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      長鏈非編碼RNA HOTAIR對胰腺癌細胞增殖、遷移能力的影響

      2022-04-11 04:35:54成洪杰崔培林
      胃腸病學和肝病學雜志 2022年2期
      關(guān)鍵詞:胰腺癌陰性細胞

      成洪杰,張 曉,崔培林

      1.首都醫(yī)科大學大興教學醫(yī)院消化內(nèi)科,北京 102600;2.北京市大興區(qū)榆垡鎮(zhèn)中心衛(wèi)生院;3.首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院國際醫(yī)療部綜合內(nèi)科

      胰腺癌是惡性程度最高的腫瘤之一,發(fā)病率和死亡率高。根據(jù)最新中國癌癥城市報告[1],2013年中國城市居民中,胰腺癌發(fā)病率為6.95/10萬,死亡率為6.18/10萬,且發(fā)病率和死亡率呈逐年升高的趨勢。胰腺癌的早期診斷困難,就診時,只有不足20%的患者適合接受手術(shù)治療;晚期治療困難,進展期胰腺癌患者的中位生存時間不足6個月[2]。鑒于胰腺癌惡性程度高、早期診斷難、晚期治療難、易發(fā)生局部浸潤和全身轉(zhuǎn)移,深入探索胰腺癌發(fā)生發(fā)展的分子機制,發(fā)現(xiàn)潛在臨床治療靶點尤為重要[3]。

      長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA分子總稱。研究[4-6]顯示,lncRNA在多種腫瘤中存在異常表達,與肝癌、結(jié)直腸癌、肺癌、前列腺癌、乳腺癌等密切相關(guān),lncRNA可通過調(diào)控基因表達,影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移、預后等。近年來,有關(guān)lncRNA在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用得到了越來越多的關(guān)注。研究[2-3]表明,多種lncRNA在胰腺癌組織中存在異常表達,lncRNA可能在胰腺癌的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。HOTAIR、MALAT1、H19、gas5、HOTTIP、PVT-1等多種lncRNA與胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移和預后有明顯相關(guān)性。

      HOX的反義基因間RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)是第一個被發(fā)現(xiàn)與胰腺癌有關(guān)的lncRNA分子,長度為2 158 bp,位于染色12q13.13的HoxC位點。近年來研究表明,HOTAIR在乳腺癌、肝癌、食管癌、結(jié)腸癌等存在異常表達[7-11],HOTAIR高表達增加了腫瘤細胞的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移能力。研究[2-3]表明,HOTAIR可能是一種原癌基因,在胰腺癌發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用。研究[12]發(fā)現(xiàn),HOTAIR在胰腺癌組織中表達水平顯著上調(diào),與胰腺癌周圍淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠處浸潤密切相關(guān),并且異常表達HOTAIR還是影響胰腺癌患者臨床預后的重要因素之一,高表達水平的HOTAIR預示著較短的生存期。

      目前,關(guān)于HOTAIR在胰腺癌中作用的報道仍然較少,研究尚處于初步階段,HOTAIR在胰腺癌中的生物學功能尚不明確,具體發(fā)揮作用途徑和分子機制更是知之甚少。因此,本研究體外培養(yǎng)胰腺癌細胞,旨在研究HOTAIR對胰腺癌細胞增殖、遷移等影響,為胰腺癌的臨床靶點治療提供可能的方向和實驗依據(jù),為胰腺癌的診斷和治療開辟新的途徑。

      1 材料與方法

      1.1 材料與試劑人胰腺癌細胞系A(chǔ)sPC-1和Panc-1購自美國ATCC細胞中心;DMEM高糖培養(yǎng)基、質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清、青鏈雙抗購自美國Gibco公司;Trizol試劑、質(zhì)粒表達載體pcDNA3.1、轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000均購自美國Invitrogen公司;小干擾RNA(siRNAs)和陰性對照siRNA(si-NC)由北京健坤禾潤科技有限公司代購;CCK8試劑盒購自日本同仁化學研究所;Transwell小室購自美國Millipore公司;GoScriptTMReverse Transcription System A5001購自美國Promega公司;GoTaq?qPCR Master Mix A6001購自美國Promega公司;RQ1 Rnase-Free Dnase M610A購自美國Promega公司。

      1.2 方法

      1.2.1 細胞培養(yǎng):人胰腺癌細胞(Panc-1、AsPC-1)用DMEM高糖培養(yǎng)基培養(yǎng),補充含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清、100 U/ml青霉素及100 mg/ml鏈霉素,置于37 ℃、體積分數(shù)為5% CO2的飽和濕度恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每1~2 d更換1次培養(yǎng)基,當細胞融合度為80%~90%時進行傳代培養(yǎng)。

