黃玉英,楊明偉,譚紅連,梁 正,曾 蘭,韋信賢,黃光華*,童桂香*
(1廣西水產(chǎn)科學(xué)研究院/廣西水產(chǎn)遺傳育種與健康養(yǎng)殖重點實驗室,廣西南寧 530021;2廣西水產(chǎn)畜牧學(xué)校,廣西南寧 530021)
【研究意義】羅氏沼蝦野田村病毒(nodavirus,MrNV)是一種單股正鏈RNA病毒,隸屬于野田村病毒科(Nodaviridae)(黃光華等,2015),主要感染羅氏沼蝦苗種,可造成淡化后仔蝦的死亡率高達(dá)90%,患病蝦以肌肉白濁、白斑或白尾等癥狀為臨床特征,因此被稱為羅氏沼蝦白尾?。╓hite tail disease,WTD)(姜蘭等,2002;陳之航等,2015)。WTD是世界動物衛(wèi)生組織(OIE)規(guī)定必須申報的疫病,自報道以來曾在多個國家和地區(qū)廣泛流行,發(fā)病快、死亡率高,給羅氏沼蝦養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展造成極大危害,我國已將其列為二類動物疫?。–heng and Chen,1998;錢冬等,2002;陳之航等,2015)。十足目虹彩病毒1(Decapod iridescent virus 1,DIV1)是近年來蝦類養(yǎng)殖中新出現(xiàn)的傳染性病原,隸屬于虹彩病毒科(Iridoviridae)十足目虹彩病毒屬()(Chen et al.,2019),可感染羅氏沼蝦、凡納濱對蝦、紅螯螯蝦、中國對蝦及青蝦等主要養(yǎng)殖蝦品種,并造成大批量死亡(Xu et al.,2016;Li et al.,2017;Qiu et al.,2017),也可感染河蝦、河蟹、螺螄及浮游生物等水生生物成為傳染源(王甘翔等,2018)。由于DIV1的多宿主特征,其傳播迅速且廣泛,DIV1疫情在我國蝦類養(yǎng)殖各區(qū)域相繼暴發(fā),造成巨大經(jīng)濟損失,且疫情有進(jìn)一步擴大和加劇的趨勢,給我國蝦類養(yǎng)殖業(yè)帶來嚴(yán)峻挑戰(zhàn),農(nóng)業(yè)農(nóng)村部已將DIV1引起的蝦虹彩病毒?。―ecapod iri‐descent virus 1 disease,DIV1D)定為新發(fā)疫病,并暫時參照一類疫病處置(農(nóng)漁技疫函〔2018〕95號)。WTD和DIV1D是羅氏沼蝦養(yǎng)殖中危害最嚴(yán)重的2種病毒性疾病,目前尚無特效藥物及治療方法,切斷病毒傳播途經(jīng)仍是最有效的預(yù)防措施。因此,亟待建立一種能同時鑒別MrNV和DIV1的檢測方法,為蝦苗檢疫、親蝦篩選及疾病診斷等提供更高效的技術(shù)手段?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】目前,針對MrNV的檢測方法有膠體金試紙條、ELISA、RT-PCR、熒光定量RT-PCR及RT-LAMP 等(Romestand and Bonami,2003;Sri Widada et al.,2003;Pillai et al.,2006;童桂香等,2012;黃光華等,2015),關(guān)于DIV1的檢測方法已報道有套式PCR、熒光定量PCR、LAMP和RPA等(Qiu et al.,2017,2018;韋信賢等,2020;鄒瑩等,2020;Tong et al.,2022)。這些檢測方法在實際檢測工作中各具優(yōu)缺點,RT-PCR需進(jìn)行PCR和電泳分析,且敏感性較低;套氏PCR敏感性高,但需進(jìn)行兩輪PCR及電泳分析,檢測耗時長,且多次開蓋操作易造成交叉污染;ELISA準(zhǔn)確性高,但操作繁瑣、耗時長;LAMP靈敏、快速,但易出現(xiàn)假陽性。相對而言,實時熒光定量PCR具有特異性強、靈敏度高、重復(fù)性好、定量準(zhǔn)確、自動化程度高、檢測速度快、全封閉反應(yīng)等優(yōu)點,已成為實驗室診斷最常用的檢測方法(鐘江華等,2011;隗黎麗,2012)。多重?zé)晒舛縋CR是在熒光定量PCR的基礎(chǔ)上,利用幾種不同熒光基團的組合,結(jié)合儀器對不同通道熒光的檢測能力實現(xiàn)對多個靶標(biāo)的實時定量檢測分析,應(yīng)用于病原檢測時可實現(xiàn)對多種病原進(jìn)行同步檢測,具有簡便、高效、檢測成本低等優(yōu)勢。