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      新冠病毒不是“人工病毒”

      2020-03-02 02:27向治霖
      南風(fēng)窗 2020年4期
      關(guān)鍵詞:宿主氨基酸論文

      向治霖

      石正麗被推到了中心。

      她是中科院新發(fā)和烈性病原與生物安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、武漢病毒所新發(fā)傳染病研究中心主任。2015年,有她參與的、發(fā)表在《自然醫(yī)學(xué)》的一項(xiàng)研究,被解讀為人工制造了超級(jí)毒株,接著被質(zhì)疑是此次疫情的禍根。

      兩個(gè)“被”字,需要有數(shù)據(jù)和論證,而病毒學(xué)具有門檻,不容易討論。但是,在2020年1月31日,印度學(xué)者發(fā)表文章說(shuō),經(jīng)比對(duì)發(fā)現(xiàn)新冠病毒的棘突蛋白上有4段新的插入序列,具體細(xì)節(jié)在后文敘述。印度學(xué)者據(jù)此說(shuō),新冠病毒不太可能是自然形成的。印度論文似乎佐證了“陰謀論”,實(shí)際也推動(dòng)了“生化武器說(shuō)”。但是,新冠病毒不可能是“人工病毒”,主要理由如下:

      1. 根據(jù)目前公開的新冠病毒RNA序列,變異位點(diǎn)分散,符合自然變異,證明它是自然界的病毒。

      2. 基因編輯技術(shù)不是仙術(shù),很難對(duì)單一的位點(diǎn)編輯。(事實(shí)上,因?yàn)檎撟C不嚴(yán)謹(jǐn),沒(méi)有證明“插入序列”作用于人的機(jī)制等,印度論文早就撤稿。)

      3. 病毒的基因序列中,沒(méi)有人工制造的位點(diǎn),證明它不可能產(chǎn)生于實(shí)驗(yàn)室。

      自1月21日,湖北省科技廳啟動(dòng)“2019新型肺炎應(yīng)急科技攻關(guān)研究項(xiàng)目”,石正麗擔(dān)任了應(yīng)急攻關(guān)專家組組長(zhǎng),她在此次疫情中貢獻(xiàn)突出。技術(shù)誠(chéng)然是一把“雙刃劍”,然而謠言往往更寒人心。

      “人工病毒”沒(méi)那么可怕

      真正的敵人是冠狀病毒。人類第一次發(fā)現(xiàn)它是在1961年,科學(xué)家將它從感冒者的分泌物中分離出來(lái),認(rèn)為它是引起感冒的“元兇”。到了20世紀(jì)70年代,第二個(gè)感染人的冠狀病毒被發(fā)現(xiàn),于是有了專門的“冠狀病毒科”。

      在整個(gè)自然界中,冠狀病毒廣泛存在,分為α、β、γ、δ屬等4個(gè)屬,截至目前共計(jì)有24種。它們的宿主包括豬、牛、貓、犬、貂、駱駝、蝙蝠、老鼠、刺猬等多種哺乳動(dòng)物以及多種鳥類。但是,迄今為止,可感染人的冠狀病毒只有7種。

      然而,它的攻勢(shì)很猛,2003年暴發(fā)的SARS病毒,曾給中國(guó)一記重拳,并在全球造成大流行。SARS病毒全稱“嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒”,屬于β冠狀病毒屬。最終在2016年,科學(xué)家終于確定,它真正的自然宿主是中國(guó)馬蹄蝠。

      SARS流行的10年后,在沙特、阿聯(lián)酋等地,MERS病毒席卷而來(lái)。它具有駭人的死亡率,達(dá)到了50%,但它持續(xù)在人際傳染的能力比較弱,它也是β冠狀病毒屬,全稱叫“中東呼吸綜合征冠狀病毒”。

      冠狀病毒既如此可怕,那么它如何獲得入侵人體的能力?其他類型的冠狀病毒,又是否有入侵人類的可能?SARS暴發(fā)以來(lái),這成為科學(xué)家的研究課題,也是石正麗被質(zhì)疑的研究項(xiàng)目本來(lái)目的所在。

