劉 娟,張 凱,范勝男,韓 洋,馮玉梅,李星巖,韓 冰,楊 燕
(內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物生物技術(shù)功能實驗室/內(nèi)蒙古自治區(qū)植物逆境生理與分子生物學(xué)重點實驗室,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018)
小麥作為全球主要的糧食作物之一[1],隨著全球人口數(shù)量不斷增加、氣候不斷惡化以及旱澇等自然災(zāi)害頻發(fā),使得小麥產(chǎn)量大幅度下降。因此,高產(chǎn)成為小麥育種的主要目標(biāo)之一。株高作為谷類作物的重要農(nóng)藝性狀,對作物產(chǎn)量潛力和穩(wěn)定性具有重要影響。研究表明,降低株高可提高植物的抗倒伏性[2-3]。
上世紀(jì)60年代,矮稈基因首次應(yīng)用到小麥育種中,引發(fā)了第一次“綠色革命”[4],在小麥育種實踐中利用的矮稈基因大體可分為三類:草叢型矮生基因(D)、單莖矮生基因(Us)[5-6]和降低株高的主效矮稈基因(Rht)。截止目前,已發(fā)現(xiàn)的小麥Rht矮稈基因共有25個,每個Rht基因?qū)π←溨旮弋a(chǎn)生的影響不同。其中,在小麥的矮化育種中,使用最廣泛的矮稈基因是來自于農(nóng)林10號的Rht-B1b(Rht1基因突變型)、Rht-D1b(Rht2基因突變型)和來自于日本赤小麥(Akakomugi)的Rht8[7-8]。Rht-B1b、Rht-D1b和Rht8為隱性基因,分別位于小麥4B、4D和2D染色體上。研究發(fā)現(xiàn),Rht-B1b和Rht-D1b基因單獨存在時,降稈效應(yīng)約24%,Rht-B1b和Rht-D1b同時存在時,會產(chǎn)生累加作用,降稈效應(yīng)近60%[9-10]。而Rht8降稈效應(yīng)為11%[11],相較于Rht-B1b和Rht-D1b,降稈能力較弱[12]。
分子標(biāo)記的應(yīng)用,使得更多的基因被準(zhǔn)確定位,Ellis等[13]設(shè)計的STS分子標(biāo)記可以準(zhǔn)確地鑒定出Rht-B1b和Rht-D1b基因。本研究利用Ellis等[13]設(shè)計的STS分子標(biāo)記引物對321份中國小麥材料Rht-B1b和Rht-D1b基因的分布情況進(jìn)行檢測,此外,對91份春小麥育種材料(具有株高表型數(shù)據(jù))中Rht-B1b、Rht-D1b以及Rht-B1b+Rht-D1b的分布及各單倍型對小麥株高的影響進(jìn)行分析,以期篩選出優(yōu)良的矮稈基因資源,為合理利用小麥資源提供參考依據(jù)。
供試材料包括321份小麥材料,其中,中國冬麥區(qū)白粒小麥品種84份,中國小麥歷史品種106份,春小麥育種材料131份,均由本實驗室收集和保存。并選取91份春小麥育種材料(具有株高表型數(shù)據(jù))進(jìn)行春小麥自然群體的株高鑒定。
1.2.1 小麥基因組DNA提取
利用CTAB法[14]提取321份小麥幼嫩葉片的基因組DNA,利用紫外分光光度計檢測DNA濃度,并將終濃度調(diào)至50 ng·μL-1,存于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 矮稈基因的分子標(biāo)記檢測
根據(jù)Ellis等[13]發(fā)表的序列設(shè)計引物,引物對BF/WR1用于擴增Rht-B1a基因(Rht1基因野生型),引物對BF/MR1用于擴增Rht-B1b基因(Rht1基因突變型);引物對DF2/WR2用于擴增Rht-D1a(Rht2基因野生型),引物對DF1/MR2用于擴增Rht-D1b(Rht2基因突變型),分別以小偃 6 號(含有Rht-B1b基因)[15]和新麥18(含有Rht-D1b基因)[16]為陽性對照,驗證PCR反應(yīng)和電泳結(jié)果的準(zhǔn)確性。上述引物均由北京六合華大基因科技有限公司合成,具體序列信息見表1。