姜利霞等(2021)建立了可同時檢測牛皰疹病毒、牛呼吸道合胞體病毒、牛副流感病毒3型和牛病毒性腹瀉病毒單一或混合感染的四重?zé)晒舛縋CR;史喜菊等(2021)建立了可用于偽狂犬病病毒、豬細(xì)小病毒和豬圓環(huán)病毒2等3種病毒混合感染檢測和鑒別診斷的三重?zé)晒舛縋CR;王然等(2021)建立了可快速檢測6種常見下呼吸道感染病原菌的多重?zé)晒舛縋CR?!颈狙芯壳腥朦c】MrNV和DIV1是羅氏沼蝦養(yǎng)殖中危害最嚴(yán)重的傳染性病原,但目前主要是采用MrNV和DIV1的單重?zé)晒舛縋CR分別進(jìn)行檢測,操作繁瑣,耗時費力,因此亟待建立一種能同時檢測MrNV和DIV1的二重?zé)晒舛縋CR,實現(xiàn)對羅氏沼蝦WTD和DIV1D的快速診斷及科學(xué)防控?!緮M解決的關(guān)鍵問題】采用TaqMan-MGB探針技術(shù)建立能同時檢測MrNV和DIV1的二重?zé)晒舛縋CR,以提高M(jìn)rNV和DIV1檢測的效率,為WTD和DIV1D的臨床診斷及疫情監(jiān)測提供一種更簡便和高效的檢測方法。
MrNV、DIV1、白斑綜合征病毒(WSSV)、蝦肝腸胞蟲(EHP)、傳染性皮下和造血器官壞死病毒(IHHNV)陽性材料由廣西水生動物疫病監(jiān)控中心實驗室保存提供;無MrNV和DIV1感染的羅氏沼蝦由國家級廣西南寧羅氏沼蝦良種場提供;117份羅氏沼蝦樣品為2020年采自廣西南寧、柳州和百色等地的養(yǎng)殖場。2×F8 Fast Long PCR MasterMix、病毒基因組DNA/RNA核酸快速提取試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒小量提取試劑盒購自北京艾德萊生物技術(shù)有限公司;pGM-T載體、氨芐青霉素、大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞及瓊脂糖購自天根生化科技(北京)有限公司;T7體外轉(zhuǎn)錄試劑盒及DNase I購自Fermentas 公司;DL500 DNA Marker、I、EASY Dilution(for Real Time PCR)和OneStep PrimeScriptRT-PCR Kit(Perfect Real Time)購自寶生物工程(大連)有限公司;無水乙醇、氯仿、異丙醇等試劑均為國產(chǎn)分析純。主要儀器設(shè)備為安捷倫公司的Mx3005P熒光定量PCR儀。
1.2.1 引物與探針設(shè)計及合成 MrNV的衣殼蛋白(Capsid protein,CP)基因和DIV1的主衣殼蛋白(Major capsid protein,MCP)基因均為病毒主要功能基因,且其序列含有多個保守區(qū)域(Tidona et al.,1998),故選取MrNV的CP基因(MrNV-CP)和DIV1的MCP基因(DIV1-MCP)為檢測目標(biāo)基因。采用Primer Express v3.0分別在MrNV-CP基因(HQ287005)和DIV1-MCP基因(KY681039)的保守區(qū)域設(shè)計多組特異性引物和TaqMan-MGB探針,委托生工生物工程(上海)股份有限公司合成。其中,MrNV和DIV1探針的5'端分別標(biāo)記HEX和FAM熒光染料、3'端均標(biāo)記MGB基團。經(jīng)預(yù)試驗測試篩選,各選擇一套效果較好的引物及TapMan-MGB探針(表1)用于二重?zé)晒舛縋CR檢測方法的建立。
1.2.2 病毒核酸提取及標(biāo)準(zhǔn)品制備 取陽性病料組織按1∶2(w/v)的比例加入生理鹽水,勻漿,離心收集200.0 μL上清液,按照病毒基因組DNA/RNA快速提取試劑盒說明分別提取MrNV、DIV1、WSSV、IHHNV和EHP的核酸,最后加50.0 μL洗脫緩沖液溶解,病毒DNA置于-20 ℃冰箱保存,病毒RNA置于-70 ℃冰箱保存。參照黃光華等(2015)的方法,制備重組質(zhì)粒pGM-T-CP和pGM-T-MCP;提取pGM-T-CP質(zhì)粒DNA,以I單酶切使質(zhì)粒線性化后采用瓊脂糖凝膠試劑盒回收純化;以線性化pGM-T-CP質(zhì)粒DNA為模板,T7體外轉(zhuǎn)錄試劑盒體外轉(zhuǎn)錄獲得的RNA為檢測MrNV的標(biāo)準(zhǔn)品RNA,pGM-T-MCP質(zhì)粒DNA則直接作為檢測DIV1的標(biāo)準(zhǔn)品DNA。