李博宇 郭 勇 倪和民 盛熙暉 陳 余 王 梁 王相國 肖龍菲 邢 凱* 齊曉龍
(1.北京農(nóng)學(xué)院 動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,北京 102206; 2.北京市畜牧總站,北京 100107)
冷凍精子通常用于人工授精(AI)、體外受精(IVF)和卵胞漿內(nèi)單精子注射(ICSI)。在農(nóng)業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、瀕危物種保護(hù)等方面具有廣闊的應(yīng)用前景[1]。在近幾十年中,冷凍精液已經(jīng)進(jìn)行了廣泛應(yīng)用,抗凍保護(hù)劑是影響精液冷凍保存效果的重要條件之一,主要包括提供精子存活所需要能源物質(zhì),維持適宜滲透壓和pH的精液稀釋液以及防止或減少冷凍過程中精子冰晶形成的抗凍劑。DMA和DMSO是目前公認(rèn)的效果最好的2種抗凍劑?,F(xiàn)在大多數(shù)抗凍保護(hù)劑研究主要集中于稀釋液配方的優(yōu)化或者抗凍劑的選擇上,李潔等[2]通過在抗凍保護(hù)劑中添加不同抗氧化劑,發(fā)現(xiàn)一定濃度的褪黑素對雞精液保存具有顯著作用,同樣添加不同濃度的紅景天多糖、枸杞多糖等能顯著提高雞精子的凍后活率[3]。然而不同抗凍保護(hù)劑對雞精液抗凍效果及抗凍機(jī)制的相關(guān)研究較少。而且由于家禽精子獨(dú)特的生理學(xué)特征及個體差異性,到目前為止,尚未發(fā)現(xiàn)一種特別有效的雞精液抗凍保護(hù)劑[4]。
基因表達(dá)譜芯片已被應(yīng)用到動物精子基因表達(dá)水平檢測。Singh等[5]采用表達(dá)譜芯片鑒定出了幾千個雞精液中高表達(dá)的基因。而針對冷凍前后的精液,Chen等[6]比較了荷斯坦牛鮮精和凍融精的基因表達(dá)水平,并鑒定出15個差異表達(dá)的基因(Differentially expressed genes,DEG)。這些研究表明表達(dá)譜芯片是鑒定精子基因表達(dá)的一種研究方法。
因此本研究以海蘭褐種公雞為研究對象,通過分析不同抗凍保護(hù)劑處理組的精子活性,旨在篩選冷凍效果更好的抗凍保護(hù)劑。并通過采用Affymetrix公司全基因表達(dá)譜芯片對兩組雞精液進(jìn)行全基因組基因表達(dá)檢測,并篩選出兩組間的差異表達(dá)基因,為闡明不同抗凍保護(hù)劑的抗凍機(jī)制提供參考。
1.1.1樣品采集
試驗(yàn)用的海蘭褐種公雞飼養(yǎng)在北京農(nóng)學(xué)院動物房至6月齡。飼養(yǎng)條件為自然光周期,自然溫度,自由飲食和飲水。采用腹部按摩法對18只健康的種公雞進(jìn)行精液采集。采集得到的每只種公雞的精液平均分成兩組,分別添加兩種稀釋保護(hù)液,然后用于制作凍精,2種稀釋液分別用DMA和DMSO做抗凍保護(hù)劑。
1.1.2主要試劑
Trizol購自Invitrogen公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Promega公司;其余試劑未作特殊說明均購自Sigma公司。
1.1.3抗凍保護(hù)劑配方
抗凍保護(hù)劑Ⅰ:谷氨酸鈉0.867 g,D-果糖0.5 g,磷酸二氫鉀0.065 g,磷酸氫鉀1.27 g,乙酸鈉0.26 g,六水氯化鎂0.03 4 g,檸檬酸鉀0.064 g,用水補(bǔ)至100 mL,pH=7.4,終質(zhì)量濃度含6%DMA。
抗凍保護(hù)劑Ⅱ:谷氨酸鈉1.4 g,葡萄糖0.7 g,D-果糖0.2 g,一水合檸檬酸鈉0.14 g,聚乙烯吡咯烷酮0.1 g,硫酸魚精蛋白0.02 g,無水磷酸氫鈉0.98 g,無水磷酸二氫鈉0.21 g,用水補(bǔ)至100 mL,pH=7.4,終質(zhì)量濃度含10%DMSO。
1.2.1精液的程序化冷凍及解凍
將采集得到的鮮精分別與抗凍保護(hù)劑Ⅰ和抗凍保護(hù)劑Ⅱ按1∶1稀釋處理,5 ℃平衡30 min,用2種保護(hù)劑再次稀釋,使終稀釋比例為1∶3,5 ℃平衡30 min后,通過程序化冷凍儀(CL-8800i型,上海京燦精密機(jī)械有限公司上海),制備雞細(xì)管凍精。冷凍程序?yàn)閺? ℃至-35 ℃,速率為7 ℃/min,-35 ℃至-120 ℃,速率為9 ℃/min,最后投入液氮保存,冷凍7 d后進(jìn)行后續(xù)研究。精液解凍時(shí)將冷凍保存的精液在37 ℃水浴解凍40 s。
