李文慶,尹昭吉,陳凱云,陳家輝*
1.中國科學(xué)院昆明植物研究所,中國科學(xué)院東亞植物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,昆明 650201
數(shù)據(jù)庫(集)基本信息簡介
數(shù)據(jù)庫(集)名稱 滇西北縣域種子植物名錄數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)作者 李文慶、尹昭吉、陳凱云、陳家輝數(shù)據(jù)通信作者 陳家輝(chenjh@mail.cn)地理區(qū)域滇西北(24°38′-29°15′N,98°05′-101°16′E),其中包括:隆陽區(qū)、騰沖市、瀘水縣、福貢縣、貢山縣、維西縣、蘭坪縣、云龍縣、劍川縣、洱源縣、大理市、漾濞縣、玉龍縣、香格里拉市、德欽縣、寧蒗縣??臻g分辨率 縣級數(shù)據(jù)量 371 KB,合計總數(shù)據(jù)量5867條數(shù)據(jù)格式 *.xlsx數(shù)據(jù)服務(wù)系統(tǒng)網(wǎng)址 http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/979基金項(xiàng)目 生態(tài)環(huán)境部,生物多樣性調(diào)查評估項(xiàng)目(2019HJ2096001006)數(shù)據(jù)庫(集)組成數(shù)據(jù)集包括滇西北地區(qū)種子植物56目185科1233屬5866種,其中被子植物53目181科1218屬5822種(含種下等級),裸子植物3目4科15屬44種(含種下等級)。數(shù)據(jù)內(nèi)容由7部分組成,分別為拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、學(xué)名、中文名、縣名。
滇西北地處青藏高原南緣,屬于橫斷山的南端,特殊的地質(zhì)地貌、復(fù)雜多樣的氣候類型與縱橫交錯的河網(wǎng)水系,使該地區(qū)成為我國乃至世界生物多樣性豐富和獨(dú)特的地區(qū)之一[1]。該地區(qū)位于云南省西北部,在行政區(qū)劃上包括迪慶藏族自治州、怒江傈僳族自治州、麗江市、保山市和大理白族自治州。在《中國生物多樣性保護(hù)戰(zhàn)略與行動計劃》(2011?2030年)中,滇西北是8個優(yōu)先保護(hù)區(qū)域之一的西南高山峽谷區(qū)的主要組成區(qū)域。此外,在《中國的生物多樣性:現(xiàn)狀及其保護(hù)對策》[2]中,滇西高山峽谷地區(qū)是我國14個具有國際意義的陸地生物多樣性關(guān)鍵地區(qū)之一。滇西北面積為79 800 km2,占比不到國土面積的1%,卻擁有全國約三分之一的高等植物,然而生物多樣性空間分布數(shù)據(jù)卻十分欠缺[3]。
生物物種名錄是一個自然地理區(qū)域或行政單元生物區(qū)系本底性的基礎(chǔ)資料[4],物種名錄編制是一個需要及時更新的動態(tài)過程。2006年完成的《云南植物志》[5]、2004年完成的《中國植物志》[6]和2013年完成的第二版《Flora of China》(50卷)[7],反映了學(xué)者們對云南包括滇西北地區(qū)高等植物認(rèn)識的階段性成就,在一定程度上補(bǔ)充和完善了對云南植物物種多樣性的認(rèn)識。然而,區(qū)域性(滇西北等)生物多樣性評估非常有限,物種精確的分布、狀態(tài)和變化趨勢大都不清楚[8-9]。加之隨著近年來對滇西北地區(qū)生物多樣性調(diào)查和研究的深入,大量的新分類群和新記錄物種的發(fā)現(xiàn)和發(fā)表,以及分類學(xué)和系統(tǒng)學(xué)的深入研究導(dǎo)致大量科、屬和種范圍界定和系統(tǒng)位置發(fā)生變化等原因[10],編制滇西北種子植物名錄并建立及時更新制度與平臺,對于區(qū)域性生物多樣性研究和保護(hù)與利用實(shí)踐都是十分重要的。
滇西北縣域種子植物名錄數(shù)據(jù)集的主要來源于《云南植物志》各卷冊[5]和《云南種子植物名錄》[10],同時補(bǔ)充:
(1)區(qū)域性植物志書和生物多樣性專著:如《中國植物志》[6]、《Flora of China》[7]、《云南省生物物種名錄(2016版)》[11]、《云南生物物種紅色名錄(2017版)》[12]、《青藏高原維管植物及其生態(tài)地理分布》[13]和《橫斷山區(qū)維管植物》[14]等。
(2)文獻(xiàn):國內(nèi)外分類學(xué)學(xué)術(shù)期刊發(fā)表的涉及到滇西北區(qū)域的類群的分類學(xué)修訂以及該區(qū)域有分布的新類群和新記錄。