使用核酸蛋白分析儀分別測定MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA的純度和濃度,并換算成拷貝數(shù):拷貝數(shù)(Copies/μL)=6.02×10×(ng/μL×10)÷(RNA長度×340)/(DNA長度×660);采用10倍梯度稀釋,將標(biāo)準(zhǔn)品系列稀釋成1.0×10~1.0×10Copies/μL,-40 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 二重?zé)晒舛縋CR退火溫度優(yōu)化 參考各引物的退火溫度(Tm),以1.0×10、1.0×10和1.0×10Copies/μL等3個濃度的MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA等比混合液為模板,按1 ℃的梯度在58~62 ℃范圍內(nèi)分別進(jìn)行二重?zé)晒舛縋CR擴增,以獲得較低值及較高相對熒光強度增加值(ΔRn)時的退火溫度最佳。
1.2.4 二重?zé)晒舛縋CR檢測體系優(yōu)化 選擇1.0×10、1.0×10和1.0×10Copies/μL等3個不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)品RNA/DNA為模板,參考黃國秋等(2017)的方法,先進(jìn)行單個病毒檢測體系優(yōu)化;再以濃度為1.0×10Copies/μL的2種標(biāo)準(zhǔn)品等比混合液為模板,進(jìn)行二重?zé)晒舛縋CR檢測體系優(yōu)化,以確定最佳的引物和探針濃度。
1.2.5 標(biāo)準(zhǔn)曲線建立及敏感性試驗 取2.0 μL的10倍梯度系列稀釋MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA同梯度等比混合液(1.0×10~1.0×10Copies/μL)為模板,以優(yōu)化后的二重?zé)晒舛縋CR進(jìn)行擴增,每個梯度設(shè)3個平行;參考韋信賢等(2020)的方法建立標(biāo)準(zhǔn)曲線和標(biāo)準(zhǔn)方程,并判斷方法的敏感性。
1.2.6 特異性試驗 運用優(yōu)化后的二重?zé)晒舛縋CR對MrNV、DIV1、WSSV、IHHNV和EHP的核酸進(jìn)行檢測,觀察有無出現(xiàn)擴增曲線及值,評價方法的特異性。
1.2.7 重復(fù)性試驗 以1.0×10、1.0×10和1.0×10Copies/μL等3個梯度的MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA同梯度等比混合液為模板,分別在第1 d、第7 d和第14 d進(jìn)行重復(fù)試驗,每個梯度設(shè)3個平行;計算組內(nèi)及組間值的變異系數(shù)(CV),評價標(biāo)準(zhǔn)品和二重?zé)晒舛縋CR的穩(wěn)定性。
取300 mg臨床樣品按1.2.2的方法提取病毒核酸,分別用二重?zé)晒舛縋CR和套式PCR(DB 45/T 942—2013和SC/T 7237—2020)對117份羅氏沼蝦臨床樣品進(jìn)行MrNV和DIV1檢測,比較2種方法檢測結(jié)果的吻合度,評價二重?zé)晒舛縋CR對臨床樣品檢測的可靠性和實用性。
分別以MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA為模板進(jìn)行PCR擴增,均可獲得相應(yīng)的目的片段(圖1)。PCR產(chǎn)物經(jīng)回收純化后克隆至pGM-T載體上,經(jīng)PCR篩選、測序鑒定和BLAST同源比對,證實目的片段已正確插入pGM-T載體,表明重組質(zhì)粒pGM-TCP和pGM-T-MCP構(gòu)建成功。分別提取陽性克隆質(zhì)粒,其中以pGM-T-CP質(zhì)粒線性化DNA為模板體外轉(zhuǎn)錄獲得的RNA濃度為7.6 ng/μL,換算成拷貝數(shù)為4.3×10Copies/μL,OD/OD為1.93,符合標(biāo)準(zhǔn)品的要求;pGM-T-MCP質(zhì)粒的DNA濃度為113 ng/μL,換算成拷貝數(shù)為3.2×10Copies/μL,OD/OD為1.86,也可作為試驗標(biāo)準(zhǔn)品。
