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      基于深度學(xué)習(xí)技術(shù)的放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng)設(shè)計(jì)與功能實(shí)現(xiàn)

      2024-12-20 00:00:00王斌
      電腦知識(shí)與技術(shù) 2024年30期

      關(guān)鍵詞:深度學(xué)習(xí);放療;自動(dòng)勾畫;危及器官;大體腫瘤體積;臨床腫瘤體積

      0 引言

      近年來(lái),隨著云計(jì)算、大數(shù)據(jù)、人工智能等新一代信息技術(shù)在醫(yī)療信息化領(lǐng)域中的深入應(yīng)用,信息技術(shù)在輔助臨床診療方面發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。深度學(xué)習(xí)作為人工智能的重要分支,在醫(yī)學(xué)圖像自動(dòng)分割領(lǐng)域具有準(zhǔn)確性高、可靠性高、學(xué)習(xí)性強(qiáng)、數(shù)據(jù)處理能力強(qiáng)等優(yōu)勢(shì),展現(xiàn)出巨大潛力并得到廣泛應(yīng)用[1],而臨床診療手段也在隨著信息技術(shù)的進(jìn)步不斷豐富和完善。

      放射治療是惡性腫瘤常規(guī)治療手段之一。在放射治療的過(guò)程中,醫(yī)生需要逐層對(duì)患者的CT掃描圖像進(jìn)行腫瘤靶區(qū)和危及器官(Organ At Risk,OAR) 的精準(zhǔn)勾畫。以往主要依靠放射科臨床醫(yī)生手動(dòng)完成病人放療前OAR、大體腫瘤體積(Gross Tumor Volume,GTV) 、臨床腫瘤體積(Clinical Tumor Volume,CTV) 的勾畫,不僅耗費(fèi)時(shí)間長(zhǎng)、診療效率低,而且不同醫(yī)生勾畫的正常器官也會(huì)有所差異[2],更有可能延誤患者的治療時(shí)間,增加醫(yī)患矛盾,不利于構(gòu)建和諧安寧的醫(yī)患關(guān)系。

      腫瘤治療通常有三種方式:手術(shù)治療、化學(xué)藥物治療、放射治療。放療技術(shù)的進(jìn)步促進(jìn)了精準(zhǔn)放療的發(fā)展,在與日俱增的精準(zhǔn)放療需求背景下,為使治療時(shí)間縮短、效果提高、副作用減少、不良反應(yīng)降低,迫切要求醫(yī)務(wù)人員提高工作效率,滿足患者及時(shí)、高效、精確治療的需求。精準(zhǔn)放療不僅依賴于先進(jìn)的成像與治療設(shè)備,OAR、GTV、CTV的高精度勾畫也是實(shí)施精確放療的關(guān)鍵技術(shù)和手段。對(duì)此,醫(yī)院引入一套基于OAR自動(dòng)分割以及器官和組織三維重建等技術(shù)的放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng),該系統(tǒng)是一套專門針對(duì)放射治療圖像處理的軟件,能輔助醫(yī)生在放療前完成對(duì)腫瘤及相關(guān)器官和組織的輪廓勾畫。醫(yī)生利用系統(tǒng)分析處理后的影像信息,確定腫瘤靶區(qū)和OAR的邊界,為患者制訂個(gè)性化放射治療計(jì)劃提供了依據(jù)[3]。

      該系統(tǒng)與醫(yī)院現(xiàn)有的放療系統(tǒng)及影像歸檔和通信系統(tǒng)(Picture Archiving and Communication System,PACS) 無(wú)縫對(duì)接,通過(guò)人工智能技術(shù)實(shí)現(xiàn)OAR、GTV、CTV的自動(dòng)勾畫。同時(shí),系統(tǒng)能根據(jù)臨床醫(yī)生的勾畫風(fēng)格調(diào)整完成自適應(yīng)模型,滿足科室的臨床應(yīng)用及科研需求,不僅提高了影像勾畫的精準(zhǔn)度和患者滿意度,也提升了放療科醫(yī)療、教學(xué)、科研等各項(xiàng)工作的質(zhì)量和效率。本文介紹了上述基于深度學(xué)習(xí)技術(shù)的放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng),對(duì)其設(shè)計(jì)與功能實(shí)現(xiàn)進(jìn)行了闡述,并對(duì)其應(yīng)用效果作出了說(shuō)明。

      1 系統(tǒng)設(shè)計(jì)

      1.1 架構(gòu)設(shè)計(jì)

