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      斯萬特·帕博:非典型“諾二代”

      2022-11-17 02:06:33何承波
      南風窗 2022年21期
      關(guān)鍵詞:索瓦人尼安德特人

      何承波

      今年的諾貝爾自然科學獎“生理學或醫(yī)學獎”有些冷門,給了人類進化遺傳學。

      獲獎?wù)咧挥幸晃唬鸬溥M化遺傳學家斯萬特·帕博,古遺傳學的創(chuàng)始人之一—也意味著,折合人民幣640多萬元的獎金,由他一人獨享,也是該獎項近年少見的情況。

      同時,這也是進化遺傳學在該獎項上的首次問鼎。

      學科雖然冷門,但斯萬特·帕博卻是一個明星級的學者。他上過《花花公子》,寫過暢銷書,還參與電視節(jié)目。學術(shù)成就上,他對古人類基因和人類進化的研究,也確實是開創(chuàng)性的,刷新了我們對人類起源的認知。

      帕博的研究,看上去就是“不可能任務(wù)”。他對 3萬年前的尼安德特人進行基因測序,這多少有點瘋狂了。畢竟,1856年尼安德特人被發(fā)現(xiàn)以來,他們到底是獨立物種,還是我們祖先智人的亞種?100多年來,這些謎團只能依靠化石去拼湊,以至懸而未決。

      但帕博研究表明,尼安德特人其實是現(xiàn)代人類的親戚。

      當然,帕博也并未止步于此。一如諾獎委員會的評價,通過帕博的開創(chuàng)性工作,我們確認了智人和已滅絕親屬之間的基因差異,如今密集的研究,正在解釋是什么使我們成為獨特的人類。

      我們的祖先,是否真的是野蠻殘暴的侵略者,橫掃了整個星球?如果不是,他們又如何與其他物種互動,他們交配嗎?我們的糖尿病、抑郁癥、煙癮、皮膚病,這些基因又從何處繼承?

      換句話說,與其他物種的互動,如何造就了人類自身的進化優(yōu)勢與劣勢?

      但對于帕博來說,酷,才是一切的標準。在他進入學術(shù)界的早期,用基因技術(shù)研究古人類,是一項不務(wù)正業(yè)的妄想,但這些謎團勾引著他的好奇心,逐漸形成一個瘋狂的夢想。

      這項工作極具挑戰(zhàn),如同在巨型垃圾填埋場里,尋找碎紙機處理過的紙屑,并把它們重新拼接成一本書。而帕博面對的,是橫跨數(shù)萬年的混亂時空。

      瘋狂的計劃

      2006年7月,斯萬特·帕博公布了一項空前的計劃:對整個尼安德特人的基因組進行測序。

      他是馬克斯·普朗克進化人類學研究所的遺傳學負責人,他計劃跟美國454生命科學公司合作,開發(fā)一種高通量的測序機—一次可以復(fù)制數(shù)萬個DNA片段。

      帕博專注尼安德特人DNA研究十多年了。過去測序技術(shù)不發(fā)達,每次只能測出百來個樣本,可讀取的核苷酸序列嚴重受限。要知道,人類基因組擁有32億對堿基,要測完整何其困難。

      進入新世紀,人類、黑猩猩、大小鼠等生物的完整基因組序列已經(jīng)公布。此時正值尼安德特人被發(fā)現(xiàn)150周年,帕博雄心勃勃,勢必在2年內(nèi)拿下。

      《經(jīng)濟學人》對此評價:“很有膽量的研究?!?/p>

      問題是,尼安德特人滅絕起碼3萬年了。要找到足夠的DNA,成了最大的挑戰(zhàn)。在他拿到的基因信息中,遠不足以重組整個基因組。

      后來,他找到了一組來自克羅地亞的骨頭,它們屬于三位尼安德特女性,這帶來了希望。

      2006年底,他報告說,他們成功完成了100萬個堿基對的測序。尼安德特人完整的基因組由30億個堿基對組成,以此推斷,機器運行6000次,兩年時間,可如期完成。

      但隨后發(fā)現(xiàn),這100萬堿基對被人類DNA污染了,而且骨頭中80%的DNA屬于各種微生物,這基本宣告了計劃的無效。這讓他們感到絕望。

      污染,是古DNA測序最頭疼的問題。早在1990年,帕博就意識到污染的嚴重性。在慕尼黑大學開啟科研生涯之初,他就以偏執(zhí)的態(tài)度,堅持先建世界上第一間潔凈室。他還制定嚴苛的行為準則,避免環(huán)境中的DNA片段與古DNA混淆。

