唐藝瑋
(四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,四川 成都 610000)
茄科雷爾氏菌又名青枯菌,是一種土壤傳播的細菌病原體,是世界上許多作物生產(chǎn)的主要限制因素。該菌是馬鈴薯褐腐病,番茄、煙草、茄子的細菌性枯萎病或南方枯萎病的致病因子。整個物種的宿主范圍很廣,但物種內(nèi)不同的致病種會根據(jù)宿主的偏好發(fā)生。通常病原菌會侵染包括44 科在內(nèi)的數(shù)百種植物,以及茄科中具有重要經(jīng)濟價值的寄主植物[1]。
由于茄科雷爾氏菌的眾多致病性決定因素、廣泛的宿主范圍和強大的生存能力,使得控制青枯病變得困難,特別是應(yīng)用化學(xué)品和物理治療。銅化合物和其他農(nóng)用化學(xué)品的應(yīng)用對環(huán)境有很大的影響,并且通常與細菌耐藥性的出現(xiàn),甚至與可行但不可以培養(yǎng)的狀態(tài)有關(guān)。因此世界上很多國家開始實施了許多生物防治的方法,而這些防治策略具有環(huán)境友好的優(yōu)點。現(xiàn)有的生物防治方法主要是利用拮抗微生物以及噬菌體兩種途徑。
青枯病有馬鈴薯褐腐病、噴霧劑眼病、煙草格蘭維爾青枯病、香蕉莫科病和其他描述性名稱。據(jù)統(tǒng)計,受青枯病影響的植物包括但不限于以下作物,例如,主要作物馬鈴薯、水果作物如香蕉和西紅柿、油料作物向日葵和花生、香料作物、飼料、花卉、鐵木和桉樹以及許多觀賞性的植物。其可以感染50 多個科的450 多個作物的物種。青枯菌可在植物次生根的根端和腋部等滲出部位定植。隨后在細胞間感染內(nèi)皮層和維管薄壁組織,然后侵入原生木質(zhì)部血管,最終導(dǎo)致細胞壁的降解。青枯菌是植物致病菌中第二大破壞性病原菌,會導(dǎo)致嚴重的經(jīng)濟后果。Elphinstone 在2005 年報告青枯病造成的年度損失估計為10 億美元。在青枯菌物種復(fù)合體中的細菌與新的寄主聯(lián)系在一起,在世界范圍內(nèi)對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成嚴重威脅。此外,由于青枯病的防治價值高,危害性大,在發(fā)達國家農(nóng)業(yè)經(jīng)濟中的貨幣損失是非常大的,僅美國土豆和番茄產(chǎn)業(yè)的價值分別為37 億美元和16.7 億美元。而且這種病原體很容易通過灌溉用水、農(nóng)具和作物碎片傳播,對發(fā)展中國家的自給農(nóng)業(yè)也會構(gòu)成嚴重威脅。
青枯病的病害癥狀表現(xiàn)為整個植物突然枯萎,一般莖橫截面會出現(xiàn)黏液狀的細菌滲出液,香蕉莫科病和馬鈴薯褐腐病在香蕉果實和馬鈴薯塊莖上還會出現(xiàn)明顯的細菌定植[2]。
作為一種高度多樣化的病原體,青枯病病原菌被認為是一個物種綜合體(RSSC),數(shù)百種基因上有截然不同的茄科雷爾氏菌。歷史上,物種復(fù)合體被松散地根據(jù)寄主范圍劃分為種,根據(jù)從碳水化合物中產(chǎn)生酸的能力劃分為生物變種。
隨著分子工具的發(fā)展,近10 年來茄科雷爾氏菌的分類發(fā)生了很大的變化。2005 年,F(xiàn)egan&Prior 在分析了ITS(internal transcription spacer)區(qū)域、超敏反應(yīng)、致病機理B(hrpB)和內(nèi)切葡聚糖酶(endoglucanase,egl)基因序列的基礎(chǔ)上,提出了一種新的分級分類。分析從世界各地分離到的140 株茄科雷氏菌菌株,發(fā)現(xiàn)該菌株可細分為4 個系統(tǒng)類型。