張俊娣, 翟佳佳, 左志洪
(1.河北省廊坊市人民醫(yī)院, 河北 廊 坊 065000 2.河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院, 河北 石家莊 050000)
RNA 干擾(RNA interference,RNAi)通過(guò)導(dǎo)入細(xì)胞或組織內(nèi)的雙鏈 RNA(double-strand RNA,dsRNA)引起特異性的同源 mRNA 的降解或抑制翻譯,導(dǎo)致相應(yīng)蛋白功能受損。1998年,研究者首次在秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegan,C.elegans)揭示了 RNAi 現(xiàn)象,眾多研究團(tuán)隊(duì)借助 RNAi 展開相關(guān)研究。C.elegans 基因組中與人類同源的基因高達(dá) 60%-80%,是第一個(gè)完成全基因組測(cè)序的動(dòng)物[1]。目前已建立了包含87% C.elegans 已知基因的 RNA 干擾菌庫(kù),并且線蟲的 RNAi 技術(shù)發(fā)展成熟且操作簡(jiǎn)單,可以對(duì)靶基因?qū)嵤┒ㄏ虺聊琜2],這使得我們通過(guò) RNAi 來(lái)進(jìn)行遺傳篩選具有可行性。C.elegans[3]是一種食細(xì)菌的線性動(dòng)物,因其尺寸小、身體透明易觀察、生活史時(shí)間短和易于培養(yǎng)等優(yōu)勢(shì),成為了生物學(xué)實(shí)驗(yàn)重要的體內(nèi)模式生物[4]。C.elegans從蟲卵發(fā)育到成蟲僅需3~4d,平均壽命大約為2~3周,是研究胚胎發(fā)育的良好載體。小頭激酶2(minibrain kinase 2,mbk-2)可以通過(guò)調(diào)節(jié)微管蛋白從而影響早期胚胎發(fā)育[5],是早期胚胎發(fā)育的重要調(diào)節(jié)蛋白。通過(guò)對(duì)mbk-2 RNAi篩選,發(fā)現(xiàn)了4種mbk-2的增強(qiáng)子(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)。由于RNAi可以有效的避免因某些基因功能缺失所引起的發(fā)育初期卵和幼蟲的死亡,因此RNAi技術(shù)是研究胚胎發(fā)育初期相關(guān)基因的的有力手段。在本研究中,課題組借助RNAi技術(shù)深入的研究了mbk-2其及增強(qiáng)子在胚胎早期發(fā)育過(guò)程中的作用,以期為相關(guān)研究提供理論依據(jù)。
1.1秀麗隱桿線蟲株系:野生型N2、mbk-2突變型線蟲株系和OP50(大腸艾希桿菌)自美國(guó)秀麗線蟲遺傳中心(Caenorhabditis Genetics Center)購(gòu)買。
1.2儀器及試劑:羧芐青霉素(美國(guó)SigmaA6140);氨芐青霉素(上海BBI,A610028);L4440質(zhì)粒(美國(guó)Addgene);氯化鈉、蛋白棟和瓊脂(北京索萊寶)。體式解剖顯微鏡(廈門Motic);低溫高速離心機(jī)(德國(guó)eppendorf);激光共聚焦成像系統(tǒng)(德國(guó)Leica)。
1.3實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1線蟲生長(zhǎng)培養(yǎng)基:稱取1.5g NaCl、10g瓊脂、1.3g蛋白胨,加入487mL ddH2O溶解上述試劑,高壓玻璃紙封口,放入高壓鍋中滅菌。滅菌完成后,待培養(yǎng)基冷卻后加入0.5mL Cacl2(1moL/L)、0.5mL膽固醇(5mg/mL)、0.5mL MgSO4(1moL/L)和12.5mL KPO4(1moL/L)緩沖液,倒入無(wú)菌培養(yǎng)皿中。NGM平板培養(yǎng)基室溫放置2d后,滴加OP50菌,室溫放置后用于培養(yǎng)線蟲培養(yǎng)。
1.3.2線蟲同步化培養(yǎng):將生化培養(yǎng)箱溫度設(shè)定為20℃,線蟲放在NGM培養(yǎng)板上進(jìn)行常規(guī)培養(yǎng)。用2mL Bleach裂解液沖洗NGM培養(yǎng)板,轉(zhuǎn)移秀麗線蟲到1.5mL EP管中,渦旋震蕩,低速離心,棄上清。加入S-basal溶液,震蕩混勻,低速離心,棄上清,重復(fù)至少兩次以上操作。然后,加入S-buffer溶液重懸,放入生化培養(yǎng)箱25℃,恒溫過(guò)夜培養(yǎng)。次日,離心后棄上清,剩余部分混勻,均勻涂在NGM培養(yǎng)基,進(jìn)行培養(yǎng)。觀察線蟲至起進(jìn)入產(chǎn)卵期,將該階段的線蟲挑到NGM培養(yǎng)基培養(yǎng)產(chǎn)卵。培養(yǎng)2~3h后將線蟲(母蟲)挑走,將NGM平板放入生化培養(yǎng)箱進(jìn)行培養(yǎng)。次日,觀察存活情況,待發(fā)育至L4期(成蟲)后進(jìn)行后續(xù)相關(guān)實(shí)驗(yàn)。