對二重?zé)晒舛縋CR的退火溫度、引物和探針使用終濃度進(jìn)行優(yōu)化,最終確定反應(yīng)體系20.0 μL:2×One Step RT-PCR Buffer Ⅲ10.0 μL,PrimeScript RT Enzyme Mix II 0.4 μL,ExHS(5 U/μL)0.4 μL,MrNV 上、下游引物MrNV-qF/MrNV-qR(10 μmol/L)各0.8 μL和探針MrNV-qP(5 μmol/L)1.2 μL,DIV1上、下游引物DIV1-qF/DIV1-qR(10 μmol/L)及探針DIV1-qP(5 μmol/L)各0.8 μL,ROX Reference Dye II(50×)0.4 μL,核酸模板2.0 μL,滅菌DEPC水補足至20.0 μL。以健康無MrNV和DIV1感染羅氏沼蝦肝胰腺組織提取的核酸為陰性對照,以滅菌DEPC水為空白對照。按照試劑盒說明進(jìn)行擴增操作,其中,反轉(zhuǎn)錄程序:42 ℃5 min,95 ℃10 s;熒光定量PCR擴增程序:95 ℃5 s,60 ℃45 s,進(jìn)行40個循環(huán)。
采用優(yōu)化后的二重?zé)晒舛縋CR對10倍系列梯度的MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA同梯度等比混合液(1.0×10~1.0×10Copies/μL)進(jìn)行擴增,結(jié)果(圖2)顯示,高濃度標(biāo)準(zhǔn)品的擴增曲線呈典型的S形,低濃度標(biāo)準(zhǔn)品的擴增曲線因擴增未達(dá)平臺期而呈半S形,陰性對照和空白對照均未出現(xiàn)擴增曲線。利用Mx3005P熒光定量PCR儀自帶的軟件進(jìn)行分析,橫坐標(biāo)為起始拷貝數(shù)()對數(shù)、縱坐標(biāo)為值()繪制相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖3),其標(biāo)準(zhǔn)曲線方程分別為:=-3.558×lg()+41.85,Eff.(擴增效率)和RSq(相關(guān)系數(shù)方值)分別為91.0%和0.994;=-3.489×lg()+43.53,Eff.和RSq分別為93.5%和0.994??梢姡瑧?yīng)用TaqMan-MGB探針建立的二重?zé)晒舛縋CR對MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA均具有很高的擴增效率,制定的標(biāo)準(zhǔn)曲線線性關(guān)系良好,能實現(xiàn)同時定量分析MrNV和DIV1。
二重?zé)晒舛縋CR的敏感性試驗結(jié)果表明,MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA模板為100和10 Copies/反應(yīng)時,3 個平行試驗的值分別為34.00、34.23、34.35和37.15、37.46、37.69;DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA模板為100和10 Copies/反應(yīng)時,3個平行試驗的值分別為34.95、34.99、35.36和37.25、38.40、38.87,且均獲得明顯的擴增曲線(圖4和圖5),說明二重?zé)晒舛縋CR檢測MrNV和DIV1的靈敏度均低至10 Copies/反應(yīng)。但在實際應(yīng)用中,為保證檢測結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性,建議以值35.00為界限,當(dāng)值≤35.00且有擴增曲線,判定為MrNV或DIV1陽性;值>35.00同時有擴增曲線,需重復(fù)檢測1次,若結(jié)果一致判定為MrNV或DIV1陽性,重復(fù)結(jié)果無擴增曲線則判定為MrNV或DIV1陰性。
