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      基于近場熔體靜電紡絲PCR微流控芯片的構(gòu)建與應(yīng)用

      2020-04-27 08:45王子忠卓少木
      科技視界 2020年5期
      關(guān)鍵詞:微流表面質(zhì)量紡絲

      王子忠 卓少木

      摘 要

      本文介紹了一種利用近場熔體靜電紡絲直寫技術(shù)制作PCR(聚合酶鏈反應(yīng),英文全稱為:Polymerase chain reaction)微流控芯片的工藝。本文先介紹了利用近場熔體靜電紡絲直寫技術(shù)在導(dǎo)電玻璃上面制作PCL纖維的過程,再介紹了PCR微流控芯片的內(nèi)部結(jié)構(gòu)設(shè)計,接著就介紹了PCL纖維的熱處理工藝以及芯片的制作方法,最后介紹了DNA提取與應(yīng)用PCR微流控芯片驗證PCR實驗的效果。

      關(guān)鍵詞

      近場熔體靜電紡絲;PCR;微流控

      中圖分類號: P313.1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻標識碼: A

      DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2020.05.007

      0 前言

      PCR(聚合酶鏈反應(yīng),英文全稱為:Polymerase chain reaction)[1, 2]是一種可以在生物體外進行的生物反應(yīng),能夠?qū)NA片段進行選擇性快速擴增[3,4],在分子生物學(xué)的各個領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用[5]。制作PCR微流控芯片的關(guān)鍵是微結(jié)構(gòu)的制作[6,7],微結(jié)構(gòu)的制作方式多種多樣,例如,利用減材制造的方式,如化學(xué)腐蝕、激光加工、光刻等;利用等材制造的方式,如壓印、注塑等;利用增材制造的方式,如3D打印、近場靜電紡絲等。這些制作工藝各有其特點,化學(xué)腐蝕具有難以控制加工量的多少,會產(chǎn)生污染液,加工時間比較長的特點;激光加工需要昂貴的激光設(shè)備,制造精度由激光設(shè)備的精度決定,加工時間比較短;光刻可以加工超高精度的PCR微流控芯片[8],但設(shè)備昂貴,工藝復(fù)雜;壓印需要制造一個對應(yīng)的模具,而模具的生產(chǎn)需要超精密加工用來實現(xiàn),但模具難以更改;注塑可能因為模具的一些尺寸太小產(chǎn)生一些空隙、氣泡等;一般3D打印設(shè)備難以控制打印件表面質(zhì)量和形狀精度;近場熔體靜電紡絲技術(shù)是一種在高壓電場下,沉積纖維可控的技術(shù),基于近場靜熔體靜電紡絲制作微流控芯片的微結(jié)構(gòu)精度可控,并且可以降低成本,同時還能快速根據(jù)用戶需求制作不同內(nèi)部結(jié)構(gòu)的微流控芯片?,F(xiàn)階段近場靜電紡絲制作微流控芯片微結(jié)構(gòu)主要是直線型或者十字交叉型微結(jié)構(gòu),這為制作PCR微流控芯片打下了基礎(chǔ)[9]。同時,我們發(fā)現(xiàn)纖維由于熱應(yīng)力等因素的影響在冷卻過程中表面質(zhì)量會變差,為了獲得表面質(zhì)量更高的微通道,我們提出了一種近場熔體靜電紡絲纖維表面質(zhì)量改進的方法——酒精氣氛下熱處理。

      2006年,孫道恒等提出近場靜電紡絲技術(shù)[10],當接收距離在穩(wěn)定射流階段,維持PEO溶液射流所需電壓變小,纖維的沉積變得可控。他們探究了針頭液滴,聚合物溶液濃度,電壓,接收距離,速度對纖維形貌的影響。然而,纖維的形狀精度及表面質(zhì)量都不太理想在后續(xù)的研究上,孫道恒等利用PEO溶液近場電紡沉積在硅片上PEO納米纖維作為犧牲層制作了納通道,其步驟如下:在硅片上沉積納米尺寸的PEO纖維,對帶纖維的硅片鍍膜,PEO纖維氯仿超聲氯仿處理溶解,清理獲得納米通道。

      2016年,廣東工業(yè)大學(xué)的梁烽基于相似的技術(shù)制作了間距為50微米的納通道,間距可控的納通道可以作為光柵此的刻線。然而電紡纖維制作的納米通道表面質(zhì)量亦不太理想。

