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      生物安全樣本庫的發(fā)展、應(yīng)用現(xiàn)狀與探討

      2021-01-03 02:26:51趙小燕裴宇盛高華杜然然
      中國醫(yī)藥生物技術(shù) 2021年4期
      關(guān)鍵詞:樣本生物研究

      趙小燕,裴宇盛,高華,杜然然

      ·生物樣本庫建設(shè)·

      生物安全樣本庫的發(fā)展、應(yīng)用現(xiàn)狀與探討

      趙小燕,裴宇盛,高華,杜然然

      102600 北京,中國食品藥品檢定研究院藥理室

      隨著轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和個體化醫(yī)療的興起及迅猛發(fā)展,生物樣本庫的概念逐漸引起了國內(nèi)外政府及研究機(jī)構(gòu)的重視,各國政府更是加大了對建庫資金的投入力度[1]。生物樣本是實現(xiàn)臨床到科研,再將科研成果快速用于臨床,在提高科研效率的同時,能夠讓患者充分受益的重要生物資源。生物樣本庫已經(jīng)成為臨床疾病的治療和預(yù)防、生命科學(xué)研究、個體化治療、科研成果轉(zhuǎn)化的重要基礎(chǔ)設(shè)施[2]。

      近年來,國內(nèi)外生物樣本庫逐漸實現(xiàn)了大規(guī)模、高質(zhì)量的發(fā)展,生物樣本庫所涵蓋的信息愈加完善。國外生物樣本庫已經(jīng)明顯呈現(xiàn)了網(wǎng)絡(luò)化、聯(lián)盟化的趨勢,美國、歐盟等國家和地區(qū)的生物樣本庫已完成全國性的聯(lián)合,使得資源共享應(yīng)用、質(zhì)量管理體系統(tǒng)一、協(xié)調(diào)合作更加高效[3]。和國外的發(fā)展進(jìn)程相比,我國還處于起步階段,但是基于豐富的生物樣本資源,在建庫方面優(yōu)勢明顯。近年來我國生物樣本庫的發(fā)展極為迅速,國內(nèi)多地都已經(jīng)建立了大型生物樣本庫。1994 年中國科學(xué)院建立的中華民族永生細(xì)胞庫是我國最早的生物樣本庫。經(jīng)過多年的發(fā)展,國內(nèi)生物樣本庫建設(shè)的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程和信息數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)有了很大的改善[4]。

      在生物安全相關(guān)樣本庫建庫及管理方面,2005 年在國家衛(wèi)健委主導(dǎo)下,形成并逐步完善了國家微生物資源保藏平臺,由于起步較晚,生物安全樣本從采集、運(yùn)輸、檢定到處置的全流程監(jiān)管規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)體系缺失,急需建立樣本庫數(shù)據(jù)和質(zhì)量管理體系,搭建分散實體庫和集中信息庫。

      2020 年 2 月 14 日,在中央全面深化改革委員會第十二次會議上,習(xí)近平發(fā)表重要講話,把生物安全納入國家安全體系,要全面提高國家生物安全治理能力、加快生物安全相關(guān)法律法規(guī)體系建設(shè)。重要病原體及其媒介生物、宿主生物和人類遺傳資源等生物樣本是關(guān)乎國家安全的重要戰(zhàn)略資源。當(dāng)前我國的生物相關(guān)樣本庫存在標(biāo)準(zhǔn)缺失、利用率低下、信息孤立和人類遺傳資源外流等諸多問題,生物安全形勢嚴(yán)峻。本文將從生物安全相關(guān)樣本庫的建設(shè)現(xiàn)狀、質(zhì)量管理、信息化建設(shè)、共享應(yīng)用情況幾個方面入手對生物安全樣本庫的建設(shè)現(xiàn)狀進(jìn)行探討。

      1 生物樣本庫、生物安全樣本庫定義和分類

      對于生物樣本庫的定義,我們可以分為兩塊來理解,首先是生物樣本,生物樣本是指將一些組織、血液、體液及生物大分子等利用蠟塊或者冰凍制成可以用于診斷和分析的標(biāo)本。把這些樣本規(guī)范化收集、保存,進(jìn)行合理的處置,對相關(guān)生物學(xué)信息和臨床信息進(jìn)行匯總和儲存,并在疾病診斷和預(yù)防、藥物研發(fā)等研究需要時為其所用,這樣一個既包含實體又包含相關(guān)數(shù)據(jù)信息及相關(guān)流程和政策的集合稱為生物樣本庫[5]。

