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      纖維素降解菌的篩選和培養(yǎng)條件的優(yōu)化

      2022-01-04 02:52:04陳詩瑤勞艷婷
      武夷科學 2021年2期
      關鍵詞:吸光碳源纖維素

      陳詩瑤, 勞艷婷, 謝 苗

      (1.福建農林大學生命科學學院, 福建福州350002;2.閩臺作物有害生物生態(tài)防控國家重點實驗室, 福建福州350002)

      纖維素是植物細胞壁的重要組成成分,在大自然中分布很廣,在食品、醫(yī)藥、建筑、廢水處理以及造紙等行業(yè)中有著非常廣泛的應用(羅成成等,2015)。 但作為一種重要的資源和能源,廣泛存在的纖維素并沒有得到有效地處理或利用,大部分都被直接焚燒或丟棄,這樣的處理方式給環(huán)境和生態(tài)平衡帶來了極大的破壞(張瀚罡,2019)。 因此,如何高效、無害地降解以及利用環(huán)境中的纖維素成為目前急需解決的問題。

      目前對纖維素的主要處理方法有物理法、化學法和生物學方法,但物理法和化學法工藝復雜,成本較高且有一定的環(huán)境污染,所以在實際應用中有所限制。 自然界中存在眾多高產纖維素酶的微生物,這些微生物能將自身產生的纖維素酶分泌至胞外且易于純化,且對纖維素降解有較強的專一性(王盼星等,2018)。 此外,纖維素降解菌對環(huán)境的危害小,能實現對資源的循環(huán)利用(佟碩秋等,2020;文少白等,2010)。 因此,利用微生物降解是當前降解纖維素最有效、最經濟、最環(huán)保、也是最熱門的方法(喬健敏等,2019)。 自20 世紀以來,國內外已經報道了數千個產纖維素酶的菌株(賈丙志等,2008),如小刺青霉菌(簡立燕等,2017)、多粘芽孢桿菌(Gorskaet al,2001)、泡盛曲霉(邢力等,2019)等。 盡管目前在土壤(吳越等,2018)、植物(顧挺等,2011)、動物(李君風等,2017)和糞便(張智等,2017)等內都有獲得纖維素降解菌的相關報道,同時纖維素的生物學處理方法也得到了廣泛關注,但由于其產酶數量及產酶活力都沒有達到工業(yè)應用的要求、水解液中的產物會抑制微生物的發(fā)酵結果、部分菌株的耐受能力較低等原因,目前還難以運用到實際生產中(Daret al,2018;馬澤林等,2017)。 因此,人們仍需尋找更穩(wěn)定、更高效的纖維素降解酶來源。

      廚余垃圾內有機物含量高、營養(yǎng)元素豐富,容易滋養(yǎng)病原菌等有害微生物,因此廚余垃圾的不當處理,會對環(huán)境造成嚴重污染(徐銳,2014)。 目前,對廚余垃圾的主要處理方法有焚燒、填埋、粉碎直排等非生物處理方法,好氧堆肥是主要的生物處理方法。 大部分的非生物處理方法經濟效益低,容易造成資源浪費且嚴重破壞生態(tài)環(huán)境(孫孟喜,2017)。 而采用生物處理法是較為簡單、易行、環(huán)保的方法(吳昊等,2011)。 研究表明,廚余垃圾內纖維素含量較高(鄭旴等,2016),因此可能富含纖維素降解菌。 本研究通過剛果紅水解圈直徑初篩和測定酶活力等指標復篩,從經半年發(fā)酵的廚余垃圾中篩選出高效的纖維素降解菌,并使用響應面法優(yōu)化纖維素降解菌的培養(yǎng)條件,分析了不同碳源濃度、培養(yǎng)時間和溫度對菌株產酶活力的影響,以期得出菌株的最佳培養(yǎng)環(huán)境。

