近日，西北農(nóng)林科技大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院小麥赤霉病防控研究團(tuán)隊(duì)在《New Phytologist》期刊上在線發(fā)表了題為“Landscape and regulation of alternative splicing and alternative polyadenylation in a plant pathogenic fungus”的研究論文。劉慧泉研究員為論文通訊作者，博士研究生路平為論文第一作者，該團(tuán)隊(duì)江聰研究員、王秦虎副教授和部分研究生也參與了該研究工作。

禾谷鐮刀菌是引起小麥赤霉病的主要病原菌，由于現(xiàn)有的禾谷鐮刀菌參考基因組和基因注釋還存在較多錯(cuò)誤和不完善的地方，研究團(tuán)隊(duì)修正了禾谷鐮刀菌參考基因組中的組裝和序列錯(cuò)誤，為禾谷鐮刀菌建立了一套全面完整的全長轉(zhuǎn)錄本注釋，這也是目前絲狀真菌中報(bào)道的最為全面和完整的轉(zhuǎn)錄本注釋。

利用新產(chǎn)生的全長轉(zhuǎn)錄本注釋，結(jié)合對不同發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和基因功能驗(yàn)證，該研究明確了禾谷鐮刀菌中可變剪接和可變聚腺苷酸化的發(fā)生動態(tài)，證明可變剪接和可變聚腺苷酸化作為一種統(tǒng)一的細(xì)胞重編程機(jī)制負(fù)責(zé)降低衰老和休眠組織中的蛋白產(chǎn)量，從而調(diào)控真菌組織衰老和休眠。此外，研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)禾谷鐮刀菌中無義介導(dǎo)的mRNA降解機(jī)制對可變剪接產(chǎn)生的提前終止轉(zhuǎn)錄本并沒有明顯的轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控，而是對正常轉(zhuǎn)錄本行使翻譯調(diào)控功能，mRNA 3-末端加工因子不僅調(diào)控禾谷鐮刀菌可變聚腺苷酸化，而且調(diào)控可變剪接。

該研究成果不僅有利于促進(jìn)禾谷鐮刀菌功能基因組學(xué)的深入研究，也為認(rèn)識絲狀真菌可變剪接和可變聚腺苷酸化的復(fù)雜性和調(diào)控提供了新見解，受到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。0F42E0FD-5CE0-4789-8969-FED884934AB0