      可以根據(jù)單位或部門、規(guī)模大小、虛擬或?qū)嶓w、使用目的等進(jìn)行樣本庫分類[6]。按照樣本來源的不同,可以分為腫瘤組織生物樣本庫、消化系統(tǒng)疾病生物樣本庫、代謝疾病生物樣本庫等。按照使用目的又可以分為人口生物樣本庫和疾病生物樣本庫[7]。

      目前生物安全樣本庫還沒有統(tǒng)一的概念,我們認(rèn)為主要是指保藏烈性、重要人畜病原體及其媒介生物、宿主動物和人類遺傳資源等的樣本庫。其中值得一提的是病原微生物菌(毒)種保藏。病原微生物菌(毒)種是指具有保藏價值的,可以人工培養(yǎng)的,需要經(jīng)過病原微生物菌(毒)種保藏中心鑒定、分類并給予固定編號的,能使人類或者動物致病的病毒、細(xì)菌、真菌、放線菌、螺旋體、立克次體等微生物[8]。

      2 國內(nèi)外生物安全樣本庫現(xiàn)狀

      2.1 國外生物安全樣本庫現(xiàn)狀

      20 世紀(jì) 20 年代,工業(yè)化國家已經(jīng)意識到了病原微生物菌(毒)株保藏對疾病研究的重要性,逐步制定了重要病原體管理技術(shù)規(guī)范,并開發(fā)相關(guān)數(shù)據(jù)庫從全球獵取重要生物資源。

      發(fā)達(dá)國家生物樣本庫建設(shè)起步較早,其對微生物資源的收集、保藏、研究以及開發(fā)利用非常重視。捷克的生物學(xué)家在 1890 – 1911 年間首次在世界范圍內(nèi)收集、保存一大批有價值的微生物資源[9]。幾乎同一時間,歐美等國家也相繼建立了有著本國特色的微生物菌(毒)株資源保藏中心,由于二戰(zhàn)的爆發(fā),許多保藏庫都遭到毀滅,荷蘭的真菌保藏中心(CBS)是現(xiàn)存最早的微生物資源保藏中心[10]。二戰(zhàn)后,前蘇聯(lián)建立了龐大的微生物保藏中心,專門設(shè)立了高致病性及烈性傳染病菌株庫,并制定了包含該國特色的技術(shù)要求。目前,俄羅斯微生物保藏中心主要從事細(xì)菌和真菌的分類及生態(tài)研究,制定標(biāo)本采集、菌株分離鑒定及保藏技術(shù)規(guī)范。英國的國家菌種保藏中心是英國最大的菌種保藏中心,該中心保藏了細(xì)菌、真菌、放線菌等資源,并記載了菌株的生長條件、純化、鑒別及保藏的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范,為生物樣本資源化提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。美國國防部于 1996 年建立了全球新發(fā)傳染病監(jiān)測系統(tǒng),重點(diǎn)監(jiān)測新發(fā)、突發(fā)傳染病,規(guī)范了生物樣本的保藏管理,推動了生物安全樣本庫的建設(shè)、科學(xué)研究及標(biāo)準(zhǔn)的制定。其他從事相關(guān)研究的國外機(jī)構(gòu)主要有歐洲生物樣本庫與分子生物資源研究機(jī)構(gòu)和國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會,主要貢獻(xiàn)是在倫理、法規(guī)和管理方面提出標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范及創(chuàng)建了生物樣本庫的規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)體系。

      發(fā)達(dá)國家生物樣本庫相關(guān)技術(shù)規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)體系較為成熟。發(fā)達(dá)國家在微生物菌株保藏的基礎(chǔ)上,建立了一整套從病原發(fā)現(xiàn)、分離、純化、檢定、保藏到利用的技術(shù)規(guī)范,成為全球最具影響力和不可替代的科學(xué)研究團(tuán)隊及稀缺資源占有者。2008 年成立的泛歐洲生物樣本庫與生物分子資源研究平臺、2009 年成立的澳大利亞生物樣本網(wǎng)絡(luò)均已成為國際上最具影響力的生物樣本庫;2018 年國際標(biāo)準(zhǔn)化組織頒布了 ISO 20387:2018 生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求,這個要求是 ISO 成員國目前普遍認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)。

