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      一種葉片RGB圖像快速切割多重去噪方法

      2021-08-02 12:23:17林志華林國(guó)健陳享燈林雷通曾文龍邱銘生江海東林天然
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年12期

      林志華 林國(guó)健 陳享燈 林雷通 曾文龍 邱銘生 江海東 林天然

      摘要:基于RGB圖像連通性,提出一種圖像快速切割多重去噪法(fast cutting and multiplede-noise,簡(jiǎn)稱FCMD),并與現(xiàn)有的4種算法進(jìn)行對(duì)比。結(jié)果表明,該方法處理時(shí)長(zhǎng)適中,對(duì)單色葉和雜色葉的識(shí)別像素、色階均值、色階中位數(shù)的準(zhǔn)確率均達(dá)到98.78%及以上,綜合表現(xiàn)最優(yōu)。FCMD能夠在不同的邊緣算子下完成對(duì)各種類型葉片準(zhǔn)確、快速的切割消噪,其中以sobel算子的處理效果最優(yōu),其處理效果與手動(dòng)切割(CK)無明顯差異。同時(shí),F(xiàn)CMD法在中高分辨率(3 750×2 500)的切割效果與手動(dòng)切割無明顯差異,而所用時(shí)長(zhǎng)僅為CK的23.21%,效率提升近5倍。因此,F(xiàn)CMD是一種高效、準(zhǔn)確、適用范圍廣的RGB圖像自動(dòng)化葉片切割去噪方法。

      關(guān)鍵詞:RGB圖像;圖像切割;背景去噪;植物葉片;FCMD

      中圖分類號(hào): TP391.41文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A

      文章編號(hào):1002-1302(2021)12-0151-06

      收稿日期:2020-09-29

      基金項(xiàng)目:福建省煙草公司龍巖市公司科技項(xiàng)目(編號(hào):2020Y01)。

      作者簡(jiǎn)介:林志華(1985—),男,福建連城人,農(nóng)藝師,主要從事煙葉生產(chǎn)管理、煙葉產(chǎn)業(yè)信息化建設(shè)、煙田基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)相關(guān)研究。E-mail:532337187@qq.com。

      通信作者:林天然,碩士,農(nóng)藝師,主要從事煙草植保相關(guān)研究。E-mail:chltr@126.com。

      獲取精確的葉色信息是采用RGB圖像定量描述葉片表型特征的前提[1-2]。在通過數(shù)碼相機(jī)獲取葉片圖片后,必須先對(duì)原始圖片進(jìn)行切割,將目標(biāo)葉片和背景干擾物分離后,再對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行提取分析[1-4]?,F(xiàn)有的計(jì)算機(jī)圖片切割方式主要有手動(dòng)切割法[5-6]、顏色閾值法[2,7-10]、最大類間方差(OTSU)法[11-12]、邊緣識(shí)別分割法[11-13]及復(fù)合法[11-12,14],這些方法在特定拍攝環(huán)境下[15](如黑箱拍攝)或者對(duì)特定植物的分割效果較好,但也存在適用范圍窄[16]、背景切割分離不夠充分[10-12]、處理效率較慢[13-14]等問題。針對(duì)以上問題,本研究根據(jù)數(shù)碼圖片連通域的原理,綜合背景差分[17-19]、邊緣識(shí)別、顏色閾值等算法,提出圖像切割去噪法(fast cutting and multiplede-noise,簡(jiǎn)稱FCMD),并對(duì)比FCMD與現(xiàn)有算法在處理效果、數(shù)據(jù)提取準(zhǔn)確率、處理效率上的差異及FCMD對(duì)不同邊緣算子、不同葉片類型、不同分辨率圖像的適應(yīng)性,以期能夠提供一種高效、精確、適用范圍廣的RGB圖像葉片自動(dòng)化切割去噪方法。

