大豆栽培品種在不斷馴化改良過程中,逐漸適應了不同的種植環(huán)境,從而能夠在全球范圍內(nèi)大規(guī)模種植。然而,這種廣泛適應的遺傳基礎(chǔ)仍然不清楚。最近,中國農(nóng)科院作物所邱麗娟和劉斌團隊在大豆中發(fā)現(xiàn)了一個重要的花期調(diào)控基因GmPRR3b,在大豆生態(tài)適應性馴化和遺傳改良過程中扮演著重要的角色。
研究人員對包含279份材料的大豆地方品種群體進行了全基因組關(guān)聯(lián)分析,確定了16個與開花時間和成熟期相關(guān)的候選QTL位點。最強的信號位于已知的開花基因E2上,驗證了分析方法的有效性。另檢測到一個包含GmPRR3b的基因組區(qū)域與開花和成熟時間都有很強的關(guān)聯(lián)信號。單倍型分析表明,GmPRR3b H6是現(xiàn)代品種選育過程中應用的主要形式。mRNA表達譜分析表明,GmPRR3b H6的表達表現(xiàn)出對節(jié)律性和光周期的依賴,在長日照條件下誘導明顯。超表達GmPRR3b H6可增加大豆主莖節(jié)數(shù)并產(chǎn)生高產(chǎn)表型,而使用CRISPR-Cas9敲除GmPRR3b H6可延緩植株生長和花期。GmPRR3b H6似乎對多個預測的生物鐘基因具有轉(zhuǎn)錄抑制作用,包括通過直接上調(diào)J/GmELF3a來調(diào)節(jié)開花時間的GmCCA1a。
因此,Chr12:5520945位置處的SNP能夠適度提高GmPRR3bH6的活性,提早大豆的花期并增強生長勢,以在大豆馴化過程中適應多種生長環(huán)境。