這與菌株的地理來源有關(guān),來自亞洲的菌株處于系統(tǒng)型Ⅰ,來自美洲的菌株處于系統(tǒng)型Ⅱ,來自非洲的菌株處于系統(tǒng)型Ⅲ,來自印度尼西亞、澳大利亞和日本的菌株處于系統(tǒng)型Ⅳ。而地理隔離和非寄主偏好是青茄菌株分離為4 種系統(tǒng)類型的主要驅(qū)動因素。系統(tǒng)類型本身還可以進一步細分為菌株組,稱為sequevars 或序列變異。到目前為止,已經(jīng)確定了50 多個sequevar。研究發(fā)現(xiàn),新的RSSC 宿主的不斷出現(xiàn)與不斷擴大的系統(tǒng)型I 物種群有關(guān),茄科雷氏菌具有長距離遷移和高重組潛力。此外,RSSC 還能通過其宿主特異性被分為5 個生理小種(Physiological Race),以及對6 種碳源(乳糖、麥芽糖和纖維二糖、甜醇、甘露醇和山梨醇)的利用能力被分成5 個不同的生化型(Biovar):I、II、III、IV 和V[3]。
研究證明,青枯病菌主要致病性決定因素是Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS),此系統(tǒng)是一種注射器狀的膜附錄,將所謂的“效應(yīng)蛋白”(Ⅲ型效應(yīng)蛋白,簡稱為T3E)注射到植物細胞胞漿中以促進感染。Boucher 等(1992)發(fā)現(xiàn)任何大于20 hrp 或hrp 保守基因(hrc,編碼該分子注射器的結(jié)構(gòu)蛋白或調(diào)節(jié)蛋白)缺陷的突變都是非致病性的。胞外多糖(EPS)是一種松散的黏液,含異質(zhì)組成,它在青枯菌的致病性中也起著重要作用。EPS 具備助于木質(zhì)部血管閉塞的強大功效,最終會導(dǎo)致植物萎蔫癥狀。此外,Denny&Baek(1991)發(fā)現(xiàn)EPS 在植物定植中也起重要作用。除這兩種主要的毒力決定因素以外,青枯菌還會產(chǎn)生一系列的其他因素,也有助于結(jié)腸化合癥狀的出現(xiàn)。其中包括Ⅱ型分泌的植物細胞壁降解酶、運動性或附著附體、趨氧轉(zhuǎn)導(dǎo)器、纖維素酶和果膠酶。如Kang 等(2001)研究證明參與抽搐運動、生物膜形成和根系附著的Ⅳ型菌毛,以及負責(zé)游泳運動的鞭毛有助于青枯菌對番茄的毒性。此外,運動和附著似乎在植物入侵過程中也發(fā)揮作用,這是由于大多數(shù)受這些能力影響的突變體在土壤中接種時是低致病性的,但在植物莖中直接接種時表現(xiàn)與野生型菌株一樣。最近Wairuri 等人的報告表明,F(xiàn)lp 菌毛引起的聚集也在青枯菌的致病性中起作用,因為這些菌毛缺乏的突變體會表現(xiàn)出野生型的游泳或抽搐運動,但它會導(dǎo)致馬鈴薯植株萎蔫的能力下降[4]。
已有研究發(fā)現(xiàn)控制青枯菌的主要毒力基因轉(zhuǎn)錄途徑。LysR 家族的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子PhcA 發(fā)揮著核心作用。PhcA 激活EPS 和纖維素酶編碼基因,抑制游泳運動、T3SS 和鐵載體表達。PhcA 通過PehR 抑制一個果膠酶編碼基因的轉(zhuǎn)錄,盡管其也稍微激活其他果膠酶基因的表達。此外,全局調(diào)控因子PhcA 的轉(zhuǎn)錄受青枯菌特異性細胞密度依賴機制的控制,包括內(nèi)膜蛋白PhcB 產(chǎn)生的3-羥基棕櫚酸甲酯(3-OH PAME)。在低細胞密度時,PhcA 的表達被PhcR 通過轉(zhuǎn)錄后機制抑制。當(dāng)3-羥基棕櫚酸甲酯的數(shù)量由于限制或細菌密度超過107 個細胞/mL 而增加時,分子激活了PhcS/PhcR雙組分系統(tǒng)。然后,PhcR 被磷酸化,PhcA 表達被去抑制。