      1 材料與方法

      1.1 試驗材料

      1.1.1 樣品 福州某公司提供的已發(fā)酵6 個月的廚余垃圾。

      1.1.2 培養(yǎng)基 羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)固體培養(yǎng)基:0.5 g KCl,0.5 g MgSO4,1.0 g K2HPO4,3.0 g NaNO3,5.0 g CMC-Na 和 20.0 g 瓊脂,溶于 1 000 mL 蒸餾水;CMC-Na 液體培養(yǎng)基:0.5 g MgSO4,3.0 g NaNO3,1.0 g K2HPO4,0.5 g KCl 和 5.0 g CMC-Na,溶于 1 000 mL 蒸餾水;LB 液體培養(yǎng)基:5.0 g 酵母提取物,5.0 g NaCl 和 10.0 g 蛋白胨,溶于 1 000 mL 蒸餾水,pH調至7.4;以上培養(yǎng)基均121 ℃高壓滅菌20 min。

      1.2 試驗方法

      1.2.1 纖維素降解菌的培養(yǎng)及分離純化 取10.0 g 樣品加入90 mL 無菌水中,振蕩30 min。運用梯度稀釋法制備稀釋度為10-1~10-5的樣品稀釋液。 在CMC-Na 固體培養(yǎng)基中分別進行平板涂布,28 ℃培養(yǎng)72 h。 使用三區(qū)劃線法從稀釋度為10-3~10-5且優(yōu)勢菌落分布均勻的平板中分離獲取形態(tài)大小不一的單菌株,并接種于LB 液體培養(yǎng)基制成菌液并保存。

      1.2.2 纖維素降解菌的初篩 從上述菌液中各取2.5 μL 分別點種于CMC-Na 固體培養(yǎng)基中心,28 ℃培養(yǎng)72 h,重復3 次。 培養(yǎng)完畢后加入適量1 g·L-1剛果紅,均勻覆蓋培養(yǎng)基表面染色30 min 后,用1 mol·L-1NaCl 溶液浸泡30 min 洗滌。 分別測量、計算每個纖維素降解菌周圍的透明水解圈的平均直徑,經比較篩選出降解能力較強的菌株。

      1.2.3 纖維素降解菌的復篩 將初篩得到的菌株分別接種于50 mL 0.5%的CMC-Na 液體培養(yǎng)基中,28 ℃振蕩培養(yǎng)72 h。 培養(yǎng)完成后進行CMC-Na 酶活力和濾紙酶活力測定,復篩出酶活力更高的菌株。

      1.2.4 纖維素酶活力測定 采用二硝基水楊酸法(DNS 法),并在馮?,|等(2013)的方法上加以改進,測定還原糖含量。 首先取干燥的葡萄糖配制1 mg·mL-1葡萄糖溶液,再取7 只試管,分別按表1 加入各試劑,沸水浴5 min,立刻冷卻至室溫,并在540 nm 波長處測定吸光值(OD值),并以葡萄糖含量為橫坐標,吸光值為縱坐標繪制葡萄糖標準曲線。

      CMC-Na 酶活力測定,在段杰(2015)方法的基礎上略有改進,各菌株取10 mL 菌液,4 ℃,4 000 r·min-1離心15 min,取2 mL 上清液于試管中,并加入2 mL 1% CMC-Na 溶液進行充分混合,60 ℃水浴30 min。 加3 mL DNS 試劑,沸水浴5 min,迅速冷卻至室溫,并定容至10 mL。 在540 nm 處測定各菌株吸光值,按葡萄糖標準曲線計算每個菌株的葡萄糖含量。 其中,對照組以2 mL 蒸餾水代替上清液。

      濾紙酶活力測定,在段杰(2015)方法的基礎上略有改進:各菌株取10 mL 菌液,4 ℃,4 000 r·min-1離心15 min,取2 mL 上清液加入50 mg 干燥濾紙條于試管中振蕩充分混合,60 ℃水浴30 min。 取出濾紙條,加入3 mL DNS 試劑,沸水浴5 min,迅速冷卻至室溫,并將體積定容至10 mL。 在540 nm 處測定各菌株吸光值,按葡萄糖標準曲線計算每個菌株的葡萄糖含量。 其中,以2 mL 蒸餾水代替上清液作對照組。 上述條件下,定義1 mL 酶液在60 ℃條件下,每分鐘水解纖維素產生的葡萄糖的μg 數為1 個酶活單位,以U·mL-1表示。