1.2.2精液活力和活率的檢測
精液的活力通過偉力精子分析儀進(jìn)行精液活力的檢測(WLJY-9000型,偉力彩色精子質(zhì)量檢測系統(tǒng),北京偉力新世紀(jì)科技發(fā)展有限公司,北京)。每個樣品重復(fù)測量3次,取均值代表樣品精子活力?;盥实臋z測利用伊紅-苯胺黑染色方法。精子冷凍-解凍后置于1.5 mL離心管中,滴加1~2滴伊紅染色液,混勻,放置30 min。滴加苯胺黑染色液3滴,混勻,放置30~60 s制成精液-伊紅-苯胺黑染色液。滴加精子-伊紅-苯胺黑染色液1滴于載玻片,制成涂片,晾干后在40倍油鏡下進(jìn)行統(tǒng)計(jì),對載玻片的兩端及中間部位分別計(jì)數(shù),每次計(jì)數(shù)200個精子,共600個精子,求出平均數(shù)。未著色的精子為活精子。
1.2.3總RNA的提取、質(zhì)量檢測和純化
將2組凍精解凍后的各18支精液隨機(jī)分為3組,等量混勻,然后采用密度梯度離心法進(jìn)行純化。純化后的精液去除緩沖液,并至于冰上30 min使用體細(xì)胞裂解液處理。
按照Trizol試劑盒的說明書,采用Trizol法提取精液中的總RNA。RNA的純度使用OD260/OD280值、OD260/OD230值和1%的凝膠電泳評估。使用分光光度計(jì)檢測總RNA的濃度。使用脫氧核糖核酸酶Ⅰ去除總RNA中的DNA。測得RNA的OD260/OD280值在1.8~2.0,OD260/OD230值在2.0~2.2。滿足Affymetrix公司全基因表達(dá)譜芯片使用標(biāo)準(zhǔn)的RNA進(jìn)入下一步試驗(yàn)。
1.2.4芯片雜交
采用Affymetrix公司雞全基因表達(dá)譜芯片(購自北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司),共包含38 535個探針。純化后的總RNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄合成first strand cDNA和second strand DNA后,形成雙鏈DNA。以second strand cDNA為模板,利用T7 Enzyme Mix合成cRNA,摻入生物素Biotin。使用磁珠純化cRNA,除去鹽、酶等雜質(zhì),并對cRNA進(jìn)行定量。將cRNA片段化成適宜雜交的大小以備雜交使用。根據(jù)Affymetrix公司相應(yīng)試劑盒,將cRNA與芯片進(jìn)行雜交。并進(jìn)一步對芯片進(jìn)行清洗、染色和掃描。使用AGCC軟件將芯片的熒光掃描圖像保存分析。
1.2.5qPCR結(jié)果驗(yàn)證
為了驗(yàn)證表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,選擇了5個 DEG進(jìn)行qPCR檢測。采用AriaMx G8830A qPCR系統(tǒng)(美國安捷倫科技公司)并按照制造商的說明,使用TransStart?Top Green qPCR SuperMix(TransGen Biotech,北京)進(jìn)行qPCR驗(yàn)證。采用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,引物序列見表1。引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。使用甘油醛-3-磷酸脫氫酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPDH)基因作為內(nèi)參,使用2-ΔΔCt方法計(jì)算基因的相對表達(dá)水平。
1.2.6數(shù)據(jù)分析
使用Expression Console軟件(Affymetrix)將文件的圖像信號轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號,即每個探針的熒光信號強(qiáng)度。使用RMA算法將數(shù)據(jù)進(jìn)行背景校正和歸一化。使用SAM R程序包分析DEG,DEG的篩選標(biāo)準(zhǔn)為:q-value≤0.05且Fold change≥2或≤0.5。使用Molecule Annotation System對DEG進(jìn)行基因功能(Gene ontology, GO)和KEGG通路富集分析,顯著的閾值為P≤0.05。驗(yàn)證結(jié)果使用SPSS版本10.0(IBM Corporation,NY) t-test進(jìn)行對不同組之間的精子活力進(jìn)行差異顯著性分析。P<0.05表示在兩組之間差異顯著。
