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      2型糖尿病的代謝組學(xué)研究進展

      2021-12-04 22:12:22鄭曉玲綜述丁大法娜審校
      關(guān)鍵詞:丙酮酸磷脂代謝物

      鄭曉玲綜述,丁大法,游 娜審校

      0 引 言

      2型糖尿病(type 2 diabetic mellitus,T2DM) 是最常見的慢性代謝性疾病。隨著我國人民生活水平的不斷提高,T2DM的發(fā)病率逐年增加。國際糖尿病聯(lián)盟(IDF)發(fā)布的第九版《糖尿病圖集》顯示,2019年全球糖尿病患病率為9.3%,約合4.63億人,預(yù)計到2045年患病人數(shù)將上升至7億[1]。代謝組學(xué)技術(shù)近年來常用于研究糖尿病發(fā)作前后的代謝物和代謝途徑的變化,使人們有可能進一步了解T2DM的發(fā)病機制,并在疾病的早期預(yù)測,早期診斷和治療中發(fā)揮重大作用。本文就近年來T2DM的代謝組學(xué)研究作一綜述。

      1 代謝組學(xué)概述

      1.1 代謝組學(xué)的概念代謝組學(xué)是一門新興的學(xué)科,隨著基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展而迅速發(fā)展,在給定的時間和條件下,發(fā)現(xiàn)生物體系(細胞、組織、體液或有機體)受到外部刺激(如基因變異或環(huán)境變化)后,產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物(相對分子質(zhì)量小于1000的小分子)的變化,來進行定性和定量分析的一門科學(xué),該生物體系中的全套代謝物的集合稱為代謝組[2]。代謝產(chǎn)物是生物過程的最終下游產(chǎn)物,因此,代謝產(chǎn)物的形式隨基因效應(yīng),基因-基因相互作用和基因-環(huán)境相互作用而變化。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)具有快速準(zhǔn)確,分辨率高,靈敏度高和所需樣品量較少的特點。因此,代謝組學(xué)對發(fā)現(xiàn)細胞,組織和體液等的病理生理變化非常有幫助,是發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)生物標(biāo)志物的有效方法[3]。

      1.2代謝組學(xué)的研究方法目前常用的代謝組學(xué)檢測技術(shù)主要有核磁共振(nuclear magnetic resonance spectroscopy,NMR)、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)或液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)技術(shù)。NMR幾乎不需要樣品預(yù)處理,檢測速度快,不破壞樣品,但其也具有靈敏度低和分辨率差等缺點,可能會導(dǎo)致信號重疊,低豐度代謝物被高豐度代謝物所掩蓋。GC-MS具有較高的分辨率和檢測靈敏度,缺點是樣品前處理工作量大且難以進行新的化合物鑒定[4]。LC-MS具有更高的靈敏度和較廣的檢測范圍,可用于分析相對分子質(zhì)量較高且熱穩(wěn)定性較差的化合物。因此,其更適合用于樣品中復(fù)雜代謝物的檢測。借助以上這些技術(shù),研究人員既可采用針對特定代謝物的靶向方法,也可采用非靶向方法來檢測盡可能多的代謝物類別,包括代謝數(shù)據(jù)庫中標(biāo)注的未知代謝物[5]。

      2 T2DM與相關(guān)代謝組學(xué)產(chǎn)物

      T2DM可引起體內(nèi)許多物質(zhì)的代謝異常,如碳水化合物,脂質(zhì),氨基酸等。通過代謝組學(xué)技術(shù)檢測這些代謝物的異常情況,發(fā)現(xiàn)可預(yù)測糖尿病發(fā)生和發(fā)展的早期生物標(biāo)志物,這對于糖尿病的早期預(yù)防和早期治療至關(guān)重要。近年來,越來越多的學(xué)者研究了T2DM的代謝產(chǎn)物,并根據(jù)代謝產(chǎn)物的差異確定可能的生物標(biāo)志物及其代謝途徑,為有效預(yù)防和治療T2DM提供了重要的理論依據(jù)。