      2011年T.D Brown等提出了近場熔體靜電紡絲技術(shù)[11],PCL在熔融狀態(tài)具備特別理想的粘度,探究了速度對射流狀態(tài)的影響,獲得有序纖維的條件:平臺運動速度大于或等于射流流動速度。2018年廣東工業(yè)大學(xué)的曾俊基于近場熔體靜電紡絲直寫技術(shù)探究了速度[12],電壓,高度,氣壓,溫度對纖維直徑的影響,并且利用軟光刻方法制作了三種微通道,進行了液滴,層流實驗。

      在本文中,基于近場熔體靜電紡絲特性,我們設(shè)計了PCR微流控的CAD圖形,進行了近場電紡。在觀測纖維形貌的過程中,我們發(fā)現(xiàn)纖維的表面質(zhì)量不好,借用本課題組用酒精配置溶液來改善表面溶液近場靜電紡絲表面質(zhì)量,提出了酒精氣氛下熱處理提高表面質(zhì)量的方法。采用軟光刻的方法使用改善表面質(zhì)量的近場電紡纖維作為PDMS微通道的模具,制作了PCR微流控芯片。最后,在制作的PCR微流控芯片上進行了相關(guān)實驗,并用電泳了PCR產(chǎn)物檢驗芯片有效性。

      1 實驗材料

      PDMS(polydimethylsiloxane,美國道康寧),導(dǎo)電玻璃(方阻7Ω,購于佛山晶美),PCL(poly(ε-caprolactone),Mv=80000即聚己內(nèi)酯,購于深圳易生),金黃色葡萄球菌菌株及復(fù)蘇液(ATCC25923購廣東微生物有限公司),PCR緩沖液(購于大連寶日生物科技有限公司),定制薄膜加熱系統(tǒng)(廠家上海松導(dǎo)加熱傳感器有限公司),無水乙醇(AR級,購于阿拉丁),三氯全氟辛基硅烷(AR,購于Sigma-Aldrich)。

      2 紡絲過程

      近場熔體靜電紡絲直寫實驗設(shè)備的主要組成部分有:壓縮氣體供氣系統(tǒng)、直流高壓電系統(tǒng)、X-Y-Z軸運動平臺、加熱系統(tǒng)、照明系統(tǒng)。紡絲過程按如下步驟:將PCL顆粒裝填滿帶有可調(diào)節(jié)溫度加熱器的料筒,料筒針頭接負極,導(dǎo)電玻璃平穩(wěn)地固定在近場熔體靜電紡絲直寫實驗設(shè)備的平臺上合適的位置上并接高壓電正極,將料筒上的加熱器溫度設(shè)置為150℃,壓縮空氣壓供氣系統(tǒng)的輸出氣壓設(shè)置為4kPa,直流高壓電系統(tǒng)的輸出電壓設(shè)置為1.5kV,X-Y-Z軸運動平臺的X與Y軸方向的運動速度設(shè)置為5mm/s,擠出熔體紡絲的噴頭末端到導(dǎo)電玻璃上表面的距離設(shè)置為0.9mm,然后根據(jù)預(yù)先設(shè)計好的PCL纖維分布軌跡進行紡絲。

      3 微流控芯片設(shè)計

      圖1所示是所設(shè)計的PCR微流控芯片,PCR微流控芯片主要包括三個區(qū)域:C區(qū)域覆蓋的PCL纖維的溫度為92℃(用于實現(xiàn)DNA的變性);B區(qū)域覆蓋的PCL纖維的溫度為72℃(用于實現(xiàn)DNA的延伸);A區(qū)域覆蓋的PCL纖維的溫度為42℃(用于實現(xiàn)DNA的退火),其他相關(guān)參數(shù)的具體見于表1。