      系統(tǒng)采用主流可擴(kuò)展的B/S軟件架構(gòu),系統(tǒng)開發(fā)采用主流的編程語(yǔ)言:前端界面開發(fā)使用HTML、tChSoSn、、JCa+v+aS等cr語(yǔ)ipt言等,語(yǔ)算言法,設(shè)后計(jì)端使開用發(fā)C使++用、PJyathvoanSc等rip語(yǔ)t、言Py。?在保證數(shù)據(jù)安全性、時(shí)效性、準(zhǔn)確性和易用性的同時(shí),系統(tǒng)具有更方便的功能擴(kuò)充和與其他系統(tǒng)對(duì)接融合的能力。

      系統(tǒng)遵循國(guó)際醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信(Digital Imag? ing and Communications in Medicine,DICOM) 3.0標(biāo)準(zhǔn),可處理CR、DX、CT、MR、PET、SPECT 等設(shè)備輸出的DICOM 3.0接口圖像,可輸出DICOM 3.0格式圖像文件和RT Structure文件。系統(tǒng)支持DICOM Query/Re? trieve、DICOM Storage SCP(Service Class Provider) 、SDeIrCvOicMe 等St接ora口ge服 SC務(wù)U,(S支erv持ic放e C療la靶ss 區(qū)Us勾er)畫 、影DIC像O數(shù)M 據(jù)W傳eb輸、勾畫、配準(zhǔn)等功能,并包含了國(guó)內(nèi)多家頂級(jí)三甲醫(yī)院醫(yī)生的臨床診斷勾畫標(biāo)準(zhǔn)。系統(tǒng)支持的DICOM接口服務(wù)內(nèi)容如表1所示。

      1.2 接口設(shè)計(jì)

      系統(tǒng)接口分為內(nèi)部接口和外部接口。內(nèi)部接口是客戶端與服務(wù)器之間進(jìn)行的數(shù)據(jù)交互,接口設(shè)計(jì)遵從表象化狀態(tài)轉(zhuǎn)變(Representational State Transfer,REST) 應(yīng)用程序接口標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范,采用輕量級(jí)、無(wú)狀態(tài)的數(shù)據(jù)交互方式??蛻舳送ㄟ^(guò)REST協(xié)議與服務(wù)器進(jìn)行交互,獲得后臺(tái)系統(tǒng)算法分析得出的數(shù)據(jù)結(jié)果,從而為用戶的臨床診斷勾畫提供輔助。外部接口是服務(wù)器與PACS系統(tǒng)之間進(jìn)行的數(shù)據(jù)交互,接口設(shè)計(jì)遵從DICOM協(xié)議標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范。服務(wù)器通過(guò)DICOM協(xié)議與PACS系統(tǒng)進(jìn)行通信,接收PACS系統(tǒng)傳輸?shù)腄ICOM 格式數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析處理,最后將分析處理的圖像數(shù)據(jù)回傳到PACS服務(wù)器中進(jìn)行存儲(chǔ)歸檔。

      1.3 安全性設(shè)計(jì)

      系統(tǒng)安全性設(shè)計(jì)涵蓋網(wǎng)絡(luò)安全和數(shù)據(jù)安全兩個(gè)方面。

      在網(wǎng)絡(luò)安全方面,系統(tǒng)部署于醫(yī)院內(nèi)網(wǎng),并通過(guò)防火墻、防病毒軟件等安全設(shè)備保障運(yùn)行環(huán)境的安全。

      在數(shù)據(jù)安全方面,系統(tǒng)采用賬號(hào)密碼認(rèn)證和用戶權(quán)限管理機(jī)制,確保只有被授權(quán)的用戶才能訪問(wèn)相應(yīng)數(shù)據(jù);此外,系統(tǒng)僅允許通過(guò)Web客戶端瀏覽器進(jìn)行數(shù)據(jù)訪問(wèn),進(jìn)一步提高了數(shù)據(jù)的安全性。

      2 系統(tǒng)功能實(shí)現(xiàn)

      人工智能,特別是深度學(xué)習(xí)技術(shù),已在自然語(yǔ)言處理、模式識(shí)別、圖像識(shí)別、語(yǔ)音識(shí)別等領(lǐng)域取得顯著成效。與傳統(tǒng)方法相比,深度學(xué)習(xí)在特征學(xué)習(xí)、魯棒性、泛化能力以及通用性等方面具有明顯優(yōu)勢(shì)。深度學(xué)習(xí)技術(shù)能夠自動(dòng)提取數(shù)據(jù)的特征,無(wú)須人工干預(yù),從而大幅度降低了特征工程的復(fù)雜性和對(duì)專業(yè)知識(shí)的依賴[4]。同時(shí),基于深度學(xué)習(xí)的圖像分割方法能夠使用多種方式自動(dòng)提取更豐富的特征信息,在器官分割中具有快速、準(zhǔn)確、可靠等優(yōu)勢(shì),已逐漸成為圖像分割領(lǐng)域的首選方法[5]。