      盡管馬克斯·普朗克研究所也配備了高規(guī)格的潔凈室,但眼下,類似問題還是無法避免,以致項目停擺了一年多。

      帕博覺得這一點很酷,尼安德特人并未滅絕,而是在我們身上“活”了一部分。

      又過了兩年,帕博擁有了足夠的DNA序列,但新的問題又產(chǎn)生了。篩查測序機產(chǎn)生的數(shù)據(jù)—一長串A、T、G、X列表時,團隊成員發(fā)現(xiàn)了怪異的現(xiàn)象:尼安德特人的序列,與現(xiàn)代歐洲人序列非常相似,而且這個相似度要遠高于其他種族的人類。歐洲人、亞洲人與尼安德特人共享的DNA,比非洲人多。

      常規(guī)的認知是,這是似乎不可能的;“又一起污染事件”,團隊成員如此懷疑,他們試圖消除這個“錯誤”結(jié)果。

      過去20多年,“走出非洲”是一種絕對主導(dǎo)的理論。學術(shù)界也提出單一起源的假說,認為現(xiàn)代人是20萬年前某支非洲智人群體的后裔。在大約距今12.5萬年到6萬年間,他們離開非洲大陸。6萬年前,他們進入東亞,距今5萬年前,他們來到南亞,距今4萬年前,他們遷到澳大利亞,擴張到早期直立人從未到達的領(lǐng)域。

      一段時間后,這些智人一步步取代了本土的早期人類群體,不僅包括歐洲的尼安德特人,還有亞洲的直立人,乃至北京猿人的后代,均被這一支智人替代或滅絕。 他們呈現(xiàn)出強烈侵略擴張的意愿,與其他并存的古人類是一種直線關(guān)系—取代與被取代。這種戲劇性的說法,在大眾媒體上極具魅惑力。

      基于此,科學家也相信,當尼安德特人出現(xiàn)與人類相似的基因序列時,這種可能是某種實驗事故,而非一種“真相”。帕博沒有氣餒,他重新投入反反復(fù)復(fù)的測試,數(shù)據(jù)量越來越大,一種具有統(tǒng)計學意義的結(jié)論,成立了。

      非洲以外的人,都帶有1%~4%的尼安德特人的基因。智人祖先在“取代”尼安德特人前,曾與他們“同床共枕”,發(fā)生了性關(guān)系。他們不僅交配了,還將某些遺傳信息保留了下來,融入現(xiàn)代人類社會。他們的孩子,遍布了歐洲、亞洲和各種新大陸。

      盡管現(xiàn)代人類已經(jīng)同化了許多祖先的基因,但尼安德特人的基因所發(fā)揮的作用,依然不可忽視。研究表明,現(xiàn)代人泛濫成災(zāi)的抑郁癥、尼古丁成癮,皮膚疾病、膽固醇和維生素D的水平,乃至膚色和頭發(fā)變化,都與尼安德特人的基因相關(guān)。尼安德特人用以抵御饑餓的基因,也成了增加我們糖尿病的易感性。當然,事情也不全是壞的,尼安德特人留下的某些基因,也有助于免疫系統(tǒng)抵御疾病。

      只是,取代尼安德特人的,值得重新商榷。

      帕博覺得這一點很酷,尼安德特人并未滅絕,而是在我們身上“活”了一部分。

      非典型諾二代

      “酷”是帕博的口頭禪。

      在媒體訪問中,他不止一次地說,最酷的事情,莫過于探究尼安德特人與我們之間的關(guān)系。

      帕博很小就展現(xiàn)出他對古老事物的迷戀。

      1955年,他出生在瑞典斯德哥爾摩。母親是化學家,是一位來自愛沙尼亞的難民。很小的時候,他就喜歡去樹林里找古老的陶瓷碎片,把房間擺得滿滿的。十來歲時,他隨母親參觀埃及金字塔,對木乃伊產(chǎn)生了迷戀。他立志成為一名埃及學家,就像后來電影里出現(xiàn)的印第安納·瓊斯那樣。

