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      成都部分地區(qū)斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)感染情況調(diào)查及基因型分析

      2022-07-30 03:21:58李青松
      四川畜牧獸醫(yī) 2022年7期
      關(guān)鍵詞:賈第奶牛場(chǎng)犢牛

      李青松

      (四川省綿陽(yáng)市經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,四川 綿陽(yáng) 621000)

      賈第蟲(chóng)是一種最常見(jiàn)的寄生生物,可感染人類(lèi)和多種動(dòng)物[1]。根據(jù)宿主和形態(tài)學(xué)分類(lèi),賈第蟲(chóng)被分為六個(gè)種,其中只有腸賈第蟲(chóng)(又名藍(lán)氏賈第鞭毛蟲(chóng)、十二指腸賈第蟲(chóng))可感染人類(lèi)。腸賈第蟲(chóng)的基因型復(fù)雜,根據(jù)遺傳學(xué)和表型,至少分為8 個(gè)集聚體(A~H)[2]。奶牛主要感染集聚體E,其次是集聚體A和B[3]。近年來(lái)許多對(duì)奶牛犢牛感染腸賈第蟲(chóng)的相關(guān)研究顯示,奶牛犢牛斷奶前后腸賈第蟲(chóng)的感染率存在差異,斷奶前后犢牛感染腸賈第蟲(chóng)的基因型也有差異[4-14]。

      本研究以成都部分地區(qū)(崇州、青白江、邛崍)奶牛場(chǎng)中的斷奶犢牛為研究對(duì)象,采用巢式PCR擴(kuò)增腸賈第蟲(chóng)β-賈第素(bg)基因、磷酸丙糖異構(gòu)酶(tpi)基因和谷氨酸脫氫酶(gdh)基因位點(diǎn),確定感染率,并對(duì)陽(yáng)性樣品進(jìn)行集聚體鑒定。隨后基于三個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增出的序列,對(duì)斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)進(jìn)行亞型分析,最后建立系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。旨在為奶牛場(chǎng)防治腸賈第蟲(chóng)感染以及腸賈第蟲(chóng)人獸共患病的監(jiān)測(cè)提供依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 主要試劑 Power Soil?DNA Isolation Kit(糞便DNA提取試劑盒),2×Taq PCR Master Mix,購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。

      1.2 樣品采集 在成都市崇州、青白江、邛崍的三個(gè)奶牛場(chǎng)采集圈養(yǎng)斷奶犢牛(2~12月齡)的新鮮糞便共計(jì)104份,每份糞樣約50 g,置于潔凈塑料采樣袋中,做好標(biāo)記、編號(hào),于4 ℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.3 樣品處理 取每份糞便樣品20 g,放入50 mL小燒杯中,加入適量蒸餾水,攪拌溶解并過(guò)濾。將濾液轉(zhuǎn)移到50 mL 離心管內(nèi),以3 000 r/min 離心5 min,緩慢棄去上清液,保留沉淀物,一部分沉淀物直接用于DNA提取,另一部分沉淀物儲(chǔ)存于2.5%重鉻酸鉀,并于4 ℃冰箱中保存。

      1.4 DNA提取 樣品處理后得到含糞便及卵囊的沉淀物,按照Power Soil?DNA Isolation Kit 說(shuō)明書(shū)提取樣本DNA。提取的DNA 置-20 ℃環(huán)境中保存。

      1.5 PCR擴(kuò)增 基于β-賈第素(bg)基因位點(diǎn)對(duì)所有樣品進(jìn)行檢測(cè),引物設(shè)計(jì)及擴(kuò)增條件參照Sulaiman 等[15]的報(bào)道?;讦?賈第素基因鑒定出的陽(yáng)性樣品,使用磷酸丙糖異構(gòu)酶(tpi)、谷氨酸脫氫酶(gdh)基因位點(diǎn)進(jìn)行基因亞型鑒定,引物設(shè)計(jì)及擴(kuò)增條件參照Appelbee 等[16]和Cacciò等[17]的報(bào)道。PCR反應(yīng)體系均為25 μL,包括:2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL、去離子水8.5 μL、上下游引物各1 μL、模板DNA 2 μL(第1輪PCR 產(chǎn)物為第2 輪PCR 的模板)。通過(guò)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)第2 套巢式PCR 產(chǎn)物,置于凝膠成像儀內(nèi),使用Image Lab Version 3.0 軟件成像拍照。

      1.6 測(cè)序及分析 將PCR 陽(yáng)性產(chǎn)物進(jìn)行雙向測(cè)序,通過(guò)DNAMAN Version 8.0 軟件進(jìn)行拼接。將測(cè)序結(jié)果在GenBank中經(jīng)BLAST比對(duì)校正后,使用MEGA 7的NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

      2 結(jié)果

      2.1 巢式PCR擴(kuò)增結(jié)果 基于巢氏PCR擴(kuò)增β-賈第素(bg)基因位點(diǎn)、磷酸丙糖異構(gòu)酶(tpi)基因位點(diǎn)、谷氨酸脫氫酶(gdh)基因位點(diǎn)的目的基因條帶長(zhǎng)度分別為511 bp、532 bp、520 bp。