      2.2 國內(nèi)生物安全樣本庫發(fā)展現(xiàn)狀

      我國對微生物資源引起重視并進(jìn)行保藏管理、建立相關(guān)生物樣本庫認(rèn)識比國外發(fā)達(dá)國家要晚,生物安全樣本庫管理規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)體系匱乏,生物安全形式不容樂觀。我國全國性質(zhì)的微生物資源保藏管理委員會是在 1951 年成立的,該委員會不僅對微生物資源的收集、保藏提出引導(dǎo)性的建議,委員會成立不久后初步有了自己的實體庫,對微生物資源進(jìn)行收集、保藏并對有用的資源開展研究工作[10]。

      我國生物安全樣本庫建設(shè)起步較晚。20 世紀(jì) 70 年代,我國開始重視生物資源管理工作。1985 年,中國醫(yī)學(xué)真菌菌種保藏管理中心、中國醫(yī)學(xué)細(xì)菌保藏管理中心、中國醫(yī)學(xué)病毒菌種保藏管理中心及中國典型培養(yǎng)物保藏中心陸續(xù)建立。2003 年非典過后,一些重要的單位被國家衛(wèi)生計生委選取作為 SARS 毒株的保藏單位[10]。2005 年,在國家科技部資源共享平臺的資助下,形成并逐步完善了國家微生物資源保藏平臺;2010 年,在國家衛(wèi)生健康委主導(dǎo)下,逐步認(rèn)證了 6 個國家級病原微生物保藏中心。隨后,部分大型醫(yī)療機(jī)構(gòu)及高校建立了用于研究的樣本庫,各省也逐步建立本省的病原微生物保藏中心,生物資源的重要性逐步被認(rèn)知。國家級病原微生物保藏中心是以國內(nèi)從事相關(guān)研究的主要機(jī)構(gòu)為依托建立起來的,相對而言,這些研究機(jī)構(gòu)擁有較好的基礎(chǔ),實力和水平在國內(nèi)都比較高,不僅擁有良好的基礎(chǔ)建設(shè),更是以生物安全戰(zhàn)略發(fā)展為指引,為國家安全和相關(guān)菌(毒)株的研究提供了支撐。

      國內(nèi)擁有病原微生物菌(毒)株類生物安全樣本庫的單位有:

      ⑴中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所

      傳染病所是 1953 年成立的,該所的領(lǐng)導(dǎo)單位是中國疾病預(yù)防控制中心,是一所國家級細(xì)菌性傳染病預(yù)防控制專業(yè)機(jī)構(gòu),該所的成立一方面面臨的是國外細(xì)菌武器的大肆擴(kuò)張使用,一方面也是希望能夠?qū)鴥?nèi)烈性傳染病進(jìn)行整體的預(yù)防和控制。該單位承擔(dān)國家級重大傳染病病原體及相關(guān)媒介宿主監(jiān)測和防控工作,主持了重要病原實驗室生物安全、菌(毒)株保藏技術(shù)規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)體系的制定,建立了中國疾病預(yù)防控制中心菌(毒)株保藏中心。傳染病所的主要研究病原體有傳染病如鼠疫、炭疽等細(xì)菌性 P3 病原體。

      ⑵中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所

      作為中國疾病預(yù)防控制中心的下屬機(jī)構(gòu)以及我國唯一的國家級病毒性疾病的預(yù)防控制和研究機(jī)構(gòu),中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所于 1949 年成立,其前身是中央衛(wèi)生研究院病毒系。病毒所擁有完善的病毒檢測體系與參比實驗室系統(tǒng)。其研究的病原體有埃博拉、MERS 和狂犬病等 P3 病原體,曾經(jīng)多次獲得“埃博拉出血熱疫情防控先進(jìn)集體”“埃博拉出血熱疫情防控集體記大功”等榮譽(yù)稱號。

      ⑶中國科學(xué)院武漢病毒學(xué)研究所

      武漢病毒所是專門從事病毒學(xué)基礎(chǔ)研究及相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新的綜合性研究機(jī)構(gòu),成立于 1956 年,是我國首個擁有 P4 生物實驗室的單位。該所重點(diǎn)關(guān)注病毒學(xué)、新興生物技術(shù)以及生物安全等方面的基礎(chǔ)研究工作、集中力量突破以馬爾堡等 P4 烈性病原體為代表的新發(fā)、突發(fā)烈性傳染病病原的科學(xué)研究和技術(shù)問題。同時,武漢病毒所是我國高等級生物安全平臺和病毒資源保藏平臺的領(lǐng)軍單位,在病毒生物安全和保藏資源實力雄厚。