      式中:A表示計算得出的葡萄糖含量(mg);K表示稀釋倍數;V表示粗酶液體積(mL);T表示反應時間(min)。

      1.3 培養(yǎng)條件的優(yōu)化

      1.3.1 不同碳源濃度對菌株產酶的影響 分別接種1 mL 菌液在CMC-Na 濃度為0.5%,0.7%,0.9%,1.1%,1.3%,1.5%,1.7%,1.9%和 2.1%的 50 mLCMC-Na 液體培養(yǎng)基中,在30 ℃,180 r·min-1條件下培養(yǎng)72 h 后,在540 nm 波長下測定菌液吸光值,計算其CMC-Na 酶活力。

      1.3.2 不同培養(yǎng)時間對菌株產酶的影響 取1 mL 菌液加入50 mL 0.5%的CMC-Na 液體培養(yǎng)基中,30 ℃,180 r·min-1條件下培養(yǎng),每隔 6 h 在 540 nm 波長下測定菌液吸光值。 從第 48 h 開始記錄數據、繪制曲線,并計算其CMC-Na 酶活力。

      1.3.3 不同培養(yǎng)溫度對菌株產酶的影響 取1 mL 菌液加入50 mL 0.5%的CMC-Na 液體培養(yǎng)基中,分別在 20、25、30、35、40 和 45 ℃,180 r·min-1條件下培養(yǎng) 72 h,培養(yǎng)結束后在 540 nm 波長下測定吸光值、繪制曲線,并計算其CMC-Na 酶活力。

      1.3.4 響應面試驗優(yōu)化培養(yǎng)條件 在以上3個單因素試驗的基礎上,采用Design-Expert 8.0.6 軟件中Box-Behnken 試驗設計,選擇碳源濃度(A)、培養(yǎng)時間(B)、培養(yǎng)溫度(C)對菌株的培養(yǎng)條件進行優(yōu)化,以菌株經培養(yǎng)后用DNS 法所測得的540 nm 吸光值作為響應值。 試驗因素水平見表2。

      表2 響應面分析因素水平表Table 2 Independent variables and levels of the response surface analysis experiment

      1.4 優(yōu)化條件的檢驗

      根據1.3.4 分析所得最佳培養(yǎng)條件,設計對應、可行的條件數值進行重復試驗,比較菌株經培養(yǎng)后的540 nm 處吸光值以及回歸方程模擬推測的最大吸光值,并計算其相對誤差,以檢驗優(yōu)化是否成功。

      2 結果與分析

      2.1 纖維素降解菌的分離和篩選

      2.1.1 初篩結果 剛果紅染色后即形成以菌株為中心的透明水解圈。 菌株纖維素降解能力越大,分解纖維素越多,即透明水解圈直徑越大。 初篩后獲得3 個優(yōu)勢菌株為1、5、10 號,其水解圈平均直徑分別為10.50、16.50、13.33 mm。

      2.1.2 復篩結果 根據葡萄糖標準曲線,計算出1、5、10 號菌株產生的葡萄糖含量。 并通過公式(1)計算CMC-Na 酶活力和濾紙酶活力(表3)。

      表3 CMC-Na 酶活力及濾紙酶活力測定結果Table 3 The results of CMC-Na enzyme activity and filter paper enzyme activity test

      CMC-Na 酶活力與濾紙酶活力大小均為5 號>10 號>1 號。 因此,選擇 5 號菌株、10號菌株進行后續(xù)培養(yǎng)條件優(yōu)化的研究。

      2.2 纖維素降解菌培養(yǎng)條件的優(yōu)化

      2.2.1 不同碳源濃度對菌株酶活的影響 如圖1 所示,5 號菌和10 號菌在低濃度CMC-Na 培養(yǎng)基中,酶活力都隨著碳源濃度的上升而逐步上升。 當碳源濃度達到1.7%時,5 號菌和10 號菌的CMC-Na 酶活力都達到最高值,分別為212.625 和49.657 U·mL-1。 到達最高值后,兩菌株的酶活力都隨著碳源濃度的增加而快速下降。

