梁成真,金雙俠
·導(dǎo)讀·
我國耐除草劑棉花研發(fā)與育種應(yīng)用
梁成真1,金雙俠2
1中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所,北京 100081;2華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院/作物遺傳改良全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,武漢 430070
棉花是世界上最主要的天然纖維來源,也是重要的油料和飼料兼用作物,在國民經(jīng)濟(jì)中具有重要的戰(zhàn)略地位[1-3]。經(jīng)過近30年的努力,我國基本解決了棉鈴蟲危害,棉花單產(chǎn)居世界前列,優(yōu)質(zhì)進(jìn)程也明顯加快[4]。近年來,草害上升為我國棉花生產(chǎn)的主要危害之一。棉田雜草不僅競爭水分、養(yǎng)分和光照,而且滋生病害和蟲害,嚴(yán)重影響棉纖維的產(chǎn)量和品質(zhì),給棉花生產(chǎn)帶來極大危害[5-6],成為亟待解決的產(chǎn)業(yè)問題。1996年全世界第一例轉(zhuǎn)基因耐除草劑大豆GTS40-3-2商業(yè)化以來,耐除草劑作物在玉米、大豆和棉花等作物中得到廣泛的應(yīng)用[7]。目前,具有耐除草劑性狀作物占全球轉(zhuǎn)基因作物種植面積的80%左右[7-9]。美國率先通過導(dǎo)入用根癌農(nóng)桿菌(sp. CP4)5-烯醇式丙酮酰莽草酸-3-磷酸合成酶(5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase,EPSPS)編碼基因獲得耐草甘膦除草劑棉花,并于1997年商業(yè)化種植。由于其顯著的經(jīng)濟(jì)、社會(huì)和生態(tài)效益,耐除草劑棉花全美種植面積占比從1997年的3.2%增加到2005年的60%,目前穩(wěn)定在90%左右[7-9]。近年來,我國在耐除草劑新基因克隆和耐除草劑棉花種質(zhì)創(chuàng)制等方面都取得顯著的進(jìn)展,且部分耐除草劑種質(zhì)已進(jìn)入農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全性評(píng)價(jià)流程[10],但是,我國自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的耐除草劑棉花產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用仍然滯后。本專題展示了我國耐除草劑棉花創(chuàng)制和轉(zhuǎn)基因安全性評(píng)價(jià)的研究進(jìn)展,以期加快國產(chǎn)耐除草棉花的育種應(yīng)用,為培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)高抗棉花新品種提供種質(zhì)資源和應(yīng)用指導(dǎo)。
農(nóng)桿菌介導(dǎo)法是棉花廣泛應(yīng)用的遺傳轉(zhuǎn)化方法,具有效率高、拷貝數(shù)低、穩(wěn)定性好等優(yōu)點(diǎn)[11]。然而,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)遺傳轉(zhuǎn)化法進(jìn)行基因操作時(shí),T-DNA整合到植物染色體的位置具有隨機(jī)性,可能會(huì)導(dǎo)致外源或內(nèi)源基因表達(dá)的沉默或功能缺失[12]。陸地棉占棉花總產(chǎn)的95%以上,但由于其基因組是復(fù)雜的異源四倍體,基因組較大且含有高比例的重復(fù)序列[1-3],棉花遺傳轉(zhuǎn)化中T-DNA序列整合位點(diǎn)以及邊界序列的狀態(tài)尚難以精準(zhǔn)的控制。因此,對(duì)比研究轉(zhuǎn)基因作物不同世代的外源基因DNA整合、基因表達(dá)、蛋白表達(dá)、目的性狀及農(nóng)藝性狀等遺傳穩(wěn)定性,是轉(zhuǎn)基因作物商業(yè)化應(yīng)用的前提[13]。本專題論文《耐除草劑棉花GGK2的遺傳穩(wěn)定性分析及性狀鑒定》[14]對(duì)連續(xù)3代轉(zhuǎn)基因棉花GGK2的檢測結(jié)果顯示,外源目的基因穩(wěn)定的整合到棉花基因組中,目的基因、和篩選標(biāo)記基因的拷貝數(shù)、蛋白表達(dá)量、草甘膦耐受性以及農(nóng)藝性狀等在不同代際間均無顯著差異,并且轉(zhuǎn)基因棉花GGK2能夠耐受田間使用中劑量4倍的草甘膦濃度,農(nóng)藝性狀和營養(yǎng)品質(zhì)與對(duì)照組相比無顯著差異,達(dá)到了生產(chǎn)用耐除草劑棉花對(duì)草甘膦除草劑的耐受水平。未來,與生產(chǎn)中廣泛應(yīng)用的國產(chǎn)抗蟲棉品種雜交,可獲得同時(shí)抗棉鈴蟲和耐除草劑的棉花新品種??傊?,轉(zhuǎn)基因棉花GGK2是高耐除草劑且穩(wěn)定遺傳的轉(zhuǎn)基因材料,目前已經(jīng)進(jìn)入轉(zhuǎn)基因安全性評(píng)價(jià)生產(chǎn)應(yīng)用證書申報(bào)階段,具有廣闊的產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用前景。