      4 熱處理及芯片制作

      將真空電熱恒溫爐內(nèi)部溫度加熱到50℃,保溫60min,確保干燥箱內(nèi)達到50℃,同時把無水乙醇倒入容器內(nèi),接著把帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃按照圖2中的(c)圖的放置方式放在真空電熱恒溫爐內(nèi)部,設(shè)置電熱恒溫烘干箱加熱溫度為65℃、加熱時間為120min,使得PCL纖維在無水乙醇一直揮發(fā)的氣氛下熱處理 120min。將熱處理后的帶纖維玻璃放入真空斧內(nèi),滴一滴三氯全氟辛基硅烷進行表面硅烷化處理,將硅烷化表面處理后的PCL纖維倒入,在50℃真空環(huán)境下固化4h;取出固化后的PDMS打孔;3.異丙醇清理PDMS表面后 將PDMS,玻璃用氧等離子處理倒,處理后貼合,并熱壓輔助鍵合。(圖2中,圖(a)是近場近場熔體靜電紡絲直寫實驗設(shè)備核心部件的示意圖,圖(b)是帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃,圖(c)是AR級無水乙醇對PCL纖維進行熱處理的示意圖(在此圖中,A是玻璃皿,B是AR級無水乙醇,C是帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃,D是放置帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃的玻璃支架,E是干燥箱;另外,實驗開始的時候,AR級無水乙醇的液面距離帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃底面距離為1mm。),圖(d)是帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃上面覆蓋有PDMS熔體冷卻后的狀態(tài),圖(e)是冷卻成型后的帶有微流控芯片通道的PDMS倒模片,圖(f)是微流控芯片通道兩端有打孔的PDMS倒模片,圖(g)是PDMS倒模片與等面積的玻璃基板進行等離子體鍵合后的結(jié)合體,圖(h)是等離子體鍵合后的結(jié)合體在打孔的地方外接特氟龍管道接頭)。圖3所示的是近場熔體靜電紡絲直寫實驗設(shè)備核心部件的實物圖。圖4是已經(jīng)鍵合成功的PCR微流控芯片實物圖。圖5是加熱器和PCR微流控芯片連接在一起的實物圖。

      5 DNA的提取

      由于金黃色葡萄球菌菌株是凍干粉,需要利用細菌復(fù)蘇液對菌株進行復(fù)蘇,將菌株凍干粉與蒸餾水以體積比1:100的比例進行稀釋,再把已經(jīng)稀釋菌株的液體與復(fù)蘇液以1:10的體積比進行混合,取1ml菌株與復(fù)蘇液的混合液均勻地涂布在玻璃培養(yǎng)皿中的營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基表面,并把培養(yǎng)皿放進電熱恒溫培養(yǎng)箱,把電熱恒溫培養(yǎng)箱調(diào)至37℃恒溫培養(yǎng)24小時。用潔凈玻璃鑷子刮取一兩個菌落放進裝有適量DNA提取液的離心管中,把離心管放置在高速離心機以12000r/min的轉(zhuǎn)速進行離心10min,舍棄上清,并置于-20℃保存。

      6 結(jié)果與討論

      6.1 纖維表面質(zhì)量差的形成原因

      在導(dǎo)電玻璃沒加熱的前提條件下,利用近場熔體靜電紡絲直寫技術(shù)制作的PCL纖維,令PCL纖維在室溫下自然冷卻成固態(tài),放在光學(xué)顯微鏡以10倍放大倍數(shù)進行觀察,得到圖6中(a)的觀察結(jié)果;把帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃放在加熱器上面,而加熱器放在光學(xué)顯微鏡的物鏡的平臺上,觀察PCL纖維表面的微觀結(jié)構(gòu),其實際操作的實物圖如下圖6中(d)所示;把加熱器快速加熱到150℃,光學(xué)顯微鏡同樣以10倍放大倍數(shù)進行觀察,得到下圖6中(b)的觀察結(jié)果;把加熱器的電源斷掉,移走加熱器,把帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃放在光學(xué)顯微鏡的觀察平臺,令PCL纖維在室溫下自然冷卻成型,光學(xué)顯微鏡也同樣以10倍放大倍數(shù)進行觀察,得到下圖6中(c)的觀察結(jié)果。由實驗圖片可以知道,PCL纖維在室溫下自然冷卻成固態(tài),纖維的微觀表面變得粗糙,表面質(zhì)量很差;重新加熱到150℃之后,PCL纖維在受熱之后變成熔融狀態(tài),纖維的微觀表面變得光滑,表面質(zhì)量很好;受熱之后的PCL纖維再一次全部纖維同時在室溫下自然冷卻成型,此時的纖維的微觀表面變得粗糙,表面質(zhì)量較差,但是比加熱器加熱前的粗糙度小一點,表面質(zhì)量好一點。