      放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng)基于深度學(xué)習(xí)技術(shù),能夠?qū)崿F(xiàn)簡(jiǎn)單一鍵輕松勾畫。在PACS系統(tǒng)將患者圖像信息傳輸?shù)皆撓到y(tǒng)后,放療科醫(yī)生只須點(diǎn)擊勾畫按鍵,即可實(shí)現(xiàn)OAR、GTV、CTV的自動(dòng)勾畫,而放療科醫(yī)生只須進(jìn)行少量修改甚至某些器官無(wú)須修改即可完成。但任何自動(dòng)勾畫技術(shù)只能輔助臨床診療,圖像在經(jīng)自動(dòng)勾畫處理后,必須經(jīng)人工審核及修改后才能用于患者的治療[1,6-7]。

      系統(tǒng)包括勾畫客戶端和系統(tǒng)管理端兩部分,實(shí)現(xiàn)用戶權(quán)限管理、影像組學(xué)分析、影像數(shù)據(jù)獲取、腫瘤區(qū)域標(biāo)定、腫瘤區(qū)域分割、腫瘤特征提取和量化、影像數(shù)據(jù)庫(kù)建立、輔助靶區(qū)勾畫等功能。系統(tǒng)功能結(jié)構(gòu)如圖1所示。

      2.1 勾畫客戶端主要功能

      1) 用戶訪問(wèn)控制。用戶通過(guò)用戶名和密碼登錄客戶端系統(tǒng),若輸入錯(cuò)誤系統(tǒng)會(huì)提示錯(cuò)誤信息。管理員可對(duì)用戶角色及權(quán)限進(jìn)行配置,根據(jù)不同用戶角色配置不同的功能權(quán)限。

      2) 影像數(shù)據(jù)管理。影像數(shù)據(jù)管理包括公共數(shù)據(jù)集和個(gè)人數(shù)據(jù)集兩種數(shù)據(jù)集的管理。

      公共數(shù)據(jù)集:公用數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)空間,存放系統(tǒng)與大型醫(yī)療設(shè)備直聯(lián)獲取的影像,或與PACS系統(tǒng)對(duì)接獲取的影像,并按來(lái)源對(duì)影像設(shè)備進(jìn)行分類管理。管理員在后臺(tái)對(duì)公共數(shù)據(jù)集進(jìn)行配置,使獲得授權(quán)的用戶能查看公共數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù),并能進(jìn)行勾畫、修改、刪除等操作。

      個(gè)人數(shù)據(jù)集:用戶個(gè)人的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)空間,用戶可新建、編輯或刪除個(gè)人數(shù)據(jù)集中的文件夾,實(shí)現(xiàn)對(duì)影像數(shù)據(jù)的個(gè)性化管理。系統(tǒng)支持用戶將公共數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)歸檔到個(gè)人數(shù)據(jù)集,或從移動(dòng)存儲(chǔ)介質(zhì)拷貝影像存入個(gè)人數(shù)據(jù)集的不同文件夾。

      3) 影像勾畫。影像勾畫是系統(tǒng)的核心功能,包含多種專業(yè)性的醫(yī)學(xué)影像分析處理和勾畫工具,主要用于系統(tǒng)性地顯示放療影像以及對(duì)腫瘤靶區(qū)進(jìn)行定位勾畫。在臨床診療過(guò)程中,放療科醫(yī)生結(jié)合患者影像,并借助系統(tǒng)自動(dòng)識(shí)別其日常閱片和影像勾畫習(xí)慣的性能,能準(zhǔn)確劃定出患者的腫瘤范圍,為后續(xù)給患者實(shí)施腫瘤放射治療提供了高效準(zhǔn)確的技術(shù)性支持。影像處理和勾畫工具主要包括斷層影像滾動(dòng)、三維影像融合、影像聯(lián)動(dòng)設(shè)置、畫筆、替換、反向替換、筆刷、圓形輪廓、復(fù)制輪廓層、撤銷輪廓編輯、擦除輪廓等。

