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      基于MiSeq測(cè)序技術(shù)石花酒大曲中微生物多樣性解析

      2020-08-06 10:41:34薛宇昂趙慧君張振東
      中國(guó)釀造 2020年7期
      關(guān)鍵詞:石花大曲高通量

      薛宇昂,郭 壯,趙慧君,張振東,雷 敏*

      (1.湖北文理學(xué)院食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院鄂西北傳統(tǒng)發(fā)酵食品研究所,湖北襄陽 441053;2.石河子大學(xué)食品學(xué)院,新疆石河子 832003)

      石花酒是用高粱、糯米為原料,以豌豆、大麥制曲,進(jìn)行地缸發(fā)酵、分段取酒,最后勾兌而成的清香型白酒,是湖北省名酒之一。大曲中豐富的微生物菌落是酒體風(fēng)味品質(zhì)形成的關(guān)鍵因素。近年來,研究人員對(duì)全國(guó)各類大曲中微生物多樣性展開了廣泛的研究。劉桂君等[1]從牛欄山酒廠清香型大曲和酒醅中分離出23株芽孢桿菌,通過生理生化試驗(yàn)鑒定12株為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis);李增勝[2]研究發(fā)現(xiàn),汾酒酒醅中的酵母菌以酵母菌屬(Saccharomyces)為主,其產(chǎn)酒精能力最強(qiáng),其次是具有一定產(chǎn)香和產(chǎn)酒精能力的漢遜酵母(Hansenula)和假絲酵母(Candida)及產(chǎn)酒精不強(qiáng)的擬內(nèi)孢霉(Endomycopsis),還有極少量的畢赤酵母(Pichia)等產(chǎn)膜酵母;蘭玉倩等[3]利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)指紋技術(shù)分析了清香型大曲在生產(chǎn)過程中酵母類微生物的演替規(guī)律。共檢測(cè)到伊薩酵母屬(Issatchenkia)、畢氏酵母(Pichia)、酵母菌屬(Saccharomyces)、復(fù)膜孢酵母屬(Saccharomycopsis)、地霉屬(Geotrichum)和根霉屬(Rhizopus)6個(gè)真菌微生物屬,其中東方伊薩酵母(Issatchenkia orientalis)在大曲整個(gè)生產(chǎn)過程中占絕對(duì)優(yōu)勢(shì);王彩虹[4]采用克隆文庫技術(shù)與PCR-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restricted fragment length polymorphisms,RFLP)技術(shù)相結(jié)合的手段研究發(fā)現(xiàn),3種汾酒清香型大曲中細(xì)菌均分布于芽孢桿菌綱(Bacillibacteria)、放線菌綱(Actinobacteria)及變形菌綱(Alphaproteobacteria),且3種大曲的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌群均含有乳桿菌屬。以上研究成果為酒曲中優(yōu)勢(shì)菌種的開發(fā)及進(jìn)一步深入研究的開展奠定了良好的基礎(chǔ)。石花酒大曲(以下簡(jiǎn)稱石花大曲)中微生物豐富,群落結(jié)構(gòu)復(fù)雜,種類繁多,然而目前未有關(guān)于石花大曲微生物多樣性研究的報(bào)道。

      下一代測(cè)序(next generation sequencing,NGS)一方面可快速準(zhǔn)確地提供高通量測(cè)序信息,另一方面可為分析提供定位結(jié)果[5],其中Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于各項(xiàng)研究中。HU X L等[6]使用Illumina MiSeq對(duì)濃香型白酒窖泥微生物信息進(jìn)行測(cè)序分析,結(jié)果表明,窖泥微生物群落與窖泥品質(zhì)和環(huán)境因素有關(guān)。YANG H Y等[7]根據(jù)Illumina MiSeq測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),東北地區(qū)酸菜發(fā)酵的過程中出現(xiàn)了硬桿菌、變形桿菌、擬桿菌、放線菌、藍(lán)藻、梭桿菌和疣菌,以及其他未分類的細(xì)菌;沈馨等[8]利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn),孝感地區(qū)3個(gè)鳳窩酒曲共有大量的核心細(xì)菌菌群;POLKA J等[9]利用Illumina MiSeq測(cè)序在意大利蒜味咸腸中鑒定出32種不同的葡萄球菌和33種乳酸桿菌,其中23個(gè)存在于至少10%的調(diào)查樣品中。綜上,Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)能夠更準(zhǔn)確全面地獲取樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)信息。