      圖1 不同碳源濃度對菌株酶活的影響Figure 1 Effect of different carbon source concentrations on enzyme activity

      2.2.2 不同培養(yǎng)時間對菌株酶活的影響 如圖2 所示,在培養(yǎng)48 h 后,5 號菌的酶活力隨著培養(yǎng)時間的增加而平穩(wěn)上升,當培養(yǎng)時間達到 72 h 時,CMC-Na 酶活力達到最高值172.742 U·mL-1。 在培養(yǎng)時間達到54 h 前,10 號菌株的產酶能力很弱,酶活力都很低,這可能是因為10 號菌的繁殖能力相對較弱;54 h 后,隨著培養(yǎng)時間增加,菌株酶活力逐步升高,當培養(yǎng)時間為66 h 時,其CMC-Na 酶活力達到最高值48.996 U·mL-1。 到達最高值后,兩菌株的酶活力都隨著培養(yǎng)時間的進一步增加而呈緩慢下降趨勢。

      圖2 不同培養(yǎng)時間對菌株酶活的影響Figure 2 Effect of different culture times on enzyme activity

      2.2.3 不同培養(yǎng)溫度對菌株酶活的影響如圖3 所示,在低溫培養(yǎng)條件下,5 號菌株的酶活力隨著培養(yǎng)溫度的升高而穩(wěn)定增加。 當培養(yǎng)溫度達到 40 ℃時,菌株的CMC-Na 酶 活 性 達 到 最 高 值177.100 U·mL-1。 在低溫培養(yǎng)條件下,10號菌的活性逐漸增加,當溫度達到35 ℃時, 其 CMC-Na 酶 活 性 達 到 最 高 值47.940 U·mL-1。 到達最高值后,兩菌株的酶活力都隨著培養(yǎng)溫度的升高而持續(xù)下降。

      圖3 不同培養(yǎng)溫度對菌株酶活的影響Figure 3 Effect of different culture temperatures on enzyme activity

      2.2.4 響應面試驗優(yōu)化 根據以上3 個單因素試驗的試驗結果,以菌株在540 nm 處的吸光值為因變量,碳源濃度、培養(yǎng)時間、培養(yǎng)溫度為自變量,選用3 因素3 水平的Box-Behnken 進行試驗分析(表4、表5)。

      表4 5 號菌響應面試驗設計及結果Table 4 The results of response surface methodology for bacteria No.5

      表5 10 號菌響應面試驗設計及結果Table 5 Design and results of response surface methodology for bacteria No.10

      分別對碳源濃度(A)、培養(yǎng)時間(B)、培養(yǎng)溫度(C)3 個影響因素的試驗數據進行回歸擬合(表6、表7),得到兩個菌株經培養(yǎng)后540 nm 處吸光值的二次多項式回歸方程。

      表6 5 號菌回歸方程的顯著性檢驗Table 6 Significance analysis of the regression model of bacteria No.5

      表7 10 號菌回歸方程的顯著性檢驗Table 7 Significance analysis of the regression model of bacteria No.10

      5 號菌的回歸方程為:吸光值=2.380+0.110A+0.066B-0.072C-3.000×10-3AB+0.071AC+9.000×10-3BC-0.190A2-0.130B2-0.470C2。 10 號菌的回歸方程為:吸光值 = 0.180 +7.875×10-3A-8.000×10-3B+ 0.020C+ 5.250×10-3AB+0.014AC-5.750 × 10-3BC-0.020A2-7.050×10-3B2-0.072C2。

      在菌株吸光值回歸模型的顯著性考察中,當P<0.05 時,說明模型差異顯著,P<0.01 時,表示模型差異極顯著(張學彬等,2019)。 根據表6 可知,在5 號菌的回歸方程中,一次項A、B、C,二次項A2、B2、C2均達到極顯著水平;根據表7 可知,在10 號菌回歸方程中,一次項C,二次項A2、C2達到極顯著水平。 由此可得,兩個回歸模型擬合度都較好,預測值較為準確,可采用回歸方程計算值模擬試驗結果,進行預測和研究分析。

