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      染色體核型聯(lián)合CNV-seq對(duì)羊水嵌合體的診斷分析

      2022-12-12 06:24:06黃柳萍梁莊嚴(yán)吳偉彪魏楚洪羅小芳吳海燕郭潤(rùn)民趙卓姝
      中國(guó)醫(yī)藥科學(xué) 2022年21期
      關(guān)鍵詞:嵌合體真性核型

      黃柳萍 梁莊嚴(yán) 吳偉彪 魏楚洪 羅小芳 吳海燕 郭潤(rùn)民 趙卓姝▲

      1.廣東醫(yī)科大學(xué)順德婦女兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)遺傳實(shí)驗(yàn)室,廣東佛山 528300;2.廣東醫(yī)科大學(xué)順德婦女兒童醫(yī)院新生兒疾病篩查中心,廣東佛山 528300;3.廣東醫(yī)科大學(xué)順德婦女兒童醫(yī)院產(chǎn)前診斷中心,廣東佛山 528300

      在產(chǎn)前診斷工作中經(jīng)常遇到嵌合體的情形,如何準(zhǔn)確判斷所觀察到的嵌合現(xiàn)象屬于真性嵌合還是假性嵌合,是困擾每一個(gè)產(chǎn)前診斷醫(yī)生的難題。染色體核型是一種傳統(tǒng)方法,通過(guò)計(jì)算核型的數(shù)量算出異常核型的比例來(lái)分辨嵌合體,該方法受培養(yǎng)過(guò)程的影響,也無(wú)法發(fā)現(xiàn)<5 Mb 的染色體異常,具有局限性??截悢?shù)變異測(cè)序(copy number variations-sequencing,CNV-seq)檢測(cè)不需要進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),分辨率高,但是無(wú)法檢出純合區(qū)域、單親二倍體和染色體結(jié)構(gòu)異常[1]。因此,兩種方法的結(jié)合理論上可提高羊水嵌合體的診斷準(zhǔn)確率。本研究納入染色體核型聯(lián)合CNV-seq 診斷嵌合體的病例,分析其診斷結(jié)果,為產(chǎn)前診斷中羊水嵌合體的診斷提供數(shù)據(jù)和經(jīng)驗(yàn)支持。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料

      選擇2019年1月至2021年6月因各種高危因素于廣東醫(yī)科大學(xué)順德婦女兒童醫(yī)院(我院)產(chǎn)前診斷中心就診并進(jìn)行產(chǎn)前診斷的孕婦3163 例作為研究對(duì)象,收集所有的羊水染色體核型分析結(jié)果或CNV-seq 結(jié)果為嵌合體的病例進(jìn)行分析。所有入選孕婦均簽署知情同意書(shū),該研究得到我院產(chǎn)前診斷中心醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。納入標(biāo)準(zhǔn):①單胎妊娠且孕周16~24 周;②有明確產(chǎn)前診斷指征,包括高齡、超聲異常、唐氏篩查異常、不良孕產(chǎn)史等。排除標(biāo)準(zhǔn):①多胎妊娠;②孕周<9 周;③近幾個(gè)月有先兆流產(chǎn)者;④其他侵入性產(chǎn)前診斷有禁忌證者。所有入選孕婦接受由具有遺傳咨詢資質(zhì)的臨床醫(yī)生提供詳細(xì)遺傳咨詢,建立遺傳咨詢病例,記錄孕婦的臨床相關(guān)信息。所有孕婦均在超聲定位后,在無(wú)菌條件下經(jīng)腹壁行羊水穿刺術(shù),取羊水20~25 ml 進(jìn)行相關(guān)檢測(cè)。

      1.2 染色體核型分析

      羊水離心后去上清,細(xì)胞懸液置于37℃ 5%CO2培養(yǎng),帶羊水細(xì)胞貼壁鏡下見(jiàn)多個(gè)克隆即可進(jìn)行收獲。常規(guī)制片,G 顯帶,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)[2],計(jì)數(shù)不少于20 個(gè)分裂相,分析5 個(gè)核型。根據(jù)人類(lèi)細(xì)胞遺傳學(xué)國(guó)際命名體制(ISCN)對(duì)所檢染色體進(jìn)行命名,依據(jù)判讀指南對(duì)染色體結(jié)果進(jìn)行分析和判讀[3]。

      1.3 CNV-seq檢測(cè)

      按照DNA 提取,DNA 文庫(kù)構(gòu)建與測(cè)序,生物信息學(xué)分析的流程進(jìn)行CNV-seq 檢測(cè),分析并記錄相關(guān)數(shù)據(jù)。

