• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      PCR-Sanger測(cè)序法在幽門(mén)螺桿菌感染個(gè)體化治療中的應(yīng)用研究

      2021-01-22 04:14:44周晴接孟飛朱麗明蔣曉芬朱方超潘杰
      浙江醫(yī)學(xué) 2021年1期
      關(guān)鍵詞:克拉氧氟沙星個(gè)體化

      周晴接 孟飛 朱麗明 蔣曉芬 朱方超 潘杰

      幽門(mén)螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)是消化性潰瘍、慢性胃炎、胃癌及胃黏膜相關(guān)淋巴組織樣淋巴瘤的主要致病因子,根除Hp對(duì)治療和預(yù)防上述疾病具有重要意義[1]。然而,隨著抗生素的廣泛使用,Hp對(duì)常用抗生素的耐藥率越來(lái)越高,傳統(tǒng)Hp根除治療方案的根除率越來(lái)越低。目前Hp根除治療失敗的原因包括抗生素的選擇、患者依從性、地區(qū)因素、宿主因素、質(zhì)子泵抑制劑(PPI)代謝等,其中細(xì)菌耐藥是最主要的原因。因此,如何正確選擇抗生素并制定個(gè)體化治療方案是根治Hp的關(guān)鍵。研究發(fā)現(xiàn)Hp的耐藥性與其相應(yīng)的基因耐藥位點(diǎn)相關(guān),如23S rRNA基因(克拉霉素耐藥位點(diǎn))、gyrA基因(喹諾酮耐藥位點(diǎn))等,通過(guò)對(duì)Hp進(jìn)行耐藥基因測(cè)序,即可得到該耐藥位點(diǎn)的信息,從而推斷出耐藥情況[2-3]。本研究通過(guò)雙脫氧鏈終止法(PCR-Sanger)測(cè)序檢測(cè)Hp并獲得耐藥基因23S rRNA與gyrA的突變情況,推斷出Hp對(duì)克拉霉素與左氧氟沙星的耐藥情況,從而選擇敏感抗生素進(jìn)行個(gè)體化治療,以期提高Hp的根除率。

      1 對(duì)象和方法

      1.1 對(duì)象 選取2018年1至6月因各種消化道癥狀于溫州市中心醫(yī)院就診且13C尿素呼氣試驗(yàn)陽(yáng)性提示存在Hp感染的患者200例,依據(jù)“第五次全國(guó)幽門(mén)螺桿菌感染處理共識(shí)報(bào)告”推薦[4],所有患者均符合Hp根除治療指征。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)年齡18~70歲,男女不限,均為初治患者;(2)因腹痛、腹脹、反酸、噯氣、惡心、嘔吐、燒心、胸痛、嘔血、黑便等各種不適癥狀就診;(3)4周內(nèi)未使用抗生素、鉍劑、H2受體拮抗劑或PPI制劑;(4)同意行胃鏡檢查取胃黏膜活檢組織標(biāo)本進(jìn)行Hp PCRSanger測(cè)序、細(xì)菌培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn);(5)同意進(jìn)行Hp根除治療,并愿意配合醫(yī)生進(jìn)行根除療效的隨訪調(diào)查。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)嚴(yán)重心、肝、腎功能損害者;(2)妊娠或哺乳期婦女;(3)有上消化道活動(dòng)性出血、穿孔、幽門(mén)梗阻、癌癥并發(fā)癥者;(4)有食管、胃腸手術(shù)史者;(5)患者不能正確表達(dá)自己的主訴,如精神病、嚴(yán)重神經(jīng)官能癥者;(6)同時(shí)服用非甾體抗炎藥或酗酒者;(7)對(duì)阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、呋喃唑酮等4種抗生素任一種過(guò)敏者。將所有患者按隨機(jī)數(shù)字表法分為個(gè)體化治療組與經(jīng)驗(yàn)治療組兩組,每組100例。本研究經(jīng)溫州市中心醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),所有患者均知情同意。

      1.2 標(biāo)本采集 常規(guī)胃鏡檢查后選擇胃竇小彎側(cè)距幽門(mén)5 cm內(nèi)的黏膜深部組織,在相近部位(1 cm以?xún)?nèi))取3塊胃黏膜組織,分別用于Hp PCR-Sanger測(cè)序、細(xì)菌培養(yǎng)及組織病理學(xué)檢查。