PCR反應(yīng)體系為15 μL,包括模板DNA 1 μL,2×EasyTaq PCR SuperMix 6.2 μL,引物(濃度為0.25 nmol·μL-1)各0.15 μL,滅菌雙蒸水補充至15 μL。PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性 5 min,94 ℃變性30 s,退火溫度見表1,時間為 30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。擴增產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測,用Gold View核酸染料染色,緩沖體系為1×TAE溶液,100 V電壓下電泳20 min,在凝膠成像儀下觀察并照相。
表1 擴增矮稈基因所用的特異引物Table 1 Specific primers for amplification of dwarfing genes
1.2.3 91份春小麥育種材料株高的測定
2015和2016年分別將91份春小麥育種材料播種于內(nèi)蒙古呼和浩特市,采用隨機區(qū)組設(shè)計,行長2 m,株距15 cm,行距20 cm,設(shè)置2個重復(fù),在相同外界條件下進(jìn)行培養(yǎng),小麥進(jìn)入成熟期后,每一株系隨機選取10個單株進(jìn)行株高測量,統(tǒng)計每份材料兩年的平均株高數(shù)據(jù),求均值。
利用兩對引物BF/MR1和BF/WR1對供試材料Rht-B1基因位點進(jìn)行PCR檢測,結(jié)果(圖1,表2~4)顯示,在321份材料中,中國春、河套3號等66份材料含有矮稈基因Rht-B1a,占總數(shù)的20.1%;82170-1、臨優(yōu)一號等193份小麥品種含有矮稈基因Rht-B1b,占總數(shù)的 60.1%;巴豐5號、蘭天25號等62份材料不含所檢測矮稈基因,占總數(shù)的19.3%。
在84份中國冬麥區(qū)白粒小麥品種中,含有Rht-B1a、Rht-B1b以及不含所檢測矮稈基因的材料分別有30、29和25份,占比分別為35.7%、34.5%和29.8%。在106份歷史小麥品種中,含有Rht-B1a、Rht-B1b以及不含所檢測矮稈基因材料分別有8、77和21份,占比分別為7.6%、72.6%和19.8%。在131份春小麥育種材料中,含有Rht-B1a、Rht-B1b以及不含所檢測矮稈基因的材料分別有28、87和16份,占比分別為 21.4%、66.4%和12.2%。
對供試小麥品種Rht-D1基因位點進(jìn)行PCR檢測,結(jié)果(圖2,表2~4)顯示,321份材料中,永2352、臨農(nóng)14等73份小麥品種含有矮稈基因Rht-D1a,占總數(shù)的22.7%;臨優(yōu)一號、格蘭尼等135份小麥品種矮稈基因Rht-D1b,占總數(shù)的42.1%;沈太1號、陜農(nóng)757等113份小麥品種均不含所檢測矮稈基因,占總數(shù)的35.2%。
表2 84份中國冬麥區(qū)白粒小麥品種矮稈基因的檢測Table 2 Detection result of dwarfing genes in 84 wheat cultivars in China winter wheat areas
+代表有該材料含有所檢測的矮稈基因;-代表該材料不含所檢測的矮稈基因。表3~4同。
+ means containing the dwarfing genes detected;-means not containing dwarfing genes detected.The same in tables 3-4.
