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      基于RAPD技術(shù)探討黃精屬部分藥用植物系統(tǒng)位置

      2011-01-24 07:48:44秦民堅(jiān)張朝鳳
      中國(guó)野生植物資源 2011年6期
      關(guān)鍵詞:玉竹親緣藥用植物

      朱 艷,孫 偉,秦民堅(jiān)*,張朝鳳*

      [1.中國(guó)藥科大學(xué)中藥學(xué)院,江蘇南京211198;2.無(wú)限極(中國(guó))有限公司,廣東廣州510665]

      黃精屬Polygonatum隸屬于百合科Liliaceae,由Miller 1754年建立,迄今已發(fā)表60余種,廣布于北溫帶,主要分布于喜馬拉雅到日本一帶,中國(guó)約39種,其中20種為我國(guó)特有種?!吨腥A人民共和國(guó)藥典》(2010年版一部)收載本屬中藥材黃精(滇黃精Polygonatum kingianum Coll.et Hemsl.,黃 精 P.sibiricum Red.,多花黃精 P.cyrtonema Hua.)和玉竹Polygonatum odoratum(Mill.)Druce[1],而民間藥用來(lái)源較為復(fù)雜,有近十幾種。1875年Baker[2]根據(jù)葉序?qū)ⅫS精屬分為互生葉類Alternifolia、輪生葉類Verticillata和對(duì)生葉類Oppositifolia,由于各類群間性狀交叉,地理分布區(qū)重疊,該屬的分類一直存在爭(zhēng)議[3],隨著新類群和變異型不斷發(fā)現(xiàn)[4],該屬至今沒(méi)有統(tǒng)一的分類系統(tǒng),導(dǎo)致同屬常用中藥材黃精和玉竹的原植物鑒定困難和應(yīng)用混亂。

      隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,從分子水平來(lái)探索黃精屬系統(tǒng)問(wèn)題已經(jīng)成為可能,如:Tamura等[5]對(duì)黃精屬17種及1變種的trnk基因進(jìn)行PCR、RFLP分析,支持將黃精屬分成兩組的觀點(diǎn);吳世安等[6]對(duì)黃精屬植物trnk基因和rpl16基因進(jìn)行進(jìn)行PCR、RFLP分析,認(rèn)為互生葉種類組成了一單系,而輪生葉和對(duì)生葉種類為多系關(guān)系,不構(gòu)成一個(gè)單系;近年來(lái),多篇文獻(xiàn)報(bào)道[7-9]利用 RAPD技術(shù)鑒定玉竹類藥材,周曄等[10]對(duì)黃精屬部分藥用植物親緣關(guān)系進(jìn)行探討,發(fā)現(xiàn)不同產(chǎn)地的玉竹、小玉竹和多花黃精出現(xiàn)一定的變異。本文在前人研究的基礎(chǔ)上,通過(guò)RAPD技術(shù)對(duì)黃精屬部分藥用植物的親緣關(guān)系進(jìn)行分析,首次報(bào)道了狹葉黃精,長(zhǎng)梗黃精、湖北黃精在此系統(tǒng)樹(shù)中的位置,利用RAPD技術(shù)對(duì)黃精屬藥用植物進(jìn)行DNA指紋圖譜研究,以期從遺傳學(xué)角度為黃精屬屬內(nèi)關(guān)系和種的鑒別提供科學(xué)依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      共20批樣品,黃精屬藥用植物19批(6種),原植物均采集人鑒定,由安徽師范大學(xué)趙麗琴老師和中國(guó)藥科大學(xué)張朝鳳老師協(xié)助審核,將百合科萬(wàn)壽竹屬的寶鐸草(Disporum sessile D.Don)設(shè)定為外類群進(jìn)行試驗(yàn)結(jié)果的聚類分析,以上實(shí)驗(yàn)材料均于2010年7月至2011年3月間采自江蘇、安徽、昆明、湖北、吉林等地,每個(gè)樣品隨機(jī)取樣10株,于-20℃冰箱保存。具體來(lái)源見(jiàn)表1,憑證標(biāo)本保存于中國(guó)藥科大學(xué)中藥資源教研室。