      根據P值的比較結果可以得出,3 個因素對5 號菌酶活力影響程度的順序為:碳源濃度>培養(yǎng)溫度>培養(yǎng)時間;10 號菌為:培養(yǎng)溫度>培養(yǎng)時間>碳源濃度。 其中兩種菌株的交互作用項中均為AC的P值最小,表示碳源濃度和培養(yǎng)溫度的交互作用對兩種菌株酶活力的影響最顯著。

      由響應面試驗法分析得出,5 號菌最佳培養(yǎng)條件為碳源濃度1.73%,培養(yǎng)時間69.96 h,培養(yǎng)溫度37.78 ℃,預測吸光值為2.407;10 號菌最佳培養(yǎng)條件為碳源濃度1.72%,培養(yǎng)時間63.41 h,培養(yǎng)溫度38.91 ℃,預測吸光值為0.186。

      2.2.5 響應面分析 根據所擬合的響應面的形狀,分析3 種因素對菌株酶活力的影響。 等高線的形狀呈橢圓形表示兩因素作用顯著,呈圓形則與之相反。 3D 交互圖曲面圖則根據形成的平面坡面陡峭度來判斷顯著性,坡面越陡峭,因素的交互作用顯著,否則與之相反(李佳橋等,2016)。

      由圖4~圖6 可知,5 號菌AB 交互作用的等高線近似圓形,交互曲線較為平滑,兩者的交互作用不顯著,而AC、BC 交互作用的等高線雖然都是橢圓,但AC 的交互曲線較為陡峭,因此,AC 兩元素間的交互作用最為顯著。 由圖7 ~ 圖 9 可知,10 號菌 AB、AC、BC 交互作用的等高線都為橢圓,但AC 的3D 交互圖曲面先上升后下降且最為陡峭,因此,AC 兩元素間的交互作用最為顯著。 綜上,碳源濃度(A)和培養(yǎng)溫度(C)的交互作用對5 號菌和10 號菌的酶活力影響最顯著,這與2.2.4 分析結果一致。

      圖4 5 號菌碳源濃度、培養(yǎng)時間交互作用對菌株酶活的影響Figure 4 The interaction effects of carbon source concentration and culture time on the enzyme activity of bacteria No.5

      圖5 5 號菌碳源濃度、培養(yǎng)溫度交互作用對菌株酶活的影響Figure 5 The interaction effects of carbon source concentration and culture temperature on the enzyme activity of bacteria No.5

      圖6 5 號菌培養(yǎng)時間、培養(yǎng)溫度交互作用對菌株酶活的影響Figure 6 The interaction effects of culture time and culture temperature on the enzyme activity of bacteria No.5

      圖7 10 號菌碳源濃度、培養(yǎng)時間交互作用對菌株酶活的影響Figure 7 The interaction effects of carbon source concentration and culture time on the enzyme activity of bacteria No.10

      圖9 10 號菌培養(yǎng)時間、培養(yǎng)溫度交互作用對菌株酶活的影響Figure 9 The interaction effects of culture time and culture temperature on the enzyme activity of bacteria No.10

      圖8 10 號菌碳源濃度、培養(yǎng)溫度交互作用對菌株酶活的影響Figure 8 The interaction effects of carbon source concentration and culture temperature on the enzyme activity of bacteria No.10

