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      基于立足點(diǎn)介導(dǎo)的熵驅(qū)動(dòng)雙足DNA 步行器及樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的一步式循環(huán)腫瘤DNA 微流控傳感研究

      2024-12-16 00:00:00楊梅傅裕張何馬文杰豆玉豪傅昕李滿霞曾超然
      分析化學(xué) 2024年11期
      關(guān)鍵詞:微珠發(fā)夾微流

      摘要 血液中低豐度的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)是一類關(guān)鍵癌癥標(biāo)志物,實(shí)現(xiàn)ctDNA 的精準(zhǔn)檢測(cè)對(duì)于疾病的早期診斷、監(jiān)測(cè)及預(yù)后評(píng)估均具有重要意義。本研究設(shè)計(jì)了一種基于微流控芯片的熵驅(qū)動(dòng)雙足DNA 步行器與樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)相結(jié)合的級(jí)聯(lián)信號(hào)放大策略,用于檢測(cè)血液中的ctDNA。當(dāng)靶標(biāo)存在時(shí),立足點(diǎn)A與靶標(biāo)相互作用,借助燃料鏈F 觸發(fā)雙向鏈置換反應(yīng),從而釋放靶標(biāo)及8-17 DNAzyme 活性中心。其中,釋放的靶標(biāo)進(jìn)入新一輪熵驅(qū)動(dòng)鏈置換反應(yīng);同時(shí), Pb2+激活的8-17 DNAzyme 活性中心將作用于微珠表面的切割位點(diǎn),暴露出微珠表面的捕獲探針,進(jìn)而誘導(dǎo)樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng),使熒光信號(hào)富集于微珠表面。以乳腺癌突變基因PIK3CAE545K 為靶標(biāo)模型,在最優(yōu)實(shí)驗(yàn)條件下,此傳感器的線性范圍為50~10000 fmol/L,檢出限(LOD, 3σ)為0.94 fmol/L,回歸方程為y=31.6539 lgCT+474.0801(CT 為突變基因PIK3CAE545K 濃度, fmol/L)。將此方法應(yīng)用于人血清中突變基因PIK3CAE545K 含量的檢測(cè),加標(biāo)回收率在98.8%~106.5%之間。本方法靈敏度高、特異性強(qiáng)、抗干擾能力強(qiáng),并具有高通量和一步式操作的特點(diǎn),在復(fù)雜樣品的快速分析中具有良好的應(yīng)用潛力。

      關(guān)鍵詞 DNA 步行器;熵驅(qū)動(dòng)鏈置換反應(yīng);微流控芯片;8-17 DNAzyme;樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

      癌癥每年導(dǎo)致超過820 萬人死亡[1],其中,乳腺癌是女性癌癥死亡的主要原因[2],對(duì)女性健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅。早期診斷和治療是降低癌癥死亡率的關(guān)鍵因素,而高靈敏性、高特異性且便捷的檢測(cè)方法是其中的關(guān)鍵[3-6]。循環(huán)腫瘤DNA(Circulating tumor DNA, ctDNA)是由腫瘤細(xì)胞釋放到外周血中的DNA片段[7-9],可作為癌癥相關(guān)生物標(biāo)志物,例如乳腺癌突變基因PIK3CAE545K(Mutation1633 Ggt;A)是攜帶腫瘤特異性基因突變的ctDNA 片段[10-11]。近年來,基因測(cè)序[12]和聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)[13]被用于檢測(cè)ctDNA,但其操作流程復(fù)雜,并且儀器設(shè)備昂貴[14-15]。因此,開發(fā)高靈敏度、高特異性且簡(jiǎn)單、快速的ctDNA 檢測(cè)方法對(duì)癌癥的精準(zhǔn)診斷和有效治療至關(guān)重要。