      本研究以采集自湖北襄陽市石花酒廠的石花大曲為研究對(duì)象,提取樣品宏基因組,采用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)其微生物多樣性進(jìn)行解析,以期為石花大曲中微生物資源的開發(fā)奠定一定的理論基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料與試劑

      1.1.1 樣品

      石花大曲:襄陽石花酒廠;采集自湖北襄陽市石花酒廠,4個(gè)樣品分別命名為SHQ01、SHQ02、SHQ03、SHQ04。

      1.1.2 試劑

      脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate,dNTPs)Mix、5×TransStartTM、FastPfu Buffer和FastPfu Fly脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)Polymerase(5 U/μL):北京全式金生物技術(shù)有限公司;10×PCR Buffer、Solution I、pMD18-T vector、蛋白酶K(20 U/μg)、溶菌酶(400 U/μg):寶生物工程(大連)有限公司;QIAGEN DNeasy mericon Food Kit試劑盒:德國(guó)QIAGEN公司;乙二胺四乙酸二鈉、十二烷基硫酸鈉、氯仿、十六烷基三甲基溴化銨、異丙醇、乙醇、三輕甲基氨基甲烷、酚、異戊醇、氯化鈉和乙酸鈉等(均為分析純):國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。

      1.2 儀器與設(shè)備

      DYY-12電泳儀:北京六一儀器廠;ND-2000C微量紫外分光光度計(jì):美國(guó)NanoDrop公司;UVPCDS8000凝膠成像分析系統(tǒng):美國(guó)BIO-RAD公司;Vetiri梯度基因擴(kuò)增儀:美國(guó)AB公司;R920機(jī)架式服務(wù)器:美國(guó)DELL公司;Miseq高通量測(cè)序平臺(tái):美國(guó)Illumina公司;2100芯片生物分析儀:美國(guó)Agilent公司;5810R臺(tái)式高速冷凍離心機(jī):德國(guó)Eppendorf公司。

      1.3 實(shí)驗(yàn)方法

      1.3.1 樣品處理

      將采集到的石花大曲樣品置于有干冰的采樣箱中于24 h內(nèi)運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,使用潔凈無菌的研缽研成粉末后使用。

      1.3.2 石花大曲中微生物宏基因組DNA提取

      使用QIAGEN DNeasy mericon Food Kit試劑盒提取石花大曲樣品中的微生物總DNA,并用微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)提取的DNA純度及濃度,以此獲得高品質(zhì)和高濃度的微生物宏基因組DNA。

      1.3.3 細(xì)菌和真菌PCR擴(kuò)增

      按文獻(xiàn)[10]所述方法對(duì)樣品中細(xì)菌16S rRNA的V3-V4區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。按文獻(xiàn)[11]所述方法對(duì)樣品中真菌18SrRNA的V4-V5區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。用1%的瓊脂糖凝膠對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)[12],利用AxyPrepDNA凝膠回收試劑盒將其回收并送樣至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行Illumian MiSeq高通量測(cè)序,測(cè)序平臺(tái)為Illumian MiSeq PE300。

      1.3.4 序列的拼接及質(zhì)控

      按照文獻(xiàn)[13]所述的方法進(jìn)行序列拼接,按照序列間的重疊關(guān)系對(duì)Illumian MiSeq PE300平臺(tái)獲取的數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接,在拼接過程中要求重疊區(qū)的堿基數(shù)≥10 bp或最大錯(cuò)配比率≤0.2,同時(shí)要求引物堿基錯(cuò)配數(shù)≤2 bp,且切除引物后序列的長(zhǎng)度>50 bp,若序列不符合上述條件則予以剔除。

      1.3.5 生物信息統(tǒng)計(jì)與分析

      使用QIIME(quantitative insights into microbial ecology)平臺(tái)[14]進(jìn)行物種鑒定和相對(duì)含量的分析;使用PyNAST工具[15]校準(zhǔn)并排齊序列;使用UCLUST算法[16]分別以100%和97%的相似度進(jìn)行序列劃分并建立操作分類單元(opera tionaltaxonomicunits,OTU),從每個(gè)OTU中選出代表性序列,分別整合核糖體數(shù)據(jù)庫(ribosomal database project,RDP)[17]、Greengenes[18]和SILVA數(shù)據(jù)庫[19],對(duì)OTU進(jìn)行序列同源性比對(duì)和種屬分類學(xué)鑒定,從而分別明確石花大曲中細(xì)菌和真菌的相關(guān)信息。利用觀察物種(Observed Species)指數(shù)、超1(Chao 1)指數(shù)、香農(nóng)(Shannon)指數(shù)和辛普森(Simpson)指數(shù)等評(píng)價(jià)微生物菌群的豐度和多樣性[20]。