      表1 用于RAPD分析的原植物來(lái)源

      1.2 方法

      1.2.1 總DNA的提取

      參照改良 CTAB法[11],稍加改動(dòng),具體如下:植物材料經(jīng)蒸餾水洗凈后用吸水紙吸干,剪碎,在研缽內(nèi)用液氮冷卻碾碎成細(xì)粉。取200 mg材料置于1.5 mL的離心管內(nèi),加入65℃預(yù)熱的提取液1 mL,置65℃水浴,并不斷震搖,提取40 min。室溫,8 000 r/min離心10 min。吸取上清液至另一1.5 mL的離心管中,加入等體積的氯仿-異戊醇(24∶1)萃取液,輕輕顛倒混勻。室溫,10 000 r/min離心10 min,小心吸取上清液至另一離心管中,重復(fù)上述步驟2~3次,直至兩相間的蛋白質(zhì)除盡。吸取上清液至另一干凈的離心管中,加入0.7倍體積預(yù)冷的異丙醇,-20℃放置1 h。4℃ ,12 000 r/min離心20 min。棄去上清液,沉淀用70%乙醇300 μL漂洗2次,4℃,12 000 r/min離心5 min,棄去上清液。室溫風(fēng)干,用50 μL雙蒸水溶解DNA,4℃保存待用。

      1.2.2 PCR 反應(yīng)

      PCR反應(yīng)體系的總體積為25μL,包括10×PCR buffer 2.5 μL,25 mmol·L-1MgCl22.5 μL,2.5 mmol·L-1dNTP 2.5 μL,10 mmol·L-1引物 1.0 μL,Taq DNA 聚合酶 0.2 μL,Template DNA 5 ~10 ng,ddH2O 補(bǔ)足至 25 μL。

      擴(kuò)增程序?yàn)?94℃預(yù)變性3 min,94℃變性50 s,36℃復(fù)性50 s,72℃延伸100 s,40 個(gè)循環(huán)后,72℃延伸5 min。以ddH2O代替模板DNA作空白對(duì)照。擴(kuò)增產(chǎn)物以于1.5%瓊脂糖凝膠上,用1×TAE電泳緩沖液電泳,紫外檢測(cè)電泳結(jié)果并拍照。

      1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

      對(duì)凝膠紫外成像系統(tǒng)中重復(fù)性好且清晰的條帶進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以DNA Marker DL2000作分子量標(biāo)記,比較反應(yīng)條帶在凝膠上的遷移率,將遷移率相同的條帶視為同源位點(diǎn),得到[1,0]數(shù)據(jù)矩陣(有條帶計(jì)為“1”,無(wú)條帶計(jì)為“0”),用 SPSS分析軟件中的Jaccard方法計(jì)算黃精屬藥用植物及寶鐸草的相似系數(shù),用Withingroups linkage方法進(jìn)行聚類分析,建立黃精屬藥用植物的親緣關(guān)系樹(shù)狀圖。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 RAPD 擴(kuò)增

      隨機(jī)選擇1份樣品,分別用50條10bp隨機(jī)引物(上海生工生物技術(shù)有限公司合成)進(jìn)行引物初篩,從50條引物中篩選出譜帶清晰且多態(tài)性較好的引物進(jìn)行復(fù)篩,最終篩選出7條擴(kuò)增條帶清晰、反應(yīng)穩(wěn)定且多態(tài)性較好的隨機(jī)引物用于黃精屬植物的RAPD分析,其中引物S51的擴(kuò)增結(jié)果見(jiàn)圖1。7條RAPD隨機(jī)引物的序列及其擴(kuò)增結(jié)果見(jiàn)表2,由表2可見(jiàn),7條引物共擴(kuò)增出條帶48條,其中多態(tài)性條帶37條,平均多態(tài)性條帶百分率達(dá)77.1%,擴(kuò)增產(chǎn)物多集中在200~2000 bp。

      圖1 引物S51的RAPD擴(kuò)增圖譜

      表2 用于RAPD分析的引物序列及擴(kuò)增結(jié)果

      2.2 聚類分析

      根據(jù)RAPD結(jié)果計(jì)算供試的黃精屬藥用植物及寶鐸草間的相似系數(shù),可以看出寶鐸草與黃精屬藥用植物的相似系數(shù)非常低,其中與安徽霍山的長(zhǎng)梗黃精相似系數(shù)最低,為0.077,與中國(guó)藥科大學(xué)藥用植物園的玉竹相似系數(shù)最高,也僅為0.190。黃精屬藥用植物與寶鐸草的聚類分析結(jié)果見(jiàn)圖2。