      1.3 Hp檢測(cè)方法

      1.3.113C尿素呼氣試驗(yàn) 空腹或禁食2 h以上的患者正常吹氣至氣袋飽滿(mǎn)(0 min呼氣);之后,徹底漱口并服用13C尿素顆粒,靜坐30 min再次收集氣體(30 min呼氣);分別對(duì)兩次呼氣的13CO2進(jìn)行檢測(cè),并依據(jù)兩次檢測(cè)值差值判定患者呼氣試驗(yàn)結(jié)果。檢測(cè)值≥4.0判定為陽(yáng)性,<4.0判定為陰性。

      1.3.2 PCR-Sanger測(cè)序 (1)全基因組提取:將胃黏膜組織研磨后采用美國(guó)Life Technologies公司的Invitrogen Purelink Genomic DNA Mini Kit試劑盒進(jìn)行人和細(xì)菌的全基因組提取,12 000 r/min離心3 min,去除上清液,加入專(zhuān)用裂解液和鋼珠進(jìn)行細(xì)胞破碎,隨后95℃金屬浴10 min,結(jié)束后立即放入4℃冰箱冷卻30 min,最后12 000 r/min離心10 min,吸出上清液即為全基因組,提取到Hp全基因組斷定為陽(yáng)性,否則判定為陰性。(2)耐藥基因擴(kuò)增:使用23S rRNA和gyrA基因引物(表1)對(duì)耐藥基因23S rRNA和gyrA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。(3)Sanger測(cè)序:使用3730XL測(cè)序儀對(duì)23S rRNA和gyrA基因的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。(4)耐藥基因測(cè)序結(jié)果分析:采用chromas和Sequencing Analysis5.2軟件進(jìn)行序列分析,得出Sanger測(cè)序峰圖,對(duì)每個(gè)樣本的23S rRNA(A2142G、A2142C、A2142T、A2143G、A2143C),gyrA(Asn87Lys、Ala88Val、Asp91Gly/Asn/Ala/Tyr)突變位點(diǎn)進(jìn)行分析,給出耐藥性,突變判定為耐藥,未突變判定為敏感(圖1-4,插頁(yè))。

      圖1 克拉霉素未突變株測(cè)序圖

      圖2 克拉霉素A2143G純合突變株測(cè)序圖

      圖3 喹諾酮類(lèi)81位未突變、Asn91位未突變株測(cè)序圖

      圖4 喹諾酮類(lèi)Asn87Lys雜合突變、91位未突變株測(cè)序圖

      1.3.3 細(xì)菌培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn) (1)Hp分離培養(yǎng):胃黏膜組織經(jīng)充分研磨后,接種于哥倫比亞血瓊脂平板(5%脫纖維綿羊血),37 ℃三氣培養(yǎng)箱中(5% O2、10% CO2、85% N2)微需氧環(huán)境下培養(yǎng) 96 h;(2)Hp鑒定:可疑菌落經(jīng)肉眼觀察、革蘭染色鏡檢、尿素酶試驗(yàn)、過(guò)氧化氫酶和過(guò)氧化物酶試驗(yàn)陽(yáng)性者,為Hp菌株,判定為陽(yáng)性,否則判定為陰性。(3)Hp藥敏試驗(yàn):根據(jù)美國(guó)實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)推薦方法,采用耐藥臨界點(diǎn)藥物瓊脂稀釋法進(jìn)行藥敏試驗(yàn),將抗生素溶液加入瓊脂中稀釋成相應(yīng)的臨界點(diǎn)濃度,傾注平板,接種菌懸液,若接種點(diǎn)有菌生長(zhǎng)則該菌株判定為耐藥,否則判定為敏感。