      ⑷中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所

      作為中國人民解放軍的最高醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu),中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院于 1951 年在上海成立。微生物流行病研究所作為軍科院的直屬單位,長期以來從事烈性傳染病病原體的研究工作,是我國唯一一所專門向聯(lián)合國宣布從事生物武器防護(hù)研究的機(jī)構(gòu)。近年來多次承擔(dān)國家和軍隊關(guān)于烈性病原體的重大檢測任務(wù),2014 年在西非的埃博拉疫情當(dāng)中發(fā)揮了中堅作用。該研究所目前的微生物菌(毒)種保藏以 P3 媒介傳播病原體為主,例如蚊、蜱和蝙蝠,著重研究相關(guān)病原體的樣本采集、鑒定保藏、使用以及信息管理技術(shù)要求。

      ⑸中國檢驗檢疫科學(xué)研究院

      中國檢驗檢疫科學(xué)研究院于 2004 年建院,是一所公益性檢驗檢測檢疫中央研究機(jī)構(gòu),隸屬于國家質(zhì)檢總局外來傳染病防控重點(diǎn)實驗室,該院致力于解決檢驗檢測檢疫中出現(xiàn)的科學(xué)研究問題,提供技術(shù)支持以及科技服務(wù),提升人民生活品質(zhì),保護(hù)國家生態(tài)安全。該院在許多突發(fā)公共衛(wèi)生事件以及重大活動中提供了重要的支撐和保障作用,例如甲型流感、SARS、中東呼吸綜合征、埃博拉出血熱、非洲豬瘟、登革熱、2020 年新冠肺炎等疫情的防控以及奧運(yùn)會、世博會等活動的安全保障。在微生物菌毒種保藏方面,以入境重要烈性病原體為研究對象,在我國境內(nèi)重要邊境口岸的媒介生物、宿主動物和分離的病原體的監(jiān)測、收集以及使用方面發(fā)揮了重要作用。

      ⑹中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所

      作為獸醫(yī)領(lǐng)域最早的國家重點(diǎn)實驗室,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所于 1948 年在黑龍江省成立,在動物疫病研究和公共衛(wèi)生領(lǐng)域取得具有重大突破的原創(chuàng)成果。該所目前擁有國內(nèi)唯一一個大動物生物安全四級設(shè)施——國家動物疫病防控高級別生物安全實驗室。近年來,在研究和防控“禽流感”、“非典”、豬“藍(lán)耳病”和仔豬病毒性腹瀉防控等領(lǐng)域發(fā)揮了關(guān)鍵的科技支撐作用,近期更是為突發(fā)新冠肺炎聯(lián)防聯(lián)控做出了貢獻(xiàn)。

      ⑺中國人民解放軍疾病預(yù)防控制中心

      2003 年,中國人民解放軍疾病預(yù)防控制中心成立[11]。在微生物菌(毒)種保藏方面,解放軍疾控中心以病毒性 P3 病原體為代表,重點(diǎn)研究在監(jiān)測體系以及“病原-媒介生物-宿主生物”的信息關(guān)聯(lián)。目前已建立了軍隊傳染病病原檢測和監(jiān)測兩大技術(shù)平臺,并通過“國家實驗室資質(zhì)認(rèn)證”權(quán)威評審,管理菌(毒)株 8000 余株,收集各類樣本 3 萬余份,有可容納 10 萬份標(biāo)本的生物樣本庫。

      ⑻首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院

      首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院于 1886 年建立。該單位長期從事臨床生物安全相關(guān)樣本庫的實踐和應(yīng)用,已完成 400 余種 1400 株臨床菌株數(shù)據(jù)庫開發(fā)。在微生物菌(毒)種保藏方面,該院以莢膜組織胞漿菌等重要細(xì)菌、真菌、體液為主建立臨床標(biāo)本資源庫,研究樣本從采集、保藏到使用的全過程。

      生物安全樣本庫的建庫對于保藏利用我國豐富的生物資源非常重要,近年來雖然生物樣本庫的數(shù)量越來越多,質(zhì)量和庫存量也越來越高,但是生物安全樣本庫存在相關(guān)技術(shù)規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)化體系缺失,信息標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)不夠完善,樣本庫分散,應(yīng)用及管理問題突出,需要引起我們的重視。