      圖2 基于RAPD分析的黃精屬部分藥用植物聚類圖

      取λ=14,供試的樣品被明顯分為兩大類,黃精屬的藥用植物全部聚為一類(C類),而寶鐸草單獨(dú)聚為一類,從分子水平論證了寶鐸草被劃歸于百合科萬(wàn)壽竹屬,而不是黃精屬。這也從一定程度上說(shuō)明了黃精屬在“屬”一級(jí)上的分類特征比較清晰,與近緣類群容易區(qū)分,是公認(rèn)的比較自然的屬。取λ=7.5處,黃精屬藥用植物被分為4類,聚類圖上出現(xiàn)交叉現(xiàn)象,來(lái)自湖北赤壁的湖北黃精,安徽六安霍山的長(zhǎng)梗黃精沒(méi)有與其它的黃精屬藥用植物聚在一起,而是各自單獨(dú)作為一類,說(shuō)明這兩種植物與黃精屬的其它藥用植物之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。不同產(chǎn)地的玉竹基本上聚在一起,λ=5.5處,玉竹與來(lái)自南京、安徽的多花黃精聚在一起(B類),但是來(lái)自浙江天目山的多花黃精卻聚到了不同產(chǎn)地的黃精這一支(A類);來(lái)自昆明的4種黃精與陜西黃精聚在一起,而來(lái)自廣西桂林、云南富民、南京中山植物園的黃精與吉林的狹葉黃精卻聚在一起,從中可以看出部分種類在地理分布上相互重疊,種的界限相對(duì)比較模糊。

      3 討論

      黃精屬藥用植物的分類一直是個(gè)難題,特別是近年來(lái)新種的發(fā)表[12],更增添了分類與鑒定的困難,這從黃精屬部分藥用植物的聚類圖上可窺見(jiàn)一斑。從我們收集的黃精屬藥用植物的形態(tài)外觀來(lái)看,來(lái)自陜西渭南的黃精與來(lái)自吉林長(zhǎng)白山的狹葉黃精均為輪生葉,在λ=5處并未聚為一類,而在λ=7.5處與其它來(lái)自不同產(chǎn)地的黃精聚為A類,這可能從一定程度上說(shuō)明了互生葉系與輪生葉系的某些植物中的某些形態(tài)上已存在差異減小的現(xiàn)象,這也印證了吳世安[6]認(rèn)為黃精屬仍處在比較活躍的分化期的觀點(diǎn)。

      湖北黃精根莖味苦,不能入藥,長(zhǎng)梗黃精一直以來(lái)被視為黃精的摻偽品,誤食不但不能達(dá)到臨床療效,甚至引發(fā)中毒,兩者各自單獨(dú)聚為1類,從而很好地與黃精屬其它藥用植物區(qū)別開(kāi)來(lái)。

      RAPD分析用于分類和鑒定,有其獨(dú)到的優(yōu)勢(shì),可在不知道目的基因序列的情況下產(chǎn)生豐富的DNA多態(tài)性[13-14],因此被成功地運(yùn)用于動(dòng)植物藥材品種鑒定、原植物的種屬特異性研究、易混淆品種的鑒別許多方面。長(zhǎng)梗黃精和湖北黃精在植物形態(tài)均為互生葉,利用RAPD技術(shù)分可明顯的區(qū)分這兩個(gè)非藥源品種,首次確定了包括狹葉黃精在內(nèi)3個(gè)非藥源植物與《中國(guó)藥典》記載的黃精、多花黃精以及玉竹之間的親緣關(guān)系,認(rèn)為來(lái)自云南昆明的4種黃精與陜西的黃精親緣關(guān)系比較接近,而廣西桂林、云南富民、南京中山植物園、吉林長(zhǎng)白山的狹葉黃精親緣關(guān)系比較接近,至于來(lái)自浙江天目山的多花黃精為何沒(méi)有與產(chǎn)自安徽六安霍山、南京的多花黃精聚在一起,有待采用其它分子生物學(xué)方法來(lái)進(jìn)行更深入的研究。

      [1]國(guó)家藥典委員會(huì).中華人民共和國(guó)藥典(一部)[M].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2005:288,78.

      [2]Baker J D.Revision of the genera and species of Asparagaceae[J].Linn Soc Bot,1875,14:508-632.

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