      上了大學,課程無非是解析象形文字,他覺得沒什么挑戰(zhàn),無聊。受父親的啟發(fā),他改學醫(yī)學,后來,又轉(zhuǎn)學細胞生物學。

      父親在帕博的人生中,是一個特殊的存在。

      母親曾在生物化學家蘇恩·貝格斯特倫的實驗室短暫工作過。帕博則是那段關(guān)系的產(chǎn)物。但貝格斯特倫已有家室,還有個跟帕博同年的兒子魯里克。

      有趣的是,因?qū)η傲邢偎氐难芯?,父親1982年獲得了諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。準確來說,帕博是個諾二代了。

      他在自傳《尼安德特人》中披露,母親從未結(jié)婚,帕博作為“私生子”,每周六才能見一次貝格斯特倫,他們?nèi)淞稚⒉?,或者躲在不被人發(fā)現(xiàn)的地方。這種秘密關(guān)系持續(xù)了近60年,直到2004年貝格斯特倫去世,魯里克才知道自己還有個同父異母的兄弟。

      80年代初,帕博正忙于與病毒相關(guān)的博士論文,這期間,他又開始幻想他心心念念的木乃伊—竟然沒人想過從木乃伊中提取DNA?如果可能,那歷史就有一種全新的打開方式了。

      為了證明可行性,他買了一塊肝臟,把它放在實驗室的烤箱里,加熱到50攝氏度,持續(xù)數(shù)天,模擬成功。他就設(shè)法從東柏林的埃及博物館搞到了木乃伊樣本。害怕導(dǎo)師罵他太傻,他只好晚上偷偷琢磨。

      1984年,他在名不見經(jīng)傳的東德雜志上發(fā)表了成果,在死了2000年的木乃伊兒童的細胞中,他成功檢測到了DNA。在他看來,這可以探究一些深層的問題,比如,是什么導(dǎo)致了法老王朝的變革。

      至少,這也可以解答法老圖坦卡蒙身世之謎—后來還真有人做了,2010年的古DNA研究證實,其父母乃親兄妹。

      回歸正題。

      論文效果不佳,他沒放棄,準備投給英文期刊。1985年,《自然》雜志給了他的木乃伊研究一個封面的待遇,媒體評價不錯,說是生物分子學領(lǐng)域最引人注目的成就。但瑞典的同事們不太看好,叫他趕緊忘了那些干尸,把病毒研究做好。

      80年代初,帕博正忙于與病毒相關(guān)的博士論文,這期間,他又開始幻想他心心念念的木乃伊—竟然沒人想過從木乃伊中提取DNA?

      每個人都告訴他,離開如此重要的領(lǐng)域,去做一件看起來像愛好的事情,真的很愚蠢。但他不做理會,跑到美國加州去,為當時爭議極大的生物學家艾倫·威爾遜做事。威爾遜算得上是分子進化學的先驅(qū),提出“分子鐘”概念,試圖利用基因組數(shù)據(jù)來理解進化事件。

      威爾遜的博士生瑪麗·金回憶道,帕博和威爾遜的共同點,遠不止對古代DNA的興趣。

      90年代初,帕博轉(zhuǎn)向了一個雄心勃勃的項目—尼安德特人的DNA。但問題來了,面對一個極其冷門的學科,很少有博物館館長愿意奉獻一點自家珍藏的骨頭,尤其是這么一個年輕的遺傳學家,一心只想把價值連城的文物鋸成塊。

      交涉了好幾年,他總算搞到了人生中第一塊尼安德特骨頭。那是骨架中的一塊臂骨,他提取了3.5克的樣本,并從線粒體中分離出幾個DNA序列。這一成果再一次為他拿下了重磅封面。馬克斯·普朗克研究所也拋來了橄欖枝,稱要斥資2000萬英鎊,在德國萊比錫打造世界級的人類學研究中心。

      帕博便一直工作于此。直到2010年,他關(guān)于尼安德特人的基因組測序才完成,發(fā)表在《細胞》雜志上,徹底把這門冷僻的學科推到聚光燈下。他的研究,也改寫了人類的進化樹,此后古基因領(lǐng)域的研究層出不窮。