在高細胞密度條件下,PhcA 活化的主要結(jié)果之一是產(chǎn)生大量EPS。這種控制作用通過誘導(dǎo)XpsR 發(fā)揮作用,XpsR 直接激活EPS 操縱子的轉(zhuǎn)錄。已有研究表明,雙組分調(diào)控系統(tǒng)VsrA/VsrD 也需要完全激活xpsR 轉(zhuǎn)錄,進而激活EPS 合成。另一種雙組分體系VsrB/VsrC也被描述為控制EPS 合成和抑制果膠酶pglA 的轉(zhuǎn)錄,增加對EPS 合成的另一層控制。因此,XpsR 是EPS 調(diào)控的中心開關(guān),其整合了VsrAD&PhcA 的輸入,直接調(diào)控EPS 啟動因子,是EpsR 陰性調(diào)控和VsrC 陽性調(diào)控所必需的。T3SS 的調(diào)控證明,在進化過程中,水平轉(zhuǎn)移的操縱因子可以協(xié)同受體細菌中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,在青枯菌中,AraC-型調(diào)控因子HrpB 及其上游OmpR-樣雙組分響應(yīng)調(diào)控因子HrpG 控制hrp/hrc 基因的表達。HrpB 直接觸發(fā)T3SS 基因的轉(zhuǎn)錄,可能會與啟動因子區(qū)域發(fā)現(xiàn)的hrpII 核子結(jié)合,其表達受HrpG 控制。當(dāng)細菌檢測到植物細胞壁成分時,會觸發(fā)HrpG 特異性誘導(dǎo)的上游調(diào)控因子,這是青枯菌所特有的。PrhA是感知這一信號的外膜受體,并通過連續(xù)誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子PrhJ、HrpG&HrpB,將其轉(zhuǎn)移到膜相關(guān)蛋白PrhI&PrhR,從而觸發(fā)hrp/hrc 的表達[5]。
目前青枯病生物防治主要集中在拮抗微生物(一般包括病原體和其他細菌物種菌株的無毒突變體)以及噬菌體的使用上。下面討論青枯病通過青枯菌的拮抗菌和噬菌體兩種途徑的生物防治。
植物根際促生長細菌(PGPR)是存在于植物根際的一類兼有促生和生防功效的根際自生細菌。Maji&Chakrabartty(2014)研究發(fā)現(xiàn),PGPR 與植物根系以及根際其他微生物會相互作用,具有潛在的青枯病抑制作用,使病原微生物水平處于控制或低于閾限。因此,PGPR 被認為可以促進植物生長并控制青枯病,利用其進行的生物防治屬于青枯菌拮抗菌的防治。
Beneduzi 等(2012)發(fā)現(xiàn),PGPR 通過直接和間接的方式來促進植物生長。其直接機制包括氮的固定,產(chǎn)生螯合鐵的鐵載體,并使其作用于植物根系,促進磷增溶以及植物激素合成;間接機制是通過抑制植物病原體來促進植物生長,而PGPR 還利用多種作用方式來抑制青枯病病原體的生長,如產(chǎn)生抗生素起拮抗作用,產(chǎn)生鐵載體螯合鐵,生成HCN 進行空間和養(yǎng)分的競爭以及系統(tǒng)性抗性的誘導(dǎo)。此外,某些特定PGPR 有可能是通過使用其中任何一種或多種機制來影響植物生長的[6]。
Abd El-Rahman 等(2002)證明,假單胞菌屬具備很多適合作為PGPR 的特性,并且與青枯菌成拮抗作用,能抑制青枯病的發(fā)生。其中最有效的是熒光假單胞菌屬,其次為菜豆假單胞、蠟樣假單胞和枯草假單胞,而且只有熒光假單胞菌能產(chǎn)生氰化氫(HCN)和鐵載體。根際產(chǎn)生促生長激素的鐵載體存在增加了植物對Fe3+的供應(yīng),促進了植物生長,從土壤中螯合Fe3+會抑制競爭性微生物的活性。HCN 在病原菌生物防治中發(fā)揮了有效作用。生物以HCN 形式分泌氰化物離子,這些離子代謝成較少的化合物。