1.3.3RNAi干擾試驗(yàn):將含目的基因(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)的RNAi菌株,涂布在LB固體培養(yǎng)基(含抗生素)上,37℃培養(yǎng)15h左右。將LB固體培養(yǎng)基上的RNAi菌落挑至LB液體培養(yǎng)基(含50g/L氨芐青霉素、12.5g/L四環(huán)素和1mmoL/L IPTG)中于37℃震蕩過(guò)夜。次日,將含不同mbk-2增強(qiáng)子的菌液滴加在NGM瓊脂平板上(含100g/L氨芐青霉素、12.5g/L四環(huán)素和1mmoL/L IPTG),室溫誘導(dǎo)過(guò)夜。將上一步中同步化好的N2及mbk-2基因突變線蟲各分為6組,每組3個(gè)亞組,每亞組50只線蟲。在NGM培養(yǎng)基中培養(yǎng)至L4期,喂食含目的基因(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)RNAi菌株,N2野生型及mbk-2基因突變線蟲喂食含L4440空載質(zhì)粒的RNAi菌株。
1.3.4孵化率測(cè)定:取300μL含RNAi菌株的培養(yǎng)基加至培養(yǎng)基平板,進(jìn)行線蟲培養(yǎng)。觀察線蟲發(fā)育至L4期,選取一定數(shù)量的線蟲轉(zhuǎn)移至含有30μL RNAi菌株的新的瓊脂培養(yǎng)基上,孵育24h。將新的成蟲轉(zhuǎn)移到含特定增強(qiáng)子RNAi菌株的新平板上,培養(yǎng)24h后移除成蟲。將平板上的子代放于生化培養(yǎng)箱培養(yǎng)并對(duì)產(chǎn)卵數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),未孵化率=蟲卵數(shù)/產(chǎn)卵數(shù)。
1.3.5線蟲胚胎觀察:線蟲從L1階段喂食含有特定增強(qiáng)子的RNAi菌株,直到線蟲產(chǎn)卵前2d。將事先準(zhǔn)備好的0.4mm瓊脂墊和蓋玻片以及M9緩沖液放入生化培養(yǎng)箱37℃孵育2h。使用移液槍小心滴加2μL的M9緩沖液至蓋玻片,之后解剖10只左右處于產(chǎn)卵期的成蟲,使用凡士林進(jìn)行封片,DIC觀察記錄。通過(guò)DIC觀察,記錄蟲卵補(bǔ)充的分裂階段以及相關(guān)細(xì)胞器的變化。
2.1mbk-2增強(qiáng)子對(duì)N2野生型線蟲蟲卵孵化的影響:與N2+L4440組相比,mbk-2+L4440(RNAi)組蟲卵未孵化率顯著升高(P<0.05)。將含有mbk-2增強(qiáng)子(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)的RNAi細(xì)菌喂養(yǎng)線蟲,觀察抑制mbk-2增強(qiáng)子對(duì)N2野生型線蟲蟲卵孵化率的影響。結(jié)果顯示,喂養(yǎng)pptr-1 RNAi細(xì)菌的N2野生型線蟲蟲卵未孵化率與N2 野生型線蟲蟲卵未孵化率相同,無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;喂養(yǎng)pptr-2、rsa-1和rsa-2 RNAi 細(xì)菌N2野生型線蟲蟲卵未孵化率顯著高于N2+L4440 組(P<0.05)。見表1。
表1 N2野生型線蟲RNAi蟲卵未孵化率
2.2沉默mbk-2增強(qiáng)子對(duì)mbk-2突變型線蟲蟲卵孵化的影響:我們采用pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2的RNAi細(xì)菌喂養(yǎng)mbk-2突變型線蟲,觀察抑制pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2對(duì)mbk-2突變型線蟲的影響。結(jié)果顯示,沉默mbk-2突變型線蟲mbk-2增強(qiáng)子后,四個(gè)沉默組蟲卵未孵化率相較于mbk-2突變型線蟲顯著升高,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。與mbk-2+pptr-1(RNAi)組相比,其余增強(qiáng)子沉默組蟲卵未孵化率顯著升高,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。結(jié)果顯示pptr基因中pptr-2增強(qiáng)子未孵化率顯著高于pptr-1增強(qiáng)子(P<0.05)。同時(shí)rsa基因中rsa-2增強(qiáng)子未孵化率顯著高于rsa-1增強(qiáng)子(P<0.05)。見表2。
表2 mbk-2突變線蟲RNAi蟲卵孵化率統(tǒng)計(jì)