      1.3.6 圖像繪制與數(shù)據(jù)處理

      使用Matlab2016b軟件進(jìn)行熱圖的繪制,其他圖由Origin 8.5軟件繪制。相關(guān)性由SAS V8軟件分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 石花大曲樣品細(xì)菌序列豐富度分析

      使用Illumian MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)4個(gè)石花大曲樣品的細(xì)菌多樣性進(jìn)行分析,其16S rRNA測(cè)序結(jié)果及多樣性指數(shù)見表1。其中Observed Species指數(shù)和Chao 1指數(shù)是估算樣品中含有物種數(shù)目及所含OTU數(shù)目的指數(shù),兩者均能反映樣品的物種豐度,Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)用來表現(xiàn)樣品中物種的豐富度和均勻度,兩者均能反映樣品的物種多樣性。

      表1 石花酒大曲樣品中細(xì)菌的測(cè)序結(jié)果及多樣性指數(shù)Table 1 Sequencing results and diversity index of bacteria in Shihua Baijiu Daqu samples

      由表1可知,4個(gè)石花大曲樣品中共產(chǎn)生246 873條細(xì)菌序列,平均每個(gè)樣品產(chǎn)生61 718條序列。根據(jù)97%相似性歸類共得到8 180個(gè)OTU,平均每個(gè)樣品2 045個(gè)OTU。當(dāng)測(cè)序量為54 010時(shí),樣品SHQ04的Observed Species指數(shù)、Chao 1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)均為各樣品中的最大值,分別為1 189、1 257、6.27和0.96,表明樣品SHQ04中細(xì)菌群落豐富度和多樣性均為最高;樣品SHQ02的Observed Species指數(shù)、Chao 1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)均為最小,分別為779、912、3.80和0.74,表明樣品SHQ02中細(xì)菌群落豐富度和多樣性均為最低。

      2.2 基于門和屬水平的細(xì)菌多樣性分析

      圖1 基于細(xì)菌門(A)和屬(B)水平石花酒大曲樣品中細(xì)菌多樣性分析Fig.1 Analysis of bacteria diversity in Shihua Baijiu Daqu samples based on the phylum (A) and genus (B) level

      從每個(gè)OTU中挑選一條代表性序列進(jìn)行比對(duì),然后統(tǒng)計(jì)其界、門、綱、目、科和屬的種類和數(shù)量,其中細(xì)菌門及屬的分析結(jié)果見圖1,將相對(duì)含量<0.1%的細(xì)菌門或相對(duì)含量<0.1%的細(xì)菌屬歸為其他,相對(duì)含量>0.1%的細(xì)菌門或相對(duì)含量>1%的細(xì)菌屬定義為優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門或?qū)佟?/p>

      由圖1A可知,4個(gè)石花大曲樣品中共檢測(cè)出17個(gè)細(xì)菌門,其中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門為變形桿菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和放線菌門(Actinobacteria),平均相對(duì)含量分別為61.33%、32.25%、5.04%,且平均僅有0.1%的菌株不能鑒定到門水平。樣品中變形桿菌門和厚壁菌門的累積平均相對(duì)含量高達(dá)93.58%,而放線菌門平均相對(duì)含量<5.04%。樣品SHQ04中變形桿菌門的相對(duì)含量明顯低于其他樣品,而樣品SHQ02中厚壁菌門含量亦明顯低于其他樣品,說明各樣品中細(xì)菌門的種類和含量存在差異。