      冠狀病毒入侵人體的關(guān)鍵,在于其病毒粒子囊膜上的一種蛋白,叫S蛋白。冠狀病毒結(jié)構(gòu)呈球形,其表面圍簇著突出的“小刺”,在電子顯微鏡下形如“王冠”,它的名字來(lái)源于此,而“小刺”就是S蛋白。

      S蛋白是進(jìn)攻入侵細(xì)胞的武器,相當(dāng)于一把“鑰匙”,由它來(lái)識(shí)別和結(jié)合位于宿主細(xì)胞表面上的受體,相當(dāng)于尋找宿主細(xì)胞上對(duì)應(yīng)的“門”。對(duì)SARS病毒來(lái)說(shuō),人體細(xì)胞的ACE2(血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2)就是這扇門。進(jìn)了門,它就開始為害人體。

      或許有人疑惑,既然基因決定了蛋白質(zhì)的表達(dá),那么不具備“鑰匙”基因的冠狀病毒,本身對(duì)人體沒(méi)有危害,何必杞人憂天?但事實(shí)上,冠狀病毒是單鏈RNA結(jié)構(gòu),容易產(chǎn)生變異,通過(guò)進(jìn)化獲得入侵人體的能力。

      石正麗飽受爭(zhēng)議的研究項(xiàng)目,是為了檢測(cè)另一種冠狀病毒SHC014,是否具有入侵人體的能力。

      石正麗飽受爭(zhēng)議的研究項(xiàng)目,是為了檢測(cè)另一種冠狀病毒SHC014,是否具有入侵人體的能力。它和流行性SARS病毒都以中國(guó)馬蹄蝠作為自然宿主,但在與人ACE2結(jié)合的關(guān)鍵位點(diǎn)上,SHC014的棘突蛋白與流行性SARS并不同。根據(jù)序列預(yù)測(cè),SHC014的棘突蛋白并沒(méi)有結(jié)合人類細(xì)胞ACE2的能力。然而令人費(fèi)解的是,其他相關(guān)的能夠結(jié)合人類ACE2的SARS冠狀病毒中卻存在類似于SHC014的棘突蛋白位點(diǎn)。為了解答這個(gè)疑惑,石正麗小組進(jìn)行了功能性研究。

      簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),項(xiàng)目研究者的做法是,將SHC014的棘突蛋白嫁接到一個(gè)能夠在鼠類中感染并復(fù)制的SARS病毒骨架上,也就是去嘗試SHC014的鑰匙能否打開人類細(xì)胞的傳染途徑。意外的是,這個(gè)“嵌合病毒”能夠感染人體細(xì)胞。

      研究證明,SHC014的棘突蛋白具備入侵人體的可能性,而其尚未導(dǎo)致流行性疾病,可能是因?yàn)椴《镜钠渌糠中枰鄳?yīng)的適應(yīng)性突變,從而能讓進(jìn)入人體細(xì)胞的病毒高效率地繁殖復(fù)制。因此論文對(duì)外提示了一種風(fēng)險(xiǎn),就是在野生動(dòng)物中流傳的冠狀病毒中可能已經(jīng)存在一部分潛在的能夠打開人類細(xì)胞的病毒??紤]到冠狀病毒的危害程度和它的易變性,這種提示很有必要。

      雖然“功能獲得性研究”面臨爭(zhēng)議,但要注意,研究者替換的是“鑰匙”,本體是SARS病毒而非SHC014,即沒(méi)有帶給人類世界新的病毒,它也絕對(duì)不是所謂的超級(jí)毒株。

      “印度論文”匆匆被撤

      研究中的“嵌合病毒”,雖然容易造成混淆,但實(shí)驗(yàn)經(jīng)過(guò)與結(jié)論俱在,澄清并不難。回到新冠病毒,印度學(xué)者的一篇論文,提出新冠病毒比SARS病毒“有4段新的插入序列”,而4段序列均能在艾滋病的蛋白序列中找到。然而,這4段序列是新冠病毒所獨(dú)有的,在其它冠狀病毒中卻不存在。