(3)標(biāo)本館及公共數(shù)據(jù)庫:收集中國科學(xué)院昆明植物研究所標(biāo)本館(KUN)、中國科學(xué)院植物研究所標(biāo)本館(PE)、中國科學(xué)院成都生物研究所植物標(biāo)本館(CDBI)、中國科學(xué)院西北高原生物研究所植物標(biāo)本館(QTPMB)、四川大學(xué)植物標(biāo)本館(SZ)、西藏高原生物研究所標(biāo)本館、云南大學(xué)標(biāo)本館(PYU)等高校和科研院所滇西北高等植物的館藏標(biāo)本信息,以及中國數(shù)字植物標(biāo)本館(CVH,http://www.cvh.org.cn),中國國家標(biāo)本資源平臺(NSII,http://www.nsii.org.cn/),全球生物多樣性信息網(wǎng)絡(luò)(GBIF,https://www.gbif.org/)等分類學(xué)公共網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺的滇西北高等植物的標(biāo)本信息,完善縣域分布。
(4)補(bǔ)充和更新近年的野外考察成果和專家建議。
將通過以上各種數(shù)據(jù)源整合得到的種子植物名錄和地理分布的集合數(shù)據(jù)錄入EXCEL,以方便后期處理。
(1)異名處理
通過 Tropicos(http://www.tropicos.org/)、物種 2000(http://www.sp2000.cn/joaen/index.php)、Flora of China(http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2)等數(shù)據(jù)庫平臺對整合的種子植物名錄集合數(shù)據(jù)中的科名和學(xué)名進(jìn)行核對[15-16],具體的處理細(xì)過程詳見陳家輝等(2018)[10]文獻(xiàn)。
(2)分類系統(tǒng)
參照最新的分子系統(tǒng)學(xué)和分類學(xué)成果決定啟用的名稱和系統(tǒng)位置,裸子植物和被子植物的分類系統(tǒng)分別以采用克氏系統(tǒng)和APG Ⅳ系統(tǒng)為基礎(chǔ),但也有所修訂,詳見陳家輝等(2018)[10]文獻(xiàn)。
(3)種下等級處理
為了細(xì)化植物多樣性,采用變種或亞種的概念。當(dāng)一個種的種下有2個以上的亞種或變種,若僅僅是某變種/亞種(包括原變種/亞種)分布于滇西北,則僅收錄該變種/亞種[10]。
(4)提取地理分布
從上述已經(jīng)進(jìn)行異名處理后的種子植物數(shù)據(jù)集中按照地理分布信息分別提取出隆陽區(qū)、騰沖市、瀘水縣、福貢縣、貢山縣、維西縣、蘭坪縣、云龍縣、劍川縣、洱源縣、大理市、漾濞縣、玉龍縣、香格里拉市、德欽縣、寧蒗縣這16個縣域中的被子植物和裸子植物名錄數(shù)據(jù),最終形成滇西北地區(qū)縣域種子植物名錄數(shù)據(jù)集。針對歷史采集信息,存在許多地點(diǎn)描述不規(guī)范和信息缺失的問題,同時考慮我國行政區(qū)劃在不斷發(fā)生更替(如中甸變更為香格里拉市等),早期的很多地名已經(jīng)發(fā)生變化[17],因此還進(jìn)行了手工逐條校對并更正。
(5)中文名選用原則
選用的類群中文名首先依據(jù)《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》所記載的中文名,對于沒有記載或者匹配失敗的物種名稱,依次選用《Flora of China》、《云南植物志》。
數(shù)據(jù)集合計總數(shù)據(jù)量為5867條,每條目包含一個縣級分布地,具體包括滇西北地區(qū)種子植物56目185科1233屬5866種,其中被子植物53目181科1218屬5822種(含種下等級),裸子植物3目4科15屬44種(含種下等級)。數(shù)據(jù)內(nèi)容由7部分組成,分別為拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、學(xué)名、中文名、縣名(見圖1)。
圖1 滇西北種子植物數(shù)據(jù)集
為了對數(shù)據(jù)質(zhì)量進(jìn)行控制和評估,我們采用工作組初審和專家會審和函評的工作流程。初審主要由工作組完成,即根據(jù)以上原則對滇西北記錄的所有物種名稱進(jìn)行逐一審核。邀請云南省內(nèi)外有關(guān)分類學(xué)專家參加專家審核會,專家組成員提出質(zhì)疑,再由工作組成員根據(jù)專家意見進(jìn)行審核和修改。對一些從事專科專屬研究的專家,則采用通過電子郵件發(fā)送邀請函的方式請專家對相應(yīng)的科屬進(jìn)行審核。由專家出具書面審核意見和建議,工作組再根據(jù)專家的審核意見和建議進(jìn)行修改、調(diào)整和完善。
滇西北是中國西南山地這一全球生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)的核心區(qū)域,但其生態(tài)環(huán)境十分脆弱、經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展相對滯后,進(jìn)行該區(qū)域植物多樣性摸底調(diào)查對于這一重要區(qū)域的生物多樣性保護(hù)和科學(xué)利用是十分必要的。本數(shù)據(jù)集可以為掌握生物多樣性空間分布規(guī)律和明確滇西北地區(qū)植物保護(hù)空缺提供數(shù)據(jù)支持,為提出優(yōu)先區(qū)域生物多樣性的保護(hù)與監(jiān)管對策以及政府決策提供依據(jù)和基礎(chǔ)資料,為我國未來開展大尺度的生物多樣性本底調(diào)查與評估提供案例。