      1 材料與方法

      1.1 葉片收集及圖像采集

      采用福建省龍巖市龍津湖公園(117.023 011°E,25.068 662°N)拾取的10種不同類型葉片,用吸水紙擦干表面水分及灰塵后作為研究對(duì)象。圖像采集所用平臺(tái)為長(zhǎng)300 cm、寬 200 cm、離地高度80 cm的長(zhǎng)方形桌面,桌面底板顏色為灰白色(RGB值為230,230,230)啞光磨砂臺(tái)面。照明光源為直徑30 cm環(huán)型10 W白色發(fā)光二極管(LED)燈,色溫為5 000 K(4 726.85 ℃),燈管懸掛位置位于平臺(tái)中心高100 cm處,保證平臺(tái)臺(tái)面光線均勻;距離平臺(tái)臺(tái)面100 cm處用三腳架和云臺(tái)固定數(shù)碼相機(jī),鏡頭穿過環(huán)型LED燈中心,采用高分辨率照相機(jī)(型號(hào):EOS-550D,日本佳能公司)進(jìn)行垂直拍攝。圖像采集時(shí),將葉片保持自然舒展?fàn)顟B(tài)放入鏡頭中央,采用M檔無閃光拍攝,感光度(ISO)值為100,光圈f/5,快門1/15 s,焦距41 mm,白平衡設(shè)為自動(dòng),原始數(shù)字圖像分辨率為5 184×3 456。

      1.2 手動(dòng)切割及顏色信息提取方法

      采用Photoshop CS(下文簡(jiǎn)稱PS)軟件中的顏色魔棒工具及磁性邊緣索套工具對(duì)葉片圖像進(jìn)行手工切割,并以此作為對(duì)照(CK)。采用PS自帶的圖像信息直方圖獲取目標(biāo)圖像的顏色參數(shù)信息。

      1.3 現(xiàn)有計(jì)算機(jī)自動(dòng)化切割方法

      現(xiàn)有計(jì)算機(jī)自動(dòng)化切割方法主要通過Matlab 2016R軟件來實(shí)現(xiàn):

      顏色閾值法(以下簡(jiǎn)稱C1):通過預(yù)先設(shè)定好顏色閾值(本研究以采樣臺(tái)底板顏色的RGB 值為閾值)對(duì)圖像逐個(gè)像素顏色進(jìn)行識(shí)別、篩選、分離。

      OTSU法(以下簡(jiǎn)稱C2):運(yùn)用im2double函數(shù)將圖片轉(zhuǎn)化為雙精度數(shù)組;運(yùn)用graythresh函數(shù)獲得最優(yōu)閾值,然后運(yùn)用im2bw函數(shù)以此為閾值進(jìn)行二值化填充。

      邊緣識(shí)別分割法(以下簡(jiǎn)稱C3):運(yùn)用im2double函數(shù)將圖片轉(zhuǎn)化為雙精度數(shù)組,運(yùn)用rgb2gray函數(shù)將圖片轉(zhuǎn)為灰度圖;運(yùn)用ddencmp函數(shù)進(jìn)行分層小波消噪,而后采用wdencmp函數(shù)進(jìn)行全局閥值消噪;最后運(yùn)用edge函數(shù)canny算子進(jìn)行邊緣識(shí)別切割。

      復(fù)合法(以下簡(jiǎn)稱C4):先采用C3方法進(jìn)行邊緣識(shí)別切割,而后采用C2方法進(jìn)行顏色去噪處理。

      1.4 計(jì)算機(jī)自動(dòng)化葉色參數(shù)提取方法

      本研究采用Matlab軟件對(duì)彩色圖像進(jìn)行數(shù)據(jù)提取。葉色參數(shù)均以彩色圖片Red通道色階參數(shù)值為數(shù)據(jù)處理、比較、分析對(duì)象。

      1.4.1 葉色圖片預(yù)處理 運(yùn)用image(:,:,1)函數(shù)讀取目標(biāo)圖像Red通道每個(gè)像素色階,運(yùn)用全循環(huán)算法檢索記錄圖像中非黑部分像素索引碼,將其組合為新的色階數(shù)組,該數(shù)組即為無軟件特性干擾的葉片色階信息矩陣。本研究中所用到的方法在提取葉色參數(shù)提取前,均采用此方式進(jìn)行預(yù)處理。

      1.4.2 色階累積直方圖構(gòu)建 運(yùn)用imhist函數(shù)獲取Red通道色階累積直方圖。

      1.4.3 葉色特征參數(shù)表建立 運(yùn)用Mean、Median、Std函數(shù)分別獲取Red通道的色階均值、中位數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差等參數(shù),形成葉色特征參數(shù)表。