      等溫信號(hào)放大技術(shù)相比于熱循環(huán)擴(kuò)增具有設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單且無需專用設(shè)備的優(yōu)勢(shì),如3D DNA 步行器[16]、鏈置換反應(yīng)(Strand replacement reaction, SDR)[17]、雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Hybridization strand reaction, HCR)[18]和支鏈雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)[19]等。立足點(diǎn)(Toehold)介導(dǎo)的鏈置換反應(yīng)[20]是由Toehold 結(jié)構(gòu)域開始的鏈置換反應(yīng),基于Watson-Crick 堿基互補(bǔ)配對(duì)原則和熵驅(qū)動(dòng)反應(yīng)的雙重條件使其具有高特異性。然而,鏈置換反應(yīng)的檢測(cè)靈敏度有限,因此,研究者提出結(jié)合多種等溫信號(hào)擴(kuò)增技術(shù),以提高檢測(cè)靈敏度。3D DNA 步行器[16,21]是一種受化學(xué)能(如鏈置換和酶切反應(yīng))驅(qū)動(dòng)、能沿著特定軌跡移動(dòng)的納米機(jī)器,可通過提高反應(yīng)物的局部濃度,縮短反應(yīng)時(shí)間,提高靈敏度。Yuan 等[22]提出了一種鏈置換反應(yīng)結(jié)合蛋白酶驅(qū)動(dòng)的3D DNA 步行器,用于檢測(cè)病毒DNA,雖然該方法可有效提高檢測(cè)靈敏度,但其依賴于蛋白酶切割,易受復(fù)雜實(shí)驗(yàn)條件(如緩沖液和溫度)的影響。8-17 DNAzyme 是一種具有催化活性的DNA 序列[23-25],克服了蛋白酶的一些局限性。盡管如此,多種等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的操作仍然繁瑣,限制了其實(shí)際應(yīng)用。

      微流控芯片技術(shù)以其便攜性和高度集成的特性,為血液中低豐度ctDNA 的檢測(cè)提供了新思路[26]。該技術(shù)同時(shí)具有高通量平行分析能力和高效物質(zhì)傳輸效率,可提高檢測(cè)靈敏度[27-29]。Peng 等[30]設(shè)計(jì)了一種基于功能化微珠的多通道微芯片,僅需30 min 即可同時(shí)檢測(cè)人類、兔、雞和鼠的免疫球蛋白G,展現(xiàn)出微流控芯片快速檢測(cè)、高靈敏度以及操作簡(jiǎn)便的顯著優(yōu)勢(shì)。

      本研究設(shè)計(jì)了一種三通道平行的微流控微珠陣列芯片,并構(gòu)建了一步式立足點(diǎn)介導(dǎo)的熵驅(qū)動(dòng)雙足3D DNA 步行器,用于ctDNA 的高靈敏度檢測(cè)。以靶標(biāo)和8-17 DNAzyme 為3D DNA 步行器的雙足,通過多種DNA 納米技術(shù)實(shí)現(xiàn)級(jí)聯(lián)信號(hào)放大;以乳腺癌突變基因PIK3CAE545K 為靶標(biāo),驗(yàn)證了一步式微流控微珠陣列芯片生物傳感器的性能。本方法具有高靈敏度、高特異性和高效、便捷等優(yōu)點(diǎn),可用于乳腺癌突變基因PIK3CAE545K 的高靈敏的檢測(cè),為癌癥的早期篩查提供參考和技術(shù)支持。

      1 實(shí)驗(yàn)部分

      1.1 儀器與試劑

      IX73 倒置熒光顯微鏡(日本Olympus 公司);ChemiDoc XRS+電泳儀(美國(guó)Bio-Rad 公司);KVB-30D紫外曝光機(jī)(中國(guó)臺(tái)灣金電子股份有限公司)。

      乙二胺四乙酸二鈉(EDTA?2Na)、30%聚丙烯酰胺(29∶1)、四甲基乙二胺(TEMED)、牛血清白蛋白(BSA)、6 × Loading 緩沖溶液和25 bp DNA Marker(上海生物工程(上海)股份有限公司);三羥甲基氨基甲烷鹽酸鹽(Tris-HCl)和PbCl2(國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES,上海麥克林生化科技股份有限公司);15 μm 聚苯乙烯微珠(蘇州知益微珠科技有限公司);聚二甲基硅氧烷(PDMS)和固化劑(Dow Corning 公司);人血清(上海金馬生物技術(shù)有限公司)。