      表1 耐藥基因測(cè)序引物序列

      1.4 分組處理 個(gè)體化治療組所有患者均予行胃鏡檢查及病理活檢,并同時(shí)行Hp PCR-Sanger測(cè)序、細(xì)菌培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn),對(duì)比分析測(cè)序法與細(xì)菌培養(yǎng)法檢測(cè)Hp的陽(yáng)性率及藥敏結(jié)果;測(cè)序陽(yáng)性患者予測(cè)序方案治療(抗生素選擇阿莫西林+克拉霉素與左氧氟沙星中任一敏感者,如均耐藥,則選擇呋喃唑酮),即艾司奧美拉唑腸溶片(耐信片:中國(guó)阿斯利康制藥有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字H20046379,20 mg/7 片/盒)1 片/次,2 次/d+膠體果膠鉍膠囊(膠體果鉍膠囊:山西振東安特生物制藥有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字 H20058476,100 mg/48 片/盒)2 片/次,2次/d+阿莫西林膠囊(阿莫仙:珠海聯(lián)邦制藥股份有限公司中山分公司,國(guó)藥準(zhǔn)字 H44021351,250 mg/24 片/盒)4 片/次,2次/d+克拉霉素緩釋片(諾邦:江蘇恒瑞醫(yī)藥股份有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字H20031041,500 mg/3 片/盒)1片/次,2次/d或左氧氟沙星片(可樂(lè)必妥:北京第一三共制藥有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字 H20040091,500 mg/4 片/盒)1 片/次,1 次/d或呋喃唑酮片(痢特靈:上海金不換蘭考制藥有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字 H41021628,100 mg/100 片/瓶)1 片/次,2 次/d。經(jīng)驗(yàn)治療組患者未行PCR-Sanger測(cè)序,其余檢測(cè)方法相同,給予經(jīng)驗(yàn)方案治療,即艾司奧美拉唑腸溶片1片/次,2次/d+膠體果膠鉍膠囊2片/次,2次/d+阿莫西林膠囊4 片/次,2次/d+克拉霉素緩釋片 1片/次,2次/d。兩組患者療程均為14 d,停藥后4~8周后復(fù)查13C呼氣試驗(yàn)確定Hp是否已根除成功。治療過(guò)程中對(duì)所有患者進(jìn)行隨訪,記錄患者的基本信息、檢查結(jié)果、用藥情況、藥物不良反應(yīng)及Hp根除治療結(jié)果,對(duì)比分析兩組患者的Hp根除率。

      1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn);采用意向性分析(ITT)與遵循研究方案分析(PP)評(píng)價(jià)療效;P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用Kappa檢驗(yàn)對(duì)個(gè)體化治療組PCR-Sanger測(cè)序與藥敏試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行一致性分析;Kappa值≥0.75說(shuō)明兩種方法診斷結(jié)果一致性較好;0.4≤Kappa值<0.75說(shuō)明兩種方法診斷結(jié)果一致性一般;Kappa值<0.4說(shuō)明兩種方法診斷結(jié)果一致性較差。

      2 結(jié)果

      2.1 個(gè)體化治療組患者Hp檢測(cè)結(jié)果分析 個(gè)體化治療組患者中男43 例,女 57 例,年齡 20~70(44.13±12.17)歲;胃鏡檢查及病理活檢結(jié)果顯示,個(gè)體化治療組均存在慢性胃炎,其中慢性活動(dòng)性胃炎81例,伴慢性萎縮性胃炎30例,伴胃或十二指腸潰瘍20例;PCR-Sanger測(cè)序法檢測(cè)Hp的陽(yáng)性率為80.00%(80/100),明顯高于細(xì)菌培養(yǎng)法的44.00%(44/100),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。其中慢性活動(dòng)性胃炎患者的PCR-Sanger測(cè)序法與細(xì)菌培養(yǎng)法檢測(cè)Hp的陽(yáng)性率均明顯高于慢性非活動(dòng)性胃炎患者,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05);而在慢性萎縮性胃炎與慢性非萎縮性胃炎、伴胃十二指腸潰瘍與不伴胃十二指腸潰瘍的患者之間兩種檢測(cè)方法的陽(yáng)性率比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見(jiàn)表2。

      表2 個(gè)體化治療組Hp檢測(cè)結(jié)果分析(例)

      另外,PCR-Sanger測(cè)序陽(yáng)性80株菌株的耐藥基因測(cè)序結(jié)果分析顯示,克拉霉素耐藥31例,耐藥率38.75%(31/80),左氧氟沙星耐藥34例,耐藥率42.50%(34/80);細(xì)菌培養(yǎng)陽(yáng)性44株菌株的體外藥敏結(jié)果顯示,克拉霉素耐藥10例,耐藥率22.73%(10/44),左氧氟沙星耐藥12例,耐藥率27.27%(12/44)。細(xì)菌培養(yǎng)陽(yáng)性44例中僅1例測(cè)序陰性,即兩種檢測(cè)方法均陽(yáng)性43例。Kappa分析結(jié)果顯示,兩種檢測(cè)方法對(duì)克拉霉素及左氧氟沙星藥敏情況診斷的一致性分析Kappa值分別為0.532及0.641,提示兩種檢測(cè)方法診斷結(jié)果的一致性一般,見(jiàn)表3。