      3 我國生物樣本庫的質(zhì)量管理體系建設(shè)

      樣本庫是一個龐大的組織機(jī)構(gòu),需要科學(xué)的管理體系來運(yùn)行。生物安全樣本庫建設(shè)的關(guān)鍵要素之一是質(zhì)量,樣本收集、處理等全過程的標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化才能保證樣品質(zhì)量,高質(zhì)量的生物樣本才能保證科學(xué)研究與臨床轉(zhuǎn)化的順利進(jìn)行。雖然我國不同區(qū)域的生物樣本庫有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),但是在國家層面目前還沒有統(tǒng)一專門應(yīng)用于生物安全樣本庫的質(zhì)量管理體系標(biāo)準(zhǔn)[12],另外生物安全樣本庫在國家層面更是缺少統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)及質(zhì)量管理體系。因此,在樣本的制備全過程建立并執(zhí)行標(biāo)準(zhǔn)操作程序,完善我國生物安全樣本庫的質(zhì)量管理體系意義重大。

      為了制定質(zhì)量管理體系建設(shè)及標(biāo)準(zhǔn)化研究,同時不斷提高生物安全樣本庫的質(zhì)量和水平建設(shè),必須制定和規(guī)劃一系列統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。目前很多國際組織,如國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會(ISBER)、美國國家癌癥研究所生物資源和生物樣本辦公室(OBBR)、OECD、BBMRI、國際癌癥研究機(jī)構(gòu)(IARC)都參與生物樣本庫的質(zhì)量管理體系標(biāo)準(zhǔn)的制定和推廣。國際標(biāo)準(zhǔn)化組織(ISO)是當(dāng)前世界上影響最大的標(biāo)準(zhǔn)化專業(yè)機(jī)構(gòu),其中的“生物技術(shù)”標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(ISO/TC276)負(fù)責(zé)生物樣本采集全過程及相關(guān)技術(shù)、方法和產(chǎn)品的標(biāo)準(zhǔn)制定修訂工作,全國生物樣本標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(SAC/TC559)是我國與之對應(yīng)的技術(shù)委員會,該委員會成立于 2015 年[13]。ISBER 制定的《生物樣本庫最佳實踐》在國際上認(rèn)可度比較高,根據(jù)最近幾年建庫操作及技術(shù)的發(fā)展,該實踐從 2005 – 2018 年共出版了 4 版。

      緊跟國際形勢,我國參考國際生物樣本庫的規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè),在制定質(zhì)量管理體系等方面做了很多工作。

      2009 年,中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物組織樣本庫分會成立,并于 2011 年發(fā)布了生物樣本庫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)――《中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物樣本庫標(biāo)準(zhǔn)(試行)》[14]。2016 年,由生物芯片上海國家工程研究中心牽頭的“中國生物樣本庫聯(lián)盟”(CBA)在上海成立,此舉有利于促進(jìn)國內(nèi)生物樣本庫向標(biāo)準(zhǔn)化、國際化發(fā)展。2019 年 5 月,中國合格評定國家中心(CNAS)啟動生物樣本庫試點(diǎn)認(rèn)可活動,用戶可以通過該試點(diǎn)去了解生物樣本庫的質(zhì)量和提供合適樣本的能力。有生物樣本庫的工作作為參考,生物安全樣本庫的規(guī)范及標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè)一定能夠得到快速發(fā)展。

      4 我國生物樣本庫信息數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)

      大數(shù)據(jù)時代的樣本庫建設(shè)有三項非常重要的因素,即質(zhì)量管理、信息數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化與標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)共享[2]。一個樣本庫的靈魂是信息數(shù)據(jù),樣本庫不是簡單的樣本儲存庫,更是一個巨大的數(shù)據(jù)庫。由于生物樣本庫的儲存量大,和生物樣本有關(guān)的信息更是龐大,包括每個樣本采集、處置、儲存、運(yùn)輸、管理過程中唯一的標(biāo)示和記錄;與樣本有關(guān)的臨床信息、流行病學(xué)信息以及隨訪等其他相關(guān)信息。如果不能將樣本的信息資源進(jìn)行合理的整合匯總,建設(shè)統(tǒng)一的信息數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),那樣本庫就失去了價值,變成了“死庫”[1]。信息化標(biāo)準(zhǔn)平臺的建立及管理有助于追溯到樣本采集、保藏和使用全過程的信息,如果出現(xiàn)問題能夠及時溯源并處理[15]。不僅如此,樣本庫信息化數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)是轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究的關(guān)鍵數(shù)據(jù)資源和重要手段,是高標(biāo)準(zhǔn)、高質(zhì)量生物樣本庫的重要支撐[16]。

