袁新 王锃涵 余祖江
【摘要】 目的: 分析長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA) LINC01772及肝細(xì)胞肝癌臨床相關(guān)指標(biāo)與預(yù)后的相關(guān)性,以期為改善肝細(xì)胞肝癌患者的臨床結(jié)局,延長(zhǎng)生存期提供新的思路。 方法: 從癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下載有關(guān)HCC的基因組學(xué)數(shù)據(jù)和研究個(gè)體的臨床資料,并利用SPSS軟件比較分析不同LINC01772的表達(dá)量以及HCC患者的年齡、性別、TNM分期、血清AFP濃度、病例分級(jí)等臨床特性對(duì)HCC患者預(yù)后情況的影響。 結(jié)果: HCC癌組織的TNM分期及LINC01772的表達(dá)量與患者的無(wú)進(jìn)展生存期(Progress Free Survival,PFS)存在顯著相關(guān)性(P<0.05)。 結(jié)論: LINC01772與HCC的發(fā)生發(fā)展相關(guān),有望成為HCC預(yù)測(cè)預(yù)后的潛在生物學(xué)標(biāo)志物。
【關(guān)鍵詞】 長(zhǎng)非編碼RNA-LINC01772;肝細(xì)胞肝癌;癌癥基因組圖譜;患者預(yù)后
【中圖分類號(hào)】R730.3 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】2095-6851(2019)05-220-01
肝癌是與癌癥相關(guān)的死亡最常見(jiàn)的原因之一[1]。肝細(xì)胞肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)占所有肝癌病例的70%~90%。雖然我國(guó)HCC的發(fā)病率和死亡率有明顯下降的趨勢(shì),但是龐大的人口基數(shù)和快速的人口增長(zhǎng)仍然導(dǎo)致大量新的HCC病例[2]。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸的轉(zhuǎn)錄本,沒(méi)有蛋白質(zhì)編碼能力。長(zhǎng)基因間非編碼RNA(lincRNAs)是長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)的亞型,其參與了發(fā)育、分化和致癌等多種生物學(xué)過(guò)程[3]。LINC01772是lincRNA的一種,在HCC中的具體機(jī)制和作用尚待闡明。本研究旨在通過(guò)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)探究LINC01772與HCC預(yù)后的關(guān)系,探討其是否可以成為預(yù)測(cè)肝細(xì)胞肝癌無(wú)進(jìn)展生存期的指標(biāo)。
1 資料與方法
1.1 一般資料
在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中選取肝細(xì)胞肝癌的高通量測(cè)序表達(dá)譜數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)時(shí)間截止至2017年7月。運(yùn)用R軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,剔除基因表達(dá)情況、一般資料、臨床病理特征或預(yù)后情況不完整的個(gè)體資料,得到具有完整數(shù)據(jù)的病例345例(包含30例配對(duì)的癌旁組織的數(shù)據(jù))。
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)庫(kù)分類
依據(jù)研究對(duì)象的年齡、性別、TNM分期、血清AFP濃度及病理學(xué)分級(jí)等資料的不同等級(jí)進(jìn)行分類預(yù)處理。根據(jù)LINC01772的中位表達(dá)量將HCC癌組織分為高表達(dá)組和低表達(dá)組。
1.2.2 統(tǒng)計(jì)分析
使用SPSS23.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。采用單因素多因素COX回歸模型分析LINC01772表達(dá)水平與HCC患者預(yù)后的關(guān)系。以a=0.05為檢驗(yàn)水準(zhǔn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2 結(jié)果
LINC01772表達(dá)水平與HCC患者預(yù)后情況的相關(guān)性
取HCC患者的年齡、性別、TNM分期、血清AFP濃度、病理學(xué)分級(jí)和LINC01772表達(dá)水平為協(xié)變量進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析。結(jié)果顯示,LINC01772高水平表達(dá)的HCC患者的PFS顯著低于LINC01772低水平表達(dá)者(P<0.05)。采用單變量COX回歸模型和多變量COX回歸模型分析各種臨床參數(shù)在生存率中的價(jià)值,單因素分析結(jié)果顯示TNM分期以及LINC01772的表達(dá)與患者PFS顯著相關(guān)(P<0.05);此外,取HCC患者的TNM分期和LIN01772表達(dá)水平為協(xié)變量進(jìn)行對(duì)因素回歸分析,TNM分期與LINC01772表達(dá)水平均為HCC的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,詳見(jiàn)表1。
3 討論
肝細(xì)胞肝癌(HCC)已成為中國(guó)癌癥相關(guān)死亡的第二大原因[4]。雖然在診斷和手術(shù)治療方面取得了很大進(jìn)展,但復(fù)發(fā)率和轉(zhuǎn)移率仍然很高。此外,HCC患者通常在中晚期階段被初步診斷,HCC晚期疾病患者的預(yù)后仍未得到保證[5]。因此,積極探索HCC分子機(jī)制,尋找影響肝癌預(yù)后的相關(guān)因素,對(duì)延長(zhǎng)患者生存期,進(jìn)一步制定診療計(jì)劃有著重要的作用。
研究表明,長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是地址代碼的關(guān)鍵組成部分,允許將基因、染色體和蛋白質(zhì)復(fù)合物運(yùn)輸?shù)狡淠康牡?,但需要激活或停用[6]。lncRNA與腫瘤發(fā)生發(fā)展密切相關(guān) ,可作為許多人類惡性腫瘤的潛在診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物,包括肺癌[7]、乳腺癌[8]和結(jié)腸癌[9]。源自某些基因的基因間區(qū)域的lincRNA起著競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA的作用并隔離miRNA,靶向染色質(zhì)修飾復(fù)合物或RNA結(jié)合蛋白以改變基因表達(dá)。LINC01772是一種新發(fā)現(xiàn)的lncRNA,有學(xué)者報(bào)到了其在肝癌中的表達(dá)及臨床意義,但其對(duì)HCC的預(yù)后影響尚不清楚[10]。
本研究通過(guò)挖掘TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中有關(guān)LINC01772在HCC和癌旁組織中的信息,推斷LINC01772對(duì)HCC患者預(yù)后的影響,得出了HCC癌組織的TNM分期及LINC01772的表達(dá)量與患者的無(wú)進(jìn)展生存期(Progress Free Survival,PFS)存在顯著相關(guān)性(P<0.05)的結(jié)論,證實(shí)了LINC01772具有判斷肝細(xì)胞肝癌預(yù)后情況的參考價(jià)值。
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