由表2 得知,保護(hù)劑Ⅰ組的精子活力27.05±1.22高于保護(hù)劑Ⅱ組20.65±1.50,且差異顯著(P<0.05),而且,保護(hù)劑Ⅰ組的精子凍后活率47.65±5.89明顯高于保護(hù)劑Ⅱ組35.15±5.15。表明保護(hù)劑Ⅰ的冷凍效果明顯高于保護(hù)劑Ⅱ,更適合海蘭褐種公雞精液冷凍保存。
為了研究不同抗凍保護(hù)劑對雞精液冷凍-解凍后基因表達(dá)的情況,本研究采用雞全基因組表達(dá)譜芯片鑒定保護(hù)劑Ⅰ和保護(hù)劑Ⅱ中精子的基因表達(dá)情況(每組3個重復(fù))。經(jīng)掃描分析信號后,38 535個探針被檢測到在雞精液中表達(dá),其中的73.73%注釋到雞的基因上。對雞精液基因表達(dá)進(jìn)行主成分分析(PCA)發(fā)現(xiàn),保護(hù)劑Ⅰ和保護(hù)劑Ⅱ的樣本被明顯的區(qū)分開(圖1)。通過解凍后兩組間的比較,發(fā)現(xiàn)了1 604個基因在兩組中顯著差異表達(dá)(|log2(FC)|>1;q-value<0.05),與保護(hù)劑Ⅱ相比,在保護(hù)劑Ⅰ組中高表達(dá)1 380個基因,低表達(dá)224個基因(圖2)。
表1 本研究中的引物信息Table 1 Information of primers in the study
表2 不同抗凍保護(hù)劑組間精液凍后活力活率Table 2 Sperm viability after freezing in different cryoprotectants groups
圖1 不同樣本間基因表達(dá)水平的PCA分析Fig.1 PCA analysis of gene expression levels among different samples
圖中橫坐標(biāo)表示樣品間的差異倍數(shù)對數(shù)值,縱坐標(biāo)表示2個樣品的-lg(FDR)值。紅色表示保護(hù)劑Ⅰ相對于保護(hù)劑Ⅱ表達(dá)量上調(diào)的基因,綠色表示表達(dá)量下調(diào)的基因,藍(lán)色表示沒有差異的基因。The abscissa represents the logarithm of the difference between the samples, and the ordinate represents the -lg (FDR) value of the two samples. Red indicates up-regulated genes in cryoprotectant Ⅰ compared with cryoprotectant Ⅱ, green indicates down-regulated genes, and blue indicates no difference.圖2 差異表達(dá)基因的火山圖Fig.2 Volcano map of differentially expressed genes
為了解DEG涉及的生物學(xué)功能,使用超幾何檢驗(yàn)的方法對DEG進(jìn)行GO(Gene ontology)和KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路的功能富集分析。富集GO條目的結(jié)果顯示,在生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能3個方面共發(fā)現(xiàn)622個顯著富集的GO條目(q<0.05)。主要參與核糖體合成、線粒體組成及功能調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)結(jié)合、微管蛋白活性、蛋白質(zhì)靶向翻譯和mRNA分解代謝等過程(表2)。對DEG進(jìn)行KEGG通路功能富集分析,共鑒定出18個顯著的通路,其中包括內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激通路、氧化磷酸化、蛋白質(zhì)泛素化、核糖體調(diào)控以及線粒體呼吸調(diào)控等通路(圖3)。