表3 106份中國歷史小麥品種矮稈基因的檢測結(jié)果Table 3 Detection result of dwarfing genes in 106 historical wheat cultivars
表4 131份春小麥材料矮稈基因的檢測結(jié)果Table 4 Detection result of dwarfing genes in 131 spring wheat breeding materials
(續(xù)表4 Continued table 4)
在84份中國冬麥區(qū)白粒小麥品種中,含有Rht-D1a、Rht-D1b以及不含所檢測矮稈基因的材料分別有14、41和29份,占比分別為16.7%、48.8%和34.5%。在106份歷史小麥品種中,含有Rht-D1a、Rht-D1b以及不含Rht-D1a和Rht-D1b矮稈基因的材料分別有40、21和45份,占比分別為37.7%、19.8%和42.5%。在131份春小麥育種材料中,含有Rht-D1a、Rht-D1b以及不含所檢測矮稈基因的材料分別有19、73和39份,占比分別為14.5%、55.7%和29.8%。
選取91份春小麥育種材料,對其株高及其相關(guān)基因進(jìn)行分析,結(jié)果(表5)發(fā)現(xiàn),含有Rht-B1b、Rht-D1b、Rht-B1b+Rht-D1b以及不含所檢測矮稈基因小麥材料的平均株高分別為 71.95、67.84、67.19和78.29 cm。多重比較結(jié)果(表5)表明,同時含有Rht-B1b和Rht-D1b矮稈基因小麥材料的平均株高最低,但與單獨含有Rht-D1b矮稈基因小麥材料的平均株高無顯著差異,而與單獨含有Rht-B1b矮稈基因和不含所檢測矮稈基因小麥材料的平均株高差異顯著,矮稈基因的分布及株高數(shù)據(jù)詳見表6。
表5 不同矮稈基因?qū)?1份春小麥育種材料株高的影響Table 5 Effect of different dwarfing genes on plant height of 91 Spring wheat breeding materials
表6 91份春小麥育種材料 Rht-B1b和 Rht-D1b的檢測結(jié)果及株高Table 6 Plant height and detection result of Rht-B1b and Rht-D1b in 91 Spring wheat breeding materials
(續(xù)表6 Continued table 6)
(續(xù)表6 Continued table 6)
本試驗利用Ellis等[13]發(fā)表的4對特異性分子標(biāo)記,其準(zhǔn)確性已經(jīng)過楊松杰等[15]、慕美財?shù)萚17]和唐 娜等[18]的驗證,該標(biāo)記多態(tài)性強且目的基因條帶清晰,可應(yīng)用于小麥分子標(biāo)記輔助育種試驗。小麥矮稈基因Rht-B1b和Rht-D1b為隱性基因,不宜于早代篩選, 但若利用分子標(biāo)記輔助選擇可提前獲得含有矮稈基因的小麥個體,加快小麥矮化育種進(jìn)程。本研究檢測的321份材料中,Rht-B1b矮稈基因的分布頻率高于Rht-D1b矮稈基因,這與梁 丹等[19]對263份CIMMYT材料的矮稈基因分子檢測結(jié)果一致。
本試驗對91份春小麥育種材料的株高進(jìn)行相關(guān)分析,發(fā)現(xiàn)含有Rht-B1b、Rht-D1b、Rht-B1b+Rht-D1b以及不含所檢測矮稈基因小麥材料的平均株高分別為71.95、67.84、67.19和 78.29 cm,其中,單獨含有Rht-B1b、Rht-D1b矮稈基因小麥材料的平均株高與Miralles等[9]和Brner等[7]的研究結(jié)果基本一致;但在本研究中,雖然同時含有Rht-B1b和Rht-D1b矮稈基因小麥材料的平均株高最低,但可能由于本研究試驗材料品種數(shù)量的局限性,Rht-B1b和Rht-D1b矮稈基因同時存在時,降稈效應(yīng)沒有達(dá)到60%,與前人[9-10]研究結(jié)果不一致,所以,后期還需要加大樣本量來驗證這一結(jié)果。
多重比較分析發(fā)現(xiàn),同時含有Rht-B1b和Rht-D1b矮稈基因小麥材料的平均株高最低,這些小麥材料共有26份,分別為07-7165、青春556、05cm178、05cm220、07-5866、08冬中788、08冬中3008、交原356、05-1173、格蘭尼、08冬中1146、05-1411、07-6228、08冬中5378、蘭雜7002、08冬中1807、輪選、臨優(yōu)一號、08-1312 、08冬中6741、07-6239、張掖1號、08-1826、08-3348、08-1699、08冬中2455。以上材料可在降低株高的抗倒伏育種中作為親本使用。