      2.3 優(yōu)化條件檢驗

      為檢驗響應面分析結果的準確性,根據試驗的操作性和可行性進行進一步的結果檢驗,設計5 號菌在CMC-Na 濃度為 1.73%,培養(yǎng)時間 70.0 h,培養(yǎng)溫度37.8 ℃的條件下進行培養(yǎng);10號菌在CMC-Na濃度為1.72%,培養(yǎng)時間為63.5 h,培養(yǎng)溫度39.0 ℃的條件下進行培養(yǎng)。 運用回歸方程模擬預測5 號菌在540 nm 處吸光值為2.407,10 號菌為0.186。 而在優(yōu)化條件下培養(yǎng)后,5 號菌實際測得的吸光值為2.389,10 號菌測得的吸光值為0.182(表8)。 由此可知,試驗觀測值與模型預測值較為接近,兩菌株的檢驗結果與預測值相對誤差均小于2.5%。 這表明模型預測性良好,所得經優(yōu)化的菌株最適培養(yǎng)條件穩(wěn)定合理,客觀可行。

      表8 優(yōu)化條件檢驗Table 8 The results of the optimum condition test

      3 結論與討論

      本研究以發(fā)酵半年的廚余垃圾為原材料,運用羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基分離純化,并使用剛果紅染色法、CMC-Na 酶活力以及濾紙酶活力檢測進行初篩和復篩,最終成功篩選獲得5 號菌和10 號菌兩株優(yōu)勢纖維素降解菌。

      單因素試驗表明,兩菌株的CMC-Na 酶活力都隨著碳源濃度的上升而上升,并在碳源濃度為1.7%時達到最高值,此后開始快速下降。 這可能是因為在碳源濃度過低時,菌株的營養(yǎng)不足,導致菌體生長緩慢或不良;在碳源濃度過高時,雖然菌株的能量、碳源充足,但會使菌體生長過于旺盛,導致發(fā)酵液粘度過大,氧氣供應不足,使得產酶量降低(張粲,2014)。 兩菌株的CMC-Na 酶活力也隨著培養(yǎng)時間的增加而上升,5 號菌培養(yǎng)72 h 時,酶活力達到最高值;10 號菌培養(yǎng)66 h 時,酶活力達到最高值。 此后,兩菌株的酶活力都隨著培養(yǎng)時間的進一步增加而緩慢下降。 這可能是因為菌株的產酶活力會隨著其進入對數生長期而逐漸升高,在進入穩(wěn)定期后,其產酶活力達到峰值。 此后,培養(yǎng)基中的營養(yǎng)物質不斷被消耗,菌株代謝產物也不斷積累,從而導致菌株生長緩慢甚至死亡,其產酶活力大小也呈現出下降趨勢(張悅等,2018)。 兩菌株的CMC-Na 酶活力同樣隨著培養(yǎng)溫度的升高而升高,5 號菌的培養(yǎng)溫度達到40 ℃時,酶活力達到最高值;10 號菌的培養(yǎng)溫度達到35 ℃時,酶活力達到最高值。 當溫度繼續(xù)升高,兩菌株的酶活力都開始下降。 這可能是因為過低或過高的培養(yǎng)溫度會降低菌株的活力,影響其繁殖效率,從而導致產酶能力下降,酶活力降低(馮?,|等,2013)。

      為了進一步優(yōu)化兩菌株的培養(yǎng)條件,根據單因素試驗的結果,又進行了響應面試驗優(yōu)化,所得模型預測性良好,所得到的菌株最適培養(yǎng)條件穩(wěn)定合理,客觀可行。 結果表明,兩種菌株的條件優(yōu)化結果與單因素試驗結果相比較,最適培養(yǎng)時間都縮短了,即菌株的培養(yǎng)條件經優(yōu)化后不僅能得到更高的酶活力,同時還提高了產酶效率。 崔秀秀等(2016)利用此方法優(yōu)化耐冷纖維素降解菌,使其CMCase 酶活較優(yōu)化前提高2.96 倍、楊培新等(2015)利用此方法優(yōu)化分離得到的1 株產纖維素酶真菌,使其發(fā)酵產纖維素酶活性提高了15.02%,也都證明了使用響應面法優(yōu)化菌種培養(yǎng)條件是可行、有效的。

      本研究從廚余垃圾中篩選出兩株優(yōu)勢纖維素降解菌,并通過響應面法優(yōu)化了兩菌株的培養(yǎng)條件,使菌株有了更高的產酶效率及酶活力,在降解纖維素應用方面有很好的潛力。

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