以建立的二重?zé)晒舛縋CR對蝦類常見主要病原MrNV、DIV1、WSSV、IHHNV和EHP的核酸進(jìn)行檢測,結(jié)果(圖6)顯示只有MrNV和DIV1出現(xiàn)擴增曲線,對應(yīng)的值分別為20.69和21.60,判為陽性;WSSV、IHHNV、EHP及陰性對照、空白對照均未出現(xiàn)擴增曲線,判為陰性。說明建立的二重?zé)晒舛縋CR對MrNV和DIV1具有較強的特異性。
以3個不同濃度(1.0×10、1.0×10和1.0×10Copies/μL)MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA等比混合液為模板的重復(fù)試驗結(jié)果表明,二重?zé)晒舛縋CR檢測MrNV的組內(nèi)試驗變異系數(shù)為0.31%~0.93%,組間試驗變異系數(shù)為0.96%~1.33%;二重?zé)晒舛縋CR檢測DIV1的組內(nèi)試驗變異系數(shù)為0.35%~0.81%,組間試驗變異系數(shù)為0.78%~1.04%。表明以建立的二重?zé)晒舛縋CR對MrNV和DIV1進(jìn)行檢測具有較好的重復(fù)性,同時證實制備的MrNV標(biāo)準(zhǔn)品RNA和DIV1標(biāo)準(zhǔn)品DNA均具有很好的穩(wěn)定性,可作為標(biāo)準(zhǔn)品和陽性對照使用。
應(yīng)用建立的二重?zé)晒舛縋CR和國內(nèi)現(xiàn)行有效標(biāo)準(zhǔn)的套式PCR分別對117份羅氏沼蝦臨床樣品進(jìn)行檢測,結(jié)果如表3和表4所示。在MrNV檢測(表3)中,有6份樣品用2種方法檢測均呈陽性,值為19.37~34.13,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線=-3.558×lg()+41.85計算,得知MrNV拷貝數(shù)在1.48×10~2.08×10Copies/反應(yīng),羅氏沼蝦組織中的MrNV含量為3.7×10~5.2×10Copies/mg;有1份樣品的二重?zé)晒舛縋CR檢測呈陽性而套式PCR檢測呈陰性,值為36.71,MrNV拷貝數(shù)為28 Copies/反應(yīng),羅氏沼蝦組織中的MrNV含量約7 Copies/mg;有110份樣品經(jīng)2種方法檢測均呈陰性,即2種檢測方法的符合率為99.15%。
在DIV1檢測(表4)中,有11份樣品經(jīng)2種方法檢測均呈陽性,值為17.12~34.89,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線=-3.489×lg()+43.53計算,得知DIV1拷貝數(shù)在2.99×10~3.71×10Copies/反應(yīng),羅氏沼蝦組織中的DIV1含量為7.5×10~9.3×10Copies/mg;有2份樣品的二重?zé)晒舛縋CR檢測呈陽性而套式PCR檢測呈陰性,值分別為36.43和37.16,DIV1拷貝數(shù)為108和67 Copies/反應(yīng),羅氏沼蝦組織中的DIV1含量約27和17 Copies/mg;有103份樣品經(jīng)2種方法檢測均呈陰性,即2種檢測方法的符合率為97.44%。
羅氏沼蝦具有抗逆性強、適應(yīng)性廣及市場價格穩(wěn)定等特點,是我國淡水養(yǎng)殖的主要蝦品種。近年來,由于對蝦養(yǎng)殖病害頻發(fā)、養(yǎng)成率低、風(fēng)險高,許多對蝦養(yǎng)殖戶轉(zhuǎn)養(yǎng)羅氏沼蝦,加上稻田、藕田及魚蝦混養(yǎng)等養(yǎng)殖模式的推廣,羅氏沼蝦養(yǎng)殖掀起小高潮,其病害問題也引起廣泛關(guān)注(羅福廣等,2022;羅紅等,2022)。近幾年對羅氏沼蝦病害的監(jiān)測結(jié)果顯示,MrNV和DIV1已成為羅氏沼蝦養(yǎng)殖中危害最嚴(yán)重的病毒性病原(李清和陳家勇,2020;羅紅等,2022);對親蝦和苗種進(jìn)行嚴(yán)格檢疫,切斷病毒傳入途經(jīng),是目前預(yù)防病毒病最有效的防控措施。因此,快速、準(zhǔn)確檢測MrNV和DIV1對有效防控WTD和DIV1D暴發(fā)與流行具有重要意義。PCR是病毒核酸檢測最理想的方法,分別針對MrNV和DIV1的套式PCR、熒光定量PCR均已有研究報道(童桂香等,2012;黃光華等,2015;Qiu et al.,2018;韋信賢等,2020);但在羅氏沼蝦的親蝦篩選、苗種檢疫及疫病監(jiān)測等實際檢測工作中采用單重?zé)晒舛縋CR對MrNV和DIV1進(jìn)行檢測存在操作繁瑣、耗時耗力等局限,因此亟需研發(fā)出一種能同時檢測MrNV和DIV1的二重?zé)晒舛縋CR,以提高M(jìn)rNV和DIV1的檢測效率。