      1.5 FCMD法對(duì)不同邊緣算子適應(yīng)性的試驗(yàn)設(shè)計(jì)

      本研究運(yùn)用edge函數(shù)sobel、prewitt、roberts、canny 4種不同算子分別對(duì)10類葉片進(jìn)行自動(dòng)切割消噪并獲取其葉色參數(shù),與手動(dòng)切割(CK)所獲得的葉色參數(shù)進(jìn)行比較,運(yùn)用SPSS軟件對(duì)CK及4種算子的識(shí)別像素占比、色階均值、色階中位數(shù)、色階標(biāo)準(zhǔn)差通過最小顯著性差異法(Least-Significant Difference,簡(jiǎn)稱LSD)進(jìn)行多重比較。

      1.6 FCMD法對(duì)不同分辨率圖像適應(yīng)性的試驗(yàn)設(shè)計(jì)

      本研究將10種不同類型的葉片原始圖像分別通過PS軟件調(diào)整為低分辨率(A,750×500)、中等分辨率(B,1 500×1 000)、中高分辨率(C,3 750×2 500)、高分辨率(D,5 184×3 456)4類,而后采用FCMD進(jìn)行圖像切割去噪并分別提取不同分辨率圖像的葉色參數(shù)。運(yùn)用SPSS軟件對(duì)A、B、C、D與原始分辨率(CK)的識(shí)別像素占比、色階均值、色階中位數(shù)、色階標(biāo)準(zhǔn)差進(jìn)行LSD多重比較。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 現(xiàn)有葉片圖像切割和去噪方法存在背景干擾的問題

      2.2 FCMD圖像切割去噪法

      2.2.1 FCMD法的理論依據(jù) 往常用的4種算法(C1~C4)存在一定的缺陷:

      C1:因顏色閾值必須事先設(shè)定,故要求背景顏色盡可能單一且與主題有較大色差,因此采用此方法的試驗(yàn),一般采用黑箱拍攝或者掃描儀獲取背景單一的葉片圖像。然而,由于人眼無法直接感知RGB數(shù)值,在采用此方法試驗(yàn)前,一般須要將RGB圖像轉(zhuǎn)化為人眼可以直接感知的HSV(hue,saturation value,色調(diào)飽和度,亮度)色彩模型,再通過設(shè)定飽和度或者明暗度進(jìn)行閾值篩選,運(yùn)算量也因此加大。此方法適用于對(duì)目標(biāo)葉片葉色較為單一的植株,對(duì)雜色葉、多色葉處理效果較差。

      C2:不用預(yù)先設(shè)定顏色閾值,可以通過Matlab軟件算法庫(kù)直接調(diào)用函數(shù)進(jìn)行處理,其缺點(diǎn)與C1一樣,對(duì)葉色較為單一的植株處理效果較優(yōu),對(duì)雜色葉、多色葉處理效果較差。

      C3:在圖像采集中無須純色背景,對(duì)單色葉、雜色葉、多色葉識(shí)別效果均較好,但是對(duì)葉面扭曲的葉片及背景陰影較大、背景噪點(diǎn)多且雜的葉片圖像處理效果欠佳。

      C4:結(jié)合了C2和C3的優(yōu)點(diǎn),是目前處理效果較優(yōu)的一種圖像切割去噪方法。

      數(shù)字圖像像素點(diǎn)與其相鄰像素存在著連通關(guān)系。連通性(鄰接性)是描述區(qū)域和邊界的重要概念,2個(gè)像素是否連通可以通過以下2個(gè)條件進(jìn)行判定:2個(gè)像素的坐標(biāo)位置是否相鄰(如8鄰接等),2個(gè)像素的RGB值是否滿足特定的相似性準(zhǔn)則(同時(shí)滿足某種條件,如在色階區(qū)間范圍內(nèi))。圖1示意了數(shù)字圖像像素點(diǎn)的連通性,可以看到,位居中央的像素點(diǎn)與環(huán)繞在其周圍的其他8個(gè)像素點(diǎn)構(gòu)成了8鄰接,實(shí)現(xiàn)了領(lǐng)域連通;與其他像素點(diǎn)間的RGB值相近,實(shí)現(xiàn)了值域連通??梢圆捎眠@個(gè)原理,對(duì)數(shù)字圖像進(jìn)行邊緣檢測(cè)或者設(shè)定顏色閾值,