      由圖1B可知,4個(gè)石花大曲樣品中共檢測(cè)出168個(gè)細(xì)菌屬,其中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬為假單胞菌屬(Pseudomonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、魏斯氏菌屬(Weissella)、明串珠菌屬(Leuconostoc)和Kroppenstedtia,平均相對(duì)含量分別為58.97%、12.98%、12.86%、3.71%、1.83%、1.27%和1.25%,所有合格序列僅有1.70%不能鑒定到屬水平。值得一提的是,假單胞菌屬在樣品SHQ04中的相對(duì)含量?jī)H有6.51%,而在樣品SHQ02中的相對(duì)含量高達(dá)95.33%;乳桿菌屬在樣品SHQ04中的相對(duì)含量為47.88%,而在樣品SHQ01、SHQ02和SHQ03中的相對(duì)含量分別為3.37%,0.07%和0.13%;明串珠菌屬僅在樣品SHQ1和SHQ4中含有。由此可見,雖然石花大曲樣品中含有大量細(xì)菌菌群,但這些優(yōu)勢(shì)細(xì)菌在各樣品中并非均勻分布。陳申習(xí)等[21]采用傳統(tǒng)分離方法和現(xiàn)代分子技術(shù)對(duì)清香型小曲白酒機(jī)械化生產(chǎn)中微生物動(dòng)態(tài)變化進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)酒醅微生物的細(xì)菌主要為乳桿菌屬和芽孢桿菌屬。也有研究人員采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)清香型白酒發(fā)酵過程中的細(xì)菌多樣性進(jìn)行了解析。張雙燕等[22]利用高通量測(cè)序方法對(duì)北京某清香型酒廠大曲細(xì)菌進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)厚壁菌門為優(yōu)勢(shì)菌門;乳桿菌屬、片球菌屬(Pediococcus)、乳球菌屬(Factococcus)、明串珠菌屬為優(yōu)勢(shì)菌屬;王雪山等[23]利用高通量測(cè)序技術(shù)分析不同位置酒醅中微生物種群結(jié)構(gòu)及演替規(guī)律,發(fā)現(xiàn)清香型白酒發(fā)酵過程中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌種群包括乳桿菌屬、魏斯氏菌屬、Kroppenstedtia、假單胞菌屬、明串珠菌屬、芽孢桿菌屬和片球菌屬。上述結(jié)論中均有優(yōu)勢(shì)屬乳桿菌屬,其他屬在結(jié)論中也有重復(fù)出現(xiàn),結(jié)論中略微不同的原因可能是與使用原料、制作環(huán)境或制作工藝有關(guān)。

      2.3 基于OTU水平的細(xì)菌多樣性分析

      4個(gè)石花大曲樣品中的OTU數(shù)量及種類并非完全相同,其中平均相對(duì)含量>1%的OTU有9個(gè),其在各石花大曲樣品中的相對(duì)含量見圖2。

      圖2 石花酒大曲樣品中平均相對(duì)含量>1%細(xì)菌OTU統(tǒng)計(jì)分析Fig.2 Statistical analysis of OTU of bacteria with mean relative content more than 1% in Shihua Baijiu Daqu samples

      由圖2可知,平均相對(duì)含量>1%的OTU(平均相對(duì)含量)分別為OTU5 932(29.43%)、OTU9(11.79%)、OTU1 837(10.63%)、OTU6 068(3.49%)、OTU5 659(2.60%)、OTU3 353(2.29%)、OTU4 058(1.22%)、OTU895(1.10%)和OTU5 687(1.05%),其中OTU5 932、OTU9、OTU895和OTU5 687隸屬于變形桿菌門,OTU1837、OTU6068和OTU5659隸屬于厚壁菌門,OTU3353和OTU4058隸屬于放線菌門,且除OTU4058,其他OTU在各樣品中均存在。由圖2亦可知,樣品SHQ2中OTU5 932的相對(duì)含量已達(dá)65.15%,顯著高于其他樣品,而其OTU2 793的相對(duì)含量?jī)H為2.09%,樣品SHQ4中OTU6 068的相對(duì)含量已達(dá)32.25%,顯著高于其他樣品,且OTU4 058僅在樣品SHQ4中出現(xiàn)。在每個(gè)樣品中均出現(xiàn)的細(xì)菌門為樣品的核心細(xì)菌門。由此可見,石花大曲樣品中的核心細(xì)菌門為變形桿菌門、厚壁菌門和放線菌門,且各樣品相對(duì)含量存在差異。

      2.4 石花大曲樣品真菌序列豐富度分析

      使用Illumian MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)4個(gè)石花大曲樣品的真菌多樣性進(jìn)行分析,其18S rRNA測(cè)序結(jié)果及多樣性指數(shù)見表2。