      2.2 斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)感染情況 所采集的104 份樣品中共有42 份鑒定為腸賈第蟲(chóng)陽(yáng)性,總感染率為40.38%(42/104),其中崇州、青白江、邛崍三個(gè)奶牛場(chǎng)的感染率分別為46.88%(15/32)、41.94%(13/31)、34.15%(14/41),三個(gè)奶牛場(chǎng)皆發(fā)現(xiàn)了集聚體E和集聚體A感染。具體感染情況見(jiàn)表1。

      表1 斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)感染情況統(tǒng)計(jì)

      2.3 bg、tpi和gdh基因序列分析 經(jīng)過(guò)多次巢氏PCR擴(kuò)增bg、tpi、gdh三個(gè)位點(diǎn),分別擴(kuò)增出11、8、9 條基因序列,分別發(fā)現(xiàn)6 種基因亞型(A1、E1、E2、E9、E11、E13),5 種基因亞型(A1、E3、E6、E15、E22),6 種基因亞型(A1、E1、E8、E10、E12、E13)?;蛐秃突騺喰蜋z測(cè)結(jié)果見(jiàn)表2。

      表2 基于bg、gdh和tpi位點(diǎn)的腸賈第蟲(chóng)基因型和基因亞型檢測(cè)結(jié)果

      基于bg 基因位點(diǎn),11 條序列中以A1(n=2)和E1(n=2)基因亞型為主。形成的6 種基因亞型在NCBI的序列登錄號(hào)分別為A1(KR051222)、E1(KT922247)、E2(KT922248)、E9(KY769091)、E11(KY769089)、E13(MF671880),據(jù)此構(gòu)建出bg基因位點(diǎn)的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)。

      基于tpi基因位點(diǎn),8條序列中以A1(n=3)和E3(n=2)基因亞型為主。形成的5種基因亞型在NCBI 的序列登錄號(hào)分別為A1(KJ888991)、E3(KT922259)、E6(KY432850)、E15(KY432848)、E22(KY710748),據(jù)此構(gòu)建出tpi基因位點(diǎn)的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)。

      基于gdh基因位點(diǎn),9條序列中以A1(n=2)、E1(n=2)和E10(n=2)基因亞型為主。形成的6種基因亞型在NCBI 的序列登錄號(hào)分別為A1(KT922255)、E1(KY769096)、E8(KT369785)、E10(KT698971)、E12(KY432840)、E13(KY432838),據(jù)此構(gòu)建出gdh基因位點(diǎn)的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)。

      3 結(jié)論與分析

      3.1 腸賈第蟲(chóng)感染情況 我國(guó)斷奶犢牛感染腸賈第蟲(chóng)的情況非常普遍,但感染率多數(shù)偏低。通過(guò)多基因位點(diǎn)分析結(jié)果可知,本研究中斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)的總感染率為40.38%(42/104),其中崇州、青白江、邛崍三個(gè)奶牛場(chǎng)的感染率分別為46.88%(15/32)、41.94%(13/31)、34.15%(14/41),高于廣東(0.94%)[7-8]、吉林(4.39%)[9]、寧夏(2.53%)[9]、江蘇(7.48%)[10]、河北和天津(3.48%)[11]、河南(2.42%)[12]、陜西(17.54%)[13]、新疆(16.60%)[14]。表明這些場(chǎng)中斷奶犢牛感染腸賈第蟲(chóng)的情況較為嚴(yán)重,可能是不同氣候生態(tài)條件、管理水平等因素綜合作用的結(jié)果。提示成都地區(qū)奶牛場(chǎng)中腸賈第蟲(chóng)可能是一種常見(jiàn)的病原體,應(yīng)當(dāng)引起重視。

      3.2 腸賈第蟲(chóng)基因型情況 本研究在bg、tpi、gdh三個(gè)基因位點(diǎn)分別擴(kuò)增出了11、8、9條基因序列,分別形成6 種基因亞型(A1、E1、E2、E9、E11、E13),5 種基因亞型(A1、E3、E6、E15、E22),6 種基因亞型(A1、E1、E8、E10、E12、E13),均為已知亞型,且主要為集聚體E,其次為集聚體A,此項(xiàng)結(jié)果與國(guó)內(nèi)陜西[13]、新疆[14]地區(qū)的研究結(jié)果一致,故成都地區(qū)的奶牛場(chǎng)可參照這些地區(qū)的防控方法防治該病。通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析,三個(gè)奶牛場(chǎng)中斷奶犢牛腸賈第蟲(chóng)集聚體E 的遺傳種類(lèi)多樣,可能與集聚體的遺傳重組有關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)的所有集聚體A均為A1亞型,這種亞型主要在動(dòng)物身上發(fā)現(xiàn),但也可以感染人類(lèi),這提示成都地區(qū)奶牛場(chǎng)腸賈第蟲(chóng)感染具有人獸共患風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)當(dāng)引起高度重視?!?/p>

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