草甘膦除草劑自1974年商業(yè)化以來,成為世界上用量增長最快、生產(chǎn)量最大的農(nóng)藥,目前年用量100萬t左右,占全世界除草劑市場份額的30%以上[7-10]。近年來,除了之外,從抗草甘膦的微生物中分離鑒定到數(shù)個(gè)類基因并應(yīng)用于耐除草劑作物的培育,如[15]、[16]、[6]、[10]等。盡管都屬于EPSPS類蛋白,但是它們和CP4 EPSPS序列相似性相對(duì)較低,因此,能夠獲得專利權(quán),為培育具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的耐除草劑作物提供了基因基礎(chǔ)。本專題論文《轉(zhuǎn)+耐草甘膦優(yōu)異棉花種質(zhì)系的創(chuàng)制及其特性》[17]利用耐輻射奇球菌()EPSPS基因轉(zhuǎn)化中棉所49,獲得3個(gè)穩(wěn)定遺傳的單拷貝整合的轉(zhuǎn)化體ZD131、ZD185和ZD207,T-DNA插入位點(diǎn)分別在D7、D13和A12染色體。3個(gè)轉(zhuǎn)基因株系均耐受4倍田間草甘膦推薦劑量且生長發(fā)育正常。有意思的是,轉(zhuǎn)基因株系棉鈴大小、衣分、結(jié)鈴性等產(chǎn)量性狀和纖維品質(zhì)均優(yōu)于對(duì)照組,說明其具有較好的應(yīng)用潛力。本專題另外一篇論文《轉(zhuǎn)基因抗草甘膦棉花R1-3株系的分子特征鑒定》[18]利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化基因,獲得穩(wěn)定遺傳的耐草甘膦除草劑棉花R1-3。同樣,R1-3棉花中T-DNA為單拷貝插入,整合位點(diǎn)在A11或D11染色體基因間隔區(qū),未破壞受體棉花的內(nèi)源基因,也未發(fā)現(xiàn)對(duì)插入位點(diǎn)附近基因表達(dá)的影響。ZD系列和R1-3等耐除草劑棉花的創(chuàng)制,豐富了我國自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)耐除草劑棉花種質(zhì)資源的儲(chǔ)備,與GGK2棉花共同形成了國產(chǎn)耐除草劑棉花產(chǎn)業(yè)應(yīng)用的梯隊(duì)系列產(chǎn)品,為保障我國耐除草劑棉花穩(wěn)定健康發(fā)展奠定了資源基礎(chǔ)。
盡管草甘膦是全球第一大除草劑品種,但是長期大面積使用單一類型的除草劑,容易導(dǎo)致雜草抗藥性、基因逃逸、藥害殘留等問題[19]。研發(fā)安全高效且環(huán)境友好的新型除草劑,培育與之相匹配的抗性作物是未來解決草害問題的發(fā)展方向。近年來,功能基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多組學(xué)的快速發(fā)展為解決雜草危害提供了新的切入點(diǎn)。同時(shí),農(nóng)業(yè)生物技術(shù)的快速發(fā)展,尤其是基因編輯技術(shù)在棉花中的廣泛應(yīng)用[19-28],為培育新型耐除草劑棉花提供了新策略。本專題論文《后基因組時(shí)代發(fā)展抗除草劑作物的機(jī)遇及挑戰(zhàn)》[29]從3個(gè)層面系統(tǒng)綜述了耐除草劑作物的發(fā)展,一是除草劑靶標(biāo)基因與作用機(jī)制研究層面,系統(tǒng)總結(jié)了幾種不同作用機(jī)制的除草劑靶標(biāo)基因,比如植物氨基酸生物合成、植物脂類代謝、植物類胡蘿卜素、質(zhì)體醌和生育酚生物合成途徑的研究進(jìn)展。二是新型耐除草劑基因挖掘與除草劑系統(tǒng)層面,重點(diǎn)介紹了2種挖掘新型抗除草劑基因與除草劑系統(tǒng)的方法,包括基于CRISPR/Cas系統(tǒng)對(duì)作物內(nèi)源除草劑靶標(biāo)基因進(jìn)行定向突變、定向激活法和天然產(chǎn)物與生物體存在共同進(jìn)化理論的抗性基因?qū)蚍āH悄统輨┳魑锱嘤龑用?,系統(tǒng)總結(jié)了3種培育抗除草劑作物方法,包括常規(guī)育種培育法、轉(zhuǎn)基因育種培育法和基于CRISPR/Cas基因組編輯技術(shù)培育法,并且重點(diǎn)介紹了CIRSPR/ Cas系統(tǒng)、堿基編輯技術(shù)和Prime-editing系統(tǒng)在培育抗除草劑作物中的研究進(jìn)展。在后基因組時(shí)代,針對(duì)雜草防治中抗性雜草發(fā)生、環(huán)境安全和基因逃逸等挑戰(zhàn),基因組編輯技術(shù)的快速發(fā)展為雜草防治提供了新策略和機(jī)遇。