      HPLC 純化的寡核苷酸序列購(gòu)于上海生物工程(上海)股份有限公司,序列見表1。

      1.2 實(shí)驗(yàn)方法

      1.2.1 序列設(shè)計(jì)及探針預(yù)處理

      DNA 探針凍干粉用TE 緩沖溶液(10 mmol/L Tris-HCl, 0.1 mmol/L EDTA, pH 8.0)溶解,濃度為100 μmol/L,于?20 ℃儲(chǔ)存。使用HEPES 緩沖溶液(25 mmol/L HEPES, 50 mmol/L NaCl, 20 mmol/LMgCl2, pH 7.4)將Biotin-C1、C2 和C3 稀釋至10 μmol/L, SH 底物探針稀釋至5 μmol/L, H1-TMR、H2 和H3 探針稀釋至5 μmol/L,燃料鏈(F)稀釋至200 nmol/L,均于?20 ℃儲(chǔ)存。

      復(fù)合鏈S 的構(gòu)建:將3 μL Bio-C1(10 μmol/L)、3 μL C3(10 μmol/L)、6 μL C2(10 μmol/L)和8 μLHEPES 緩沖溶液混合,總體積為20 μL,于95 ℃孵育5 min 后,以0.1 ℃/s 的速度緩慢冷卻至室溫,形成復(fù)合鏈S(Bio-C1/C2/C3)。

      發(fā)夾結(jié)構(gòu)的形成:將含SH(5 μmol/L)、H1-TMR(5 μmol/L)、H2(5 μmol/L)和H3(5 μmol/L)探針的HEPES 緩沖溶液在95 ℃下孵育5 min,并以0.1 ℃/s 的速度緩慢冷卻至室溫,形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。

      1.2.2 微流控芯片的陽模板制備

      按照微流控芯片結(jié)構(gòu)圖,采用菲林打印制備光掩膜,將其覆蓋在PCB 板上并紫外曝光110 s,隨后采用100 mL 顯影液進(jìn)行顯像6 min。用水沖洗后,避光放入200 mL 刻蝕液(FeCl3·6H2O-水, 1∶2, m/V)中,靜置10~45 min,刻蝕10~30 μm 的深度,最后采用丙酮清除光刻膠,制得芯片陽模板。

      1.2.3 微流控微珠陣列芯片的裝配及微通道處理

      將PDMS 與固化劑按質(zhì)量比10∶1 混勻,靜置20 min,平鋪于陽模板上(約1 mm 厚),在70 ℃烘箱中固化40 min后從陽模板上剝離下來,進(jìn)行沖壓打孔,支撐進(jìn)樣口/出樣口。將基片a (Slip a)與基片b (Slip b)的通道面貼合,組裝成微流控芯片。用5 μL 1% 的BSA 對(duì)通道內(nèi)壁進(jìn)行改性,減少非特異性吸附。最后將功能化的微珠流入微室中,得到微流控微珠陣列芯片。

      1.2.4 微珠的表面功能化

      取100 μL 聚苯乙烯微珠,用100 μL Binding 緩沖溶液(20 mmol/L Tris-HCl, pH 7.5, 1 mol/L NaCl,1 mmol/L EDTA, 0.0005% Triton X-100, pH=7.4)洗滌3 次(3500 r/min, 5 min),棄去上清液,然后以摩爾比為1∶20 的比例加入復(fù)合鏈S 與SH 底物發(fā)夾混合(4 μL S (1.5 μmol/L)、24 μL SH (5 μmol/L)和22 μLHEPES 緩沖溶液,總體積為50 μL),室溫下反應(yīng)1 h。隨后用HEPES 緩沖溶液洗滌3 次,并在HEPES 緩沖溶液中于4 ℃儲(chǔ)存。

      1.2.5 一步式微流控芯片檢測(cè)突變基因PIK3CAE545K

      將功能化微珠稀釋10 倍后注入微室中。將4 μL F(200 nmol/L)、2 μL Pb2+ (2 mmol/L)、18 μL H1-TMR (25 nmol/L)、6 μL H2 (25 nmol/L)、6 μL H3 (25 nmol/L)和4 μL HEPES 緩沖溶液混勻,總體積為40 μL。取4 μL 上述溶液和2 μL Target 混勻后滴加于微流控微珠陣列芯片的進(jìn)樣口,在液壓驅(qū)動(dòng)下,溶液流通至微室中,在30 ℃下恒溫反應(yīng)3 h。反應(yīng)完成后,用5 μL HEPES 緩沖溶液洗滌通道。最后,采用熒光倒置顯微鏡在549 nm 的激發(fā)波長(zhǎng)下進(jìn)行熒光成像。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 實(shí)驗(yàn)原理