      6.2 形成熱應(yīng)力的因素

      由于PCL纖維在為完全冷卻成型之前屬于彈性體,彈性體在受熱或者冷卻過程中會,體積會膨脹或者收縮,從而纖維有可能會的內(nèi)部形變與外部約束相互約束使得不能自由形變,此時就會產(chǎn)生應(yīng)力,這就是熱應(yīng)力。在熔融狀態(tài)的PCL纖維擠出的過程中,由于導(dǎo)電玻璃與空氣的比熱容不一樣,因此PCL纖維與空氣接觸的表面和與玻璃接觸的表面的散熱速度不一樣,從而會產(chǎn)生其中一部分熱應(yīng)力。由于PCL纖維擠出是有先后順序的,從而PCL纖維的冷卻成型的順序也會和擠出的先后順序一樣,同一條纖維在同一時刻的不同節(jié)段的溫度存在一定的差異,因此也會產(chǎn)生一部分熱應(yīng)力。

      聚合物纖維內(nèi)外冷卻速度不一致,聚合物大分子鏈在熔融過程中形成的不平衡構(gòu)象,這種不平衡構(gòu)象在冷卻固化時不能立即恢復(fù)到與環(huán)境條件相適應(yīng)的平衡構(gòu)象。

      7 基于酒精的熱處理工藝

      在一些微透鏡陣列的制作過程中,人們通常利用液體的流動性以及液體表面存在表面張力的特性,對未成微透鏡形狀的點狀樹脂、PMMA等熔點較高的高分子材料采用熱回流技術(shù)使得高分子材料的形狀變成微透鏡的形狀。但是熱回流是利用加熱微透鏡陣列所在的基板,利用基板的熱傳導(dǎo)使得熔點較高的高分子材料熔融[13],如果采用熱回流工藝就會造成低熔點PCL材料表面的溫度不均勻,而且熱回流的加熱容易控制溫度,但是冷卻時的溫度難以控制;因此,如果利用熱回流進行熱處理PCL纖維會產(chǎn)生熱應(yīng)力,難以改善PCL纖維的表面質(zhì)量。如果對PCL纖維使用熱回流技術(shù)難以改善纖維表面質(zhì)量,會使得纖維的高度降低影響PDMS的倒模成型。廈門大學(xué)的黃永芳在利用近場靜電紡絲技術(shù)制作微納通道的時候[14,15],把PEO溶于水與乙醇的混合物中制作靜電紡絲材料,并得到質(zhì)量良好的微納通道。由于酒精具有較強的揮發(fā)性能,因此含有PEO的靜電紡絲材料能夠快速成型、能夠盡可能地減少纖維產(chǎn)生應(yīng)力而造成表面質(zhì)量很差[16]。因此,本課題的熱處理方式就利用酒精的易揮發(fā)性,把PCL纖維放置于酒精氣氛中進行熱處理。

      由于PCL纖維冷卻成型后,其表面質(zhì)量比較差;從而難以滿足用來制作PCR微流控芯片的使用要求,所以要對PCL纖維表面質(zhì)量進行改善,以達到使用要求。由于PCL纖維對溫度的變化比較敏感,因此本課題選用熱處理的方式去改善PCL纖維表面質(zhì)量。對PCL纖維進行熱處理的具體方法是:把帶有PCL纖維的導(dǎo)電玻璃放在裝有AR級無水乙醇的容器的液面上空,導(dǎo)電玻璃下表面距離AR級無水乙醇的液面1mm,把裝有AR級無水乙醇的容器放進干燥箱設(shè)置不同的溫度與時間參數(shù)觀察最優(yōu)的實驗效果。