HCN 通過阻止電子的傳輸和停止向細胞提供能量而導(dǎo)致生物體死亡。其能夠抑制酶的功能和起首細胞色素氧化酶的作用,而且還可以可逆地抑制機制受體。此外,當(dāng)根瘤菌以非特異性關(guān)系定植于非豆科植物的根部時,該屬菌株也能表現(xiàn)為PGPR,其中芽孢桿菌是根際中最常見的屬。Akintokun等(2019)發(fā)現(xiàn)蘇云金芽孢桿菌(Bt)也可用于番茄青枯病的防治。報告表明,混合生物防治微生物可改善生物防治,與單獨使用拮抗菌株或兩種混合使用相比,3 種或4 種拮抗菌株的混合使用出現(xiàn)了最高的生長促進效果。此外,有效的拮抗細菌必須篩選其在自然條件下的表現(xiàn),然后標記為生物防治劑。這是因為在自然條件下,其必須有效地在宿主植物的根際環(huán)境中定植,并需要與土壤微生物區(qū)系爭奪養(yǎng)分[7]。
目前,青枯病生物防治措施的進展對噬菌體(特別是病毒)的興趣日益增加。噬菌體是環(huán)境中調(diào)節(jié)細菌種群數(shù)量最多的微生物,其具有潛在的生物防治作用。
噬菌體對青枯病病原菌具有溶解或溶源作用,溶解性噬菌體增殖會破壞宿主細菌細胞,對目標細菌更有效,而溶原性噬菌體是將其基因組整合到宿主細菌的基因組中并復(fù)制而不破壞細菌細胞。因此,細菌感染性疾病可以通過噬菌體的作用來治療,這是一種生物防治方法,也被稱作噬菌體療法。此方法被認為是一種非常有前途的防治青枯病的策略[8]。
到現(xiàn)在為止,科學(xué)界已經(jīng)發(fā)表了3 項與青枯病生物防治有關(guān)的專利。第一項是Bhunchoth 等(2015)從日本的土壤中分離到3 種具有殺滅病原菌活性的茄根瘤菌噬菌體。其通過測定噬菌體的基因組大小和寄主范圍,初步鑒定該噬菌體對從煙草植物中分離出的6種日本品系青枯菌菌株的侵染能力。第二項是日本科學(xué)家發(fā)現(xiàn)一種名為ΦRSA1 的新型噬菌體,與之前的噬菌體相比,其宿主范圍更廣泛。第三項是日本科學(xué)家開發(fā)了一種預(yù)防青枯病的藥劑和方法,包括將感染Φrsm1 型絲狀噬菌體的菌株M4S、Ps29、Ps65 和Ps74,或Φ rsm3型絲狀噬菌體感染的菌株C319、Ps72 和Ps74,分別注射到植株8~105 個細胞/g 處的莖中。這項專利的重點是預(yù)防青枯病,因為注入含有整合在其基因組中的絲狀噬菌體的細菌細胞的植物,顯示出對病原菌的抗性增加至少2 個月[9]。
噬菌體生物生產(chǎn)和配方用于可持續(xù)和環(huán)境友好型農(nóng)業(yè)的生物農(nóng)藥將是必要的。另外,在綜合防治方案中,將噬菌體作為生物防治劑與其他生物防治策略相結(jié)合也是提高對青枯病療效的一種有前途的方法。
青枯病作為重要作物生產(chǎn)的主要病害之一,嚴重威脅著世界范圍內(nèi)的作物生產(chǎn)。而青枯菌具備致病性決定因素眾多、寄主范圍廣、生存能力強等特點。青枯病的生物防治主要利用青枯菌拮抗菌以及噬菌體這兩種途徑。
青枯菌拮抗菌可利用多種作用方式來抑制青枯病病原體的生長。例如,可以產(chǎn)生抗生素起拮抗作用,生成HCN,產(chǎn)生鐵載體螯合鐵,進行空間和養(yǎng)分的競爭以及系統(tǒng)性抗性的誘導(dǎo)等。其中假單胞菌屬中的熒光假單胞菌屬對青枯菌的拮抗作用最強,還包括根瘤菌屬中的芽孢桿菌。此外,混合拮抗菌株的生物防治還可改善青枯病的生物防治效果。
噬菌體對青枯病病原菌具有溶解或溶源作用,其中溶解性噬菌體增殖會破壞宿主細菌細胞,對目標細菌更有效。噬菌體治療青枯病被認為是一種非常有前途的防治青枯病的策略。研究表明,將噬菌體作為生物防治劑與其他生物防治策略相結(jié)合也是提高青枯病防治效果的一種有研究價值的方法[10]。