      微流控芯片由兩層PDMS 基片組成,可平行檢測(cè)3 份樣品,如圖1A 所示。其中,上層基片a(Slip a)設(shè)有進(jìn)樣口和出樣口,微室尺寸為120 μm×120 μm×10 μm;底層基片b(Slip b)僅設(shè)有進(jìn)樣通道和微室,無出樣通道,尺寸為100 μm×100 μm×15 μm。直徑為15 μm 的微珠在重力與毛細(xì)作用的驅(qū)動(dòng)下進(jìn)入微室中,微珠利用深度差被固定于微室中,以提高反應(yīng)溶液與微珠表面的接觸效率。

      如圖1B 所示,功能化微珠由復(fù)合鏈S 和底物發(fā)夾SH 構(gòu)成。復(fù)合鏈S 由Bio-C1/C2/C3 組成,其中,C3 鏈5′端的Toehold A 用于特異性識(shí)別靶標(biāo);Bio-C1 鏈構(gòu)成的DNA 步行器含有封閉的8-17 DNAzyme活性中心。功能化微珠注入微室后,形成微流控微珠陣列芯片。當(dāng)靶標(biāo)存在時(shí), Toehold A 與靶標(biāo)結(jié)合使C2 鏈解離,暴露出Toehold B。Toehold B 與燃料鏈F 相結(jié)合,觸發(fā)雙向鏈置換反應(yīng),釋放靶標(biāo)且顯露出Bio-C1 鏈中的8-17 DNAzyme 催化活性中心。靶標(biāo)作為DNA 步行器的“一條腿”在微珠之間行走,啟動(dòng)新一輪鏈置換反應(yīng)。Pb2+激活8-17 DNAzyeme, Bio-C1 作為DNA 步行器的“另一條腿”沿著三維軌道催化裂解SH,使捕獲探針顯露于微珠表面,啟動(dòng)H1-TMR、H2 和H3 進(jìn)行樹枝狀的雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Dendritichybridization chain reaction, D-HCR)。值得注意的是,發(fā)夾H1 的3′端標(biāo)記有四甲基羅丹明分子,捕獲探針(a)與H1 的5′端結(jié)合,暴露發(fā)夾序列(c、b*),并進(jìn)一步與H2 發(fā)夾的雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng);被觸發(fā)的H2 發(fā)夾(b*、a*)與新的H1 發(fā)夾進(jìn)行雜交,而H2 的5′端序列(d、e)與H3 的3′端序列(d*、e*)相互作用,完成D-HCR 過程,隨著D-HCR 的發(fā)生,微珠表面的熒光信號(hào)增強(qiáng)。

      2.2 可行性分析

      為驗(yàn)證微流控微珠陣列芯片構(gòu)建的有效性,對(duì)其進(jìn)行流通性測(cè)試。圖2A為顯微鏡下的Slip a和Slip b的結(jié)構(gòu),以及兩層基片貼合后的完整芯片。圖2B 為功能化微珠在重力和毛細(xì)作用下引入微室中的過程,證實(shí)了微珠通過深度差可固定于微室內(nèi)。采用黑色墨水驗(yàn)證了3 個(gè)通道的流通性(圖2C)。圖2D 為構(gòu)建的微流控微珠陣列檢測(cè)平臺(tái)實(shí)物圖。

      通過12%聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)分別對(duì)鏈置換反應(yīng)與樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的可行性進(jìn)行分析,各組分終濃度均為1 μmol/L。如圖3A 泳道7 所示,進(jìn)行鏈置換反應(yīng)后, S 亮帶減弱, Fuel/C3 亮帶明顯變亮,表明鏈置換反應(yīng)已完成。樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)電泳表征如圖3B 所示,泳道4、5 和6 的結(jié)果顯示各發(fā)夾處于亞穩(wěn)態(tài)結(jié)構(gòu),無引發(fā)序列時(shí),無法自組裝成納米聚合物;泳道7 為捕獲探針P/H1/H2 在30 ℃下反應(yīng)3 h 發(fā)生雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng),泳道8 為P/H1/H2/H3 在相同條件下進(jìn)行D-HCR,泳道8 亮帶分子量顯著大于泳道7,證明樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)比雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)形成的納米聚合物分子更大。