      找到目標(biāo)葉片,而后對(duì)圖像進(jìn)行切割、分離。

      2.2.2 FCMD法實(shí)現(xiàn)步驟 本研究所提供FCMD法主要通過Matlab軟件實(shí)現(xiàn)。步驟如下:(1)將目標(biāo)葉片根據(jù)本研究所提供的圖像采集方法進(jìn)行拍攝(圖2-1);(2)將葉片原始圖像及空白背景圖像分別轉(zhuǎn)化為灰度圖(圖2-2);(3)進(jìn)行差分處理,去除背景圖片(圖2-3);(4)進(jìn)一步去除圖像邊緣對(duì)象(圖2-4);(5)對(duì)圖像邊緣進(jìn)行檢測(cè)提?。▓D2-5);(6)對(duì)圖像進(jìn)行膨脹操作并填補(bǔ)邊緣縫隙(圖2-6);(7)對(duì)圖像進(jìn)行空隙填充并采用菱形結(jié)構(gòu)元素對(duì)圖像進(jìn)行平滑(圖2-7);(8)將平滑后的圖像多次中值濾波去除冗余信息(圖2-8);(9)運(yùn)用bwlabe函數(shù)尋找8聯(lián)通成份并進(jìn)行二值化處理(圖2-9);(10)運(yùn)用雙循環(huán)算法將上一步驟所得圖像二值圖中黑色部分(即背景RGB值為0,0,0)填充白色后形成背景蒙版;而后將原圖作為底圖,與背景蒙版進(jìn)行圖像加法運(yùn)算,形成具有白色背景及目標(biāo)葉片彩色圖像的JPG圖片(圖2-10);(11)運(yùn)用雙循環(huán)算法將前景復(fù)原后的JPG圖片白色背景透明度調(diào)整為0(即完全透明),得到透明背景的目標(biāo)葉片彩色圖像PNG圖片(圖2-11)。

      以上步驟2~11均通過計(jì)算機(jī)自動(dòng)實(shí)現(xiàn)。其中,步驟2~9為圖像切割步驟,步驟10為圖像復(fù)原步驟,步驟11為圖像背景透明化步驟。

      2.2.3 FCMD法與現(xiàn)有切割去噪方法的對(duì)比 采用FCMD法與現(xiàn)有算法(C1~C4)分別對(duì)單色葉片和雜色葉片進(jìn)行切割,比較其處理效果和所提取葉色特征參數(shù)準(zhǔn)確率。從圖3、表1可以看出,采用顏色閾值算法(C1)和OTSU算法(C2)能夠較好地去除純色葉片的背景,但是對(duì)雜色葉片會(huì)產(chǎn)生誤判,導(dǎo)致識(shí)別像素準(zhǔn)確率下降;而邊緣識(shí)別算法(C3)可以較好地識(shí)別雜色葉片邊緣,不會(huì)進(jìn)行多余的切割,但是背景雜音對(duì)其干擾嚴(yán)重,且對(duì)葉片陰影敏感容易造成誤判,其處理耗時(shí)較長(zhǎng),效率較低;復(fù)合切割算法(C4)在邊緣切割的基礎(chǔ)上再次進(jìn)行去噪,對(duì)純色葉和雜色葉均有較好的處理效果,所提取的葉色特征參數(shù)值也較優(yōu),對(duì)葉片陰影消噪效果較好,但是處理耗時(shí)最長(zhǎng)。本研究所提供的FCMD法結(jié)合了C1~C4的特點(diǎn),先進(jìn)行背景差分處理,將前、后景進(jìn)行簡(jiǎn)單分離;而后通過邊緣對(duì)象去除,降低扭曲葉片的陰影干擾;再通過邊緣識(shí)別、填充、平滑和多次中值濾波后獲得較好的邊緣輪廓;隨后進(jìn)行連通域區(qū)域面積篩選,去掉背景雜點(diǎn),分離出精確的前景目標(biāo)圖像,對(duì)單色、雜色葉片整體處理效果均最優(yōu),進(jìn)一步降低了葉片陰影的干擾,處理效率適中,具有較高的參數(shù)準(zhǔn)確率,綜合表現(xiàn)最優(yōu)。

      2.3 FCMD法的其他優(yōu)勢(shì)

      2.3.1 FCMD法適用于不同葉片類型 自然界中的植物葉型葉色多種多樣,本研究選取并采集大小、葉型、葉色、 葉緣各不相同的葉片共10類,通過本研究的圖像采集方法獲取葉片彩色圖像后,運(yùn)用FCMD法對(duì)葉片進(jìn)行自動(dòng)切割去噪,驗(yàn)證該方法的適用性。從圖4可以看出,F(xiàn)CMD法切割效果較好,但是由于部分葉型的葉面具有扭曲(圖4-D、圖4-E),在圖像采集時(shí),始終保持葉片自然舒展?fàn)顟B(tài),未進(jìn)行壓平處理,因此,會(huì)產(chǎn)生部分陰影;而羽狀復(fù)葉(圖4-F)則因?yàn)橹l過細(xì),在連通域篩選時(shí)由于面積閾值設(shè)定值較高,過于細(xì)小的枝葉會(huì)被誤判清除,造成圖像部分缺失,這些都導(dǎo)致切割效果有所下降。

