(lián)可通過定向誘導試驗、PBP2x與肺炎鏈球菌的關系(前者為后者的必需蛋白質(zhì)之一)等進行證實。樊歡等[18]也將PBP2x 作為肺炎鏈球菌耐藥相關基因分析的重點,其在研究中指出:這種基因?qū)Ψ窝祖溓蚓退幮缘挠绊懪cThr338-Ala 變異有關,原因為這種變異機制可波及β4 區(qū)域及α2 區(qū)域的氫鍵結合力,導致水分子結構形成受到感染,進而造成對β內(nèi)酰胺類抗菌藥物的?;饔孟陆怠?/p>
研究指出:PBP1a 在β內(nèi)酰胺類抗菌藥物(頭孢噻肟、青霉素等)的高度耐藥中扮演著重要角色[19]。石燕華等[20]以頭孢噻肟的青霉素結合蛋白轉(zhuǎn)化敏感菌株、肺炎鏈球菌高度耐藥菌株開展實驗分析,結果均證實PBP1a 基因與β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥存在關聯(lián)。張春玲等[21]的研究也與上述結果一致。
3.5.2 非PBP 基因 Müller Miriam等[22]在研究中重點探討了非PBP 基因變異與肺炎鏈球菌耐藥的關聯(lián):murM 基因變異可造成肺炎鏈球菌對頭孢曲松、青霉素等β內(nèi)酰胺類抗菌藥物耐藥,但其僅限于接受高水平β內(nèi)酰胺類抗生素治療對象(頭孢曲松、青霉素的高水平范圍分別為抗生素最小抑菌濃度超出2μg/L、8μg/L)。丁晶晶等[23]的研究認可了murM 基因變異與肺炎鏈球菌耐藥的關聯(lián),但同時指出:這種基因無法單獨誘發(fā)肺炎鏈球菌耐藥,而需與其他基因形成聯(lián)合機制,方可影響β內(nèi)酰胺類抗菌藥物治療肺炎鏈球菌感染性疾病的效果。
Ma X等[24]在研究中分析了CiaH 這種非PBP基因?qū)Ψ窝祖溓蚓退幍挠绊懀哼@種基因的胞內(nèi)C端、胞外N 端分別具有良好的激酶活性及感應器功能,同時也含有組胺激酶-受體CiaRH 系統(tǒng)。組胺激酶-受體CiaRH 系統(tǒng)可對有不同階段細胞壁抑制劑誘發(fā)的細胞溶解機制產(chǎn)生較強的抵抗作用,因此,可認為CiaH 基因與肺炎鏈球菌對萬古霉素等β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥有關。
樊歡[25]認為:cpoA 基因可造成兒童肺炎鏈球菌對哌拉西林耐藥。這種非PBP 基因與CiaH 基因?qū)Ψ窝祖溓蚓退帣C制影響的區(qū)別在于:后者對肺炎鏈球菌感受態(tài)的誘導活性消失,而cpoA 這種糖基轉(zhuǎn)移酶耐藥基因則仍保留一定的肺炎鏈球菌感受態(tài)誘導活性,但這一特征的出現(xiàn)階段較晚,因此可認為這種基因參與肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類的耐藥機制。
3.6 兒童耐β內(nèi)酰胺類肺炎鏈球菌耐藥相關基因的研究價值β內(nèi)酰胺類抗菌藥物作為臨床治療肺炎鏈球菌感染的首選藥物,其兼具經(jīng)濟成本低、療效顯著等多種優(yōu)勢[26]。但由于抗生素的普及、濫用引發(fā)的肺炎鏈球菌耐藥影響了這類抗菌藥物優(yōu)勢的發(fā)揮。而通過分離菌株、青霉素耐藥相關基因TEM 檢測等流程分析肺炎鏈球菌的耐藥相關基因,則可為這種致病菌耐藥機制提供良好的理論依據(jù)。此外,臨床檢驗結果證實[27],部分耐β內(nèi)酰胺類抗生素肺炎鏈球菌感染患兒為多重耐藥,因此,耐藥相關基因分析不僅可為肺炎鏈球菌感染治療用藥提供支持,還有利于保障多重耐藥感染患兒的治療效果,并為多重耐藥菌株的流行防范提供指導。
綜上所述,肺炎鏈球菌耐β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥相關基因包含PBP 基因、非PBP 基因等。單一PBP 位點變異難以造成肺炎鏈球菌對β內(nèi)酰胺類耐藥。因此,后續(xù)肺炎鏈球菌耐藥相關基因分析應進一步加強對不同PBP 位點變異內(nèi)部及其與非PBP 基因之間的關聯(lián),進而判定肺炎鏈球菌的耐藥機制。本研究認為,由于不同地區(qū)的醫(yī)療環(huán)境差異較大,且醫(yī)療機構使用β內(nèi)酰胺類抗生素的習慣各異,因此,其所產(chǎn)生的肺炎鏈球菌感染治療效果也存在一定差異。為了減輕肺炎鏈球菌感染患兒的痛苦體驗,應根據(jù)當?shù)胤窝祖溓蚓純旱募膊☆愋?、病情嚴重程度等,針對性地開展患兒青霉素結合蛋白基因突變及非PBP 基因突變狀況的檢測,最終根據(jù)檢測結果確立用藥方案,以降低肺炎鏈球菌患兒的耐藥率,遏制多重耐藥菌株的流行及發(fā)展。