      2.1與氨基酸有關(guān)的生物標(biāo)志物越來越多的研究證實,支鏈氨基酸(branched chain amino acids,BCAA)是T2DM的潛在生物標(biāo)志物,其中包括纈氨酸,亮氨酸和異亮氨酸。Newgard等[6]的早期研究發(fā)現(xiàn)BCAA分解代謝增加有助于肥胖相關(guān)胰島素抵抗的發(fā)展。在新加坡進行的一項研究中,胰島素抵抗與血漿BCAA、芳香族氨基酸的含量較高以及谷氨酸與谷氨酰胺的比例升高有關(guān)[7]。其中,肥胖個體的BCAA,芳香族氨基酸和谷氨酸/谷氨酰胺比率與糖尿病前期呈正相關(guān)。Guasch-Ferré等[8]對多達8000人的代謝產(chǎn)物(其中包括1940名T2DM患者)進行Meta分析,也發(fā)現(xiàn)BCAA的增加導(dǎo)致T2DM的相對風(fēng)險增加。在肥胖和胰島素抵抗的動物模型和人類中,白色脂肪組織(white adipose tissue,WAT)中BCAA分解代謝酶的表達水平降低,WAT炎癥和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的增加是WAT中BCAA分解代謝的減少可能原因[9]。腸道菌群中產(chǎn)BCAA細菌的增加和下丘腦胰島素信號傳導(dǎo)受損導(dǎo)致了肝BCAA分解代謝的減少,也導(dǎo)致了肥胖和胰島素抵抗中BCAA的升高[10]。多項研究表明,BCAA及其代謝產(chǎn)物支鏈酮酸會活化mTOR信號傳導(dǎo),誘導(dǎo)氧化應(yīng)激,引起線粒體功能障礙,更重要的是與胰島素抵抗和葡萄糖的新陳代謝有關(guān),這些均為糖尿病發(fā)病機制中的關(guān)鍵因素[11-12]。

      芳香族氨基酸中的酪氨酸和苯丙氨酸也被發(fā)現(xiàn)有增加T2DM發(fā)生風(fēng)險的作用,而甘氨酸和谷氨酰胺則與T2DM的發(fā)生呈負相關(guān)[8]。Merino等[13]的一項大型前瞻性研究對1150名空腹血糖正常的受試者進行了20年的隨訪,其中有95人逐發(fā)展為T2DM。研究對受試者的血漿代謝物進行LC-MS / MS分析,發(fā)現(xiàn)氮代謝途徑中改變的部分代謝物是T2DM早期發(fā)病的潛在效應(yīng)者,甘氨酸水平的降低和苯丙氨酸水平的升高與T2DM的發(fā)生密切相關(guān)。甘氨酸中間代謝產(chǎn)物β-羥基丙酮酸也被認為是糖尿病的預(yù)測因子,β-羥基丙酮酸改變了肌間神經(jīng)元的興奮性并減少了小鼠的胰島素量。存在葡萄糖耐量受損的受試者中β-羥基丙酮酸與絲氨酸的比例較正常人大大降低[14]。

      Wang等[15]對兩千多名患者進行了長達12年的研究,發(fā)現(xiàn)賴氨酸降解產(chǎn)物2-氨基己二酸(2-aminoadipate,2-AAA)是糖尿病的重要預(yù)測指標(biāo),血漿2-AAA濃度處于上四分位數(shù)的人群在隨訪期內(nèi)患糖尿病的幾率比處于下四分位數(shù)的人群高4倍。2-AAA與脂肪生成和胰島素抵抗有關(guān)。過量的2-AAA水平導(dǎo)致胰島素敏感細胞(肝,骨骼肌和脂肪細胞)中的胰島素信號傳導(dǎo)受損,并導(dǎo)致糖異生異常[16]。

      2.2與脂質(zhì)代謝相關(guān)的生物標(biāo)記物T2DM患者常伴有血脂異常。Lu等[17]對中國人群的血清進行LC-MS及GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),T2DM患者的部分游離脂肪酸(棕櫚酸,硬脂酸,油酸和亞油酸)較健康對照者顯著增高。T2DM患者絕對或相對胰島素缺乏會導(dǎo)致葡萄糖利用率低下,然后脂肪酸成為β-氧化的主要能源。該研究同時也發(fā)現(xiàn)T2DM患者的部分酮體(丙酮,乙酰乙酸)的含量顯著增加[17]。Zhao等[18]對741名中國T2DM患者的血漿進行了MS代謝組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)血漿?;鈮A代謝產(chǎn)物的水平升高與T2DM中的心血管疾病風(fēng)險相關(guān)。