[1] Wen X P, Chen Z W, Yang Z R, Wang M J, Jin S X, Wang G D, Zhang L, Wang L J, Li J Y, Saeed S, He S P, Wang Z, Wang K, Kong Z S, Li F G, Zhang X L, Chen X Y, Zhu Y X. A comprehensive overview of cotton genomics, biotechnology and molecular biological studies. Science China Life Sciences, 2023: 1-43.
[2] YANG Z R, QANMBER G, WANG Z, YANG Z E, LI F G. Gossypium genomics: Trends, scope, and utilization for cotton improvement. Trends in Plant Science, 2020, 25(5): 488-500.
[3] HUANG G, HUANG J Q, CHEN X Y, ZHU Y X. Recent advances and future perspectives in cotton research. Annual Review of Plant Biology, 2021, 72: 437-462.
[4] 郭三堆, 王遠(yuǎn), 孫國清, 金石橋, 周燾, 孟志剛, 張銳. 中國轉(zhuǎn)基因棉花研發(fā)應(yīng)用二十年. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2015, 48(17): 3372-3387.
GUO S D, WANG Y, SUN G Q, JIN S Q, ZHOU T, MENG Z G, ZHANG R. Twenty years of research and application of transgenic cotton in China. Scientia Agricultura Sinica, 2015, 48(17): 3372-3387. (in Chinese)
[5] 蔡曉虎, 林萍, 史亞輝, 韓睿, 張玉棟, 吳娜, 王俊剛. 扁稈荊三棱種群密度對(duì)棉花營養(yǎng)物質(zhì)吸收和積累的影響. 棉花學(xué)報(bào), 2020, 32(2): 143-150.
CAI X H, LIN P, SHI Y H, HAN R, ZHANG Y D, WU N, WANG J G. Effects of population density ofon the absorption and accumulation of cotton nutrients. Cotton Science, 2020, 32(2): 143-150. (in Chinese)
[6] 王霞, 馬燕斌, 吳霞, 沈志成, 林朝陽, 李朋波, 孫璇, 王新勝, 李燕娥, 李貴全. 轉(zhuǎn)棉花株系的獲得及分子生物學(xué)鑒定. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2014, 47(6): 1051-1057.
WANG X, MA Y B, WU X, SHEN Z C, LIN C Y, LI P B, SUN X, WANG X S, LI Y E, LI G Q. Molecular biology identification of transgenic cotton lines expressing exogenousgene. Scientia Agricultura Sinica, 2014, 47(6): 1051-1057. (in Chinese)
[7] DUKE S O, POWLES S B. Glyphosate: a once-in-a-century herbicide. Pest Management Science, 2008, 64(4): 319-325.
[8] Bonny S. Genetically modified herbicide-tolerant crops, weeds, and herbicides: Overview and impact. Environmental Management, 2016, 57(1): 31-48.
[9] DUKE S O, POWLES S B. Glyphosate-resistant weeds and crops. Pest Management Science, 2008, 64(4): 317-318.