本研究根據(jù)MrNV-CP基因和DIV1-MCP基因為病毒主要功能基因且保守性高的特點,以及Taq‐Man-MGB探針的優(yōu)勢(韋信賢等,2010),分別在MrNV-CP基因和DIV1-MCP基因保守區(qū)域設(shè)計特異性擴增引物及TaqMan-MGB探針;并制備重組質(zhì)粒pGM-T-CP和pGM-T-MCP,分 別 以pGM-TCP質(zhì)粒DNA體外轉(zhuǎn)錄合成的RNA和pGM-TMCP質(zhì)粒DNA為標(biāo)準(zhǔn)品,對退火溫度及引物和探針使用濃度進(jìn)行優(yōu)化,建立能同時檢測MrNV和DIV1的二重?zé)晒舛縋CR。結(jié)果表明,經(jīng)體外轉(zhuǎn)錄合成的MrNV標(biāo)準(zhǔn)RNA及制備的DIV1標(biāo)準(zhǔn)DNA純度高、穩(wěn)定性好,可作為標(biāo)準(zhǔn)品和陽性對照;起始模板在1×10~1×10Copies/反應(yīng)時,核酸模板濃度對數(shù)與值具有良好的線性關(guān)系,建立的標(biāo)準(zhǔn)曲線能準(zhǔn)確反映目的產(chǎn)物的擴增效果;進(jìn)行40個循環(huán)的檢測靈敏度可達(dá)10 Copies/反應(yīng),對羅氏沼蝦組織的檢測靈敏度約10 Copies/mg;且與其他蝦類的常見病原無交叉反應(yīng),組內(nèi)試驗和組間試驗的變異系數(shù)均小于2.00%,具有較好的重復(fù)性。此外,擴增過程和產(chǎn)物分析同步完成,整個檢測過程能控制在1 h左右??梢姡⒌亩?zé)晒舛縋CR具有靈敏度高、特異性強、操作簡單、快速等優(yōu)點,可滿足臨床上同時檢測MrNV和DIV1的需求。
應(yīng)用建立的二重?zé)晒舛縋CR和國內(nèi)現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)的套式PCR同時對117份羅氏沼蝦臨床樣品進(jìn)行MrNV和DIV1檢測,結(jié)果顯示,對MrNV檢測的符合率為99.15%,對DIV1檢測的符合率為97.44%,同為陽性檢測結(jié)果的樣品含目標(biāo)病毒拷貝數(shù)較高(>100 Copies/mg),而檢測結(jié)果不一致的樣品含目標(biāo)病毒拷貝數(shù)較低(<100 Copies/mg);此外,部分目標(biāo)病毒拷貝數(shù)低的樣品采用二重?zé)晒舛縋CR檢測呈陽性,而套式PCR檢測呈陰性,說明采用二重?zé)晒舛縋CR檢測目標(biāo)病毒拷貝數(shù)較低樣品時較套式PCR具有更高的靈敏度,可為WTD和DIV1D的臨床診斷及病原常規(guī)監(jiān)測提供技術(shù)保障。在DIV1檢測中,存在套式PCR檢測呈陽性而二重?zé)晒舛縋CR檢測呈陰性的樣品,因此在二重?zé)晒舛縋CR的實際應(yīng)用中,對弱陽性樣品(值>35.00)的重復(fù)試驗結(jié)果未出現(xiàn)擴增曲線時,可采用套式PCR進(jìn)行再次驗證,以防漏檢,確保檢測的準(zhǔn)確性。羅氏沼蝦臨床樣品檢測結(jié)果顯示,2020年MrNV和DIV1的陽性檢出率分別為6.0%和11.0%,即MrNV和DIV1感染在養(yǎng)殖羅氏沼蝦中存在零星流行,尤其是病毒在蝦體中呈潛伏期感染應(yīng)引起相關(guān)管理部門和從業(yè)者的重視和警惕。
結(jié)合TaqMan-MGB探針技術(shù)建立的二重?zé)晒舛縋CR能同時檢測MrNV和DIV1,且具有靈敏度高、特異性強、重復(fù)性好、簡便快速的特點,可為WTD和DIV1D的臨床診斷及實時監(jiān)測提供技術(shù)保障。