富集因子:參與通路的DEG數(shù)與該通路總基因數(shù)的比值。Enrichment factor: the ratio of the number of DEG involved in the pathway to the total number of genes in the pathway.圖3 DEG富集的顯著通路Fig.3 The pathways involved by differentially expressed genes
通過對芯片結(jié)果的相關(guān)分析,再結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)的研究進(jìn)展,從差異表達(dá)基因中挑選了CIRBP、CCND1、RHOA、HSP90和HSP70這5個基因,并對其進(jìn)行qPCR的驗(yàn)證。由圖4可知,目的基因的qPCR檢測結(jié)果雖然與表達(dá)譜芯片的檢測結(jié)果數(shù)值上有些差異,但是整體趨勢是完全一致的。經(jīng)過qPCR的驗(yàn)證對比可知,表達(dá)譜芯片的檢測結(jié)果基本可靠,所篩選出來的差異表達(dá)基因基本符合其真實(shí)表達(dá)情況。
隨著養(yǎng)禽業(yè)的快速發(fā)展,雞人工授精技術(shù)得到廣泛應(yīng)用。作為人工授精技術(shù)發(fā)展的重要環(huán)節(jié),雞精液抗凍保護(hù)劑直接影響該技術(shù)的應(yīng)用。該技術(shù)水平的高低直接影響優(yōu)良種公雞的利用效率和養(yǎng)雞生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益。用于精液冷凍保存的抗凍保護(hù)劑本質(zhì)上有助于在冷凍過程中和冷凍后維持精子的結(jié)構(gòu)和功能[7]。很少有研究比較抗凍保護(hù)劑間在雞精液冷凍過程中的效果。抗凍保護(hù)劑Ⅰ已廣泛應(yīng)用到雞冷凍精液中,而抗凍保護(hù)劑Ⅱ在松雞外的其他家禽中很少報(bào)道。因此本研究比較了這2種抗凍保護(hù)劑凍后精液的差異基因的表達(dá)情況,篩選出更為合適的海蘭褐種公雞精液抗凍保護(hù)劑,并闡明其抗凍機(jī)制。
能量代謝直接影響精子的冷凍保存[8]。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)精子線粒體是冷凍保存過程中受損最嚴(yán)重的細(xì)胞器之一,很可能是由于凍融后運(yùn)動力和生育力喪失,而通過上調(diào)線粒體呼吸鏈調(diào)節(jié)酶的活性,可以增強(qiáng)精子活力[9]。本研究通過對2種抗凍保護(hù)劑DEG進(jìn)行KEGG通路功能富集分析,發(fā)現(xiàn)了一些與能量代謝相關(guān)的途徑,如線粒體呼吸調(diào)控,氧化磷酸化,內(nèi)源性大麻素信號通路,與之相關(guān)的基因包括NADH脫氫酶(NADH dehydrogenase),泛醇-細(xì)胞色素c還原酶(Ubiquinol cytochrome C reductase),ATP合酶(ATP synthase),細(xì)胞色素b(Cytochrome b)和琥珀酸脫氫酶(Succinate dehydrogenase)等。這些基因的差異表達(dá)可能是導(dǎo)致了2種保護(hù)劑間精子活性差異的重要因素。本研究發(fā)現(xiàn),凍融處理影響了雞精子線粒體呼吸鏈酶的表達(dá),進(jìn)而減少了ATP的生成,從而阻斷了精子運(yùn)動的能量來源,其背后的具體調(diào)節(jié)機(jī)制值得進(jìn)一步研究。
表3 差異表達(dá)基因最顯著富集的GO條目Table 3 GO entries with the most significant enrichment of differentially expressed gene
圖4 表達(dá)譜芯片與qPCR中各基因差異表達(dá)情況Fig.4 Different expression of each gene in expression profile chip and qPCR
