溫室白粉虱染色體水平基因組首次被揭示

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜蟲(chóng)害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和美國(guó)康奈爾大學(xué)BTI合作解析了世界重大農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)溫室白粉虱基因組，揭示了其發(fā)育特異性表達(dá)和抗藥性分子機(jī)制，對(duì)深入開(kāi)展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物—昆蟲(chóng)—微生物及病毒互作、粉虱類(lèi)害蟲(chóng)抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。相關(guān)研究成果與3月27日在線(xiàn)發(fā)表于《分子生態(tài)資源（Molecular Ecology Resource）》上。

溫室白粉虱和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴(yán)重的2種粉虱類(lèi)害蟲(chóng)。煙粉虱基因組早在2016年和2017年由以上合作雙方共同解析完成。本研究利用三代測(cè)序平臺(tái)Pacbio長(zhǎng)reads和Hi-C技術(shù)，實(shí)現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級(jí)別的組裝。結(jié)果發(fā)現(xiàn)：白粉虱基因組組裝大小為787 Mb，含11條染色體級(jí)別scaffolds；注釋到18 275個(gè)蛋白編碼基因，重復(fù)序列占基因組的56.6%；對(duì)白粉虱發(fā)育階段特異性表達(dá)分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化關(guān)聯(lián)的基因，例如卵黃蛋白基因和cuticle基因；白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn)，天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴(kuò)張，這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān)；通過(guò)細(xì)胞色素P450家族的比較分析，在白粉虱找到和煙粉虱CYPCM1同源的4個(gè)P450基因，這4個(gè)基因有可能幫助到白粉虱代謝新煙堿類(lèi)藥劑。