      4) 影像融合。影像融合功能可以將每位患者多種成像模式的影像信息結(jié)合在一起,即將患者在不同影像設(shè)備、不同時(shí)期所做的檢查圖像結(jié)合起來(lái)。通過(guò)空間位置的匹配,并結(jié)合各種不同類型模態(tài)圖像的優(yōu)點(diǎn)和特征信息[8],使臨床醫(yī)生能夠同時(shí)瀏覽多種形式的圖像,從而針對(duì)患者的病情進(jìn)行精準(zhǔn)定位和快速綜合分析。

      系統(tǒng)能實(shí)現(xiàn)不同類型三維影像之間的相互融合,包括兩種CT設(shè)備影像、兩種MR設(shè)備影像、CT設(shè)備影像與MR設(shè)備影像等不同模態(tài)三維影像之間的融合。為方便臨床醫(yī)生操作,系統(tǒng)影像融合界面包括三個(gè)區(qū)域:影像信息區(qū)、工具區(qū)和圖像顯示區(qū)。

      影像信息區(qū):包含患者數(shù)據(jù)、信息以及相關(guān)操作等內(nèi)容,如患者姓名、圖像總數(shù)和圖像序列描述、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)圖等屬性。用戶可在此區(qū)域選擇查看被加載和選中序列的影像詳情,進(jìn)而選擇具體的序列在顯示區(qū)進(jìn)行圖像展示。

      工具區(qū):包含圖像瀏覽過(guò)程中的常規(guī)基本處理工具,如顯示和隱藏信息層、顯示和隱藏十字線、設(shè)置窗寬和窗位、縮放、拖動(dòng)、放大鏡、重置等。

      圖像顯示區(qū):主要以多平面重建(Multi-Planar Re? construction,MPR) 方式呈現(xiàn)當(dāng)前需要融合的兩個(gè)序列的圖像。MPR是指先將掃描范圍內(nèi)所有軸位圖像疊加起來(lái),再對(duì)某些標(biāo)線標(biāo)定的重組線所制定的組織進(jìn)行冠狀面、矢狀面、橫斷面圖像顯示。兩個(gè)序列圖像在同一個(gè)空間創(chuàng)建MPR,默認(rèn)只顯示一個(gè)二維橫斷面視圖、二維矢狀面視圖和二維冠狀面視圖[7],用戶也可根據(jù)實(shí)際需要更改顯示設(shè)置。

      5) 輔助靶區(qū)勾畫。輔助靶區(qū)勾畫功能主要包括全身OAR自動(dòng)勾畫、多癌種GTV、CTV勾畫、對(duì)腫瘤區(qū)域進(jìn)行標(biāo)定、分割、腫瘤特征的提取和量化、勾畫顯示、手動(dòng)勾畫、個(gè)性化勾畫等。

      2.2 系統(tǒng)管理端主要功能

      1) 管理員訪問(wèn)控制。系統(tǒng)可設(shè)置一個(gè)超級(jí)管理員賬號(hào),該賬號(hào)擁有所有權(quán)限,且不可被刪除。所有子賬號(hào)都在該賬號(hào)管理下操作,所有子賬號(hào)的創(chuàng)建、刪除等權(quán)限都通過(guò)超級(jí)管理員賬號(hào)授予。

      2) 機(jī)構(gòu)管理。機(jī)構(gòu)管理用于管理機(jī)構(gòu)和科室。系統(tǒng)可顯示醫(yī)院和科室的詳情介紹,包括醫(yī)院的概況和員工清單、每個(gè)科室的基礎(chǔ)信息和科室人員列表等信息。管理員可根據(jù)實(shí)際情況對(duì)機(jī)構(gòu)或科室信息進(jìn)行編輯、添加、刪除等維護(hù)操作。

      3) 數(shù)據(jù)與設(shè)備管理。主要包括對(duì)公共數(shù)據(jù)集、影像設(shè)備、接收器、規(guī)則等內(nèi)容的管理。公共數(shù)據(jù)集管理用于對(duì)公共數(shù)據(jù)進(jìn)行分類管理,能顯示公共數(shù)據(jù)集列表和公共數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)信息,便于管理員查詢和管理公共數(shù)據(jù)。設(shè)備管理用于管理接入系統(tǒng)的影像設(shè)備,系統(tǒng)能顯示設(shè)備列表以及設(shè)備名稱、IP地址、端口號(hào)等基礎(chǔ)信息,便于管理員對(duì)影像設(shè)備進(jìn)行增、刪、改、查等維護(hù)管理操作。接收器管理能顯示接收器列表及其基礎(chǔ)信息,包括接收器的名稱、端口號(hào)、創(chuàng)建時(shí)間等內(nèi)容。規(guī)則管理用于管理數(shù)據(jù)傳輸規(guī)則,管理員可自定義數(shù)據(jù)傳輸相關(guān)規(guī)則,根據(jù)需要設(shè)置規(guī)則名稱、準(zhǔn)入設(shè)備等條件,以及定義OAR的模板和數(shù)據(jù)自動(dòng)導(dǎo)出的參數(shù)。