      論文顯示,印度學(xué)者認(rèn)為,這種不尋常的同一性/相似性,在自然界中不太可能是偶然現(xiàn)象。意思是說(shuō),僅僅通過(guò)自然進(jìn)化,新冠病毒不太可能具有這4個(gè)序列。所以,一時(shí)間內(nèi),新冠病毒是“人工病毒”的質(zhì)疑聲更具陣仗。

      先要說(shuō)明的是,這篇印度論文沒(méi)有接受同行審閱,并且已經(jīng)撤稿。發(fā)表平臺(tái)在官網(wǎng)提示說(shuō):“這些是未經(jīng)同行評(píng)審的原始報(bào)告,不應(yīng)被認(rèn)為是具有結(jié)論性的,不能指導(dǎo)臨床實(shí)踐/與健康相關(guān)的行為,或作為既成事實(shí)信息在新聞媒體上報(bào)道。”

      接著,我們看看這篇文章到底提供了哪些推測(cè)的“科學(xué)依據(jù)”。

      論文比較了新冠病毒S蛋白的氨基酸序列,以及之前流傳的SARS病毒S蛋白的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)四處多出來(lái)的氨基酸序列,而這四個(gè)多出來(lái)的氨基酸序列被發(fā)現(xiàn)存在于HIV病毒的結(jié)構(gòu)蛋白中(gp120以及Gag)。

      印度論文顯示,研究者認(rèn)為,gp120以及Gag這兩個(gè)蛋白,在HIV病毒中起到了協(xié)助HIV和人類細(xì)胞受體結(jié)合的作用。也就是說(shuō),它是HIV病毒進(jìn)入人體的“鑰匙”。因此,論文作者認(rèn)為新冠病毒是被給予了“鑰匙”,可能是實(shí)驗(yàn)室人為改造病毒泄露事件導(dǎo)致的。

      這篇文章看似提供了一些科學(xué)證據(jù),然而仔細(xì)研讀之后不難發(fā)現(xiàn),這些展示的證據(jù)帶著作者的主觀意念。首先,多出的4處氨基酸插入序列,僅僅是比較新冠病毒和SARS病毒的結(jié)果。

      事實(shí)上,論文提到的4段插入序列,也存在于其他蝙蝠冠狀病毒中,例如2015年公布的蝙蝠冠狀病毒batSL-CoVZXC21的S蛋白序列,和人類SARS病毒相比,就存在3處同樣位置上的插入序列。

      甚至,在近期公布的云南蝙蝠bat-CoV-RaTG13中,更是存在4段所有的插入序列。意思是說(shuō),印度論文認(rèn)為這4段序列為新冠病毒獨(dú)有,缺乏最基本的事實(shí)依據(jù)。

      其次,這4段序列并不是HIV病毒所獨(dú)有。論文顯示,通過(guò)比較序列的方法,文章提出這幾處插入序列來(lái)源于HIV的結(jié)構(gòu)蛋白。然而這些短氨基酸片段(6~8個(gè)氨基酸),不僅僅存在于HIV的結(jié)構(gòu)蛋白中,還存在于眾多動(dòng)物病毒的蛋白中。所以,不能說(shuō)明新冠病毒是“冠狀病毒與HIV病毒的合體”。

      事實(shí)上,由于插入序列的氨基酸片段過(guò)短,僅僅通過(guò)比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù),很難給出明確的來(lái)源出處。

      值得注意的是,文中提到的HIV結(jié)構(gòu)蛋白gp120及Gag,分別由850個(gè)氨基酸和499個(gè)氨基酸構(gòu)成,而這兩種結(jié)構(gòu)蛋白都有其獨(dú)特的功能,并不僅僅是提供表面正電荷來(lái)輔助HIV病毒和細(xì)胞受體的結(jié)合。

      例如,gp120能夠與細(xì)胞表面CCR5受體結(jié)合,以此輔助HIV攻擊人類細(xì)胞。文章并未證明這些6~8個(gè)氨基酸片段是否真的能功能性地輔助病毒,并感染人類細(xì)胞。也就是說(shuō),這4個(gè)序列究竟是不是“鑰匙”,還沒(méi)有明確的論斷。