      2.3.2 FCMD法適用于不同邊緣識(shí)別算子 edge函數(shù)的sobel、prewitt、roberts、canny 4個(gè)算子對(duì)葉片邊緣的識(shí)別效果是不同的。從表2可以看出,4種邊緣識(shí)別算子與CK的識(shí)別像素占比、色階均值、色階中位數(shù)均無顯著性差異。在切割消噪及信息提取分析效率上,sobel、prewitt、roberts、canny算子所用時(shí)長(zhǎng)僅為CK(23.70 s)的44.68%、45.15%、46.46%、48.48%,sobel、prewitt算子用時(shí)明顯優(yōu)于canny。綜上所述,本研究所提供的FCMD法能夠適應(yīng)在不同的邊緣算子下完成各種類型葉片準(zhǔn)確、快速地切割消噪,其中以sobel算子最優(yōu),其處理效果(識(shí)別像素占比、色階均值、色階中位數(shù)、色階標(biāo)準(zhǔn)差)與手動(dòng)切割無顯著性差異,且處理用時(shí)最短。

      2.3.3 FCMD法適用于不同分辨率圖像 在進(jìn)行群體高通量表型獲取時(shí),研究人員必須考慮檢測(cè)儀器的成本投入及測(cè)量效率。通過對(duì)不同分辨率的圖像處理效果(表3)可以看出,中高分辨率(C)、高分辨率(D)在識(shí)別像素占比、色階均值、色階中位數(shù)、色階標(biāo)準(zhǔn)差4項(xiàng)參數(shù)中均與CK無顯著性差異;低分辨率(A)、中分辨率(B)的色階標(biāo)準(zhǔn)差、色階均值、色階中位數(shù)與CK均有顯著性差異。在處理效率方面,低分辨率、中分辨率、中高分辨率、高分辨率所用時(shí)長(zhǎng)僅為CK(23.70 s)的2.07%、4.43%、23.21%、44.68%,且4種分辨率的用時(shí)均呈顯著性差異。綜上所述,中高分辨率、高分辨率在切割效果和葉色特征參數(shù)在獲取方面均與手動(dòng)切割無顯著性差異,但中高分辨率的處理用時(shí)約為高分辨率用時(shí)的一半。因此,在研究中可以采用中高分辨率(3 750×2 500)的圖像代替高分辨率圖像,以提升處理效率,降低圖像采集及數(shù)據(jù)處理設(shè)備的投入。

      3 結(jié)論與討論

      數(shù)碼圖像由于其低廉的成本、精準(zhǔn)的信息、方便的操作備受表型組學(xué)研究人員青睞[20]。在圖像切割和信息獲取過程中,不同的方法對(duì)葉色提取結(jié)果有較大的影響。本研究比較了前人不同算法的優(yōu)缺點(diǎn),提出了基于RGB圖像連通性的FCMD法,并與現(xiàn)有的4種算法進(jìn)行精確度、處理效果的對(duì)比(圖3、表1), 結(jié)果顯示本研究所提供的FCMD法綜合表現(xiàn)最優(yōu)。還對(duì)FCMD法對(duì)不同葉型葉片(圖4)、不同邊緣算子(表2)、不同分辨率圖像(表3)的適用性進(jìn)行了應(yīng)用驗(yàn)證,其處理效果和準(zhǔn)確率均與手動(dòng)切割(CK)沒有顯著性差異,說明筆者所在課題組的方法是可靠有效的。

      FCMD法解決了以往研究中圖像采集條件苛刻(須黑箱拍照取樣)、須要高精度拍攝設(shè)備、背景分離不充分的問題,該方法允許研究人員在普通光照的開放環(huán)境下采集到較為精確的圖像,且對(duì)拍攝設(shè)備分辨率要求不高,中低端相機(jī)或手機(jī)攝像頭均能通過FCMD法處理獲取準(zhǔn)確的葉色參數(shù)。是一種高速、精準(zhǔn)、適用范圍廣的RGB圖像自動(dòng)化葉片切割去噪方法。

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