      1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

      使用SPSS 22.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料以率(%)表示,采用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行比較,P< 0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 羊水嵌合體檢出率

      3163 例羊水檢出嵌合體43 例,檢出率為1.36%,其中染色體核型檢出嵌合體40 例,檢出率為1.26%,CNV-seq 檢出嵌合體20 例,檢出率為0.63%,染色體核型對(duì)嵌合體的檢出率顯著高于CNV-seq 對(duì)嵌合體的檢出率(χ2=6.731,P=0.009)。

      2.2 染色體核型聯(lián)合CNV-seq對(duì)嵌合體的診斷

      如表1所示,染色體核型與CNV-seq 檢測(cè)結(jié)果相符率為39.53%(17/43),其中性染色體相符率為52.38%(11/21,21 為性染色體嵌合的病例數(shù)),大部分為45,X 嵌合體;常染色體相符率為27.27%(6/22,22 為常染色體嵌合的病例數(shù)),有8、12、13、16、21 號(hào)染色體嵌合。如表2所示,檢測(cè)結(jié)果不相符26 例,其中10 例性染色體嵌合,最多的是45,X嵌合體,其次是47,XXX 嵌合體;16 例常染色體嵌合,有5、9、10、14、18、20、21 號(hào)染色體嵌合,而最多的是18 和21 號(hào)染色體嵌合。

      表1 染色體核型與CNV-seq檢測(cè)羊水嵌合體結(jié)果相符病例

      表2 染色體核型與CNV-seq檢測(cè)羊水嵌合體結(jié)果不相符病例

      3 討論

      產(chǎn)前診斷過(guò)程中經(jīng)常遇到嵌合體的情形,胎兒整個(gè)機(jī)體存在兩種或以上的細(xì)胞系,稱之為真性嵌合體,除此之外還經(jīng)常因?yàn)槟秆廴?、培養(yǎng)過(guò)程中的細(xì)胞畸變等原因出現(xiàn)假性嵌合體的情況[4-5],可能會(huì)錯(cuò)誤地引導(dǎo)孕婦引產(chǎn),所以正確地分辨真假嵌合非常重要。目前,分辨真假嵌合主要有四種方法:①染色體核型分析。通過(guò)計(jì)數(shù)核型的數(shù)量算出異常核型的比例來(lái)分辨嵌合體。這種判斷真假嵌合體的方法有個(gè)巨大的缺陷,有可能是異常細(xì)胞產(chǎn)生了畸變后進(jìn)入羊水中,從而培養(yǎng)物中出現(xiàn)多種異常染色體核型,而誤診為真性嵌合體,也有可能是體外培養(yǎng)或制片過(guò)程中的染色體畸變的細(xì)胞較多,從而異常集落較多而誤診為真性嵌合體[6-7]。②通過(guò)孕晚期臍血細(xì)胞染色體核型分析來(lái)驗(yàn)證或者結(jié)合超聲結(jié)果綜合判斷。相關(guān)研究表明,羊水嵌合體發(fā)生率在0.29%左右,用胎兒組織或臍血來(lái)驗(yàn)證,真嵌合體的比率只有62.5%[8],而對(duì)性染色體嵌合的研究表明[9],用臍血來(lái)驗(yàn)證羊水性染色體嵌合,真性嵌合體只占47.8%(11/23)。張玲玲等[10]推薦在孕晚期采集臍血進(jìn)行復(fù)查,并結(jié)合超聲結(jié)果排除妊娠假性嵌合體,取得一定效果。該方法具有明顯的弊端,首先采集臍血具有一定的概率流產(chǎn),增加了孕婦的風(fēng)險(xiǎn),其次當(dāng)發(fā)生低比例嵌合或性染色體嵌合時(shí),超聲影像不能及時(shí)診斷[11]。③用熒光原位雜交技術(shù)(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)驗(yàn)證。付玉榮等[12]將FISH 應(yīng)用于產(chǎn)前嵌合體的輔助診斷,8 例染色體核型嵌合體結(jié)果中有3 例與FISH 結(jié)果不一致。FISH 將熒光素標(biāo)記核酸探針與待測(cè)樣本中的核酸序列雜交,實(shí)驗(yàn)周期短,成功率高,但是特異性探針價(jià)格高,并不是所有醫(yī)療機(jī)構(gòu)都有條件開(kāi)展該項(xiàng)目,探針的局限性也決定其不能對(duì)染色體結(jié)構(gòu)異常進(jìn)行檢測(cè)[13],從而限制了該技術(shù)的應(yīng)用。④應(yīng)用CNV-seq 檢測(cè)嵌合體,理想條件下可檢測(cè)出低至5%的染色體非整倍體嵌合,臨床條件下可檢出超過(guò)10%的染色體非整倍體嵌合[14],同時(shí)可以客觀地檢測(cè)出微缺失、微重復(fù),不像核型分析那樣主觀觀察和判斷,可精確檢測(cè)低至10~50 ng 的DNA 樣本,具有很強(qiáng)的臨床適用性。