      國際上有很多生物樣本庫有關(guān)的合作組織,例如 ISBER、OBBR、OECD、BBMRI 等,使用“集中”模式和“虛擬生物銀行”或“聯(lián)合模式”兩種運(yùn)作策略,即將生物樣本和樣本相關(guān)信息集中在一起,以便進(jìn)行統(tǒng)一管理以及資源共享[17]。2018 年,UK biobank 發(fā)布了來自 50 萬名參與者的全基因組遺傳數(shù)據(jù)分析結(jié)果,供全世界醫(yī)學(xué)研究使用,已經(jīng)有數(shù)百個研究項目圍繞這些數(shù)據(jù)展開并有很多新發(fā)現(xiàn)被報道[18]。

      與國際上的發(fā)展相比,國內(nèi)很多樣本庫甚至還只是一個簡單的儲存庫,對樣本進(jìn)行整合利用、科學(xué)研究還顯得非常薄弱。另外,國內(nèi)不同的生物樣本庫往往采用不同的信息化管理系統(tǒng),缺乏統(tǒng)一的運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn),各個樣本庫很難實現(xiàn)信息交流和樣本交換,造成了樣本的浪費(fèi);相關(guān)科研數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)程度很低,整合性差;同時也影響與國際接軌交流,難以開展重要的多中心研究。

      在生物安全樣本庫信息化標(biāo)準(zhǔn)的統(tǒng)一上,由于國內(nèi)剛起步不久,單個庫里信息數(shù)據(jù)建立不完善,不能得到充分運(yùn)用,各庫之間更是難以統(tǒng)一數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),更別說信息之間的交換共享,如何建設(shè)統(tǒng)一的生物樣本庫信息化標(biāo)準(zhǔn),打破目前各自為政的僵局,加強(qiáng)各個樣本庫之間的聯(lián)系,最大化利用樣本的價值,是一個急需解決的問題。

      5 生物樣本資源的應(yīng)用和共享問題

      個體化醫(yī)療,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),復(fù)雜、罕見疾病治療以及科研成果快速產(chǎn)業(yè)化都離不開大批量的生物樣本和數(shù)據(jù)資源的共享。想要完整的樣本信息及各個樣本之間的關(guān)聯(lián),就需要生物樣本及信息資源的共享應(yīng)用,如果不能為科學(xué)研究提供需要的樣本資源及信息,降低科研活動中收集樣本需要的成本,樣本庫則毫無意義甚至是在浪費(fèi)資源。目前,我國雖然擁有豐富的樣本資源,樣本庫的數(shù)量和質(zhì)量上升得很快,但是對于樣本庫的整合利用還處于初級的階段,各個庫獨(dú)立分散,使得我國樣本資源共享應(yīng)用水平較低,不能很好地保持可持續(xù)發(fā)展,使研究價值大打折扣[2],產(chǎn)生了不少“私庫”和“死庫”。國際上很多樣本庫已經(jīng)實現(xiàn)了資源共享,比如在科學(xué)倫理審查通過的情況下,全球的研究機(jī)構(gòu)都可以和英國生物銀行里不同的區(qū)域中心、生物銀行進(jìn)行資源共享,并且研究機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)會反饋到英國生物銀行,使得其他研究機(jī)構(gòu)可以參考這些研究數(shù)據(jù)[19];歐盟在 2012 年啟動生物樣本庫信息共享最小數(shù)據(jù)集(MIABIS),目標(biāo)是創(chuàng)建一個通用的生物樣本庫術(shù)語,以促進(jìn)樣本庫資源和數(shù)據(jù)共享[20]。

      國內(nèi)也有一部分樣本庫正在積極探索資源的共享與應(yīng)用。如 2009 年,在北京建設(shè)的“重大疾病臨床數(shù)據(jù)和樣本資源庫”[21]和深圳華大生命科學(xué)研究院(原深圳華大基因研究院)承建的國家基因庫(CNGB),這些樣本庫的建設(shè)都為國家生物樣本庫資源共享平臺奠定了基礎(chǔ)[22]。