      2.2 兩組患者Hp根除治療情況分析 個(gè)體化治療組PCR-Sanger測(cè)序陽(yáng)性80例患者根據(jù)測(cè)序結(jié)果給予測(cè)序方案治療,測(cè)序陰性20例患者予經(jīng)驗(yàn)方案治療,但不納入治療階段研究,而經(jīng)驗(yàn)治療組100例患者均給予經(jīng)驗(yàn)方案治療,故共180例患者納入治療階段研究。其中男 80 例,女 100 例,年齡 20~70(46.19±12.08)歲。個(gè)體化治療組共有9例患者被剔除或失訪,其中因服用克拉霉素后出現(xiàn)心悸1例,口服呋喃唑酮后出現(xiàn)皮疹或惡心無(wú)法繼續(xù)治療2例,治療不規(guī)范或失訪6例;經(jīng)驗(yàn)治療組因治療不規(guī)范或失訪被剔除12例;兩組均有部分患者(個(gè)體化治療組12例,經(jīng)驗(yàn)治療組18例)服用克拉霉素后出現(xiàn)口苦,但均未出現(xiàn)無(wú)法繼續(xù)治療的嚴(yán)重不良反應(yīng)。最終,按PP,個(gè)體化治療組Hp根除率90.14%(64/71)明顯高于經(jīng)驗(yàn)治療組的77.27%(68/88),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);按ITT,個(gè)體化治療組Hp根除率80.00%(64/80)與經(jīng)驗(yàn)治療組的 68.00%(68/100)比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表 4。

      表3 Hp PCR-Sanger測(cè)序與藥敏試驗(yàn)結(jié)果一致性分析(例)

      表4 兩組患者Hp根除治療結(jié)果分析(例)

      3 討論

      現(xiàn)在普遍認(rèn)為滿(mǎn)意的Hp根除治療方案的根除率應(yīng)達(dá)85%以上,且不引起嚴(yán)重的臨床不良反應(yīng)和細(xì)菌耐藥性。近年來(lái),隨著Hp體外細(xì)菌培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn)在臨床上的廣泛開(kāi)展,根據(jù)藥敏試驗(yàn)結(jié)果選擇敏感抗生素進(jìn)行個(gè)體化治療越來(lái)越受到重視。大量研究顯示,根據(jù)藥敏試驗(yàn)結(jié)果制定的Hp根除治療方案可顯著提高根除率[5-6]。然而,由于受到標(biāo)本采集、保存、運(yùn)送、分離培養(yǎng)等多方面因素的影響,目前Hp體外培養(yǎng)的陽(yáng)性率并不高,有文獻(xiàn)報(bào)道醫(yī)院就診患者的培養(yǎng)陽(yáng)性率僅為34.17%(17 731/51 891)[7],明顯低于 Hp 平均感染率(約 50%)[8]。這部分培養(yǎng)陰性的Hp感染患者只能采用經(jīng)驗(yàn)性方案進(jìn)行根除治療,導(dǎo)致根除率降低或出現(xiàn)嚴(yán)重不良反應(yīng),無(wú)法達(dá)到理想的治療效果。因此,想要提高這部分患者的Hp根除率,就需要一種靈敏度高且能檢測(cè)耐藥情況的檢測(cè)技術(shù)。

      熒光PCR技術(shù)是一種直接檢測(cè)核酸的分子生物學(xué)技術(shù),具有靈敏度、特異度高、操作簡(jiǎn)單、能夠早期檢測(cè)病原體的優(yōu)點(diǎn),目前已廣泛應(yīng)用于Hp的檢測(cè)[9];PCRSanger測(cè)序法是目前應(yīng)用最多的核酸測(cè)序技術(shù),具有高度的準(zhǔn)確性,是基因檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn),目前已廣泛應(yīng)用于Hp的全基因組測(cè)序[10]。本研究結(jié)果顯示,PCR-Sanger測(cè)序法檢測(cè)Hp的陽(yáng)性率為80.00%,仍有20.00%的假陰性率,考慮可能與PCR-Sanger測(cè)序法只取1塊胃黏膜組織進(jìn)行基因提取與擴(kuò)增有關(guān),但其陽(yáng)性率明顯高于細(xì)菌培養(yǎng)法的44.00%,提示PCR-Sanger測(cè)序法相對(duì)于細(xì)菌培養(yǎng)法能顯著提高Hp檢測(cè)的靈敏度,彌補(bǔ)細(xì)菌培養(yǎng)法靈敏度不高的缺點(diǎn),使培養(yǎng)陰性的Hp感染患者也可以通過(guò)PCR-Sanger測(cè)序法分析選擇敏感抗生素進(jìn)行個(gè)體化治療,從而提高Hp根除成功率。此外,目前臨床上應(yīng)用的細(xì)菌培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn)檢測(cè)的周期需要10 d,而PCR-Sanger測(cè)序法僅需3 d,可顯著提高檢測(cè)效率,從而提高患者的依從性,避免因檢測(cè)周期過(guò)長(zhǎng)導(dǎo)致的患者失訪或治療不規(guī)范。