      磷脂是所有細胞脂質(zhì)雙層的關(guān)鍵成分。Wang-Sattler等[19]發(fā)現(xiàn)溶血性磷脂酰膽堿和乙酰肉堿可以作為糖尿病前期的生物標(biāo)志物。Razquin等[20]研究發(fā)現(xiàn)溶血磷脂酰膽堿和溶血磷脂酰乙醇胺,鞘磷脂和膽固醇酯與T2D風(fēng)險呈負相關(guān)。三?;视停;视秃土字R掖及放cT2D風(fēng)險呈正相關(guān)。一項基于1H NMR的研究中也發(fā)現(xiàn)溶血磷脂酰膽堿和磷脂酰膽堿的代謝產(chǎn)物與T2DM呈負相關(guān)[21]。Lai等[22]對有妊娠期糖尿病病史的婦女進行了一項前瞻性研究,發(fā)現(xiàn)產(chǎn)后最終患有T2DM的女性早期即出現(xiàn)了血漿二?;视土字暮吭黾右约扒柿字王;榛视土字臏p少。

      2.3與糖代謝有關(guān)的生物標(biāo)記物葡萄糖升高是糖尿病的代謝特征,這歸因于非碳水化合物來源的葡萄糖產(chǎn)量增加(糖異生)和糖原分解。在糖酵解開始時,葡萄糖在細胞中轉(zhuǎn)化為丙酮酸。Lu等[23]發(fā)現(xiàn)T2DM患者的血清丙酮酸濃度高于正常對照組,這表明T2DM患者的糖酵解增加。胰島素抑制肝葡萄糖生成的主要機制是通過抑制WAT中的脂解作用而減少肝乙?;鵆oA,減少丙酮酸羧化酶活性的變構(gòu)調(diào)節(jié),從而導(dǎo)致丙酮酸減少。而炎癥和巨噬細胞誘導(dǎo)的WAT脂解則反過來導(dǎo)致T2DM,體現(xiàn)為丙酮酸升高[24]。乳酸脫氫酶在低氧條件下催化丙酮酸向乳酸的轉(zhuǎn)化。在有氧條件下,丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶A,然后進入三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle,TCA cycle),生成ATP。TCA循環(huán)也稱為檸檬酸循環(huán)。在近期一項基于1H NMR的研究中發(fā)現(xiàn)T2DM患者的丙酮酸、乳酸、檸檬酸水平升高,同時T2DM患者血清中琥珀酸,肌酸和肌酸酐等三羧酸循環(huán)的中間產(chǎn)物水平也較健康對照組升高[21]。但是在T2DM的患者的尿液中,三種TCA循環(huán)中間體,琥珀酸,富馬酸和蘋果酸的水平被顯著下調(diào)[25]。然而,Liu等[26]的一項針對T2DM的慢性腎病患者的實驗中顯示,尿檸檬酸水平較腎功能正常的T2DM患者低,但乳酸,富馬酸和蘋果酸水平明顯較高。

      1,5-脫水葡萄糖醇(1,5-Anhydroglucitol,1,5-AG)是體內(nèi)主要的多元醇,結(jié)構(gòu)與葡萄糖相似,能夠反映出T2DM患者短期的葡萄糖狀態(tài),餐后高血糖和血糖變異性[27]。Tavares等[28]的研究發(fā)現(xiàn)1,5-AG的水平下降可預(yù)測大量蛋白尿性糖尿病腎病的慢性腎病進展。Carina等[29]對健康人群、處于糖尿病前期人群和糖尿病患者行OGTT試驗,發(fā)現(xiàn)糖尿病前期人群及糖尿病患者血漿中麥芽糖,海藻糖,果糖,甘露糖水平較正常人群上升,而1,5-AG和景天庚酮糖下降。Suhre等[30]的病例對照研究顯示,T2DM患者的血漿1,5-AG水平較健康個體低約37.8%,而葡萄糖,脫氧己糖,甘露糖和二己糖水平升高。Drogan等[31]的前瞻性研究發(fā)現(xiàn)己糖與T2DM呈正相關(guān),而較高濃度的糖醇和脫氧己糖則分別降低了約60%和70%的糖尿病發(fā)病幾率。