      通過去除關(guān)鍵影響因素的方式進(jìn)行可行性分析,設(shè)計(jì)了4 組實(shí)驗(yàn),分別為不加PbCl2、不加燃料鏈F、不加靶標(biāo)探針以及完整實(shí)驗(yàn)組,未加變量均以等體積緩沖溶液替代。如圖3C 所示,缺少Pb2+時(shí),無法激活8-17 DNAzyme 進(jìn)行底物鏈切割;缺少F 鏈或靶標(biāo)時(shí),無法進(jìn)行熵驅(qū)動(dòng)鏈置換反應(yīng),背景信號(hào)較低;完整體系的熒光信號(hào)顯著增強(qiáng),證明此體系可有效檢測(cè)突變基因PIK3CAE545K。

      2.3 實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化

      考察了金屬離子種類與濃度、D-HCR 組裝中3 個(gè)發(fā)夾比例及傳感器反應(yīng)時(shí)間對(duì)8-17 DNAzyme 切割效率的影響,所有實(shí)驗(yàn)均在1 pmol/L 突變基因PIK3CAE545K 條件下進(jìn)行。

      2.3.1 激活8-17 DNAzyme 的金屬離子種類及濃度的優(yōu)化

      二價(jià)金屬離子(如Co2+、Ca2+、Mg2+、Cu2+、Zn2+和Pb2+)可促進(jìn)8-17 DNAzyme 催化磷酸二酯鍵的斷裂[31],因此,考察了二價(jià)金屬離子的種類對(duì)8-17 DNAzyme 催化活性的影響。如圖4A 所示,相同濃度的二價(jià)金屬離子(100 μmol/L)存在時(shí),對(duì)1 pmol/L 靶標(biāo)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明, Pb2+存在時(shí)8-17 DNAzyme 具有較高的催化活性。如圖4B 所示,在靶標(biāo)存在情況下,隨著Pb2+濃度從5 μmol/L 增高至100 μmol/L, 8-17DNAzyme 的切割效率加快,熒光信號(hào)在25 μmol/L 時(shí)趨于穩(wěn)定。因此,選擇Pb2+最佳濃度為25 μmol/L。

      2.3.2 樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)發(fā)夾比例的優(yōu)化

      H1-TMR、H2 和H3 發(fā)夾比例對(duì)樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)生的熒光信號(hào)具有顯著影響。如圖4C 所示,隨著H1-TMR 濃度增加,熒光信號(hào)增強(qiáng)。H1-TMR、H2 和H3 發(fā)夾比例為1∶1∶1 時(shí),含有四甲基羅丹明的H1 濃度較低,難以迅速結(jié)合至微珠表面;當(dāng)H1-TMR、H2 和H3 發(fā)夾比例為3∶1∶1 時(shí),信號(hào)趨于穩(wěn)定。因此,選擇H1-TMR、H2 和H3 發(fā)夾的最佳比例為3∶1∶1。

      2.3.3 一步式檢測(cè)體系反應(yīng)時(shí)間的優(yōu)化

      一步式微流控微珠陣列生物傳感器的反應(yīng)時(shí)間對(duì)熒光信號(hào)有較大影響。如圖4D 所示,隨著反應(yīng)時(shí)間延長(zhǎng), 30~120 min 時(shí)熒光信號(hào)不斷增加,反應(yīng)至180 min 時(shí),信號(hào)趨于穩(wěn)定。因此,后續(xù)實(shí)驗(yàn)選擇反應(yīng)時(shí)間為180 min。