      由表2可知,4個(gè)石花大曲樣品中共產(chǎn)生179 736條真菌序列,平均每個(gè)樣品產(chǎn)生44 934條序列。根據(jù)97%相似性歸類共得到4 640個(gè)OTU,平均每個(gè)樣品1 160個(gè)OTU。當(dāng)測(cè)序量為42010時(shí),樣品SHQ02的ObservedSpecies指數(shù)、Chao 1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)均為各樣品中的最大值,分別為1 275、5 478、4.69和0.90,表明樣品SHQ02中真菌群落豐富度和多樣性均最大;樣品SHQ01的Observed Species指數(shù)和Chao 1指數(shù)最小,分別為1 000和3 083,樣品SHQ04的Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)最小,分別為2.93和0.51。表明樣品SHQ01中真菌群落豐富度最低,SHQ04多樣性最低。

      表2 石花酒大曲樣品中真菌的測(cè)序結(jié)果及多樣性指數(shù)Table 2 Sequencing results and diversity index of fungi in Shihua Baijiu Daqu samples

      2.5 基于門和屬水平的真菌多樣性分析

      從每個(gè)OTU中挑選一條代表性序列進(jìn)行比對(duì),然后統(tǒng)計(jì)其界、門、綱、目、科和屬的種類和數(shù)量,其中真菌門及屬水平的分析結(jié)果見圖3,將相對(duì)含量<0.1%的真菌門或相對(duì)含量>1%的真菌屬歸為其他,相對(duì)含量>0.1%的真菌門或相對(duì)含量>1%的真菌屬定義為優(yōu)勢(shì)真菌門或?qū)佟?/p>

      由圖3A可知,4個(gè)石花大曲樣品中主共檢測(cè)出3個(gè)真菌門,其中優(yōu)勢(shì)真菌門為子囊菌門(Ascomycota)、其他的真菌門有擔(dān)子菌門(Basidiomycota)和Mucoromycota,平均相對(duì)含量分別為99.70%、0.17%、0.12%,且平均僅有0.01%不能鑒定到門水平。樣品中子囊菌門的平均相對(duì)含量高達(dá)99.70%,而擔(dān)子菌門和Mucoromycota的累計(jì)平均相對(duì)含量<0.29%。樣品SHQ04中擔(dān)子菌門和Mucoromycota的相對(duì)含量明顯低于其他樣品,而樣品SHQ02中子囊菌門含量低于其他樣品,說明各樣品中真菌門的種類和含量存在差異。

      由圖3B可知,4個(gè)樣品中共檢測(cè)出25個(gè)真菌屬,其中優(yōu)勢(shì)真菌屬為復(fù)膜孢酵母屬(Saccharomycopsis)、紅曲菌屬(Monascus)、熱子囊菌屬(Thermoascus)、青霉菌屬(Penicillium)、曲霉屬(Aspergillus)和Leiothecium,平均相對(duì)含量分別為57.08%、17.58%、5.38%、4.76%、1.78%和1.22%,所有合格序列有8.47%不能鑒定到屬水平。值得一提的是,復(fù)膜孢酵母屬在樣品SHQ02中的相對(duì)含量?jī)H有21.25%,而在樣品SHQ04中的相對(duì)含量高達(dá)88.39%;青霉菌屬在樣品SHQ02中的相對(duì)含量為18.58%,而在樣品SHQ01、SHQ03和SHQ04中的相對(duì)含量分別為0.13%、0.34%和0.01%;紅曲菌屬在樣品SHQ4中僅含有0.04%。由此可見,雖然石花大曲樣品中含有大量真菌菌群,但這些優(yōu)勢(shì)真菌在各樣品中并非均勻分布。王雪山等[23]通過高通量測(cè)序技術(shù)還發(fā)現(xiàn),在清香型白酒發(fā)酵過程中,真菌種群中子囊菌門在所有酒醅中占主導(dǎo)地位;優(yōu)勢(shì)真菌屬包括畢赤酵母屬、假絲酵母屬、曲霉屬、復(fù)膜孢酵母屬和Kazachstania;雷振河[24]應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)清香型白酒釀造用大曲和酒醅中微生物構(gòu)成進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)大曲中優(yōu)勢(shì)真核微生物主要包括曲霉菌屬、熱子囊菌屬、根霉菌屬、嗜熱真菌屬、假絲酵母屬。上述結(jié)論中的真菌優(yōu)勢(shì)屬間均有相似之處,但結(jié)論中卻沒有出現(xiàn)一個(gè)共有的優(yōu)勢(shì)真菌屬。出現(xiàn)這一結(jié)果這可能是由于原料、地域、環(huán)境、發(fā)酵工藝等因素不同造成的。