      1.2.2 獲取目的基因和構(gòu)建質(zhì)粒:查閱基因文庫,發(fā)現(xiàn)并找到人胰腺癌細胞目的基因HOTAIR轉(zhuǎn)錄mRNA核苷酸序列,利用qRT-PCR技術(shù)逆轉(zhuǎn)錄形成的cDNA再擴增形成一個全長的HOTAIR片段,用于擴增的HOTAIR的寡核苷酸序列為:上游:5′-CATGGATCCACATTCTGCCCTGATTTCCGGAACC-3′,下游:5′-ACTCT-CGAGCCACCACACACACACAACCTACAC-3′,分別包含外源性Hind Ⅲ和Xho Ⅰ位點。驗證PCR的產(chǎn)物并亞克隆至哺乳動物表達載體pcDNA3.1中。

      1.2.3 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細胞:取對數(shù)生長期胰腺癌細胞接種于細胞培養(yǎng)板,待細胞貼壁且融合度為40%~60%時,通過Lipofectamine 2000進行載體及對照組的轉(zhuǎn)染,具體方法參見產(chǎn)品說明書。注意轉(zhuǎn)染前更換為無血清培養(yǎng)液;轉(zhuǎn)染后6 h更換含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清培養(yǎng)液。第一步轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-HOTAIR至人胰腺癌細胞(Panc-1、AsPC-1)中,以空白pcDNA載體(pcDNA3.1-NC)作陰性對照(陰性對照組),空試劑做空白處理(試劑空白組)。第二步轉(zhuǎn)染HOTAIR基因小干擾RNA(siRNA-HOTAIR)至人胰腺癌細胞(Panc-1、AsPC-1)中。應(yīng)用3條獨立的小干擾RNA(siRNA-HOTAIR-1187、siRNA-HOTAIR-83、siRNA-HOTAIR-1524)分別轉(zhuǎn)染兩株胰腺癌細胞,尋找并發(fā)現(xiàn)HOTAIR干擾敲低率最佳的siRNA。以陰性siRNA(si-NC)作對照,空試劑做空白處理。3個獨立的HOTAIR siRNA靶序列分別為:siRNA-HOTAIR-1187:5′-GCACUGUCUCUCAAAUAAUTT-3′;siRNA-HOTAIR-83:5′-GCACAUUCUGCCCUGAUUUTT-3′;siRNA-HOTAIR-1524:5′-GCCUUUGCUUCGUGCUGAUTT-3′。

      1.2.4 qRT-PCR檢測HOTAIR表達量:收集轉(zhuǎn)染后48 h的胰腺癌細胞,按Trizol試劑說明書提取HOTAIR總RNA。使用GoScriptTMReverse Transcription System和GoTaq?qPCR Master Mix進行qRT-PCR分析,檢測HOTAIR表達水平,結(jié)果用磷酸甘油酸脫氫酶(GAPDH)的表達量進行標準化。HOTAIR的PCR上游引物:5′-CAGTGGGGAACTCTGACTCG-3′,下游引物:5′-GTGCCTGGTGCTCTCTTACC-3′;GAPDH上游引物:5′-GGGAGCCAAAAGGGTCAT-3′,下游引物:5′-GAGTCCTTCCACGATACCAA-3′。分析qRT-PCR的結(jié)果并計算其相對于臨界循環(huán)次數(shù)的值,然后轉(zhuǎn)換為相對GAPDH的倍數(shù)改變,采用2-ΔΔCt法進行標準化。

      1.2.5 CCK8法檢測細胞增殖活力:取對數(shù)生長期的胰腺癌細胞以起始1.0×103個/孔接種于96孔板,每孔加培養(yǎng)液100 μl,24 h后轉(zhuǎn)染,每株胰腺癌細胞均設(shè)立實驗組和陰性對照組(NC),每組設(shè)置5個復孔。向每孔加入10 μl CCK溶液,注意不要在孔中生成氣泡,否則會影響吸光度值(OD)的讀數(shù)。分別于轉(zhuǎn)染后0 d、1 d、2 d、3 d和4 d檢測細胞增殖。