      被忘記的自然能力

      由于存在證據(jù)上的漏洞,以及推理弊病,印度論文的作者早已主動(dòng)撤稿。一名作者留言說(shuō),他們將會(huì)重新分析數(shù)據(jù),并表明自己并無(wú)意提出陰謀論的觀點(diǎn)。

      這場(chǎng)風(fēng)波的當(dāng)事人石正麗,則在2月2日激動(dòng)地回應(yīng)說(shuō):“2019新型冠狀病毒是大自然給人類不文明生活習(xí)慣的懲罰,我石正麗用我的生命擔(dān)保,與實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有關(guān)系。奉勸那些相信并傳播不良媒體的謠傳的人、相信印度學(xué)者不靠譜的所謂學(xué)術(shù)分析的人,閉上你們的臭嘴。”

      “這些是未經(jīng)同行評(píng)審的原始報(bào)告,不應(yīng)被認(rèn)為是具有結(jié)論性的,不能指導(dǎo)臨床實(shí)踐/與健康相關(guān)的行為,或作為既成事實(shí)信息在新聞媒體上報(bào)道。”

      技術(shù)雖是一把“雙刃劍”,但是這場(chǎng)疫情,病毒源自自然,而后因應(yīng)對(duì)不足而擴(kuò)散。病毒學(xué)專家管軼在1月23日接受財(cái)新記者采訪時(shí)透露,華南海鮮市場(chǎng)的病毒源頭,在此前就早早清除。截至現(xiàn)在,新冠病毒的自然宿主還沒(méi)完全確定。

      主流病毒學(xué)界認(rèn)為,新冠病毒可能來(lái)源于蝙蝠冠狀病毒。石正麗團(tuán)隊(duì)在今年2月初發(fā)表在《自然》雜志的一篇論文顯示,通過(guò)比對(duì)從病人身上提取出的病毒核酸以及已知的眾多蝙蝠冠狀病毒數(shù)據(jù)庫(kù),新冠病毒與從云南蝙蝠中存在的冠狀病毒(bat-CoV-RaTG13)相似度達(dá)到了96.2%,說(shuō)明此次武漢冠狀病毒很有可能來(lái)自變異后的蝙蝠冠狀病毒。

      如前文所述,RNA病毒的一大特性便是高變異性。冠狀病毒是如何從動(dòng)物宿主得到傳染人類的能力的呢?

      目前主流的看法是,宿于動(dòng)物上的冠狀病毒通過(guò)變異(尤其是S蛋白區(qū)域),獲得感染其他物種(第二宿主)或者人類的能力。蛋白結(jié)構(gòu)的分析也表明,和其他蛋白區(qū)域相比,S蛋白區(qū)域往往更多樣。

      感染到第二宿主或者人類之后,通過(guò)自然選擇,這些變異的冠狀病毒得以在新宿主上擴(kuò)增,久而久之進(jìn)一步發(fā)展為流行性傳染疾病。

      值得注意的是,通過(guò)自然選擇,獲得了新感染能力的病毒,其基因的變異位點(diǎn)分布隨機(jī)而多變。經(jīng)人類修改的病毒,基因變異點(diǎn)則相對(duì)集中,并且會(huì)裂下“剪切”痕跡。而新冠病毒沒(méi)有人工痕跡,也能證明它不是“人工病毒”。

      石正麗受爭(zhēng)議的項(xiàng)目,將SHC014病毒的S蛋白區(qū)域,嵌合在SARS冠狀病毒中,似乎令人畏懼。但實(shí)際上,“嵌合病毒”并不是只能通過(guò)人類產(chǎn)生,這樣的重組事件,在自然的冠狀病毒家族中也經(jīng)常出現(xiàn)。

      換言之,大自然是一個(gè)不確定性更高的實(shí)驗(yàn)室。從這個(gè)角度上看,石正麗等科學(xué)家從事的工作,是探索大自然的可能性,如同為我們做出“天氣預(yù)報(bào)”,去摸準(zhǔn)大自然陰晴不定的脾氣。所以,繞了一大圈,我們又回到原點(diǎn):敬畏自然,拒絕野味。

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