      生物安全樣本庫的共享應(yīng)用問題一方面是缺乏長遠(yuǎn)的規(guī)劃安排,樣本類型太少或者同樣的樣本類型重復(fù)建庫,信息和質(zhì)量管理體系不健全,倫理問題未得到統(tǒng)一解決等。尤其是規(guī)模比較小的樣本庫,產(chǎn)出投入比低,自身不能“造血”,知名度不高,不能產(chǎn)生可觀的效益[3]。另一方面是關(guān)于生物樣本庫的法律法規(guī)和管理措施還有待完善[4],資源共享之后的參與者利益分配是否均衡無法得到保障[23]。

      6 生物安全樣本庫相關(guān)政策法規(guī)建設(shè)

      隨著傳染病所和病毒所等單位生物安全樣本庫的建設(shè),一些相關(guān)的樣本保藏及運(yùn)輸全過程的相關(guān)條例辦法也相繼頒布,指導(dǎo)著相關(guān)生物安全樣本庫的建設(shè)。1985 年3 月23 日衛(wèi)生部制定了《中國醫(yī)學(xué)微生物菌種保藏管理辦法》,此辦法的頒布是基于建立中國醫(yī)學(xué)真菌菌種保藏管理中心、中國醫(yī)學(xué)細(xì)菌菌種保藏管理中心、中國醫(yī)學(xué)病毒菌種保藏管理中心的背景,明確了保藏管理中心的負(fù)責(zé)單位及主要任務(wù),明確我國菌種分類、收集、保藏、供應(yīng)使用等流程的要求,該辦法在當(dāng)時的環(huán)境下加強(qiáng)了微生物菌種的保藏管理。1986 年 8 月 8 日國家科委頒布并實施的《中國微生物菌種保藏管理條例》,強(qiáng)調(diào)了微生物保藏對于國家建設(shè)各個方面的重要性。2005 年 11 月 24 日,衛(wèi)生部發(fā)布了《可感染人類的高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運(yùn)輸管理規(guī)定》,對相關(guān)微生物菌(毒)種或樣本運(yùn)輸?shù)墓芾矸矫娴墓ぷ鬟M(jìn)行了詳細(xì)的規(guī)定與要求。2009 年 5 月 26 日,衛(wèi)生部發(fā)布了《人間傳染的病原微生物菌(毒)種保藏機(jī)構(gòu)管理辦法》,對菌(毒)種保藏機(jī)構(gòu)的職責(zé)、認(rèn)定、保藏活動、監(jiān)督管理與處罰進(jìn)行了詳細(xì)的規(guī)定與指導(dǎo)。

      7 結(jié)語

      高質(zhì)量和高標(biāo)準(zhǔn)的生物樣本是轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)藥資助創(chuàng)新體系的重要保證,生物樣本庫的標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè)是高質(zhì)量的生物樣本的基礎(chǔ),可以看到,我國生物樣本庫的建設(shè)已逐步進(jìn)入標(biāo)準(zhǔn)化時期[24]。當(dāng)前我們存在的問題是生物樣本的質(zhì)量無法滿足大樣本科學(xué)研究對于新研究、新技術(shù)、新方法的要求,缺乏信息化管理,樣本庫分散而不集中等。

      總的來說,和國外相比,我國對生物樣本庫的認(rèn)識和起步較晚,但是基于我國豐富的樣本資源,近幾年來無論是生物樣本庫還是生物安全相關(guān)樣本庫建庫成效顯著,質(zhì)量和數(shù)量顯著提升。但是需要引起重視的是我國生物安全形勢嚴(yán)峻,存在生物安全樣本庫相關(guān)規(guī)范及標(biāo)準(zhǔn)缺失、缺乏共享、利用率低下及信息化程度嚴(yán)重不足等問題,我們應(yīng)加快相關(guān)制度建設(shè),加快制定相關(guān)法律法規(guī),做好頂層設(shè)計,提升我國生物安全樣本庫管理水平,實現(xiàn)統(tǒng)籌監(jiān)管,提高國家安全防范能力。

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      國家重點(diǎn)研發(fā)計劃(2019YFC1200704)

      高華,Email:huag55@163.com

      2021-01-19

      10.3969/j.issn.1673-713X.2021.04.016

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