      對PCL纖維進行熱處理實驗有五組,分別為:在沒有酒精氣氛環(huán)境中把真空電熱恒溫爐加熱至50℃保溫60min(圖7的c、d)、在沒有酒精氣氛環(huán)境中把真空電熱恒溫爐加熱至60℃保溫60min(圖7的e、f)、在沒有酒精氣氛環(huán)境中把真空電熱恒溫爐加熱至65℃保溫60min(圖7的g、h)、在有酒精氣氛環(huán)境中把真空電熱恒溫爐加熱至50℃保溫60min(圖7的i、j)、在有酒精氣氛環(huán)境中把真空電熱恒溫爐加熱至65℃保溫60min(圖7的k、l)。另外,圖7中的a、b是未進行熱處理之前的微觀表面圖。從下面的實驗結(jié)果圖片可以看出,在無酒精氣氛的環(huán)境中加熱至50℃保溫60min后,PCL纖維的表面質(zhì)量并沒有得到變好;在無酒精氣氛的環(huán)境中加熱至60℃保溫60min后,PCL纖維出現(xiàn)了團聚的現(xiàn)象;在無酒精氣氛的環(huán)境中加熱至65℃保溫60min后,PCL纖維的團聚現(xiàn)象更加嚴重;在有酒精氣氛的環(huán)境中加熱至50℃保溫60min后,PCL纖維的表面質(zhì)量也沒有得到變好;在有酒精氣氛的環(huán)境中加熱至60℃保溫60min后,PCL纖維的表面質(zhì)量明顯地變得很好了。在熱處理的實驗中,PCL纖維出現(xiàn)團聚現(xiàn)象的主要原因是PCL在受熱后變成熔融狀態(tài)表面張力和熱應(yīng)力同時作用使得團聚發(fā)生;而PCL纖維的表面質(zhì)量明顯地變得很好的主要原因是酒精氣氛使得熱應(yīng)力被去除了,而表面張力不足以使其團聚。

      8 PCR實驗

      PCR擴增:使用TaKaRa Tks Gflex DNA Polymerase(Code No.R060A)進行PCR擴增,PCR反應(yīng)體系的成分(其中Primer *1為CTG1095 F2,Primer *2為CTG1095 R2)比例是:CTG109 5- DNA:2×Gflex PCR Buffer( Mg2+, dNTP plus):Tks Gflex DNA Polymerase(1.25units/ul):Primer*1(20uM):Primer*2(20uM):dH2O的體積比例為1:25:1:1:1:21。實驗操作方法:注射泵裝好需要進行PCR擴增反應(yīng)的30μL液體,其輸出管直接接PCR微流控芯片的入口處的特氟龍管道接頭,PCR微流控芯片的出口處的特氟龍管道接頭外接管道把PCR擴增的液體引流到薄壁 Eppendorf管,PID調(diào)節(jié)溫度控制器不同的控制輸出分別接到不同的溫控區(qū)域;實驗第一步為利用PID調(diào)節(jié)溫度控制器控制不同區(qū)域進行加熱,接著控制注射泵把PCR反應(yīng)體系注入PCR微流控芯片進行PCR擴增反應(yīng)。

      如表2為PCR擴增所用的設(shè)計的引物名稱以及堿基序列,需要進行PCR擴增的nuc基因的正向引物以及反向引物進行擴增的起始堿基位置。理論上提取的DNA片段長度為536bp。

      把PCR產(chǎn)物各取5ul進行1%瓊脂糖凝膠電泳,其電泳的電場強度大小為2V/cm,以標記DNA(M:DL2,000 DNA Marker(購于寶生物工程(大連)有限公司))的電泳條帶為參照,分析管內(nèi)的PCR擴增產(chǎn)物檢驗擴增的結(jié)果。其實驗結(jié)果圖如圖8所示,其中圖中的標號的含義分別代表M:DL2,000 DNA Marker、1:CTG1095 F2/R2 PCR產(chǎn)物(Primer *1為CTG1095 F2,Primer *2為CTG1095 R2)。

      DL2,000 DNA Marker由六種不同長度的DNA片段組成,最短的四種DNA片段分別是100bp、250bp、500bp、750bp,即是如圖8所示的M列的標注的四種DNA片段?;谶@個實驗所選的實驗環(huán)境以及實驗材料,這個PCR擴增實驗理論上提取的DNA片段長度為536bp,而從圖8的DNA電泳圖結(jié)果可以看出來CTG1095 F2/R2 PCR產(chǎn)物離DL2,000 DNA Marker的500bp的DNA片段電泳中心比較相近,因此可以得出來結(jié)論是:此次PCR擴增的效果基本達到預(yù)期的效果。

      9 結(jié)論

      本課題利用了近場熔體靜電紡絲直寫技術(shù)在導(dǎo)電玻璃上制作PCL纖維,然后再對PCL纖維進行熱處理,提高了PCL纖維的表面質(zhì)量,接著就利用PDMS在PCL纖維上面倒模,最后把倒模出來的PDMS微流道鍵合在潔凈的導(dǎo)電玻璃上面做成PCR微流控芯片,最后驗證PCR微流控芯片的效果。最終的實驗結(jié)果表明,此課題中構(gòu)建的PCR微流控芯片效果達到預(yù)期效果,從而具有良好的市場應(yīng)用場景。

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