      本研究納入染色體核型聯(lián)合CNV-seq 診斷嵌合體的病例,分析結(jié)果顯示,染色體核型和CNV-seq結(jié)果相符率只有39.5%(17/43),其中性染色體相符率為52.38%(11/21),崔科等[15]研究發(fā)現(xiàn)染色體核型聯(lián)合CNV-seq 檢測(cè)性染色體嵌合體的符合率為78.57%,雖高于本研究結(jié)果,但符合率仍有待提高。常染色體相符率僅為27.27%(6/22)。染色體核型檢出而CNV-seq 未檢出的原因很可能是因?yàn)榈捅壤逗铣鯟NV-seq 的檢測(cè)下限,特別是常染色體嵌合,染色體核型檢出的嵌合比例都在6%以下(19、23 號(hào)病例除外,可能是細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中異常細(xì)胞優(yōu)勢(shì)生長(zhǎng),或是染色體制片過(guò)程中隨機(jī)收獲到了更多的異常細(xì)胞,導(dǎo)致嵌合比例假性增高),18號(hào)病例mos 45,X[25]/46,X,psu dic(X)(q25)[31]屬于X 單體嵌合結(jié)構(gòu)異常的psu dic(X),整體數(shù)量還是相當(dāng)于兩條X 染色體,因此CNV-seq 不能檢出。染色體核型未檢出而CNV-seq 檢出的嵌合體病例有3 例,均為常染色體嵌合,常染色體異常的細(xì)胞培養(yǎng)可能生長(zhǎng)過(guò)程緩慢,所以導(dǎo)致染色體核型未檢出而CNV-seq 檢出。可見(jiàn),染色體核型聯(lián)合CNV-seq 診斷嵌合體,可確認(rèn)一部分真性嵌合(檢測(cè)結(jié)果一致時(shí)),可檢出傳統(tǒng)染色體核型未檢出的嵌合體(病例28、29、30)。還有一部分檢測(cè)結(jié)果不相符的病例可懷疑假性嵌合,可通過(guò)FISH 驗(yàn)證或孕晚期采集臍血進(jìn)一步驗(yàn)證。從嵌合比例的分布上看,43 個(gè)病例中,染色體核型檢出嵌合比例≥10%的病例有15例,其中13例與CNV-seq檢測(cè)結(jié)果相符,2 例不相符;染色體核型檢出嵌合比例<10%的病例有28 例,其中只有4 例與CNV-seq 檢測(cè)結(jié)果相符,24 例不相符;可見(jiàn)低比例嵌合更容易造成檢測(cè)結(jié)果不相符,更需要不同的方法來(lái)相互驗(yàn)證。CNV-seq 檢出嵌合比例≥10%的病例有20 例,其中17 例與染色體核型檢測(cè)結(jié)果相符,3 例不相符;而CNV-seq 檢出嵌合比例<10%的病例為0,可能是臨床條件下CNV-seq很難檢出<10%的嵌合,與前人研究結(jié)果相符[14]。

      本研究納入嵌合體病例數(shù)量有限,有待進(jìn)一步納入更多病例以豐富臨床數(shù)據(jù)。嵌合體的診斷一直是產(chǎn)前診斷中的難題,隨著新技術(shù)的發(fā)展,可將染色體核型、CNV-seq、FISH、基因芯片等更多的技術(shù)應(yīng)用于產(chǎn)前嵌合體的診斷中,將會(huì)獲得更準(zhǔn)確的結(jié)果。本研究通過(guò)染色體核型和CNV-seq 的聯(lián)合診斷,提前確認(rèn)真性嵌合,避免孕婦后期復(fù)查臍血,減少孕婦焦慮,為產(chǎn)前診斷與遺傳咨詢工作提供巨大幫助。

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