      圖3 基于真菌門(A)和屬(B)水平石花酒大曲樣品中細(xì)菌多樣性分析Fig.3 Analysis of fungal diversity in Shihua Baijiu Daqu samples based on the phylum (A) and genus (B) level

      2.6 基于OTU水平的真菌多樣性分析

      4個(gè)石花大曲樣品中的OTU數(shù)量及種類并非完全相同,其中平均相對(duì)含量>1%的OTU有7個(gè),其在各石花大曲樣品中的相對(duì)含量見圖4。

      圖4 石花酒大曲樣品中平均相對(duì)含量>1%真菌OTU統(tǒng)計(jì)分析Fig.4 Statistical analysis of OTU of fungi with mean relative abundance more than 1%in Shihua Baijiu Daqu samples

      由圖4可知,平均相對(duì)含量>1%的OTU(平均相對(duì)含量)分別為OTU2 668(43.97%)、OTU1 186(14.50%)、OTU65(5.04%)、OTU790(3.74%)、OTU1 246(1.42%)、OTU2 387(1.34%)和OTU3 135(1.00%),OTU均屬于子囊菌門,且這些OTU在各樣品中均存在。由圖4亦可知,各樣品中所有相對(duì)含量>1%的OTU的平均累計(jì)相對(duì)含量已達(dá)71.03%。在每個(gè)樣品中均出現(xiàn)的真菌門為樣品的核心真菌門。由此可見,石花大曲樣品中的核心真菌門為子囊菌門,且各樣品相對(duì)含量存在差異。

      2.7 石花大曲真菌與細(xì)菌優(yōu)勢(shì)屬的相關(guān)性分析

      采用SAS V8軟件對(duì)4個(gè)石花大曲樣品中的真菌和細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)屬進(jìn)行初步的相關(guān)性分析,結(jié)果見圖5。

      圖5 石花酒大曲優(yōu)勢(shì)真菌屬與細(xì)菌屬相關(guān)性分析熱圖Fig.5 Heat map of relativity analysis of dominant fungi and bacteria genera in Shihua Baijiu Daqu

      由圖5可知,假單胞菌屬和曲霉屬呈現(xiàn)顯著正相關(guān)(P<0.05),R=0.96,而其他真菌與細(xì)菌優(yōu)勢(shì)屬之間相關(guān)性均不顯著(P>0.05),且部分呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)。說明假單胞菌屬細(xì)菌和曲霉屬真菌在石花大曲中有著相互促進(jìn)生長(zhǎng)的作用,而其他屬的細(xì)菌與真菌相互促進(jìn)作用不明顯,有的甚至相互抑制生長(zhǎng)。

      3 結(jié)論

      本研究使用IlluminaMiSeq高通量測(cè)序技術(shù),以16SrRNA的V3-V4區(qū)和18S rRNA的V4-V5區(qū)為測(cè)序靶點(diǎn),對(duì)石花大曲中的細(xì)菌和真菌微生物多樣性進(jìn)行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),石花大曲中的細(xì)菌主要由隸屬于變形桿菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和放線菌門(Actinobacteria)的假單胞菌屬(Pseudomonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、魏斯氏菌屬(Weissella)、明串珠菌屬(Leuconostoc)和Kroppenstedtia的7個(gè)屬組成;石花大曲中的真菌主要由隸屬于子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)和Mucoromycota的復(fù)膜孢酵母屬(Saccharomycopsis)、紅曲菌屬(Monascus)、熱子囊菌屬(Thermoascus)、青霉菌屬(Penicillium)、曲霉屬(Aspergillus)和Leiothecium6個(gè)屬組成,且石花酒曲樣品共有大量的核心細(xì)菌和真菌菌群。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)細(xì)菌中的假單胞菌屬與真菌的曲霉屬有顯著的正相關(guān)性(P<0.05)。該研究為石花大曲中微生物資源的開發(fā)奠定一定的理論基礎(chǔ)。

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