      一項(xiàng)納入12篇RCT研究的薈萃分析結(jié)果表明[11],含鉍劑經(jīng)驗(yàn)四聯(lián)療法的根除率為77.6%,而含克拉霉素經(jīng)驗(yàn)三聯(lián)療法的根除率僅為68.9%,均無(wú)法達(dá)到滿(mǎn)意的根除治療效果。目前Hp根除治療失敗的原因主要是由于Hp對(duì)常用的抗生素耐藥[12]。近些年報(bào)道推薦用于Hp根除治療的6種抗生素中,甲硝唑耐藥率達(dá)到40%~70%,克拉霉素達(dá)到20%~50%,左氧氟沙星達(dá)到20%~50%,而阿莫西林、呋喃唑酮和四環(huán)素的耐藥率仍很低(1%~5%)[4]。其中,甲硝唑因耐藥率太高,呋喃唑酮與四環(huán)素因藥物不良反應(yīng)及安全性問(wèn)題,均已很少作為臨床一線使用;目前臨床上使用最多的抗生素是阿莫西林、克拉霉素及左氧氟沙星,因此Hp對(duì)左氧氟沙星與克拉霉素的耐藥情況與根除治療結(jié)果密切相關(guān),如果能在治療前檢測(cè)出Hp對(duì)這兩種抗生素的耐藥情況,即可選擇敏感抗生素進(jìn)行根除治療。

      本研究通過(guò)PCR-Sanger測(cè)序法得出Hp對(duì)克拉霉素與左氧氟沙星的耐藥情況,從而制定個(gè)體化方案進(jìn)行根除治療。結(jié)果顯示,個(gè)體化治療組Hp的根除率按PP達(dá)到90.14%(64/71),明顯高于經(jīng)驗(yàn)治療組的77.27%(68/88),提示根據(jù)Sanger測(cè)序結(jié)果的個(gè)體化治療方案可顯著提高Hp的根除率;而個(gè)體化治療組與經(jīng)驗(yàn)治療組的Hp根除率按ITT分別為80.00%(64/80)及68.00%(68/100),個(gè)體化治療組Hp根除率高于經(jīng)驗(yàn)治療組,但兩組間比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,分析原因可能與本研究的樣本量相對(duì)較少以及失訪率相對(duì)較高有關(guān)。同時(shí),Kappa分析結(jié)果顯示,兩種檢測(cè)方法對(duì)克拉霉素及左氧氟沙星藥敏情況診斷結(jié)果的一致性一般,提示診斷Hp耐藥情況的基因型與表型之間可能還是存在一定的差異,也可能與本研究的樣本量相對(duì)不足有關(guān),有待后續(xù)的大樣本研究加以證實(shí)。

      綜上所述,PCR-Sanger測(cè)序法檢測(cè)Hp不僅靈敏度高,且檢測(cè)周期短、效率高,同時(shí)能分析Hp對(duì)克拉霉素與左氧氟沙星的耐藥情況,從而制定個(gè)體化治療方案,能顯著提高Hp根除率。

      猜你喜歡
      克拉氧氟沙星個(gè)體化
      《風(fēng)平浪靜》黑色影像的個(gè)體化表述
      今傳媒(2022年12期)2022-12-22 07:20:12
      一克拉便利店
      個(gè)體化護(hù)理在感染科中的護(hù)理應(yīng)用
      《克拉戀人》夏日里的歡樂(lè)之戀
      逾100克拉的“巨鉆”臨沂出了5顆
      個(gè)體化治療實(shí)現(xiàn)理想應(yīng)答
      肝博士(2015年2期)2015-02-27 10:49:46
      脂肪肝需要針對(duì)病因進(jìn)行個(gè)體化治療
      肝博士(2015年2期)2015-02-27 10:49:43
      左氧氟沙星致癲癇持續(xù)狀態(tài)1例
      鹽酸左氧氟沙星治療盆腔炎的療效觀察
      左氧氟沙星及莫西沙星引起神經(jīng)毒性1例
      青冈县| 日土县| 库尔勒市| 铅山县| 军事| 曲麻莱县| 大足县| 金山区| 扎囊县| 宁国市| 同德县| 灌云县| 海宁市| 永仁县| 高阳县| 宿州市| 邛崃市| 平江县| 南华县| 清远市| 林甸县| 潜江市| 嘉黎县| 吐鲁番市| 五常市| 沙洋县| 巴东县| 云安县| 仁寿县| 昌宁县| 辽源市| 临西县| 锡林郭勒盟| 东至县| 洛隆县| 平远县| 保靖县| 社旗县| 营口市| 永春县| 乐安县|