      他成了學術(shù)明星,登上了《花花公子》雜志。他打趣說,這可能是這輩子唯一一個上《花花公子》的機會,不能錯過。同時,他也遭到了很多保守宗教力量的批評。

      他的風趣,在自傳中也有展現(xiàn)。比如,談及自己的性取向,他一直堅信自己是同性戀,直到遇到了現(xiàn)在的妻子,相當“男孩子氣”的科學家琳達·維吉倫特。兩人婚后育有一兒一女。

      重繪演化樹

      帕博和人類進化的故事,還沒有講完?!罢J親”尼安德特人,只是一個起點。

      時間回到2008年。

      某天,帕博接到同事的電話,對方說:“結(jié)果出來了,你最好坐下來,這根手指不是人類的?!毖韵轮?,它可能是來自某種未知人類物種。

      指骨來自丹尼索瓦,一個位于西伯利亞山脈的僻靜洞穴。2008年,一隊考古學家在此發(fā)現(xiàn)了一個小指頭的化石碎片。其歷史,可以追溯到3.5萬年前。很快,它被送到了帕博的實驗室。

      常規(guī)遺傳分析結(jié)果表明,指骨的主人,與同時期當?shù)氐闹侨擞忻黠@區(qū)別,于是被命名為丹尼索瓦人。最終,一番折騰后,帕博和同事們分離出了它的基因組和污染過的病菌DNA,經(jīng)過測序,得到一個完整的遺傳圖譜。

      他們確認,丹尼索瓦人,是一個全新的物種。

      后來,甘肅夏河縣發(fā)現(xiàn)了一份下頜骨化石,經(jīng)測定為丹尼索瓦人,距今已有16萬年。這說明,青藏高原范圍內(nèi),很早就有丹尼索瓦人的活動蹤跡。丹尼索瓦人現(xiàn)身后,中國境內(nèi)發(fā)現(xiàn)的大荔人、金牛山人等,也一度被懷疑是丹尼索瓦人的東亞代表。

      帕博團隊的基因研究揭示,大多數(shù)亞洲人都有丹尼索瓦人的DNA。美拉尼西亞人中,丹尼索瓦人的基因比例甚至高達6%。同時也有證據(jù)顯示,他們與現(xiàn)代人的祖先共同生活了幾千年??梢哉f,丹尼索瓦人跟現(xiàn)代人類的血緣關(guān)系,比尼安德特人更親近。

      單地起源的人類演化史,已經(jīng)不再具有說服力了,必須得到更新和修正。

      到這里,事情變得有趣起來了。

      先做個假設(shè),尼安德特人,生活在歐亞大陸西部,丹尼索瓦人,則居住在該大陸的東部地區(qū),大陸兩端的人類種群,會產(chǎn)生怎樣的交集?

      2015年,牛津大學進化遺傳學家Katerina Douka和Tom Higham拿到了幾塊丹尼索瓦人的骨骼碎片,測年和同位素分析顯示,骨骼迄今已有5萬年歷史,來自一位女性的手臂和腿部,其主人被命名為丹妮。遠在德國的帕博,則負責了丹妮的基因測序,他得出的結(jié)論是:丹妮是一個混血兒。

      丹妮的每對染色體中,一條來自丹尼索瓦人,另一條對應(yīng)尼安德特人。也就是說,丹妮的母親是尼安德特人,父親是丹尼索瓦人。這種案例相當罕見,但卻揭示了一個事實:智人與其他古人類之間的繁衍關(guān)系,比任何人的想象都更復(fù)雜。

      現(xiàn)在可以肯定的是,智人走出非洲前,丹尼索瓦所代表的支系、尼安德特人等不同的人種,已經(jīng)在亞歐大陸上獨立演化了數(shù)十萬年,他們跟智人共同組成了現(xiàn)代人類的祖先。更多的人類近親,也在DNA技術(shù)的幫助下,得以“相認”。

      單地起源的人類演化史,已經(jīng)不再具有說服力了,必須得到更新和修正。人類的進化,并不是一枝一葉,而是相互交織的、密集的叢林。

      這一切,似乎都來自當年那個少年不切實際的天真幻想。

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