      4) 用戶管理。系統(tǒng)提供了用戶權(quán)限分級(jí)分類管理,用以保障系統(tǒng)分級(jí)授權(quán)審批和數(shù)據(jù)安全,支持權(quán)限從高到低的系統(tǒng)管理員、高級(jí)用戶和普通用戶三種用戶類型,且低級(jí)別的用戶不能創(chuàng)建高級(jí)別的用戶。

      5) 結(jié)構(gòu)管理。主要包括勾畫設(shè)置、結(jié)構(gòu)設(shè)置、模板設(shè)置等功能。勾畫設(shè)置提供CTV設(shè)置選項(xiàng),管理員可根據(jù)臨床實(shí)際工作需要?jiǎng)?chuàng)建某個(gè)科室專用的、與檢查明細(xì)關(guān)聯(lián)的CTV。結(jié)構(gòu)設(shè)置分類型詳細(xì)列出系統(tǒng)支持的所有OAR,管理員可根據(jù)需要通過(guò)結(jié)構(gòu)名稱或代碼來(lái)搜索對(duì)應(yīng)的OAR結(jié)構(gòu),并可根據(jù)個(gè)人習(xí)慣修改備注、類型或顏色等參數(shù)。模板設(shè)置提供OAR模板設(shè)置功能,管理員可根據(jù)臨床實(shí)際工作需要?jiǎng)?chuàng)建某個(gè)科室專用的模板。

      6) 系統(tǒng)管理。主要包括系統(tǒng)快捷方式設(shè)置、掛片布局設(shè)置、窗寬和窗位設(shè)置、勾畫設(shè)置及頭頸部CT顯示參數(shù)、通用配置、后處理功能、頭頸部CT顯示參數(shù)、MR序列定義等高級(jí)功能設(shè)置。

      7) 日志管理。日志管理用于記錄用戶日常操作和系統(tǒng)運(yùn)行狀況,回溯歷史信息。管理員可在操作日志中通過(guò)設(shè)置操作模塊、操作時(shí)間范圍等條件來(lái)查詢用戶曾在系統(tǒng)上執(zhí)行過(guò)的操作,根據(jù)日期查詢系統(tǒng)運(yùn)行日志,以便在系統(tǒng)出現(xiàn)問(wèn)題時(shí)能快速準(zhǔn)確地定位原因,提高問(wèn)題處理效率。

      8) 意見管理。意見管理支持顯示意見列表,管理員可在意見管理界面統(tǒng)一管理用戶反饋的意見,根據(jù)提交的用戶名稱和時(shí)間范圍查詢意見信息。

      3 結(jié)束語(yǔ)

      本文從深度學(xué)習(xí)在醫(yī)學(xué)圖像分割中的優(yōu)勢(shì),以及傳統(tǒng)手動(dòng)腫瘤勾畫的弊端和精準(zhǔn)放療需求進(jìn)行切入,引入了放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng)在放射治療中的優(yōu)勢(shì)與作用,介紹了該系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與核心功能實(shí)現(xiàn)。與依賴醫(yī)生經(jīng)驗(yàn)且存在主觀差異的手動(dòng)勾畫相比,自動(dòng)勾畫方法可顯著減輕醫(yī)生工作量,提高勾畫效率和一致性,具有更高的臨床應(yīng)用價(jià)值[9]。

      放療靶區(qū)自動(dòng)勾畫系統(tǒng)的引入不僅提高了臨床腫瘤靶區(qū)勾畫的效率,減輕放療科醫(yī)生工作負(fù)擔(dān),加速放療準(zhǔn)備階段,使患者能更快接受治療[10-12],提高影像勾畫的精準(zhǔn)度和患者滿意度,同時(shí)也滿足科室的臨床應(yīng)用及科研需求,提升了放療科醫(yī)、教、研、防等各項(xiàng)工作的質(zhì)量和效率。未來(lái)將繼續(xù)加強(qiáng)深度學(xué)習(xí)技術(shù)在提高魯棒性和泛化能力、優(yōu)化實(shí)時(shí)性能、提高腫瘤靶區(qū)勾畫精準(zhǔn)度等方面的研究,使其更適用于實(shí)際應(yīng)用場(chǎng)景。

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