精子發(fā)生是一個高度復(fù)雜而獨(dú)特的分化過程。細(xì)胞周期調(diào)節(jié)基因在精子發(fā)生中起重要作用。細(xì)胞周期蛋白及其依賴細(xì)胞周期蛋白激酶CDK是細(xì)胞周期的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[10]。細(xì)胞周期蛋白D1(CCND1)在細(xì)胞周期G1/S轉(zhuǎn)換過程中發(fā)揮特定作用。對小鼠精原細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn),PI3K-AKT和MAPK信號通路在CCND1的調(diào)控中發(fā)揮重要作用[11]。在本研究中,在細(xì)胞周期途徑中顯著富集了17個DEG,包括CCND1、CDK4、CDK6和CDKN1B等。結(jié)果表明,這些基因不僅參與細(xì)胞周期調(diào)控,而且選擇性的保留在成熟精子中,并且可能與精子的抗凍結(jié)能力有關(guān)。細(xì)胞周期調(diào)控基因水平的降低是否會導(dǎo)致凍融后雞精子活力的下降,尚需進(jìn)一步研究。
HSP90和HSP70同屬于HSPs(熱應(yīng)激蛋白)家族。70 ku熱休克蛋白(HSP70)在生殖系統(tǒng)發(fā)育和功能調(diào)節(jié)中具有重要作用[12]。70 ku熱休克蛋白2(HSPA2)已被證明對小鼠精子發(fā)生過程中生殖細(xì)胞分化的進(jìn)展至關(guān)重要[13]。最近研究發(fā)現(xiàn),同樣在雄性生殖系統(tǒng)中高度表達(dá)的HspA1L作為絲氨酸/蘇氨酸激酶MAPKAP激酶2(MK2)的底物,通過P38 MAPK信號通路在精子的發(fā)生中發(fā)揮重要作用[14]。90 kDa熱休克蛋白(HSP90)已發(fā)現(xiàn)其位于所有檢查物種的精子尾巴中,并在精子繁殖力中起關(guān)鍵作用[15]。Casas等[16]研究表明,在豬精液冷凍保存前進(jìn)行低溫平衡、添加保護(hù)劑過程時(shí),抗凍組的公豬HSP90基因的表達(dá)量顯著高于不抗凍組,這可能是精子在適應(yīng)冷應(yīng)激所做出的反應(yīng)。同樣,王紅等[17]研究表明,HSP90蛋白的含量與凍后牛精子的活力、質(zhì)膜完整性、頂體完整性之間存在一定的正相關(guān),可能與冷凍過程中相關(guān)抗凍蛋白的降解有關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn),HSP90和HSP70的mRNA水平在2種抗凍保護(hù)劑凍后表現(xiàn)出顯著差異,而且凍后精子活力高的保護(hù)劑Ⅰ中HSP90和HSP70較保護(hù)劑Ⅱ顯著上調(diào),提示保護(hù)劑Ⅰ具有更好的抗凍保護(hù)效果,可以更好的應(yīng)用到海蘭褐種公雞精液的冷凍保存中。然而HSP90蛋白改善解凍后精子活力和活率的潛在機(jī)制仍有待進(jìn)一步研究。
冷誘導(dǎo)RNA結(jié)合蛋白(CIRBP),是冷休克蛋白的一種,參與細(xì)胞功能所需的多種信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。CIRBP高表達(dá)時(shí)維持正常的生精功能,而在精子冷凍后顯著下調(diào),導(dǎo)致有絲分裂或減數(shù)分裂紊亂,生精細(xì)胞過度凋亡,引起各種機(jī)能紊亂[18]。本研究發(fā)現(xiàn),與保護(hù)劑Ⅰ相比,凍融處理后保護(hù)劑Ⅱ中CIRBP的mRNA水平顯著下降,這表明抗凍保護(hù)劑Ⅰ更適合海蘭褐種公雞精液的冷凍保存。不過由于相關(guān)研究報(bào)道較少,具體原因還有待進(jìn)一步研究。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)抗凍保護(hù)劑Ⅰ更適合海蘭褐種公雞的精液保存,并通過采用表達(dá)譜芯片技術(shù),篩選出不同抗凍保護(hù)劑凍后精子的差異表達(dá)基因1 604個,主要參與線粒體調(diào)節(jié)、氧化磷酸化、核糖體調(diào)節(jié)和細(xì)胞周期循環(huán)等生物學(xué)過程和物質(zhì)能量的新陳代謝、信號傳導(dǎo)、細(xì)胞增殖與凋亡等通路。這些差異表達(dá)基因(如CCND1、HSP70、HSP90、RHOA和CIRBP)的變化可能影響不同抗凍保護(hù)劑的抗凍效果,為雞精液抗凍保護(hù)劑的選擇及其抗凍機(jī)制的研究奠定基礎(chǔ)。