[10] LIANG C Z, SUN B, MENG Z G, MENG Z H, WANG Y, SUN G Q, ZHU T, LU W, ZHANG W, MALIK W, LIN M, ZHANG R, GUO S D. Co-expression ofandyields herbicide-resistant cotton with low glyphosate residues. Plant Biotechnology Journal, 2017, 15(12): 1622-1629.
[11] SHILO S, TRIPATHI P, MELAMED-BESSUDO C, TZFADIA O, MUTH T R, LEVY A A. T-DNA-genome junctions form early after infection and are influenced by the chromatin state of the host genome. PLoS Genetics, 2017, 13(7): e1006875.
[12] DONG O X, RONALD P C. Targeted DNA insertion in plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118(22): e2004834117.
[13] 李圣彥, 李香銀, 李鵬程, 張明俊, 張杰, 郎志宏. 轉(zhuǎn)基因玉米2HVB5的性狀鑒定及遺傳穩(wěn)定性分析. 生物技術(shù)通報(bào), 2023, 39(1): 21-30.
LI S Y, LI X Y, LI P C, ZHANG M J, ZHANG J, LANG Z H. Identification of target traits and genetic stability of transgenic maize 2HVB5. Biotechnology Bulletin, 2023, 39(1): 21-30. (in Chinese)
[14] 梁成真, 臧有義, 孟志剛, 王遠(yuǎn), Mubashir Abbas, 何海焱, 周琪, 魏云曉, 張銳, 郭三堆. 耐除草劑棉花GGK2的遺傳穩(wěn)定性分析及性狀鑒定. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2023, 56(17): 3251-3260.
LIANG C Z, ZANG Y Y, MENG Z G, WANG Y, MUBASHIR A, HE H Y, ZHOU Q, WEI Y X, ZHANG R, GUO S D. Identification of target traits and genetic stability of transgenic cotton GGK2. Scientia Agricultura Sinica, 2023, 56(17): 3251-3260. (in Chinese)
[15] GUO B F, GUO Y, HONG H L, JIN L G, ZHANG L J, CHANG R Z, LU W, LIN M, QIU L J. Co-expression ofand glyphosate acetyltransferasegenes conferring high tolerance to glyphosate in soybean. Frontiers in Plant Science, 2015, 6: 847.
[16] 梅磊, 陳進(jìn)紅, 何秋伶, 祝水金. 草甘膦對(duì)轉(zhuǎn)基因棉花種質(zhì)系配子育性的影響. 棉花學(xué)報(bào), 2013, 25(2): 115-120.
MEI L, Chen J H, He Q L, Zhu S J. Effect of glyphosate on the gamete fertility of transgenic glyphosate-resistant cotton germplasms with EPSPS-G6. Cotton Science, 2013, 25(2): 115-120.
[17] 王宛如, 曹躍芬, 盛況, 陳進(jìn)紅, 趙天倫, 祝水金. 轉(zhuǎn)+耐草甘膦優(yōu)異棉花種質(zhì)系的創(chuàng)制及其特性. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2023, 56(17): 3261-3276.
WANG W R, CAO Y F, SHENG K, CHEN J H, ZHAO T L, ZHU S J. The creation and characteristics of cotton germplasm lines transgenic+gene with excellent glyphosate tolerance. Scientia Agricultura Sinica, 2023, 56(17): 3261-3276. (in Chinese)
[18] 馬燕斌, 李換麗, 文晉, 周仙婷, 秦欣, 王霞, 王新勝, 李燕娥. 轉(zhuǎn)基因抗草甘膦棉花R1-3株系的分子特征鑒定. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2023, 56(17): 3277-3284.
MA Y B, LI H L, WEN J, ZHOU X T, QIN X, WANG X, WANG X S, LI Y E. Identification of molecular characterizations for transgenic cotton R1-3 line of glyphosate tolerance. Scientia Agricultura Sinica, 2023, 56(17): 3277-3284. (in Chinese)
[19] Li J Y, Manghwar H, Sun L, Wang P C, Wang G Y, Sheng H Y, Zhang J, Liu H, Qin L, Rui H P, Li B, Lindsey K, Daniell H, Jin S X, Zhang X L. Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations and considerable inherent genetic or/and somaclonal variations in CRISPR/Cas9-edited cotton plants.Plant Biotechnology Journal,2019, 17(5): 858-868.
[20] YU L, Li Z S, DING X, ALARIQI M, ZHANG C J, Zhu X Q, Fan S L, Zhu L F, ZHANG X L, JIN S X. Developing an efficient CRISPR/dCas9-TV-derived transcriptional activation system to create three novel cotton germplasm materials. Plant Communications, 2023, 4(4): 100600.