2.3rsa-2和pptr-2基因沉默對(duì)mbk-2突變型線蟲胚胎發(fā)育表型的影響:為了進(jìn)一步研究mbk-2及其pptr和rsa增強(qiáng)子基因在胚胎發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控作用,我們分別選取了pptr基因中未孵化率較高的增強(qiáng)子pptr-2和rsa基因中未孵化率較高的增強(qiáng)子rsa-2增強(qiáng)子基因進(jìn)行進(jìn)一步研究。rsa-2和pptr-2 RNAi細(xì)菌喂養(yǎng)mbk-2突變型線蟲,并通過(guò)DIC對(duì)胚胎發(fā)育進(jìn)行觀察。結(jié)果顯示,在胚胎發(fā)育單細(xì)胞階段,mbk-2+rsa-2(RNAi)組相較于其余組在原核遷移方面(原核相遇沒(méi)有接近細(xì)胞后部和原核沒(méi)有移至胚胎中央)存在明顯差異(P<0.05)。在胚胎發(fā)育的四細(xì)胞階段,mbk-2+pptr-2(RNAi)組在細(xì)胞大小差異、多細(xì)胞核和細(xì)胞間接觸異常等方面與其余組有明顯差異(P<0.05)。見表3。
表3 線蟲胚胎發(fā)育表型檢測(cè)
線蟲的生命周期包括胚胎發(fā)育期、生產(chǎn)發(fā)育期、生殖期和生殖后期四個(gè)階段[6]。Sulston第一次描述了C.elegans從受精卵到成蟲的細(xì)胞譜系圖,這也是多細(xì)胞生物唯一的一張細(xì)胞譜系圖,這為其他研究者進(jìn)行胚胎發(fā)育、細(xì)胞凋亡和性別決定等的相關(guān)研究奠定了基礎(chǔ)[7]。基于線蟲胚胎發(fā)育周期短以及發(fā)育圖譜明確的前提下,利用RNAi技術(shù)特異性的沉默與胚胎發(fā)育相關(guān)的靶基因,可以特異性的研究該基因在胚胎發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮的調(diào)控作用。因此,本研究利用RNAi技術(shù)特異性的沉默線蟲mbk-2及其增強(qiáng)子的表達(dá),深入探討其在胚胎早期發(fā)育的調(diào)控作用。
mbk-2在胚胎發(fā)育階段可以發(fā)揮調(diào)控紡錘體方向、原核遷移和微管穩(wěn)定性等作用,對(duì)于胚胎的早期發(fā)育至關(guān)重要。結(jié)果顯示,抑制mbk-2增強(qiáng)子可以顯著提高蟲卵未孵化率,進(jìn)一步證明了mbk-2及其增強(qiáng)子在胚胎發(fā)育早期階段發(fā)揮重要的作用。然而,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示抑制pptr-1的表達(dá),蟲卵未孵化率(0)與N2野生型沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。我們猜測(cè),可能是線蟲體內(nèi)有其它蛋白可以起到同等的替代作用或者是其增強(qiáng)作用不顯著,在后續(xù)研究中我們將對(duì)其進(jìn)行深入研究。表1中結(jié)果顯示,除pptr-1外,其余三個(gè)增強(qiáng)子均可導(dǎo)致野生型線蟲蟲卵未孵化率升高,這表明其余三個(gè)增強(qiáng)子存在mbk-2基因以外調(diào)節(jié)胚胎發(fā)育的途徑。
本研究結(jié)果顯示mbk-2基因的調(diào)控作用對(duì)其增強(qiáng)子有較強(qiáng)的依賴作用。然而如表2中顯示,在mbk-2突變型線蟲中增強(qiáng)子pptr-1喂食組蟲卵未孵化率為3.78±0.14%,而野生組為0。以上結(jié)果表明,mbk-2基因可能是pptr-1調(diào)控胚胎發(fā)育所必需的。文獻(xiàn)指出,rsa-1、pptr-1和pptr-2是蛋白磷酸化酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)的亞單位,而PP2A是細(xì)胞有絲分裂的調(diào)節(jié)酶,與細(xì)胞進(jìn)入有絲分裂周期、染色體向中板集合以及紡錘體集中的管卡密切相關(guān)[8]。rsa-1和rsa-2形成的復(fù)合物(RSA復(fù)合物)在有絲分裂紡錘體的形成中起作用,同時(shí)RSA復(fù)合物可以被募集至中心體中[9],從而發(fā)揮調(diào)節(jié)有絲分裂的作用。我們猜測(cè),mbk-2增強(qiáng)子可能也通過(guò)以上途徑發(fā)揮調(diào)節(jié)早期胚胎發(fā)育的功能。選取pptr基因中未孵化率較高的增強(qiáng)子pptr-2和rsa基因中未孵化率較高的基因rsa-2進(jìn)行影像分析。于是我們采用DIC觀察pptr-2和rsa-2組在胚胎早期不同階段的作用。以上結(jié)果揭示,pptr-2和rsa-2通過(guò)與mbk-2相互作用在胚胎發(fā)育階段均可發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,然而其調(diào)節(jié)的階段可能不同,后續(xù)我們也將進(jìn)一步研究mbk-2及其不同增強(qiáng)子在有絲分裂過(guò)程中的具體調(diào)節(jié)作用。