      1.2.6 Transwell細胞遷移實驗:胰腺癌細胞轉(zhuǎn)染后48 h進行Transwell細胞遷移實驗。將胰腺癌細胞消化后鋪在transwell小室上層,起始數(shù)量為2.0×104個/100 μl。含質(zhì)量濃度為100 g/L的胎牛血清的培養(yǎng)基600 μl位于下層。24 h取出小室,用棉簽擦去小室內(nèi)壁一面細胞,外側(cè)細胞結(jié)晶紫染色。顯微鏡下拍照。之后2% SDS裂解細胞(600 μl)。之后移入96孔板檢測OD值。

      2 結(jié)果

      2.1 HOTAIR在人胰腺癌細胞系A(chǔ)sPC-1和Panc-1的表達情況

      2.1.1 AsPC-1細胞:HOTAIR轉(zhuǎn)染成功過表達,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。AsPC-1的敲低取得成功,siRNA-1187檢測到最高敲低率,約為89.6%。其余兩條分別為 43.8%(siRNA-83),74.3%(siRNA-1524),差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)(見表1、圖1)。PCR擴增曲線和熔解曲線良好,擴增產(chǎn)物特異性良好(以AsPc-1過表達為例,見圖2)。

      2.1.2 Panc-1細胞:HOTAIR轉(zhuǎn)染成功過表達,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。Panc-1的敲低取得成功,siRNA-83敲低率最高,相對陰性白質(zhì)粒對照組平均值,敲低效率約為62.2%,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)(見表2、圖3)。PCR擴增曲線和熔解曲線良好,擴增產(chǎn)物特異性良好。

      表1 AsPC-1細胞中HOTAIR相對表達量Tab 1 The relative expression of HOTAIR in AsPC-1

      圖1 AsPC-1細胞HOTAIR過表達(A)和敲低(B)Fig 1 The overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR in AsPC-1

      圖2 AsPC-1過表達擴增曲線(A)和AsPC-1過表達熔解曲線(B)Fig 2 Amplification curve: the overexpression of HOTAIR in AsPC-1 (A) and melting curve: the overexpression of HOTAIR in AsPC-1 (B)

      表2 Panc-1細胞中HOTAIR相對表達量Tab 2 The relative expression of HOTAIR in Panc-1

      2.2 HOTAIR對人胰腺癌細胞AsPC-1和Panc-1增殖的影響

      2.2.1 AsPC-1細胞:HOTAIR過表達組與空載體對照組相比,細胞增殖能力差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)(見圖4A),這可能與HOTAIR本身在AsPC-1細胞中的高表達相關(guān)。但HOTAIR敲低實驗中,3組HOTAIR敲低表達的細胞增殖能力普遍弱于陰性對照組,0~2 d此趨勢較明顯,差異有統(tǒng)計學意義(P>0.05)(見圖4B)。

      2.2.2 Panc-1細胞:跟蹤細胞生長狀況表明,相比陰性對照組,0~3 d過表達HOTAIR組呈生長優(yōu)勢;相比陰性對照組,HOTAIR敲低效率較高的siRNA-83和siRNA-1187組增殖能力減弱(見圖5)。

      圖3 Panc-1細胞HOTAIR過表達(A)和敲低(B)Fig 3 The overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR in Panc-1

      圖4 AsPC-1細胞HOTAIR過表達(A)和敲低(B)對細胞增殖的影響Fig 4 The effect of overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR on proliferation in AsPC-1

      圖5 Panc-1細胞HOTAIR過表達(A)和敲低(B)對細胞增殖的影響Fig 5 The effect of overexpression (A) and knockdown (B) of HOTAIR on proliferation in Panc-1

      2.3 HOTAIR對人胰腺癌細胞AsPC-1和Panc-1遷移的影響

      2.3.1 AsPC-1細胞:Transwell結(jié)果表明,相比陰性對照組,過表達HOTAIR組細胞遷移能力增強。siRNA-1187轉(zhuǎn)染的細胞遷移能力明顯下降,而siRNA-83和siRNA-1524變化相對陰性對照組不明顯(見圖6)。

      2.3.2 Panc-1細胞:Transwell結(jié)果表明,相比陰性對照組,過表達HOTAIR組細胞遷移能力增強。敲低效率較高的siRNA-83和siRNA-1187轉(zhuǎn)染的細胞遷移能力明顯下降,而siRNA-1524變化相對陰性對照組不明顯(見圖7)。