      2.4 檢測(cè)性能分析

      在最優(yōu)實(shí)驗(yàn)條件下,采用制備的芯片對(duì)不同濃度的突變基因PIK3CAE545K 進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,隨著靶標(biāo)濃度增加,熒光信號(hào)增強(qiáng),濃度達(dá)到50 pmol/L 時(shí),信號(hào)趨于穩(wěn)定(圖5A),在50~10000 fmol/L 濃度范圍內(nèi),熒光信號(hào)與靶標(biāo)濃度的對(duì)數(shù)呈良好的線性關(guān)系(圖5B),線性回歸方程為y=31.65 lgCT+474.08(R2=0.9890),檢出限(LOD, 3σ)為0.94 fmol/L。在相同條件下,未采用微流控芯片(芯片外)對(duì)不同濃度的突變基因PIK3CAE545K 進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明,熒光信號(hào)隨著PIK3CAE545K 濃度增加而增強(qiáng), PIK3CAE545K 濃度為1 nmol/L 時(shí),熒光信號(hào)趨于穩(wěn)定(圖5C),在10~5000 pmol/L 濃度范圍內(nèi),熒光信號(hào)與靶標(biāo)濃度的對(duì)數(shù)呈良好的線性關(guān)系(圖5D),線性方程為y=19.78 lgCT+221.92(R2=0.9879),檢出限(LOD, 3σ)為1.03 pmol/L。微流控芯片的高效傳質(zhì)作用使檢測(cè)靶標(biāo)的熒光信號(hào)顯著高于芯片外信號(hào),檢測(cè)靈敏度提升了約3 個(gè)數(shù)量級(jí),這歸因于不同的反應(yīng)裝載方式。在芯片外檢測(cè)靶標(biāo)采用EP 管進(jìn)行反應(yīng),靜置3 h 后,微珠沉降至管底,導(dǎo)致反應(yīng)不充分。采用微流控芯片檢測(cè)靶標(biāo)時(shí),溶液在重力和毛細(xì)作用驅(qū)動(dòng)下持續(xù)流入微室,提高了分子碰撞效率,增強(qiáng)了熒光信號(hào)。綜上,相較于文獻(xiàn)中報(bào)道的ctDNA 檢測(cè)方法(表2),本研究通過級(jí)聯(lián)信號(hào)放大技術(shù)和微流控芯片的高效傳質(zhì)特性,獲得了更高的靈敏度。

      2.5 特異性分析

      為考察一步式微流控微珠陣列芯片檢測(cè)方法對(duì)突變基因PIK3CAE545K 檢測(cè)的特異性,在相同實(shí)驗(yàn)條件下,采用本方法分別對(duì)1 pmol/L 濃度的單堿基錯(cuò)配(M1)、雙堿基錯(cuò)配(M2)和三堿基錯(cuò)配(M3)目標(biāo)基因序列,以及正?;騊IK3CAE545K(WT)與突變基因PIK3CAE545K 靶標(biāo)(Target)進(jìn)行檢測(cè)。如圖6 所示,Target 的熒光信號(hào)明顯高于相同濃度的其它堿基錯(cuò)配目標(biāo)基因序列,通過t 檢驗(yàn)計(jì)算p 值,結(jié)果顯示存在顯著性差異,表明本方法對(duì)突變基因PIK3CAE545K 序列具有良好的特異性。

      2.6 實(shí)際樣品分析

      為考察本方法在實(shí)際樣品檢測(cè)中的檢測(cè)性能,對(duì)模擬實(shí)際樣本進(jìn)行檢測(cè),并進(jìn)行加標(biāo)回收實(shí)驗(yàn)。將突變基因PIK3CAE545K 加入至已稀釋20 倍的健康人血清中,加標(biāo)濃度分別為0.5、1 和3 pmol/L。結(jié)果如表3 所示,加標(biāo)回收率為98.8%~106.5%,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)為1.2%~2.1%,表明本方法可用于實(shí)際復(fù)雜樣品中突變基因PIK3CAE545K 的檢測(cè)。

      3 結(jié)論

      構(gòu)建了一種基于立足點(diǎn)介導(dǎo)的熵驅(qū)動(dòng)雙足DNA 步行器與樹枝狀雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的信號(hào)放大策略,并結(jié)合微流控芯片傳感平臺(tái),檢測(cè)了血液中的突變基因PIK3CAE545K。本方法采用微流控芯片實(shí)現(xiàn)一步法檢測(cè),操作簡(jiǎn)便,靈敏度顯著高于其它生物傳感器,檢出限低至0.94 fmol/L,并具備單堿基識(shí)別能力,展現(xiàn)出極高的特異性。本方法能夠在3 h 內(nèi)實(shí)現(xiàn)血液中PIK3CAE545K 的快速檢測(cè),為癌癥的早期診斷提供了新策略。

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