      3 代謝組學(xué)與多組學(xué)的聯(lián)合

      越來越多的證據(jù)表明,腸道菌群在T2DM的發(fā)生發(fā)展中具有重要意義?;蚪M學(xué)技術(shù)如宏基因組測序和16S rRNA高通量測序,是目前較為常用的微生物組測序技術(shù),可明確腸道菌群的多樣性、組成、結(jié)構(gòu)分布、功能等。然而基因的存在并不一定意味著該基因已表達。因此,分別使用宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)或宏蛋白質(zhì)組學(xué)直接測量轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物或蛋白質(zhì),已成為宏基因組學(xué)的重要補充方法。目前,整合宏基因組學(xué)、宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)、宏蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等多組學(xué)數(shù)據(jù),對腸道菌群進行綜合分析至關(guān)重要[32]。

      Pedersen等[10]進行的研究整合了受試者胰島素敏感性,腸道微生物組和空腹血清代謝組的數(shù)據(jù)。研究人員發(fā)現(xiàn)胰島素抵抗個體的血清代謝組學(xué)特征是BCAA水平升高,這與腸道微生物組有關(guān),該腸道微生物組具有豐富的BCAA生物合成潛力,并且缺乏編碼BCCA向細菌內(nèi)轉(zhuǎn)運所需轉(zhuǎn)運蛋白的基因。而普氏菌(P.copri)和普通擬桿菌(B.vulgatus)則被鑒定為驅(qū)動BCAA生物合成與胰島素抵抗之間聯(lián)系的主要物種。Zhou等[33]從106名受試者中獲取了約四年的樣本,并對其轉(zhuǎn)錄組,代謝組,細胞因子和蛋白質(zhì)組以及微生物組的變化進行了研究,將獲得的大量數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),胰島素抵抗和胰島素敏感個體之間腸道微生物、宿主免疫力和代謝模式不同。如在胰島素敏感的受試者中,Barnesiella屬與IL-1β正相關(guān);在胰島素抵抗的受試者中,Butyricimonas屬與四種脂質(zhì)呈負相關(guān),也與糖代謝失調(diào)有關(guān)。

      由于所收集數(shù)據(jù)的復(fù)雜性和多樣性的增加,集成多組數(shù)據(jù)不易,需要使用新興的統(tǒng)計方法。盡管具有很大的挑戰(zhàn)性,但多組學(xué)數(shù)據(jù)的集成為宿主-微生物組相互作用的研究提供了可能。

      4 結(jié)語與展望

      近年來,代謝組學(xué)在疾病診治、器官移植、評價藥效等方面已有部分應(yīng)用[34]。隨著代謝組學(xué)的應(yīng)用和快速發(fā)展,對T2DM發(fā)病機理的認識已經(jīng)更加系統(tǒng)化和清晰化。代謝組學(xué)通過檢測體內(nèi)大量內(nèi)源性代謝物的變化來發(fā)現(xiàn)T2DM及其并發(fā)癥病理生理過程的生物標(biāo)志物。未來如果將這些生物標(biāo)志物應(yīng)用到臨床診療中,不僅使T2DM的預(yù)測、早期診斷、治療和預(yù)后判斷成為可能,還能預(yù)測和監(jiān)測藥物治療效果,成為精準(zhǔn)化藥物治療的有力工具[35]。同時代謝組學(xué)與多組學(xué)數(shù)據(jù)的集成也幫助我們?nèi)媪私饽c道環(huán)境,宿主代謝和T2DM發(fā)病機制之間的復(fù)雜相互關(guān)系,找到新的診斷、治療方法,為實現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)鋪平道路。

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