      注:A1為HOTAIR過表達組,A2為A1的陰性對照組,B1為siRNA-1187組,B2為B1的陰性對照組,圖片均放大100倍。

      注:A1為HOTAIR過表達組,A2為A1的陰性對照組,B1為siRNA-83組,B2為B1的陰性對照組,圖片均放大100倍。

      3 討論

      胰腺癌是常見的惡性腫瘤之一,惡性程度高,轉(zhuǎn)移出現(xiàn)早,早期診斷困難,晚期治療困難,預后較差。目前胰腺癌的治療仍以手術(shù)切除聯(lián)合術(shù)后化療為主,雖然患者術(shù)后中位生存期延長,但生存質(zhì)量并未得到顯著提高。因此,深入研究胰腺癌發(fā)生發(fā)展機制和靶向治療尤為重要。

      lncRNA是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA分子總稱。近年來研究[7-11]表明,lncRNA與肝癌、食管癌、結(jié)腸癌、乳腺癌等多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展相關(guān),HOTAIR高表達可能增加了腫瘤細胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力。此外,HOTAIR高表達常常提示腫瘤患者不良的預后。

      近年來,有關(guān)lncRNA在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用得到了越來越多的關(guān)注,為臨床上胰腺癌的早期診斷、治療和預后提供了新的方向。Kim等[12]研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR在胰腺癌組織中表達水平顯著上調(diào),與胰腺癌周圍淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠處浸潤密切相關(guān),并且高表達水平的HOTAIR常預示著較短的生存期。但關(guān)于HOTAIR在胰腺癌中作用的報道仍然較少,研究尚處于起步階段。

      HOTAIR由Rinn等[13]于2007年首次發(fā)現(xiàn)并描述,是第一個被發(fā)現(xiàn)以反式轉(zhuǎn)錄干預基因表達的lncRNA。HOTAIR僅存在于哺乳動物中,由2 185個核苷酸組成,位于染色體12q13.13的HOXC11與HOXC12之間,包括6個外顯子[14]。

      HOTAIR有分子骨架的作用,具有特異性雙向結(jié)合能力,能同時結(jié)合兩種不同的組蛋白修飾復合體,并可能起到協(xié)調(diào)兩者功能的作用。其5′端與多梳抑制復合體2(polycomb repressive complex 2,PRC2)的核心組成部分之一EZH2結(jié)合,可使組蛋白H3第27位的賴氨酸三甲基化(H3K27me3),介導PRC2至特定位點來沉默HOXD基因座及相關(guān)抑癌基因如HOXD10、JAM2、PCDH的轉(zhuǎn)錄從而促進腫瘤的轉(zhuǎn)移復發(fā);而3′端與賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶復合體(LSD1/CoREST/REST)結(jié)合,可使組蛋白H3第4位的賴氨酸去甲基化(H3K4deme)[15],調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄活性,在染色體層面調(diào)控目的基因活性[16]。進一步研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR可以通過PRC2依賴性和PRC2非依賴性兩種途徑來介導下游基因表達調(diào)控,但HOTAIR發(fā)揮調(diào)控作用的機制仍不完全清楚。

      本研究體外培養(yǎng)胰腺癌細胞,通過調(diào)控HOTAIR在胰腺癌細胞中的表達水平,對其增殖、遷移能力進行分析。本研究發(fā)現(xiàn),在HOTAIR過量表達實驗中,HOTAIR過量表達可增強Panc-1細胞增殖能力,但對AsPC-1細胞增殖無影響,我們分析可能與HOTAIR在AsPC-1細胞本身呈高表達狀態(tài)相關(guān),進一步上調(diào)HOTAIR在AsPC-1的表達水平,其促進胰腺癌細胞增殖的作用和效果可能不顯著;同時,過表達的HOTAIR可以同時增強AsPC-1細胞、Panc-1細胞的遷移能力。在HOTAIR敲低實驗中,通過下調(diào)HOTAIR在胰腺癌細胞的表達水平,可以顯著抑制AsPC-1細胞、Panc-1細胞的增殖和遷移能力,這與前人研究結(jié)果相吻合,提示HOTAIR可能促進了胰腺癌的發(fā)展,HOTAIR高表達可能與預后不良相關(guān)[12]。

      綜上所述,本研究表明,HOTAIR高表達可以增強胰腺癌細胞的增殖和遷移能力,下調(diào)HOTAIR表達會抑制胰腺癌細胞的增殖和遷移能力,但由于人胰腺癌細胞種類較多,本研究只對AsPC-1和Panc-1兩株胰腺癌細胞進行了研究,將來的研究可能涉及更多不同種類的胰腺癌細胞系,研究結(jié)果可能與本研究有所差異。此外,本研究僅是體外實驗,研究結(jié)果尚需要進一步體內(nèi)實驗和臨床試驗的證實。

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