[21] Wang G Y, Xu Z P, Wang F Q, Huang Y F, Xin Y F, Liang S J, Li B, Si H, Sun L, Wang Q Q, Ding X, Zhu X Q, Chen L, Yu L, Lindsey K, Zhang X L, Jin S X. Development of an efficient and precise adenine base editor (ABE) with expanded target range in allotetraploid cotton (). BMC Biology, 2022, 20(1): 45.
[22] Li B, Liang S J, Alariqi M, Wang F Q, Wang G Y, Wang Q Q, Xu Z P, Yu L, Zafar M N, Sun L, Si H, Yuan D J, Guo W F, Wang Y Q, Lindsey K, Zhang X L, Jin S X. The application of temperature sensitivity CRISPR/LbCpf1 (LbCas12a) mediated genome editing in allotetraploid cotton () and creation of nontransgenic, gossypol-free cotton. Plant Biotechnology Journal, 2021, 19(2): 221-223.
[23] Chen Y Z, Fu M C, Li H, Wang L G, Liu R Z, Liu Z J, Zhang X L, Jin S X. High-oleic acid content, nontransgenic allotetraploid cotton (L.) generated by knockout ofgenes with CRISPR/Cas9 system. Plant Biotechnology Journal, 2021, 19(3): 424-426.
[24] Wang Q Q, Alariqi M, Wang F Q, Li B, Ding X, Rui H P, Li Y J, Li J Y, Xu Z P, Qin L, Sun L, Li J Y, Zou J W, Lindsey K, Zhang X L, Jin S X. The application of a heat-inducible CRISPR/Cas12b (C2c1) genome editing system in tetraploid cotton () plants. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(12): 2436-2443.
[25] Manghwar H, Li B, Zhang X L, Jin S X. Strategies to overcome off-target effects by CRISPR/Cas system (2020). Advanced Science, 2020, 7(6): 1902312.
[26] Qin L, Li J Y, Wang Q Q, Xu Z P, Sun L, Alariqi M, Manghwar H, Wang G Y, Li B, Ding X, Rui H P, Huang H M, Lu T L, Lindsey K, Daniell D, Zhang X L, Jin S X. High efficient and precise base editing of C?G to T?A in the allotetraploid cotton () genome using a modified CRISPR/Cas9 system.Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(1): 45-56.
[27] Li B, Rui H P, Li Y J, Wang Q Q, Alariqi M, Qin L, Sun L, Ding X, Wang F Q, Zou J W, Wang Y Q, Yuan D J, Zhang X L, Jin S X. Robust CRISPR/Cpf1(Cas12a) mediated genome editing in allotetraploid cotton (). Plant Biotechnology Journal, 2019, 17(10): 1862-1864.
[28] Wang P C, Zhang J, Sun L, Ma Y Z, Xu J, Liang S J, Deng J W, Tan J F, Zhang Q, Tu L L, Henry D,Jin S X, Zhang X L. High efficient multi-sites genome editing in allotetraploid cotton () using CRISPR/Cas9 system. Plant Biotechnology Journal,2018, 16(1): 137-150.
[29] 吳元龍, 惠鳳嬌, 潘振遠(yuǎn), 尤春源, 林海榮, 李志博, 金雙俠, 聶新輝. 后基因組時(shí)代發(fā)展抗除草劑作物的機(jī)遇及挑戰(zhàn). 中國農(nóng)業(yè)科學(xué), 2023, 56(17): 3285-3301.
WU Y L, HUI F J, PAN Z Y, YOU C Y, LIN H R, LI Z B, JIN S X, NIE X H. Opportunities and challenges for developing herbicide- resistance crops in the post-genomic era. Scientia Agricultura Sinica, 2023, 56(17): 3285-3301. (in Chinese)
Advancements in Herbicide-Tolerant Cotton Research and Breeding in China
LIANG Chengzhen1, JIN Shuangxia2
1Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081;2College of Plant Science & Technology of Huazhong Agricultural University/National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Wuhan 430070
10.3864/j.issn.0578-1752.2023.17.001
2023-07-27;
2023-08-01
國家自然科學(xué)基金(32072115)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)
通信作者梁成真,E-mail:liangchengzhen@caas.cn。通信作者金雙俠,E-mail:jsx@mail.hzau.edu.cn
(責(zé)任編輯 李莉)